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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6701 - 6720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6701 | 2025-10-06 |
Next-Generation and Single-Cell Sequencing Approaches to Study Atherosclerosis and Vascular Inflammation Pathophysiology: A Systematic Review
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.849675
PMID:35419441
|
系统综述 | 本综述全面评估了利用单细胞和二代测序技术研究动脉粥样硬化及血管炎症病理生理学的研究现状 | 首次系统整合单细胞测序和二代测序在动脉粥样硬化研究中的应用，提供比传统方法更高分辨率的疾病解析 | 研究间存在显著异质性，对淋巴细胞和内皮细胞等其他细胞类型关注不足 | 评估单细胞和二代测序技术在阐明动脉粥样硬化病理生理机制中的应用价值 | 动脉粥样硬化相关细胞类型（平滑肌细胞、巨噬细胞、干细胞/祖细胞等）及血管组织 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 二代测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 34项符合条件的研究（16项单细胞测序，10项二代测序，8项组合方法） | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 6702 | 2025-10-06 |
Role of synovial fibroblast subsets across synovial pathotypes in rheumatoid arthritis: a deconvolution analysis
2022-01, RMD open
IF:5.1Q1
DOI:10.1136/rmdopen-2021-001949
PMID:34987094
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据并进行反卷积分析，研究类风湿关节炎中滑膜成纤维细胞亚群在不同滑膜病理类型中的分布及其与临床特征的关系 | 首次揭示了不同滑膜病理类型与单细胞RNA测序定义的滑膜成纤维细胞亚型之间的关联 | 研究为计算机模拟分析，需要进一步实验验证 | 评估滑膜成纤维细胞亚群对滑膜病理类型和临床特征的贡献 | 87名未接受治疗的早期关节炎患者的滑膜组织 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 反卷积分析 | Seurat, Harmony, Liger, MuSiC | 基因表达数据 | 87名早期关节炎患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6703 | 2025-10-06 |
Decoding gene regulation in the fly brain
2022-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04262-z
PMID:34987221
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞染色质可及性和转录组数据，系统解析了果蝇大脑中细胞类型特异的基因调控网络 | 首次在果蝇大脑中结合单细胞染色质可及性分析和转录组数据，构建了细胞类型特异的增强子基因调控网络，并开发了DeepFlyBrain深度学习模型 | 研究仅针对果蝇大脑，结果在其他生物系统中的普适性有待验证 | 解析果蝇大脑中细胞类型水平的基因调控网络 | 果蝇大脑神经元和胶质细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞染色质可及性分析, 单细胞转录组测序, 深度学习 | 深度学习 | 单细胞基因组学数据 | 240,919个单细胞，涵盖9个发育时间点 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6704 | 2025-10-06 |
Comparative Proteome Signatures of Trace Samples by Multiplexed Data-Independent Acquisition
2022-01, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2021.100177
PMID:34793982
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研究论文 | 开发了一种结合DIA和TMT多重标记的新方法，用于从痕量样本中生成高重复性的定量蛋白质组特征 | 将两种对立分析策略DIA和TMT多重标记相结合，开发了不依赖识别的蛋白质组数据分析流程 | NA | 解决质谱单细胞蛋白质组学在比较数千个单细胞蛋白质表达谱时面临的重复性挑战 | 痕量输入样本和人类细胞系 | 蛋白质组学 | NA | 数据非依赖性采集(DIA)、串联质量标签(TMT)、质谱蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据 | 数百个样本 | NA | 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 6705 | 2025-10-06 |
Cell-by-cell dissection of phloem development links a maturation gradient to cell specialization
2021-Dec-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aba5531
PMID:34941412
