单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6721 - 6740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6721 | 2025-10-06 |
Integration of spatial and single-cell transcriptomic data elucidates mouse organogenesis
2022-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01006-2
PMID:34489600
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组和单细胞转录组数据，阐明了小鼠器官发育过程中的细胞类型和分化轨迹 | 开发了基于图像的空间单细胞转录组方法，首次将空间信息与单细胞转录组图谱整合，揭示了scRNA-seq数据中无法观察到的细胞分化轴 | 仅检测了387个目标基因，覆盖度有限；研究局限于小鼠胚胎8-12体节阶段 | 研究复杂组织中细胞命运决定的分子机制 | 小鼠胚胎组织切片 | 空间转录组学 | 发育生物学 | seqFISH, scRNA-seq | NA | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎8-12体节阶段组织切片 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | seqFISH | 顺序荧光原位杂交技术，检测387个目标基因 |
| 6722 | 2025-10-06 |
Deciphering Mesenchymal Drivers of Human Dupuytren's Disease at Single-Cell Level
2022-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2021.05.030
PMID:34274346
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术识别人类掌腱膜挛缩症中致病性间充质细胞亚群及其关键分子通路 | 首次在单细胞水平鉴定出Dupuytren病特异性PDPN/FAP致病性间充质细胞群，并发现TNFRSF12A和SCX在成纤维细胞分化中的关键作用 | 样本量相对有限（35,250个细胞），功能验证仅通过体外细胞培养实验完成 | 解析Dupuytren病的细胞和分子驱动机制，为开发新疗法提供靶点 | 人类Dupuytren病变组织、非致病性筋膜和健康真皮组织 | 单细胞组学 | 掌腱膜挛缩症 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 35,250个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6723 | 2025-10-06 |
Simultaneous Analysis of Single-Cell Transcriptomes and Cell Surface Protein Expression of Human Hematopoietic Stem Cells and Progenitors Using the 10x Genomics Platform
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1771-7_13
PMID:34766273
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研究论文 | 本文介绍使用10x Genomics平台同时分析人类造血干细胞和祖细胞的单细胞转录组与细胞表面蛋白表达的方法 | 将CITE-seq工作流程与10x Genomics平台结合，实现单细胞转录组和表面蛋白表达的同时分析 | NA | 开发同时表征蛋白质和RNA的单细胞分析方法 | 人类脐带血单核细胞和CD34+富集的造血祖细胞 | 单细胞多组学 | NA | CITE-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | 10x Genomics, BioLegend | 单细胞RNA-seq, 免疫表型分析 | 10x Chromium, TotalSeq | 基于液滴的单细胞RNA-seq商业平台, TotalSeq™寡核苷酸偶联抗体 |
| 6724 | 2025-10-06 |
Delineating chromatin accessibility re-patterning at single cell level during early stage of direct cardiac reprogramming
2022-01, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2021.09.002
PMID:34509499
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研究论文 | 本研究通过单细胞ATAC-seq技术揭示了心脏重编程早期阶段染色质可及性重塑的动态过程 | 首次在单细胞水平系统描绘心脏重编程早期的染色质可及性重编程模式，并发现Smad3在重编程过程中具有双重作用 | 研究聚焦于重编程早期阶段（第3天），未涵盖完整重编程过程 | 解析心脏成纤维细胞直接重编程为心肌细胞过程中染色质景观变化的驱动机制 | 由Mef2c、Gata4和Tbx5诱导的早期重编程心肌细胞（iCMs） | 表观基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 表观基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6725 | 2025-10-06 |
Identification of HSC/MPP expansion units in fetal liver by single-cell spatiotemporal transcriptomics
2022-01, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00540-7
PMID:34341490
