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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6681 | 2025-10-06 |
Discordant Genome Assemblies Drastically Alter the Interpretation of Single-Cell RNA Sequencing Data Which Can Be Mitigated by a Novel Integration Method
2022-02-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11040608
PMID:35203259
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研究论文 | 本研究揭示了不同基因组组装版本对单细胞RNA测序数据解读的显著影响,并提出了一种新的整合方法以缓解此问题 | 首次系统评估不同基因组组装对scRNAseq数据解读的影响,并提出多基因组组装对齐与数据集成的创新方法 | 研究主要关注非模式生物,在模式生物中的适用性需要进一步验证 | 解决多基因组组装版本对单细胞RNA测序数据解读的一致性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6682 | 2025-10-06 |
Complement activation induces excessive T cell cytotoxicity in severe COVID-19
2022-02-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.040
PMID:35032429
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术发现严重COVID-19中补体激活诱导CD16 T细胞产生过度细胞毒性 | 首次发现CD16 T细胞在COVID-19中具有免疫复合物介导的T细胞受体非依赖性细胞毒性功能 | 研究样本量有限,需要更大规模验证 | 探究严重COVID-19中T细胞的致病机制 | COVID-19患者的T细胞和微血管内皮细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学, 单细胞蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | COVID-19患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
6683 | 2025-10-06 |
Human embryonic genome activation initiates at the one-cell stage
2022-02-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.11.012
PMID:34936886
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研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞RNA测序揭示了人类胚胎基因组激活在一细胞阶段即已开始 | 发现人类胚胎转录在一细胞阶段就开始启动,比传统认为的八细胞阶段更早 | 研究样本类型有限,主要关注正常和异常原核形态的胚胎 | 确定人类胚胎基因组激活的确切时间和表达特征 | 人类中期II卵母细胞和双原核一细胞胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类卵母细胞和一细胞胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6684 | 2025-10-06 |
Urine Single-Cell RNA Sequencing in Focal Segmental Glomerulosclerosis Reveals Inflammatory Signatures
2022-Feb, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2021.11.005
PMID:35155868
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研究论文 | 通过尿液单细胞RNA测序分析局灶节段性肾小球硬化症患者的炎症特征 | 首次在FSGS患者尿液中鉴定出单细胞亚型和足细胞上皮-间质转化特征基因 | 样本量较小(12名患者,17份尿液样本),缺乏纵向随访数据 | 探索尿液细胞分子特征作为肾病综合征诊断和预后工具的潜力 | 局灶节段性肾小球硬化症患者的尿液细胞 | 单细胞组学 | 肾病综合征/局灶节段性肾小球硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12名FSGS患者的17份尿液样本,捕获为23个尿液细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6685 | 2025-10-06 |
Tumor-specific T cells support chemokine-driven spatial organization of intratumoral immune microaggregates needed for long survival
2022-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004346
PMID:35217577
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研究论文 | 本研究通过多模态分析揭示了肿瘤特异性T细胞通过分泌趋化因子驱动肿瘤内免疫微聚集体的空间组织,从而促进长期生存的机制 | 首次在头颈鳞癌中系统解析了免疫应答阳性患者肿瘤微环境的空间组织结构特征,发现肿瘤特异性T细胞通过分泌CCL4和LTB等趋化因子形成正反馈环路 | 研究样本量相对有限,主要聚焦于口咽鳞状细胞癌,结论在其他癌种中的普适性需要进一步验证 | 解析与肿瘤特异性T细胞应答相关的肿瘤免疫微环境蓝图特征 | 口咽鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理 | 头颈癌 | bulk RNA测序,成像质谱流式,单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | 空间相互作用分析 | 基因表达数据,空间表型数据,单细胞转录组数据 | 前瞻性口咽鳞癌队列患者 | NanoString,Fluidigm,10x Genomics | bulk RNA测序,成像质谱流式,单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NanoString nCounter,Hyperion,10x Chromium | NanoString基因表达分析,Hyperion组织成像系统,10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
6686 | 2025-10-06 |
The threat of programmed DNA damage to neuronal genome integrity and plasticity
2022-02, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-01001-y
PMID:35145299
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综述 | 探讨神经元中程序性DNA损伤对基因组完整性和可塑性的威胁及其修复机制 | 提出神经元程序性DNA断裂的新范式,揭示其与生理代谢过程及神经退行性疾病的关联 | 程序性DNA断裂在神经元生理和疾病中的作用尚未充分探索 | 研究神经元DNA修复机制以保护基因组免受程序性断裂的错误影响 | 神经元基因组 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序, bulk测序 | NA | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞测序, bulk测序 | NA | NA |
6687 | 2025-10-06 |
Diversity of satellite glia in sympathetic and sensory ganglia
2022-02-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110328
PMID:35108545
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了外周神经系统交感神经节和感觉神经节中卫星胶质细胞的分子多样性 | 首次系统识别了交感神经节和感觉神经节中五种不同的卫星胶质细胞亚群,并发现感觉特异性胶质细胞富含谷氨酸代谢相关基因 | 研究主要基于转录组分析,功能验证实验相对有限 | 探索外周神经系统中卫星胶质细胞的分子多样性 | 交感神经节和感觉神经节中的卫星胶质细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6688 | 2025-10-06 |
Characterization of the COPD alveolar niche using single-cell RNA sequencing
2022-01-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28062-9
PMID:35078977
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术表征COPD肺泡微环境,识别了疾病特异性细胞亚群及其分子机制 | 首次在晚期COPD中识别出具有异常代谢特征和应激耐受性降低的肺泡上皮II型细胞亚群,并发现高表达金属硫蛋白的巨噬细胞亚群 | 研究主要基于晚期COPD患者样本,可能无法完全反映疾病早期变化 | 揭示慢性阻塞性肺疾病(COPD)发病机制中的细胞特异性分子机制 | 晚期COPD患者和对照者的离体肺组织、香烟烟雾暴露小鼠的肺组织、分离的人肺泡上皮细胞 | 单细胞生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 体外功能模型, 原位杂交, 免疫染色 | 转录组网络分析 | 基因表达数据, 组织图像 | 晚期COPD患者和对照者的肺组织样本,香烟烟雾暴露小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6689 | 2025-10-06 |
Hyperpolarised 13C-MRI identifies the emergence of a glycolytic cell population within intermediate-risk human prostate cancer
2022-01-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28069-2
PMID:35075123
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研究论文 | 本研究利用超极化13C-MRI技术识别中危前列腺癌中糖酵解细胞群的出现 | 首次证明HP 13C-MRI可基于上皮和基质肿瘤区室的代谢差异对临床显著疾病进行代谢表型分析 | 研究样本局限于低/中危人群,需在更大队列中验证 | 区分临床显著前列腺癌与惰性疾病 | 人类前列腺癌组织 | 医学影像 | 前列腺癌 | 超极化13C-MRI, 免疫组织化学, 空间转录组学 | NA | 医学影像, 组织化学, 基因表达数据 | 低/中危前列腺癌患者队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
6690 | 2025-10-06 |
Salivary ZG16B expression loss follows exocrine gland dysfunction related to oral chronic graft-versus-host disease
2022-Jan-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103592
PMID:35005541
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析发现唾液蛋白ZG16B在口腔慢性移植物抗宿主病中表达降低,可能作为该疾病的生物标志物 | 首次发现ZG16B在口腔cGVHD患者唾液中表达显著降低,并通过单细胞RNA测序技术定位其在健康唾液腺中的特异性表达细胞群 | 样本量有限,需要更大规模研究验证ZG16B作为诊断标志物的可靠性 | 寻找口腔慢性移植物抗宿主病的非侵入性诊断生物标志物 | 异基因造血干细胞移植后发生口腔cGVHD的患者唾液和唾液腺组织 | 蛋白质组学 | 移植物抗宿主病 | 液相色谱-串联质谱, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 活检证实口腔GVHD患者的唾液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6691 | 2025-10-06 |
scAnnotatR: framework to accurately classify cell types in single-cell RNA-sequencing data