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学解析植物韧皮部发育轨迹，揭示了成熟梯度与细胞特化的关联机制 | 首次在单细胞水平重建韧皮部发育全过程，发现PEAR转录因子通过激活GTPase信号介导谱系分叉，并揭示PLETHORA梯度抑制分化程序的机制 | 研究仅针对根尖分生组织的韧皮部发育，未涉及其他组织或环境条件下的发育过程 | 解析植物韧皮部细胞从祖细胞到终末分化的发育机制 | 拟南芥根尖分生组织的韧皮部细胞 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 根尖分生组织韧皮部细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 6706 | 2025-10-06 |
Identification and Characterization of Antigen-Specific CD8+ T Cells Using Surface-Trapped TNF-α and Single-Cell Sequencing
2021-12-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100535
PMID:34810222
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研究论文 | 开发了一种基于表面捕获TNF-α和单细胞测序技术快速鉴定抗原特异性CD8+ T细胞的新方法 | 利用表面捕获的TNF-α进行活细胞分选，结合单细胞测序获得配对TCR全长序列，创建了可无限扩增的实验试剂 | 方法主要适用于原代细胞数量有限的样本，未明确说明技术应用的广泛性验证 | 建立快速鉴定和表征抗原特异性CD8+ T细胞的新策略 | 抗原特异性CD8+ T细胞 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞测序，TCR测序，逆转录病毒转导 | NA | 单细胞序列数据 | 恒河猴CMV特异性CD8 T细胞和HIV感染供体样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6707 | 2025-10-06 |
TNF plays a crucial role in inflammation by signaling via T cell TNFR2
2021-12-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2109972118
PMID:34873037
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研究论文 | 本研究揭示了TNF通过T细胞TNFR2信号在炎症中发挥关键作用，不仅是效应分子还是炎症性Th细胞分化的启动因子 | 发现TNF通过TNFR2介导Th17和Th1细胞向炎症表型分化，且不依赖IL-6和STAT3信号通路 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究TNF在炎症性T细胞分化中的上游调控作用 | 小鼠CD4 T细胞、实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型、结肠炎模型 | 免疫学 | 多发性硬化症、自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6708 | 2025-10-06 |
The onset of circulation triggers a metabolic switch required for endothelial to hematopoietic transition
2021-12-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110103
PMID:34910918
|
研究论文 | 本研究揭示了血液循环起始通过触发代谢转换促进造血干细胞生成的新机制 | 首次发现血液循环起始触发内皮细胞向造血细胞转变过程中的糖酵解向氧化磷酸化代谢转换 | 研究主要基于Ncx1缺陷小鼠模型，人类胚胎中的适用性需要进一步验证 | 探究血液循环起始对造血干细胞生成的影响机制 | 小鼠胚胎造血干细胞谱系 | 发育生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6709 | 2025-10-06 |
Delayed antiretroviral therapy in HIV-infected individuals leads to irreversible depletion of skin- and mucosa-resident memory T cells
2021-12-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.10.021
PMID:34813775
|
研究论文 | 本研究揭示了延迟抗逆转录病毒治疗会导致HIV感染者皮肤和黏膜组织驻留记忆T细胞不可逆耗竭的机制 | 首次发现早期与延迟ART治疗对皮肤CD4 Trm细胞重建的不同影响，并揭示CXCR3 Trm细胞在HIV相关免疫缺陷中的关键作用 | 研究样本量有限，主要关注皮肤和黏膜组织，未涉及其他组织类型 | 探究HIV感染者接受延迟抗逆转录病毒治疗后组织特异性免疫缺陷的机制 | HIV感染者的皮肤和黏膜组织驻留记忆T细胞 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序，TCR克隆分析 | NA | 基因表达数据，T细胞受体数据 | HIV感染者组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6710 | 2025-10-06 |
CIDER: an interpretable meta-clustering framework for single-cell RNA-seq data integration and evaluation
2021-12-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02561-2
PMID:34903266
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研究论文 | 提出一种基于组间相似性度量的可解释元聚类框架CIDER，用于单细胞RNA-seq数据整合与评估 | 无需假设样本间细胞群体组成完全相同，通过元聚类工作流程解决批次效应和生物变异等混杂因素 | NA | 开发单细胞RNA-seq数据整合与评估方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 元聚类框架 | 基因表达数据 | 模拟和真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6711 | 2025-10-06 |
Delayed induction of type I and III interferons mediates nasal epithelial cell permissiveness to SARS-CoV-2
2021-12-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27318-0
PMID:34876592
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，揭示了SARS-CoV-2在鼻上皮细胞中的感染机制及I/III型干扰素应答的延迟特征 | 首次发现SARS-CoV-2在鼻上皮细胞中引发I/III型干扰素应答的延迟现象，并证明外源性干扰素可有效抑制病毒复制 | 研究基于体外细胞模型，与体内实际情况可能存在差异 | 探究SARS-CoV-2与鼻上皮细胞先天免疫系统的相互作用机制 | 人鼻上皮细胞气液界面分化模型 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6712 | 2025-10-06 |
Germline biallelic mutation affecting the transcription factor Helios causes pleiotropic defects of immunity
2021-Nov-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abe3981
PMID:34826259
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研究论文 | 本研究首次发现影响转录因子Helios的种系双等位基因突变会导致免疫多效性缺陷 | 首次鉴定出Helios种系纯合错义突变(p.Ile325Val)导致的人类先天免疫错误，并揭示其通过影响表观遗传调控导致T细胞稳态失衡的机制 | 研究仅基于单例患者，需要更大样本验证；Helios调控其他T细胞亚群的具体机制仍需进一步研究 | 探究Helios转录因子在人类免疫稳态中的作用机制 | 携带Helios突变的免疫缺陷患者及其免疫细胞 | 免疫学 | 先天免疫错误 | 单细胞RNA测序，表观遗传分析 | NA | 基因组数据，转录组数据，表观遗传数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6713 | 2025-10-06 |
Alternative poly-adenylation modulates α1-antitrypsin expression in chronic obstructive pulmonary disease
2021-11, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009912
PMID:34784346
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研究论文 | 本研究揭示了慢性阻塞性肺疾病中通过选择性多聚腺苷酸化调控α1-抗胰蛋白酶表达的分子机制 | 首次发现SERPINA1基因3'UTR远端多聚腺苷酸化位点的使用增加导致mRNA翻译效率显著降低，并鉴定出QKI作为调控该过程的关键RNA结合蛋白 | 研究主要基于体外实验和测序数据分析，需要进一步在体功能验证 | 探究非A1AT缺乏个体中α1-抗胰蛋白酶在慢性阻塞性肺疾病中的调控机制 | 人类原代肺组织、肝组织和各种免疫细胞类型 | 分子生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA-seq, eCLIP, 纳米荧光素酶报告实验, shRNA敲低, 核质分离, RNA结构探测 | NA | RNA测序数据, 蛋白质结合数据, 荧光素酶活性数据 | 82例COPD患者和64例对照（发现队列），376例COPD和267例对照（验证队列） | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6714 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing profiling of mouse endothelial cells in response to pulmonary arterial hypertension
2022-08-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab296
PMID:34528097
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠内皮细胞在肺动脉高压中的转录组变化 | 首次在单细胞分辨率下系统表征肺动脉高压中内皮细胞的动态变化，并发现跨物种保守的基因表达模式 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究肺动脉高压中内皮细胞的功能失调机制 | 小鼠、大鼠和人类的内皮细胞 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠内皮细胞（对照和PAH模型），大鼠和人类PAH单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6715 | 2025-10-06 |
Efficacy and limitations of senolysis in atherosclerosis
2022-06-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab208
PMID:34142149
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞衰老标志物在动脉粥样硬化中的特异性以及遗传和药物性衰老细胞清除（senolysis）对疾病的影响 | 揭示了传统衰老标志物p16在动脉粥样硬化中的局限性，并首次比较了遗传性和药物性衰老细胞清除策略的不同效果 | 传统衰老标志物缺乏特异性，药物性衰老细胞清除可能引起非特异性效应如单核细胞和血小板减少 | 评估衰老细胞清除在动脉粥样硬化治疗中的疗效和局限性 | 血管平滑肌细胞（VSMCs）、小鼠动脉粥样硬化模型、人类VSMCs培养细胞 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、谱系追踪、细胞培养 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 人类和小鼠VSMCs细胞、小鼠动脉粥样硬化模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6716 | 2025-10-06 |
The tumour microenvironment shapes innate lymphoid cells in patients with hepatocellular carcinoma
2022-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-325288
PMID:34340996
|
研究论文 | 本研究探讨肝细胞癌肿瘤微环境如何通过细胞因子梯度调控先天淋巴细胞的组成和可塑性 | 首次在肝细胞癌中系统揭示肿瘤微环境通过细胞因子梯度调控ILC亚群转化和功能可塑性 | 样本量相对有限，未在更多癌种中验证发现的特异性 | 研究肿瘤微环境对先天淋巴细胞在肝细胞癌中的调控机制 | 48例肝细胞癌患者的肿瘤组织、癌旁组织和边缘组织 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,批量RNA测序,AbSeq | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,批量RNA测序数据 | 48例肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 6717 | 2025-10-06 |
The molecular and phenotypic makeup of fetal human skin T lymphocytes
2022-04-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199781
PMID:34604909
|
研究论文 | 本研究开发了从胎儿人类皮肤中分离和扩增T细胞的新工作流程，并系统表征了其分子表型特征 | 建立了首个从胎儿皮肤中高效分离和扩增T细胞的工作流程，并首次全面表征了胎儿皮肤T细胞的分子表型 | 胎儿皮肤样本中T细胞数量稀少可能限制分析的深度，培养过程可能对细胞表型产生未知影响 | 研究胎儿人类皮肤中T细胞的分子和表型特征及其在早期免疫中的作用 | 胎儿人类皮肤组织中的T淋巴细胞 | 免疫学 | NA | 多参数流式细胞术、原位免疫荧光、单细胞转录组测序、TCR受体谱分析 | NA | 流式细胞数据、荧光图像、单细胞转录组数据、TCR序列数据 | 胎儿皮肤活检组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6718 | 2025-10-06 |
Advancing root developmental research through single-cell technologies
2022-02, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2021.102113
PMID:34562694
|
综述 | 探讨单细胞技术在植物根系发育研究中的应用与前景 | 提出通过整合多组学数据和空间转录组学提升根系发育研究的时空分辨率 | 当前技术仍处于初步阶段，尚未充分发挥单细胞技术的全部潜力 | 推动单细胞技术在植物根系发育研究领域的应用发展 | 拟南芥根分生组织及其他植物物种的根系发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 谱系追踪, 轨迹分析 | 单细胞基因调控网络 | 转录组数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 6719 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Conserved Metaplasia Program in Pancreatic Injury
2022-02, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.10.027
PMID:34695382
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胰腺损伤中腺泡向导管化生(ADM)的保守化生程序及其与肿瘤发生的关系 | 首次在单细胞水平系统描绘胰腺损伤诱导的ADM细胞群体及其发育轨迹，发现与胃幽门化生相似的转录表型，并证明KrasG12D靶向ADM群体可驱动肿瘤形成 | 样本量相对有限，人类样本仅来自15例慢性胰腺炎患者 | 定义胰腺损伤中腺泡向导管化生(ADM)产生的细胞群体、转录变化及疾病进展标志物 | 小鼠胰腺腺泡细胞、人类慢性胰腺炎手术标本 | 单细胞生物学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、免疫染色、电子显微镜 | 谱系轨迹分析 | 单细胞转录组数据、组织图像数据 | 超过13,000个EYFP+细胞进行scRNA-seq，15例人类慢性胰腺炎患者手术标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6720 | 2025-10-06 |
Differential abundance testing on single-cell data using k-nearest neighbor graphs
2022-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01033-z
PMID:34594043
|
研究论文 | 提出基于k近邻图的单细胞数据差异丰度测试新方法Milo | 使用部分重叠的k近邻图邻域替代传统离散聚类，能识别连续轨迹变化和聚类方法无法检测的扰动 | 基于细胞间相似性结构，可能不适用于所有单细胞数据类型 | 开发单细胞数据差异丰度测试的统计框架 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | k近邻图 | 单细胞基因表达数据 | 模拟数据和真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |