单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6721 - 6740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6721 | 2025-10-06 |
KLF17 promotes human naïve pluripotency but is not required for its establishment
2021-11-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199378
PMID:34661235
|
研究论文 | 本研究探讨转录因子KLF17在人类初始多能性建立中的作用 | 首次揭示KLF17足以诱导但非必需于人类初始多能性的建立，发现其与其他KLF旁系同源物可能存在功能冗余 | 研究仅限于体外实验条件，未验证体内生理环境下的功能 | 解析KLF17在人类初始多能性转录调控中的具体功能 | 人类囊胚、初始态和始发态人类胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序, CRISPR-Cas9基因敲除, 功能获得与缺失分析 | NA | 转录组数据 | 人类胚胎干细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6722 | 2025-10-06 |
CD4+ T cells contribute to neurodegeneration in Lewy body dementia
2021-Nov-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf7266
PMID:34648304
|
研究论文 | 本研究揭示了CD4+ T细胞通过CXCR4-CXCL12信号通路参与路易体痴呆神经退行性病变的机制 | 首次发现CD4+ T细胞在路易体痴呆中通过CXCR4-CXCL12信号通路介导神经退行性病变，并证实磷酸化α-突触核蛋白表位可刺激CD4+ T细胞克隆扩增 | 研究基于死后脑组织样本，无法动态观察疾病进程；样本量未明确说明 | 探究T细胞在路易体痴呆神经退行性病变中的具体作用机制 | 路易体痴呆患者死后脑组织、脑脊液样本和CD4+ T细胞 | 神经免疫学 | 路易体痴呆 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6723 | 2025-10-06 |
Oncostatin M can sensitize sensory neurons in inflammatory pruritus
2021-11-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe3037
PMID:34757808
|
研究论文 | 本研究揭示了细胞因子制瘤素M在炎症性瘙痒中对感觉神经元的敏化作用机制 | 首次发现制瘤素M不直接激活感觉神经元，而是通过增强神经元对瘙痒原的反应和神经元兴奋性来敏化瘙痒感觉 | 主要基于小鼠模型研究，人类临床验证仍需进一步研究 | 探索炎症性瘙痒的分子机制和潜在治疗靶点 | 感觉神经元、皮肤T细胞和单核细胞 | 神经科学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞测序、基因敲除、药理学拮抗 | NA | 基因表达数据、行为学数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6724 | 2025-10-06 |
Non-parametric modelling of temporal and spatial counts data from RNA-seq experiments
2021-11-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab486
PMID:34213536
|
研究论文 | 开发了一个名为GPcounts的软件包，用于对RNA-seq实验中的时间和空间计数数据进行非参数建模 | 实现了基于负二项似然函数的高斯过程回归方法，通过变分贝叶斯推断提高计算效率，能够处理单细胞和空间转录组学产生的大规模数据集 | 论文未明确说明方法在处理超大规模数据集时的具体性能限制 | 开发能够有效建模RNA-seq计数数据中时间和空间变化的计算方法 | RNA-seq计数数据，包括单细胞RNA-seq数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 高斯过程回归，负二项分布模型，零膨胀负二项模型 | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 6725 | 2025-10-06 |
XIAP restrains TNF-driven intestinal inflammation and dysbiosis by promoting innate immune responses of Paneth and dendritic cells
2021-Nov-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abf7235
PMID:34739338
|
研究论文 | 本研究揭示了XIAP通过调节潘氏细胞和树突状细胞的先天免疫反应来抑制TNF驱动的肠道炎症和菌群失调的机制 | 首次阐明XIAP缺陷通过TLR5和TNFR1/2信号通路协同作用导致潘氏细胞功能障碍和树突状细胞丢失的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者样本验证有限 | 探究XIAP缺陷导致肠道炎症和菌群失调的分子机制 | XIAP缺陷小鼠、肠道潘氏细胞、树突状细胞、XLP2患者样本 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,肠道类器官培养 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | XIAP缺陷小鼠模型和XLP2患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 6726 | 2025-10-06 |