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研究论文 | 通过单细胞时空转录组技术识别小鼠胎肝中造血干细胞/多能祖细胞扩张单元 | 首次构建小鼠胎肝时空转录组图谱，发现CD93富集的HSC/MPP亚群和由多种生态位细胞组成的HSC PLUS结构单元 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 解析造血干细胞和祖细胞在天然生态位中的扩张机制 | 小鼠胎肝中的造血干细胞/多能祖细胞及其生态位细胞 | 单细胞组学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞转录组测序，空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 6726 | 2025-10-06 |
Isolation of human fetal intestinal cells for single-cell RNA sequencing
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100890
PMID:34746860
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研究论文 | 本文提出了一种从人类胎儿肠道样本中分离上皮和非上皮细胞用于单细胞RNA测序的方案 | 开发了能够从人类胎儿样本中高活性分离肠道细胞的方案，并用于构建人类发育过程中肠道细胞的全层图谱 | NA | 建立适用于单细胞RNA测序的肠道细胞分离方法 | 人类胎儿肠道细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6727 | 2025-10-06 |
CARMN Is an Evolutionarily Conserved Smooth Muscle Cell-Specific LncRNA That Maintains Contractile Phenotype by Binding Myocardin
2021-12-07, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究鉴定了一个进化保守的平滑肌细胞特异性长链非编码RNA CARMN，并揭示其通过结合心肌素维持血管平滑肌细胞收缩表型的作用机制 | 首次发现CARMN是与心肌素相互作用的非编码RNA，揭示了其在维持血管平滑肌细胞收缩表型中的新功能 | 研究主要聚焦于血管疾病模型，在其他疾病模型中的作用仍需进一步验证 | 探索血管平滑肌细胞特异性长链非编码RNA的功能及其在血管稳态维持中的作用 | 血管平滑肌细胞、小鼠和大鼠血管损伤模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | RNA测序、实时定量PCR、反义寡核苷酸敲低、腺病毒过表达、RNA pull-down、RNA免疫沉淀、荧光素酶报告基因检测 | 基因敲除小鼠模型、大鼠颈动脉球囊损伤模型 | RNA测序数据、基因表达数据 | 多种组织和细胞类型的公共数据集、小鼠和大鼠血管损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6728 | 2025-10-06 |
Genome-wide analysis of common and rare variants via multiple knockoffs at biobank scale, with an application to Alzheimer disease genetics
2021-12-02, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2021.10.009
PMID:34767756
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研究论文 | 提出一种可扩展的KnockoffScreen-AL方法，用于生物银行规模的全基因组常见和罕见变异分析，并应用于阿尔茨海默病遗传学研究 | 开发了首个适用于生物银行规模（数十万样本和数百万遗传变异）的Knockoff方法，解决了现有方法计算成本高的问题 | 方法主要针对生物银行规模数据，在较小样本量中的性能需要进一步验证 | 开发可扩展的Knockoff方法用于全基因组常见和罕见变异分析，并应用于阿尔茨海默病遗传学研究 | 英国生物银行的388,051个全基因组插补样本，以及独立临床诊断AD荟萃分析的94,437个样本 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | Knockoff方法，全基因组关联分析，单细胞RNA测序，蛋白质组学 | KnockoffScreen-AL | 基因组数据，转录组数据，蛋白质组数据 | 388,051个WG插补样本 + 94,437个独立验证样本 + 143,793个单核转录组 + 735个蛋白质组样本 | NA | 全基因组测序，全基因组插补，单细胞RNA-seq，蛋白质组学 | NA | NA |
| 6729 | 2025-10-06 |
Mesenchymal stem cell treatment improves outcome of COVID-19 patients via multiple immunomodulatory mechanisms
2021-12, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00573-y
PMID:34702946
|
研究论文 | 本研究通过临床试验和单细胞RNA测序分析，揭示间充质干细胞通过多种免疫调节机制改善COVID-19患者临床结局 | 首次发现MSC治疗可动员VNN2造血干/祖样细胞新亚群，并阐明其通过调节免疫细胞、抑制中性粒细胞胞外诱捕网和上调kindlin-3信号通路改善预后的新机制 | 样本量相对有限（每组29例），采用单盲设计而非双盲设计 | 验证MSC治疗COVID-19的有效性并探索其免疫调节机制 | COVID-19患者和实验小鼠 | 单细胞测序分析 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据、影像学数据 | 58例COVID-19患者（29例治疗组/29例对照组）加实验小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6730 | 2025-10-06 |
Breaking the barrier: In vitro models to study choroid plexus development
2021-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2021.05.005
PMID:34182208
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综述 | 本文探讨了利用体外模型研究脉络丛发育的最新进展 | 重点关注体外三维培养等新型技术在人类脉络丛研究中的应用突破 | 人类脉络丛研究存在伦理和技术限制 | 研究脉络丛发育和生理功能 | 脉络丛组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学, 体外三维培养, 活体成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6731 | 2025-10-06 |
Inter and intra-tumoral heterogeneity as a platform for personalized therapies in medulloblastoma
2021-12, Pharmacology & therapeutics
IF:12.0Q1
DOI:10.1016/j.pharmthera.2021.107828
PMID:33662447
|
综述 | 本文综述了髓母细胞瘤的肿瘤间和肿瘤内异质性研究进展及其在个性化治疗中的应用前景 | 系统整合了从传统病理学到单细胞测序技术在不同层次上揭示髓母细胞瘤异质性的研究进展 | 作为罕见疾病研究，当前方法存在应用局限性 | 探讨髓母细胞瘤异质性特征及其对个性化治疗的指导意义 | 髓母细胞瘤患者及肿瘤样本 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | FISH, 免疫组织化学, 下一代测序, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 分子标志物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6732 | 2025-10-06 |
KLF17 promotes human naïve pluripotency but is not required for its establishment
2021-11-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199378
PMID:34661235
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研究论文 | 本研究探讨转录因子KLF17在人类初始多能性建立中的作用 | 首次揭示KLF17足以诱导但非必需于人类初始多能性的建立，发现其与其他KLF旁系同源物可能存在功能冗余 | 研究仅限于体外实验条件，未验证体内生理环境下的功能 | 解析KLF17在人类初始多能性转录调控中的具体功能 | 人类囊胚、初始态和始发态人类胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序, CRISPR-Cas9基因敲除, 功能获得与缺失分析 | NA | 转录组数据 | 人类胚胎干细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6733 | 2025-10-06 |
CD4+ T cells contribute to neurodegeneration in Lewy body dementia
2021-Nov-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf7266
PMID:34648304
|
研究论文 | 本研究揭示了CD4+ T细胞通过CXCR4-CXCL12信号通路参与路易体痴呆神经退行性病变的机制 | 首次发现CD4+ T细胞在路易体痴呆中通过CXCR4-CXCL12信号通路介导神经退行性病变，并证实磷酸化α-突触核蛋白表位可刺激CD4+ T细胞克隆扩增 | 研究基于死后脑组织样本，无法动态观察疾病进程；样本量未明确说明 | 探究T细胞在路易体痴呆神经退行性病变中的具体作用机制 | 路易体痴呆患者死后脑组织、脑脊液样本和CD4+ T细胞 | 神经免疫学 | 路易体痴呆 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6734 | 2025-10-06 |
Oncostatin M can sensitize sensory neurons in inflammatory pruritus
2021-11-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe3037
PMID:34757808
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研究论文 | 本研究揭示了细胞因子制瘤素M在炎症性瘙痒中对感觉神经元的敏化作用机制 | 首次发现制瘤素M不直接激活感觉神经元，而是通过增强神经元对瘙痒原的反应和神经元兴奋性来敏化瘙痒感觉 | 主要基于小鼠模型研究，人类临床验证仍需进一步研究 | 探索炎症性瘙痒的分子机制和潜在治疗靶点 | 感觉神经元、皮肤T细胞和单核细胞 | 神经科学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞测序、基因敲除、药理学拮抗 | NA | 基因表达数据、行为学数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6735 | 2025-10-06 |
Non-parametric modelling of temporal and spatial counts data from RNA-seq experiments
2021-11-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab486
PMID:34213536
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研究论文 | 开发了一个名为GPcounts的软件包，用于对RNA-seq实验中的时间和空间计数数据进行非参数建模 | 实现了基于负二项似然函数的高斯过程回归方法，通过变分贝叶斯推断提高计算效率，能够处理单细胞和空间转录组学产生的大规模数据集 | 论文未明确说明方法在处理超大规模数据集时的具体性能限制 | 开发能够有效建模RNA-seq计数数据中时间和空间变化的计算方法 | RNA-seq计数数据，包括单细胞RNA-seq数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 高斯过程回归，负二项分布模型，零膨胀负二项模型 | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 6736 | 2025-10-06 |
XIAP restrains TNF-driven intestinal inflammation and dysbiosis by promoting innate immune responses of Paneth and dendritic cells
2021-Nov-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abf7235
PMID:34739338
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研究论文 | 本研究揭示了XIAP通过调节潘氏细胞和树突状细胞的先天免疫反应来抑制TNF驱动的肠道炎症和菌群失调的机制 | 首次阐明XIAP缺陷通过TLR5和TNFR1/2信号通路协同作用导致潘氏细胞功能障碍和树突状细胞丢失的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者样本验证有限 | 探究XIAP缺陷导致肠道炎症和菌群失调的分子机制 | XIAP缺陷小鼠、肠道潘氏细胞、树突状细胞、XLP2患者样本 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,肠道类器官培养 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | XIAP缺陷小鼠模型和XLP2患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 6737 | 2025-10-06 |
Macrophages orchestrate the expansion of a proangiogenic perivascular niche during cancer progression
2021-Nov-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg9518
PMID:34730997
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肿瘤相关巨噬细胞中Lyve-1阳性亚群通过调控血管周围间充质细胞扩张促进肿瘤血管生成的作用机制 | 首次发现Lyve-1阳性TAMs亚群通过血小板衍生生长因子-CC依赖的方式调控血管周围间充质细胞增殖，形成促血管生成微环境 | 研究基于自发小鼠乳腺腺癌模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤进展过程中对血管生成微环境的调控作用 | 小鼠乳腺腺癌模型中的肿瘤相关巨噬细胞和血管周围间充质细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，光标记技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 自发小鼠乳腺腺癌模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6738 | 2025-10-06 |
Functional coordination of non-myocytes plays a key role in adult zebrafish heart regeneration
2021-11-04, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202152901
PMID:34523214
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示非心肌细胞在斑马鱼心脏再生中的功能协调机制 | 首次构建了心脏再生过程中非心肌细胞的细胞状态图谱，开发了Topologizer算法映射功能状态间的拓扑关系，发现巨噬细胞在诱导成纤维细胞和内皮细胞亚群中的关键作用 | 研究局限于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探索非心肌细胞在心脏再生过程中的细胞多样性、分子特征和细胞间相互作用 | 成年斑马鱼心脏再生过程中的非心肌细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | LIGER算法, Topologizer算法 | 单细胞转录组数据 | 61,977个非心肌细胞单细胞转录组图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6739 | 2025-10-06 |
Visualization of individual cell division history in complex tissues using iCOUNT
2021-11-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.08.012
PMID:34525348
|
研究论文 | 开发了一种可诱导细胞分裂计数器(iCOUNT)来追踪复杂组织中单个细胞的细胞分裂历史 | 首次开发了能够报告体内外细胞分裂事件的可诱导细胞分裂计数器，并应用于分析神经干/祖细胞的分裂历史 | NA | 研究单个干细胞的分裂潜力及其分子后果 | 人类和小鼠组织中的神经干/祖细胞(NSPCs) | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 发育中小鼠皮层和前脑区域化人类类器官的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6740 | 2025-10-06 |
Ductal Ngn3-expressing progenitors contribute to adult β cell neogenesis in the pancreas
2021-11-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.08.003
PMID:34478642
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞RNA测序技术证实胰腺导管细胞是成年β细胞新生的来源 | 首次发现表达Ngn3的导管细胞在稳态和糖尿病状态下都能产生新的β细胞 | NA | 探究成年胰腺β细胞新生的细胞来源机制 | 小鼠胰腺导管细胞和β细胞 | 发育生物学 | 糖尿病 | 谱系追踪, 3D成像, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |