单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 6681 - 6700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6681 | 2024-11-02 |
A tumorigenicity evaluation platform for cell therapies based on brain organoids
2024-Oct-29, Translational neurodegeneration
IF:10.8Q1
DOI:10.1186/s40035-024-00446-5
PMID:39472972
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于脑类器官的细胞治疗致瘤性评估平台 | 提出了使用脑类器官和胶质母细胞瘤样类器官模型来评估细胞治疗产品的致瘤性风险，相较于传统动物模型具有更高的检测敏感性 | NA | 评估脑类器官在细胞治疗致瘤性评估中的应用潜力 | 人多能干细胞（hPSCs）和从中衍生的中脑多巴胺（mDA）细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自人胚胎干细胞的中脑多巴胺细胞、hPSCs、混合细胞以及未成熟的中脑多巴胺细胞，并将其注射到脑类器官和NOD SCID小鼠中进行评估 |
| 6682 | 2024-11-02 |
Human Anti-Glycan Reactivity is Driven by the Selection of B cells Utilizing Private Antibody Gene Rearrangements that are Affinity Maturated in Germinal Centers
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.15.618486
PMID:39464096
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研究论文 | 研究分析了人类抗糖抗体的B细胞受体库，揭示了抗糖反应的驱动机制 | 首次结合BCR受体克隆与表达以及单细胞转录组学分析，探讨了抗N-乙酰-D-氨基葡萄糖(GlcNAc)抗体的B细胞库及其免疫进化 | NA | 探讨人类抗糖抗体反应的驱动机制及其在早期儿童时期的亲和力成熟过程 | 抗N-乙酰-D-氨基葡萄糖(GlcNAc)抗体的B细胞库 | 免疫学 | NA | BCR受体克隆与表达、单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 人类队列中的B细胞 |
| 6683 | 2024-11-02 |
Characterization of Cancer Stem Cells in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma by Single-cell RNA Sequencing
2024-Oct-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae056
PMID:39107908
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，全面表征喉鳞状细胞癌中的癌症干细胞 | 首次在单细胞水平上全面表征喉鳞状细胞癌中的癌症干细胞特性 | 研究样本仅限于三名患者，可能影响结果的普适性 | 识别喉鳞状细胞癌中的癌症干细胞及其分子机制 | 喉鳞状细胞癌中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三名喉鳞状细胞癌患者的匹配原发肿瘤组织、癌旁组织和局部淋巴结 |
| 6684 | 2024-11-02 |
ADAMTS7 Promotes Smooth Muscle Foam Cell Expansion in Atherosclerosis
2024-Oct-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582156
PMID:38463994
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研究论文 | 研究探讨了ADAMTS7在动脉粥样硬化中促进平滑肌泡沫细胞扩张的机制 | 首次揭示了ADAMTS7在平滑肌细胞和内皮细胞中表达，并通过增加PU.1和CD36表达促进氧化低密度脂蛋白摄取，从而促进泡沫细胞形成和动脉粥样硬化 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨ADAMTS7在动脉粥样硬化中的细胞特异性机制 | ADAMTS7在平滑肌细胞和内皮细胞中的表达及其对动脉粥样硬化的影响 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 6685 | 2024-11-02 |
Unraveling the role of low-density lipoprotein-related genes in lung adenocarcinoma: Insights into tumor microenvironment and clinical prognosis
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24230
PMID:38488684
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研究论文 | 研究探讨了低密度脂蛋白相关基因在肺腺癌中的作用及其对肿瘤微环境和临床预后的影响 | 首次系统地研究了低密度脂蛋白相关基因在肺腺癌中的作用，并开发了一种新的低密度脂蛋白相关签名用于预后评估 | 研究主要基于单细胞转录组数据，可能无法全面反映所有相关基因的表达情况 | 揭示低密度脂蛋白相关基因在肺腺癌中的功能及其对肿瘤微环境和临床预后的影响 | 低密度脂蛋白相关基因在肺腺癌中的表达模式及其与肿瘤微环境和临床预后的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
| 6686 | 2024-11-02 |
Six1 Regulates Mouse Incisor Development by Promoting Dlx1/2/5 Expression
2024-Sep, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241256286
PMID:39101661
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研究论文 | 研究探讨了Six1在调控小鼠下门齿发育中的关键作用及其分子机制 | 首次揭示了Six1通过促进Dlx1/2/5表达在牙胚发育中的重要作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证 | 阐明Six1在牙胚发育中的调控作用及其分子机制 | 小鼠下门齿发育过程中的牙胚细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠牙胚发育不同阶段的样本 |
| 6687 | 2024-11-02 |
APOE ε4-associated downregulation of the IL-7/IL-7R pathway in effector memory T cells: Implications for Alzheimer's disease
2024-Sep, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14173
PMID:39129310
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研究论文 | 研究探讨了APOE ε4等位基因对IL-7/IL-7R通路的影响及其在阿尔茨海默病中的作用 | 揭示了APOE ε4等位基因下调IL-7/IL-7R通路在调节神经炎症和海马萎缩中的作用 | NA | 探讨APOE ε4等位基因对IL-7/IL-7R通路的影响及其在阿尔茨海默病中的作用 | APOE ε4携带者和非携带者的外周血单核细胞 | NA | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | NA | RNA | 54名晚期阿尔茨海默病患者（包括28名APOE ε4携带者和26名非携带者） |
| 6688 | 2024-11-02 |
Autophagy Regulates Age-Related Jawbone Loss via LepR+ Stromal Cells
2024-Sep, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241264810
PMID:39185629
|
研究论文 | 研究探讨了自噬在年龄相关性下颌骨丢失中的作用，特别是通过LepR+基质细胞 | 首次揭示了自噬在年龄相关性下颌骨丢失中的关键作用，并提出了通过激活自噬来缓解下颌骨丢失的新方法 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步在人类中验证 | 研究自噬在下颌骨老化和骨量减少中的作用 | 下颌骨及其衍生的基质细胞（JBSCs） | NA | NA | RNA测序、单细胞转录组学 | NA | RNA序列数据 | 包括老年人和老年小鼠的下颌骨样本，以及LepR-Cre/JBSCs |
| 6689 | 2024-11-02 |
Monocyte Single-Cell Multimodal Profiling in Cardiovascular Disease Risk States
2024-Aug-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324457
PMID:39105287
|
研究论文 | 本文通过单细胞多模态分析研究了心血管疾病风险状态下单核细胞的转录组和表型特征 | 本文首次使用CITE-seq和单细胞RNA测序技术，全面描述了单核细胞的转录组和表型景观，并发现了多种功能不同的亚群 | 本文主要集中在单核细胞的研究，未涉及其他免疫细胞类型 | 研究心血管疾病风险因素对单核细胞亚群的影响 | 单核细胞及其在心血管疾病中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | CITE-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 表型数据 | 437,126个单核细胞样本 |
| 6690 | 2024-11-02 |
Remodeling of anti-tumor immunity with antibodies targeting a p53 mutant
2024-06-18, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01566-1
PMID:38886748
|
研究论文 | 开发针对p53突变体的单克隆抗体，并通过脂质纳米颗粒递送，以重塑抗肿瘤免疫反应 | 首次开发出针对p53热点突变E285K的单克隆抗体，并通过脂质纳米颗粒递送，显示出强大的抗肿瘤效果 | 研究主要集中在体外和体内实验，尚未进行临床试验 | 探索针对p53突变体的精准治疗策略 | p53突变体及其在肿瘤中的作用 | 癌症研究 | 癌症 | 单细胞测序（scRNA-seq） | 单克隆抗体（mAbs） | 蛋白质 | NA |
| 6691 | 2024-11-02 |
Identification of restrictive molecules involved in oncolytic virotherapy using genome-wide CRISPR screening
2024-05-23, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01554-5
PMID:38783389
|
研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR筛选技术，识别出限制溶瘤病毒疗法效果的分子，并研究了其在胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌中的应用 | 本文创新性地通过CRISPR筛选技术识别出PARP1作为HSV-1复制的限制因子，并展示了PARP抑制剂与免疫检查点抑制剂联合使用在溶瘤病毒疗法中的协同作用 | NA | 克服溶瘤病毒疗法的固有限制，为三阴性乳腺癌、胶质母细胞瘤和其他恶性肿瘤的临床治疗提供有价值的见解 | 溶瘤病毒疗法在胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌中的应用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | CRISPR筛选 | NA | RNA | 涉及胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌的模型 |
| 6692 | 2024-11-02 |
GRouNdGAN: GRN-guided simulation of single-cell RNA-seq data using causal generative adversarial networks
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48516-6
PMID:38744843
|
研究论文 | 介绍了一种基于基因调控网络（GRN）引导的参考型因果隐式生成模型GRouNdGAN，用于模拟单细胞RNA-seq数据、体内扰动实验和基准测试GRN推断方法 | 通过在其架构中施加用户定义的GRN，GRouNdGAN模拟稳态和瞬态单细胞数据集，其中基因在其调控转录因子（TF）的控制下因果表达 | NA | 开发一种新的生成模型，用于模拟单细胞RNA-seq数据和基准测试基因调控网络推断方法 | 单细胞RNA-seq数据、基因调控网络推断方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 生成对抗网络（GAN） | 基因表达数据 | 六个实验参考数据集 |
| 6693 | 2024-11-02 |
Quantifying 3'UTR length from scRNA-seq data reveals changes independent of gene expression
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48254-9
PMID:38744866
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研究论文 | 本文开发了一种名为scUTRquant的计算流程，用于从单细胞RNA测序数据中快速、准确地同时量化基因和3'UTR异构体的表达 | 首次提出了从单细胞RNA测序数据中量化3'UTR长度的方法，并发现3'UTR长度的变化与基因表达变化广泛且协调，但影响不同的基因 | NA | 研究3'UTR长度在不同细胞类型中的变化及其对基因调控的影响 | 人类和小鼠的200多种初级细胞类型 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 474种细胞类型和2134种扰动 |
| 6694 | 2024-11-02 |
Deciphering Endothelial and Mesenchymal Organ Specification in Vascularized Lung and Intestinal Organoids
2024-Feb-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.06.577460
PMID:38370768
|
研究论文 | 研究构建了包含肺或肠上皮、器官型间质和血管的人多能干细胞衍生的类器官系统，以研究血管、间质和上皮在器官发生中的协同发育 | 通过精确的BMP调控实现中胚层和内胚层的共分化，生成多谱系类器官和肠道管模式；单细胞RNA测序揭示了内皮和间质的器官特异性，并发现了驱动肺和肠内皮特化的关键配体 | NA | 研究血管、间质和上皮在器官发生中的协同发育及其在器官特化中的作用 | 人多能干细胞衍生的肺和肠类器官系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 6695 | 2024-11-02 |
Regulation of lymphoid-myeloid lineage bias through regnase-1/3-mediated control of Nfkbiz
2024-01-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023020903
PMID:37922454
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研究论文 | 研究揭示了regnase-1和regnase-3通过调控Nfkbiz mRNA的降解，影响造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的淋巴-髓系分化倾向 | 首次阐明了regnase-1和regnase-3在HSPCs中通过调控Nfkbiz mRNA的降解，决定淋巴系命运并限制髓系分化的机制 | NA | 探讨造血干细胞和祖细胞（HSPCs）中淋巴-髓系分化倾向的调控机制 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序 | NA | RNA | NA |
| 6696 | 2024-10-26 |
IDEIS: a tool to identify PTPRC/CD45 isoforms from single-cell transcriptomic data
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1446931
PMID:39445006
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为IDEIS的工具，用于从单细胞转录组数据中识别PTPRC/CD45的异构体 | IDEIS软件能够直接从单细胞转录组数据中量化CD45异构体，无需生成额外的DNA测序文库 | NA | 开发一种工具，用于从单细胞转录组数据中准确识别和量化CD45异构体 | PTPRC/CD45基因的异构体及其在免疫细胞亚群中的表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 使用10× Genomics 5'测序技术生成的数据集 |
| 6697 | 2024-11-02 |
Identifying HIF1A and HGF as two hub genes in aortic dissection and function analysis by integrating RNA sequencing and single-cell RNA sequencing data
2024, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2024.1475991
PMID:39479394
|
研究论文 | 通过整合RNA测序和单细胞RNA测序数据，筛选出主动脉夹层的关键基因HIF1A和HGF，并分析其功能 | 首次整合RNA测序和单细胞RNA测序数据，筛选出主动脉夹层的关键基因HIF1A和HGF，并分析其在单细胞水平的功能 | 研究仅基于公共数据集，未进行体内实验验证 | 探索主动脉夹层的调控机制，为诊断和治疗提供参考 | 主动脉夹层的关键基因及其功能 | 基因表达 | 心血管疾病 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四个AD相关数据集，包括GSE153434、GSE98770、GSE52093和GSE213740 |
| 6698 | 2024-11-02 |
Arid3c identifies an uncharacterized subpopulation of V2 interneurons during embryonic spinal cord development
2024, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2024.1466056
PMID:39479525
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研究论文 | 研究旨在通过比较胚胎脊髓V2中间神经元与其他细胞的转录组，识别新的标记基因以描述V2中间神经元群体的多样性 | 发现了Arid3c基因，识别出一个未被描述的V2中间神经元亚群，该亚群与V2c中间神经元部分重叠，并具有Onecut因子和Sox2的表达特征 | 研究未完全解析导致这种神经元多样化的机制 | 识别新的标记基因以进一步描述脊髓V2中间神经元群体的多样性 | 胚胎脊髓V2中间神经元及其亚群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 胚胎脊髓V2中间神经元及其他细胞 |
| 6699 | 2024-11-02 |
IL-21-producing effector Tfh cells promote B cell alloimmunity in lymph nodes and kidney allografts
2023-Oct-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169793
PMID:37870962
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研究论文 | 研究IL-21产生效应Tfh细胞在同种异体肾移植中的作用及其对B细胞克隆动力学的影响 | 首次揭示了IL-21产生效应Tfh细胞在同种异体肾移植中的具体亚群、起源和功能 | 研究基于小鼠模型，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨IL-21产生效应Tfh细胞在同种异体肾移植中的作用 | IL-21产生效应Tfh细胞及其在肾移植排斥中的功能 | 免疫学 | 肾移植 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 6700 | 2024-11-02 |
Epigenetic Mechanisms of Brain Sexual Differentiation
2022-11-01, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a039099
PMID:35817509
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review | 本文讨论了围产期雌二醇信号如何组织啮齿动物大脑中的细胞和分子性别差异 | 本文介绍了最近发现的由雌激素受体α（ERα）激活的基因调控程序，展示了真正的表观遗传机制 | NA | 探讨早期激素信号对大脑的持久影响及其机制 | 啮齿动物大脑中的性别差异 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达 | NA |