Macrophages orchestrate the expansion of a proangiogenic perivascular niche during cancer progression
2021-Nov-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg9518
PMID:34730997
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肿瘤相关巨噬细胞中Lyve-1阳性亚群通过调控血管周围间充质细胞扩张促进肿瘤血管生成的作用机制 | 首次发现Lyve-1阳性TAMs亚群通过血小板衍生生长因子-CC依赖的方式调控血管周围间充质细胞增殖，形成促血管生成微环境 | 研究基于自发小鼠乳腺腺癌模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤进展过程中对血管生成微环境的调控作用 | 小鼠乳腺腺癌模型中的肿瘤相关巨噬细胞和血管周围间充质细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，光标记技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 自发小鼠乳腺腺癌模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6727 | 2025-10-06 |
Functional coordination of non-myocytes plays a key role in adult zebrafish heart regeneration
2021-11-04, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202152901
PMID:34523214
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示非心肌细胞在斑马鱼心脏再生中的功能协调机制 | 首次构建了心脏再生过程中非心肌细胞的细胞状态图谱，开发了Topologizer算法映射功能状态间的拓扑关系，发现巨噬细胞在诱导成纤维细胞和内皮细胞亚群中的关键作用 | 研究局限于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探索非心肌细胞在心脏再生过程中的细胞多样性、分子特征和细胞间相互作用 | 成年斑马鱼心脏再生过程中的非心肌细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | LIGER算法, Topologizer算法 | 单细胞转录组数据 | 61,977个非心肌细胞单细胞转录组图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6728 | 2025-10-06 |
Visualization of individual cell division history in complex tissues using iCOUNT
2021-11-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.08.012
PMID:34525348
|
研究论文 | 开发了一种可诱导细胞分裂计数器(iCOUNT)来追踪复杂组织中单个细胞的细胞分裂历史 | 首次开发了能够报告体内外细胞分裂事件的可诱导细胞分裂计数器，并应用于分析神经干/祖细胞的分裂历史 | NA | 研究单个干细胞的分裂潜力及其分子后果 | 人类和小鼠组织中的神经干/祖细胞(NSPCs) | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 发育中小鼠皮层和前脑区域化人类类器官的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6729 | 2025-10-06 |
Ductal Ngn3-expressing progenitors contribute to adult β cell neogenesis in the pancreas
2021-11-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.08.003
PMID:34478642
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞RNA测序技术证实胰腺导管细胞是成年β细胞新生的来源 | 首次发现表达Ngn3的导管细胞在稳态和糖尿病状态下都能产生新的β细胞 | NA | 探究成年胰腺β细胞新生的细胞来源机制 | 小鼠胰腺导管细胞和β细胞 | 发育生物学 | 糖尿病 | 谱系追踪, 3D成像, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6730 | 2025-10-06 |
IL-1-driven stromal-neutrophil interactions define a subset of patients with inflammatory bowel disease that does not respond to therapies
2021-11, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01520-5
PMID:34675383
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了炎症性肠病中基质细胞-中性粒细胞相互作用驱动的特定病理亚型与治疗无应答的关联 | 首次在IBD中识别出由IL-1驱动、中性粒细胞浸润和成纤维细胞活化定义的特定病理亚型，并证明其与多种疗法无应答相关 | 样本量相对有限（总计719例），需要进一步验证IL-1信号阻断治疗策略的临床效果 | 解析炎症性肠病治疗无应答的生物学机制并寻找精准治疗靶点 | 炎症性肠病患者组织样本和临床数据 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | bulk转录组测序, 单细胞转录组测序, 定量组织病理学, 原位定位 | NA | 转录组数据, 组织病理图像, 临床数据 | 总计719例IBD患者（发现队列376例，验证队列343例） | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6731 | 2025-10-06 |
Regulation of intestinal immunity and tissue repair by enteric glia
2021-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04006-z
PMID:34671159
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道神经胶质细胞通过IFNγ信号轴在肠道免疫平衡和组织修复中的关键调控作用 | 首次发现肠道神经胶质细胞通过IFNγ-EGC-CXCL10信号轴调控肠道免疫反应和组织修复的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，人类临床应用的转化价值需进一步验证 | 探究肠道神经胶质细胞在肠道免疫平衡和组织修复中的功能机制 | 小鼠肠道组织、肠道神经胶质细胞、炎症性肠病患者样本 | 细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠感染模型和炎症性肠病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6732 | 2025-10-06 |
Human ALS/FTD brain organoid slice cultures display distinct early astrocyte and targetable neuronal pathology
2021-11, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00923-4
PMID:34675437
|
研究论文 | 本研究开发了源自人类诱导多能干细胞的大脑类器官切片模型，用于模拟C9ORF72 ALS/FTD疾病的早期分子病理 | 首次建立能够重现成熟皮质结构并显示ALS/FTD早期分子病理的人类大脑类器官切片模型 | 无法获取症状前患者的实际样本进行直接验证 | 研究肌萎缩侧索硬化-额颞叶痴呆重叠症(ALS/FTD)的早期细胞病理机制和治疗方法 | 人类诱导多能干细胞(iPSCs)衍生的皮质类器官切片 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化-额颞叶痴呆 | 单细胞RNA测序,生物学检测 | 类器官切片模型 | 基因表达数据,蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6733 | 2025-10-06 |
Mechanisms of vascular smooth muscle cell investment and phenotypic diversification in vascular diseases
2021-11-01, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20210138
PMID:34495326
|
综述 | 本文综述了血管平滑肌细胞在血管疾病中的可塑性机制及其表型多样化的研究进展 | 整合了谱系追踪与单细胞转录组学技术，揭示了VSMC在血管病变中的克隆扩增和表型多样性 | NA | 理解血管平滑肌细胞在血管疾病中的投资机制和表型多样化调控 | 血管平滑肌细胞(VSMC) | 生物医学 | 心血管疾病 | 谱系追踪, 单细胞转录组学, 计算分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6734 | 2025-10-06 |
Heterogeneity and Cancer-Related Features in Lymphangioleiomyomatosis Cells and Tissue
2021-11, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-21-0220
PMID:34312290
|
研究论文 | 本研究通过整合基因和蛋白特征及单细胞和批量组织转录组数据，揭示了淋巴管平滑肌瘤病的异质性特征及其与癌症的分子相似性 | 首次系统识别LAM疾病的分子和细胞特征、主要调控因子、与癌症的相似性以及疾病异质性的潜在原因 | NA | 探究淋巴管平滑肌瘤病在分子、细胞和组织水平的异质性及其与癌症特征的关联 | 淋巴管平滑肌瘤病细胞和组织 | 数字病理学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞转录组测序,批量组织转录组分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 6735 | 2025-10-06 |
Dysregulation of the Pdx1/Ovol2/Zeb2 axis in dedifferentiated β-cells triggers the induction of genes associated with epithelial-mesenchymal transition in diabetes
2021-11, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2021.101248
PMID:33989778
|
研究论文 | 本研究揭示了miR-7过表达通过Pdx1/Ovol2/Zeb2轴诱导β细胞去分化并触发上皮-间质转化的分子机制 | 首次发现β细胞去分化与EMT基因诱导的关联，并阐明Pdx1/Ovol2/Zeb2信号轴在此过程中的调控作用 | 研究主要基于转基因小鼠模型和细胞系，人类样本验证相对有限 | 探究miR-7介导的β细胞去分化对胰岛基因表达和微环境的影响机制 | β细胞特异性miR-7过表达小鼠、MIN6和EndoC-bH1细胞系、已发表的T2D数据集 | 分子生物学 | 糖尿病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 功能获得和缺失实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 转基因小鼠模型、两种细胞系、已发表的人类和小鼠T2D数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6736 | 2025-10-06 |
A survey of the mouse hindbrain in the fed and fasted states using single-nucleus RNA sequencing
2021-11, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2021.101240
PMID:33962048
|
研究论文 | 通过单核RNA测序技术对小鼠后脑在进食和禁食状态下的细胞组成和基因表达进行详细调查 | 首次在后脑区域进行单细胞水平的转录组学研究，揭示了禁食对少突胶质细胞转录组的特异性影响 | 仅研究了小鼠模型，未涉及其他物种；研究局限于后脑特定区域 | 研究后脑区域在营养信号感知和摄食行为调控中的细胞分子机制 | 小鼠后脑的极后区(AP)和孤束核(NTS)细胞 | 单细胞生物学 | 肥胖症 | 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 16,034个细胞（8,910个神经元和7,124个非神经元细胞） | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 6737 | 2025-10-06 |
LGR6 marks nephron progenitor cells
2021-11, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.346
PMID:33848015
|
研究论文 | 本研究鉴定LGR6作为肾脏祖细胞的标志物，并揭示其在肾脏发育过程中的分化轨迹 | 首次发现LGR6可作为肾脏祖细胞的标志物，填补了该领域缺乏MET过程中NPC标志物的空白 | 研究主要基于胚胎外植体和动物模型，人类肾脏发育中的验证仍需进一步研究 | 探索肾脏祖细胞的标志物及其在肾脏发育过程中的分化机制 | 肾脏祖细胞和肾脏发育过程 | 发育生物学 | 肾脏疾病 | 谱系追踪、共聚焦成像、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、成像数据 | 胚胎外植体和体内模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6738 | 2025-10-06 |
Rapid Isolation of Single Cells from Mouse and Human Teeth
2021-10-28, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63043
PMID:34779437
|
研究论文 | 开发了一种从小鼠和人类牙齿中快速分离单细胞的方案，适用于单细胞转录组测序 | 提出了一种快速、温和的组织处理方法，显著缩短了从动物处死到单细胞分析的时间，减少了基因表达的人为变化 | 未明确说明样本数量和处理时间的具体数据 | 开发适用于富含细胞外基质组织的快速单细胞分离方案 | 小鼠和人类牙齿中的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6739 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics of suprachiasmatic nuclei reveal a Prokineticin-driven circadian network
2021-10-18, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021108614
PMID:34487375
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示视交叉上核中由Prokineticin驱动的昼夜节律网络 | 首次在昼夜节律时间尺度上鉴定出11个不同的神经元亚群，构建了神经肽特异性网络拓扑并发现其时间可塑性 | 研究基于器官型切片模型，可能与在体环境存在差异 | 揭示视交叉上核的细胞组成和网络结构如何调控哺乳动物昼夜节律 | 小鼠视交叉上核的时钟细胞 | 单细胞组学 | 昼夜节律紊乱 | 单细胞RNA测序，实时成像，交叉遗传学 | NA | 单细胞转录组数据，实时成像数据 | 约20,000个时钟细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6740 | 2025-10-06 |
Combined presentation and immunogenicity analysis reveals a recurrent RAS.Q61K neoantigen in melanoma
2021-10-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI129466
PMID:34651586
|
研究论文 | 通过数据驱动方法鉴定出HLA-A*01:01与RAS.Q61K组合衍生的复发性新抗原及其免疫特性 | 首次系统鉴定并验证了RAS.Q61K突变在HLA-A*01:01背景下的内源性呈递和天然免疫原性，发现新抗原特异性T细胞克隆具有跨患者相似性且能交叉识别RAS.Q61R变异 | 样本量有限（10个肿瘤样本的HLA肽组学分析，2例患者的TIL反应验证） | 鉴定复发性新抗原并分析其免疫原性特征 | 黑色素瘤患者肿瘤样本和肿瘤浸润淋巴细胞 | 免疫学 | 黑色素瘤 | HLA肽组学、TCR测序、TCR过表达、功能测定、单细胞转录组学 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、序列数据 | 大规模患者队列分析，10个肿瘤样本的HLA肽组学验证，2例患者的TIL反应确认 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |