单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
6701	2024-10-26	Osr1-mediated mesothelial transition of liver mesenchymal cells exacerbates fibrotic liver damage 2024-Sep-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2024.02.024 PMID:38414241	研究论文	研究揭示了在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）模型小鼠中，肝星状细胞（HSCs）在肝损伤后向间皮细胞（MCs）的转变过程，并探讨了Osr1基因在这一过程中的作用	首次发现肝星状细胞在肝损伤后可以转变为间皮细胞，并揭示了Osr1基因在这一转变中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证	探讨肝星状细胞在肝损伤后的转变过程及其在肝纤维化中的作用	肝星状细胞、间皮细胞、Osr1基因	NA	肝病	单细胞RNA测序、体内谱系追踪	NA	RNA	非酒精性脂肪性肝炎（NASH）模型小鼠
6702	2024-10-26	Organoids for Cancer Research: Advances and Challenges 2024-Sep, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400056 PMID:38977414	综述	本文综述了癌症类器官在癌症研究中的进展、应用、优势、局限性和前景	癌症类器官作为复杂肿瘤微环境的模型，有望提高肿瘤药物开发的成功率并重现最有效的治疗方案	癌症类器官的应用仍面临挑战，包括技术限制和标准化问题	探讨癌症类器官在临床肿瘤治疗中的应用潜力	癌症类器官及其在肿瘤药物开发中的应用	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	NA	NA
6703	2024-10-26	A Single-Cell Transcriptome Profiling of Triptolide-Induced Nephrotoxicity in Mice 2024-Sep, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400120 PMID:38864263	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了雷公藤内酯诱导的小鼠肾毒性效应及其机制	首次在单细胞分辨率下全面描述了雷公藤内酯处理后肾脏细胞的转录组变化和细胞组成	NA	揭示雷公藤内酯诱导的肾毒性机制	雷公藤内酯处理后的小鼠肾脏组织	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	控制组和雷公藤内酯处理组的小鼠肾脏组织
6704	2024-10-26	Senolytic and senomorphic agent procyanidin C1 alleviates structural and functional decline in the aged retina 2024-Apr-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2311028121 PMID:38657052	研究论文	研究了衰老视网膜中细胞衰老负担增加对结构和功能的影响，并验证了原花青素C1（PCC1）的抗衰老和抗衰老细胞特性	首次全面描述了PCC1对衰老视网膜的改善作用，并通过单细胞RNA测序揭示了其分子机制	研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类中验证	探讨衰老视网膜中的细胞衰老负担及其治疗潜力	衰老视网膜的结构和功能变化	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	小鼠模型
6705	2024-10-26	LIG1 is a novel marker for bladder cancer prognosis: evidence based on experimental studies, machine learning and single-cell sequencing 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1419126 PMID:39234248	研究论文	本文探讨了LIG1在膀胱癌中的作用及其与预后的关系	首次系统研究LIG1在膀胱癌中的作用，结合实验研究、机器学习和单细胞测序技术	实验验证主要基于体外和细胞系，缺乏临床样本的直接验证	阐明LIG1与膀胱癌的相互作用及其与临床病理因素的相关性	LIG1在膀胱癌中的表达、功能及其与预后的关系	数字病理学	膀胱癌	单细胞测序	机器学习	基因表达数据	来自GEO数据库的膀胱癌和癌旁组织样本
6706	2024-10-26	TP63 transcriptionally regulates SLC7A5 to suppress ferroptosis in head and neck squamous cell carcinoma 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1445472 PMID:39234254	研究论文	研究探讨了TP63通过转录调控SLC7A5抑制头颈鳞状细胞癌中的铁死亡机制	首次揭示了TP63+ SLC7A5+头颈鳞状细胞癌亚群通过TP63上调SLC7A5表达抑制铁死亡，从而促进肿瘤生长和免疫治疗抵抗的新机制	NA	研究头颈鳞状细胞癌在免疫治疗前后肿瘤微环境的异质性及其机制	头颈鳞状细胞癌患者在免疫治疗前后的肿瘤微环境	数字病理学	头颈鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
6707	2024-10-26	Transcriptomic signatures of WNT-driven pathways and granulosa cell-oocyte interactions during primordial follicle activation 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0311978 PMID:39441825	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了WNT信号通路在原始卵泡激活过程中对颗粒细胞和卵母细胞相互作用的调控机制	首次使用Wntless条件性敲除小鼠模型，揭示了WNT信号通路在原始卵泡激活过程中对颗粒细胞和卵母细胞转录组变化的影响	研究仅限于Wntless条件性敲除小鼠模型，未探讨其他信号通路的影响	探讨WNT信号通路在原始卵泡激活过程中对颗粒细胞和卵母细胞相互作用的调控机制	颗粒细胞和卵母细胞在原始卵泡激活过程中的转录组变化	生殖生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	Wntless条件性敲除小鼠
6708	2024-10-26	Application of a risk score model based on glycosylation-related genes in the prognosis and treatment of patients with low-grade glioma 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1467858 PMID:39445005	研究论文	研究基于糖基化相关基因的风险评分模型在低级别胶质瘤患者预后和治疗中的应用	首次构建了基于糖基化相关基因的风险评分模型，用于低级别胶质瘤的预后预测和治疗指导	研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，需要进一步的临床验证	探讨糖基化相关基因在低级别胶质瘤中的生物学功能及其在预后和治疗中的应用	低级别胶质瘤患者及其糖基化相关基因	数字病理	脑肿瘤	RNA-seq, scRNA-seq	LASSO回归分析	基因表达数据	来自TCGA和GEO数据库的低级别胶质瘤患者数据
6709	2024-10-26	Single-cell sequencing technology in skin wound healing 2024, Burns & trauma IF:6.3Q1 DOI:10.1093/burnst/tkae043 PMID:39445224	研究论文	本文探讨了单细胞测序技术在皮肤伤口愈合中的应用价值	单细胞测序技术能够准确检测细胞表达和基因序列，为伤口愈合研究提供了新的概念和工具	NA	探讨单细胞测序技术在皮肤伤口愈合中的应用及其在临床中的价值	皮肤伤口愈合过程中的细胞和分子机制	数字病理学	皮肤疾病	单细胞测序（SCS）	NA	基因序列	NA
6710	2024-10-26	Microfluidic single-cell migration chip reveals insights into the impact of extracellular matrices on cell movement 2023-10-24, Lab on a chip IF:6.1Q2 DOI:10.1039/d3lc00651d PMID:37750357	研究论文	开发了一种高通量微流控细胞迁移芯片，结合机器人液体处理和计算机视觉技术，监测3200个单细胞的运动，研究细胞外基质对细胞迁移的影响	开发了高通量微流控细胞迁移芯片，提供前所未有的单细胞分辨率，研究不同细胞外基质对三阴性乳腺癌细胞迁移的影响	研究主要集中在三阴性乳腺癌细胞，未涵盖所有类型的细胞和疾病	研究细胞外基质对细胞迁移的影响，为开发治疗与细胞迁移相关疾病的新策略提供见解	三阴性乳腺癌细胞在不同细胞外基质中的迁移行为	数字病理学	乳腺癌	微流控技术	NA	图像	3200个单细胞
6711	2024-10-26	A subpopulation of lipogenic brown adipocytes drives thermogenic memory 2023-Oct, Nature metabolism IF:18.9Q1 DOI:10.1038/s42255-023-00893-w PMID:37783943	研究论文	本文研究了短暂寒冷暴露后棕色脂肪组织的长期转录和代谢适应机制	发现了一种脂质生成棕色脂肪细胞亚群，该亚群在短暂寒冷暴露后驱动热生成记忆，并能改善二次寒冷暴露时的热生成反应	NA	探讨短暂环境刺激后长期适应的机制	棕色脂肪组织及其在寒冷暴露后的转录和代谢适应	NA	肥胖	单核RNA测序和空间转录组学	NA	转录组数据	NA
6712	2024-10-26	Optimized protocol for mouse footpad immune cell isolation for single-cell RNA sequencing and flow cytometry 2023-Sep-15, STAR protocols IF:1.3Q4 DOI:10.1016/j.xpro.2023.102409 PMID:37402171	研究论文	本文介绍了一种优化的小鼠足垫免疫细胞分离协议，用于单细胞RNA测序和流式细胞术	提出了一个高效的小鼠足垫免疫细胞分离方法，保持高细胞活力，适用于单细胞RNA测序	NA	开发和优化用于单细胞RNA测序的小鼠足垫免疫细胞分离方法	小鼠足垫中的免疫细胞	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠足垫中的免疫细胞
6713	2024-10-26	The Dynamic Role of Cardiac Macrophages in Aging and Disease 2022-08, Current cardiology reports IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s11886-022-01714-4 PMID:35595950	综述	本文综述了心脏免疫景观在衰老、血流动力学应激和心肌损伤中的动态变化，重点介绍了心脏免疫细胞类型及其在心肌损伤后重塑细胞景观和促进组织重塑中的作用	通过单细胞转录组学和效应机制的阐明，提供了关于多种心脏疾病发病机制的新见解，并可能为治疗提供新的靶点	NA	探讨心脏免疫细胞在衰老和疾病中的动态作用及其在心脏病理中的机制	心脏巨噬细胞及其在心肌损伤后的功能	NA	心血管疾病	单细胞转录组学	NA	NA	NA
6714	2024-10-26	Towards precision medicine in lymphoid malignancies 2022-08, Journal of internal medicine IF:9.0Q1 DOI:10.1111/joim.13423 PMID:34875132	综述	本文综述了淋巴恶性肿瘤中临床相关的诊断、预后和预测生物标志物，并讨论了综合分子分析的诊断方法如何为精准诊断/医学方法的实施铺平道路	讨论了单细胞测序和其他组学技术在解析淋巴恶性肿瘤克隆动态和进化中的应用	NA	探讨淋巴恶性肿瘤中的精准医学方法	B细胞恶性肿瘤中的诊断、预后和预测生物标志物	数字病理	淋巴瘤	单细胞测序	NA	基因组和表观基因组数据	NA
6715	2024-10-26	Combinatorial transcription factor profiles predict mature and functional human islet α and β cells 2021-09-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.151621 PMID:34428183	研究论文	研究通过单细胞RNA测序分析了正常人胰岛细胞中转录因子的表达异质性，并基于组合转录因子表达对α和β细胞进行分层	首次通过组合转录因子表达预测了高度功能性和成熟的胰岛α和β细胞亚群	研究仅限于正常人胰岛细胞，未涉及糖尿病或其他疾病状态	定义胰岛细胞中转录因子表达的异质性及其对细胞功能的影响	人胰岛α和β细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	超过40,000个正常人胰岛细胞
6716	2024-10-26	Age-determined expression of priming protease TMPRSS2 and localization of SARS-CoV-2 in lung epithelium 2021-01-04, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI140766 PMID:33180746	研究论文	研究了SARS-CoV-2在肺上皮细胞中的表达及其与年龄相关的TMPRSS2蛋白酶的表达	首次揭示了TMPRSS2在不同年龄段小鼠和人类肺组织中的表达变化，并发现TMPRSS2表达与SARS-CoV-2感染细胞的共定位	研究主要基于小鼠和人类肺组织的单细胞RNA测序和免疫荧光分析，缺乏更大规模的临床数据支持	探讨SARS-CoV-2在肺上皮细胞中的表达及其与年龄相关的TMPRSS2蛋白酶的表达	SARS-CoV-2在肺上皮细胞中的表达及TMPRSS2蛋白酶的年龄相关性表达	数字病理学	呼吸系统疾病	单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和免疫荧光	NA	RNA	小鼠和人类肺组织样本
6717	2024-10-25	Spatial Transcriptomics: A New Frontier in Atherosclerosis Research? 2024-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321652 PMID:39441914	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
6718	2024-10-25	Immunoglobin attenuates fulminant myocarditis by inhibiting overactivated innate immune response 2024-Oct-23, British journal of pharmacology IF:6.8Q1 DOI:10.1111/bph.17372 PMID:39442535	研究论文	研究免疫球蛋白通过抑制过度激活的先天免疫反应来减轻暴发性心肌炎的治疗效果	首次揭示了免疫球蛋白通过调节心脏免疫稳态，特别是抑制过度激活的先天免疫反应，显著改善暴发性心肌炎小鼠的心脏功能	研究仅在A/JGpt小鼠模型中进行，结果的普适性有待进一步验证	探讨免疫调节药物对暴发性心肌炎的治疗效果	暴发性心肌炎小鼠模型	NA	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	A/JGpt小鼠
6719	2024-10-25	Integrated transcriptomics of human blood vessels defines a spatially controlled niche for early mesenchymal progenitor cells 2024-Oct-21, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.06.015 PMID:39025061	研究论文	本文通过空间和单细胞转录组学技术，详细研究了人类血管外膜中的间充质前体细胞的表型、潜能和微观解剖分布	首次详细描述了人类血管外膜中间充质前体细胞的微观解剖分布和异质性，并识别出一种具有高表面CD201表达的更原始细胞类型	研究主要集中在人类和小鼠的血管外膜细胞，未涉及其他物种或组织类型	揭示人类血管外膜中间充质前体细胞的微观解剖分布和异质性	人类和小鼠的血管外膜中间充质前体细胞	数字病理学	NA	空间转录组学和单细胞转录组学	NA	转录组数据	人类和小鼠的血管外膜样本
6720	2024-10-25	Decoding the multiple functions of ZBP1 in the mechanism of sepsis-induced acute lung injury 2024-Oct-21, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-024-07072-x PMID:39433574	研究论文	研究探讨了ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的多重功能	首次定义了ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用，并揭示了其在调节巨噬细胞和肺内皮细胞功能中的重要性	研究仅基于ZBP1敲除小鼠模型，未涉及人类样本	探讨ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用及其潜在治疗价值	ZBP1在巨噬细胞和肺内皮细胞中的功能	数字病理学	急性肺损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA	ZBP1敲除小鼠