2022-Jan-17, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04574-5
PMID:35038984
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研究论文 | 开发了一个用于单细胞RNA测序数据细胞类型自动分类的R软件包框架 | 使用分层组织的支持向量机来区分特定细胞类型与所有其他类型,能够有效识别未知细胞类型,且能处理超过60万个细胞的大型数据集 | NA | 解决单细胞RNA测序数据分析中细胞类型自动识别的关键瓶颈问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | SVM | 基因表达数据 | 超过600,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6692 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics defines keratinocyte differentiation in avian scutate scales
2022-01-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-04082-1
PMID:34997067
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学定义了鸟类盾状鳞片中角质细胞分化的基因表达程序 | 首次在鸟类盾状鳞片中鉴定出两种不同的角质细胞分化群体,并揭示了其与人类皮肤角质细胞分化的进化保守性 | 研究仅使用1日龄雏鸡的腿部皮肤样本,样本来源和发育阶段有限 | 研究鸟类盾状鳞片中角质细胞的分化过程 | 1日龄雏鸡腿部皮肤的角质细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1日龄雏鸡腿部皮肤细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6693 | 2025-10-06 |
An immunodominant NP105-113-B*07:02 cytotoxic T cell response controls viral replication and is associated with less severe COVID-19 disease
2022-01, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-01084-z
PMID:34853448
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研究论文 | 本研究揭示了NP105-113-B*07:02特异性CD8 T细胞应答在控制SARS-CoV-2病毒复制和减轻COVID-19疾病严重程度中的关键作用 | 首次系统阐明了NP-B*07:02特异性T细胞应答与疾病严重程度的关联机制,发现其通过前体细胞扩增、高功能亲和力和抗病毒效应功能发挥作用 | 样本量相对有限(急性期n=77,恢复期n=52),且为观察性研究 | 探究NP-B*07:02特异性CD8 T细胞应答在COVID-19疾病进展中的作用机制 | SARS-CoV-2感染个体的NP-B*07:02特异性CD8 T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞测序,T细胞克隆分析,体外SARS-CoV-2感染系统 | NA | 单细胞测序数据,功能评估数据 | 急性期77例,恢复期52例 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
6694 | 2025-10-06 |
Extracellular vesicles produced by the human commensal gut bacterium Bacteroides thetaiotaomicron affect host immune pathways in a cell-type specific manner that are altered in inflammatory bowel disease
2022-01, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12189
PMID:35064769
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研究论文 | 研究人类肠道共生菌Bacteroides thetaiotaomicron产生的胞外囊泡对宿主免疫细胞的细胞类型特异性影响及其在炎症性肠病中的变化 | 首次结合单细胞RNA测序和宿主-微生物蛋白质相互作用网络,揭示细菌胞外囊泡对免疫细胞的细胞类型特异性作用机制及其在疾病状态下的变化 | 研究主要基于计算机预测和体外验证,需要进一步体内实验确认 | 阐明肠道细菌胞外囊泡与宿主免疫系统的相互作用机制 | 树突状细胞、巨噬细胞和单核细胞等免疫细胞 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 体外共培养实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6695 | 2025-10-06 |
CD161 expression and regulation defines rapidly responding effector CD4+ T cells associated with improved survival in HPV16-associated tumors
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003995
PMID:35039463
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研究论文 | 本研究探讨CD161在HPV16相关肿瘤中CD4+ T细胞上的表达调控机制及其与患者生存改善的关联 | 首次揭示CD161在肿瘤特异性CD4+ T细胞中的动态表达规律及其与TCR信号放大的功能关联,发现CD161+效应记忆T细胞与改善生存相关 | 研究主要聚焦HPV16+口咽鳞状细胞癌,结论在其他癌症类型中的普适性需进一步验证 | 阐明CD161在CD4+ T细胞中的表达调控机制及其在抗肿瘤免疫中的作用 | HPV16+口咽鳞状细胞癌患者、肿瘤浸润淋巴细胞、T细胞克隆 | 免疫学 | 口咽癌 | 单细胞转录组测序, 基因编辑, 抗体阻断实验 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | HPV16+ OPSCC患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6696 | 2025-10-06 |
Mechanistic target of rapamycin signaling in human nervous system development and disease
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.1005631
PMID:36226315
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综述 | 探讨mTOR信号通路在人类神经系统发育和疾病中的关键作用 | 整合单细胞转录组学和脑类器官技术揭示mTOR信号在人类皮层发育中的特异性作用及其与灵长类进化差异的关联 | 作为小型综述未包含原始实验数据,主要基于已有研究进行总结 | 阐明mTOR信号通路在神经系统发育和疾病机制中的功能 | 人类神经系统发育过程及相关疾病(mTORopathies) | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组学,脑类器官技术,超灵敏突变检测技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6697 | 2025-10-06 |
Comparative Single-Cell Transcriptomics Reveals Novel Genes Involved in Bivalve Embryonic Shell Formation and Questions Ontogenetic Homology of Molluscan Shell Types
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.883755
PMID:35813198
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研究论文 | 通过单细胞转录组比较分析揭示双壳类胚胎壳形成相关新基因,并对软体动物壳类型的个体发育同源性提出质疑 | 首次在双壳类中使用单细胞RNA测序分析胚胎和幼虫壳形成的遗传工具箱,发现胚胎壳和幼虫壳分泌过程中基因表达的显著差异 | 目前缺乏对胚胎壳或幼虫壳形成相关组织表达基因的详细注释 | 研究斑马纹贻贝胚胎和幼虫壳形成的遗传机制 | 斑马纹贻贝的胚胎和幼虫壳形成过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6698 | 2025-10-06 |
Long Intergenic Noncoding RNA MIAT as a Regulator of Human Th17 Cell Differentiation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.856762
PMID:35784351
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研究论文 | 本研究揭示了长链基因间非编码RNA MIAT在人类Th17细胞分化早期作为关键调节因子的作用机制 | 首次发现MIAT通过STAT3信号通路调控Th17分化关键基因表达,并可能通过改变染色质可及性发挥作用 | 研究主要关注早期分化阶段,对MIAT在其他免疫细胞类型或疾病阶段的作用尚未完全阐明 | 阐明长链非编码RNA MIAT在人类Th17细胞分化过程中的功能机制 | 人类Th17细胞及其分化过程 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序,染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据,染色质可及性数据 | 类风湿关节炎患者滑膜组织中的T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6699 | 2025-10-06 |
Next-Generation and Single-Cell Sequencing Approaches to Study Atherosclerosis and Vascular Inflammation Pathophysiology: A Systematic Review
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.849675
PMID:35419441
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系统综述 | 本综述全面评估了利用单细胞和二代测序技术研究动脉粥样硬化及血管炎症病理生理学的研究现状 | 首次系统整合单细胞测序和二代测序在动脉粥样硬化研究中的应用,提供比传统方法更高分辨率的疾病解析 | 研究间存在显著异质性,对淋巴细胞和内皮细胞等其他细胞类型关注不足 | 评估单细胞和二代测序技术在阐明动脉粥样硬化病理生理机制中的应用价值 | 动脉粥样硬化相关细胞类型(平滑肌细胞、巨噬细胞、干细胞/祖细胞等)及血管组织 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 二代测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 34项符合条件的研究(16项单细胞测序,10项二代测序,8项组合方法) | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | NA |
6700 | 2025-10-06 |
Role of synovial fibroblast subsets across synovial pathotypes in rheumatoid arthritis: a deconvolution analysis
2022-01, RMD open
IF:5.1Q1
DOI:10.1136/rmdopen-2021-001949
PMID:34987094
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据并进行反卷积分析,研究类风湿关节炎中滑膜成纤维细胞亚群在不同滑膜病理类型中的分布及其与临床特征的关系 | 首次揭示了不同滑膜病理类型与单细胞RNA测序定义的滑膜成纤维细胞亚型之间的关联 | 研究为计算机模拟分析,需要进一步实验验证 | 评估滑膜成纤维细胞亚群对滑膜病理类型和临床特征的贡献 | 87名未接受治疗的早期关节炎患者的滑膜组织 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 反卷积分析 | Seurat, Harmony, Liger, MuSiC | 基因表达数据 | 87名早期关节炎患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |