单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 6681 - 6700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6681 | 2024-10-29 |
Comprehensive integration of single-cell RNA and transcriptome RNA sequencing to establish a pyroptosis-related signature for improving prognostic prediction of gastric cancer
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.02.002
PMID:38404710
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和转录组RNA测序数据，建立了一个与细胞焦亡相关的特征，以提高胃癌患者的预后预测 | 首次整合单细胞RNA测序和转录组RNA测序数据，建立了一个与细胞焦亡相关的特征，用于预测胃癌患者的生存时间和治疗反应 | 需要进一步验证该特征在不同人群和不同治疗方案中的适用性 | 探索细胞焦亡相关基因作为胃癌患者的预后生物标志物和治疗指标的价值 | 胃癌患者的细胞焦亡相关基因表达和分布 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO分析 | RNA | GSE183904数据集和TCGA数据库中的胃癌转录组数据 |
| 6682 | 2024-10-29 |
Bulk and single-cell RNA-seq analyses reveal canonical RNA editing associated with microglia homeostasis and its role in sepsis-associated encephalopathy
2024-Nov-12, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 研究分析了大量和小鼠脑组织及小胶质细胞样本的单细胞RNA测序数据，探讨了与小胶质细胞稳态相关的经典RNA编辑及其在脓毒症相关脑病中的作用 | 首次揭示了小胶质细胞稳态与RNA编辑在脓毒症相关脑病中的关系，并提供了新的见解 | 研究主要基于小鼠模型，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨小胶质细胞稳态与RNA编辑在脓毒症相关脑病中的关系 | 小鼠脑组织及小胶质细胞样本 | 数字病理学 | 脓毒症相关脑病 | RNA测序 | NA | RNA | 107个脑组织和小胶质细胞样本 |
| 6683 | 2024-10-29 |
Neuron-glia crosstalk and inflammatory mediators in migraine pathophysiology
2024-Nov-12, Neuroscience
IF:2.9Q2
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综述 | 本文综述了偏头痛病理生理学中神经炎症机制的细胞和分子层面 | 介绍了PBR28-靶向成像和单细胞测序等新技术在理解偏头痛神经炎症机制中的应用 | NA | 探讨偏头痛的神经炎症机制及其在个性化治疗中的应用 | 偏头痛的神经炎症机制，包括细胞和分子层面的研究 | NA | 偏头痛 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 6684 | 2024-10-29 |
Blocking the HIF-1α/glycolysis axis inhibits allergic airway inflammation by reducing ILC2 metabolism and function
2024-Oct-27, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16361
PMID:39462230
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研究论文 | 研究HIF-1α/糖酵解轴在ILC2介导的过敏性气道炎症中的作用 | 首次揭示了HIF-1α/糖酵解轴在ILC2介导的过敏性气道炎症中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人体中验证 | 探讨HIF-1α/糖酵解轴在ILC2介导的过敏性气道炎症中的作用 | 小鼠和人类的ILC2细胞 | NA | 哮喘 | 糖酵解抑制剂和HIF-1α抑制剂 | NA | 转录组数据、代谢数据和染色质免疫沉淀分析 | 小鼠和人类样本 |
| 6685 | 2024-10-29 |
Integrative analysis of bulk and single-cell transcriptomic data reveals novel insights into lipid metabolism and prognostic factors in hepatocellular carcinoma
2024-Oct-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01487-y
PMID:39453509
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研究论文 | 本研究整合了大量和单细胞转录组数据，揭示了肝细胞癌中脂质代谢相关基因的状态及其作为预后因子的潜力 | 首次整合大量和单细胞转录组数据，识别出与脂质代谢相关的基因，并开发了机器学习模型用于预测肝细胞癌的预后 | 研究依赖于公共数据库中的数据，可能存在数据质量和代表性的限制 | 探讨肝细胞癌中脂质代谢相关基因的状态及其作为预后因子的潜力 | 肝细胞癌患者的脂质代谢相关基因及预后因子 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 大量和单细胞转录组数据来自公共数据库 |
| 6686 | 2024-10-29 |
Microglia regulate GABAergic neurogenesis in prenatal human brain through IGF1
2024-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.19.619180
PMID:39464051
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研究论文 | 研究揭示了微胶质细胞通过IGF1调节人类胎儿大脑中GABA能神经元的生成 | 首次揭示了微胶质细胞通过IGF1促进神经前体细胞增殖和GABA能神经元发育的新机制 | NA | 探讨人类胎儿大脑中GABA能神经元生成的发育机制 | 人类胎儿大脑中的GABA能神经元和微胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、生物信息学和组织学分析 | NA | 转录组数据 | 使用新开发的神经免疫hMGE类器官模型进行实验 |
| 6687 | 2024-10-29 |
The First Comprehensive Description of the Platelet Single Cell Transcriptome
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.15.618506
PMID:39464035
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研究论文 | 首次全面描述了血小板单细胞转录组 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析血小板转录组，揭示了血小板基因表达的异质性 | 现有的细胞识别算法可能导致血小板被错误分类为其他血细胞类型 | 扩展对血小板功能的理解，超越其在凝血中的传统角色 | 血小板单细胞转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7名健康供体的血小板样本 |
| 6688 | 2024-10-29 |
In vivo CRISPRi screen identified lncRNA portfolio crucial for cutaneous squamous cell carcinoma tumor growth
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.16.618774
PMID:39464078
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研究论文 | 通过体内CRISPRi筛选，识别出对皮肤鳞状细胞癌肿瘤生长至关重要的lncRNA组合 | 首次通过单细胞测序数据和CRISPR干扰筛选，识别出在皮肤鳞状细胞癌中起关键作用的lncRNA组合 | 研究主要集中在体外和异种移植模型中，未来需要进一步验证这些lncRNA在人体内的作用 | 揭示皮肤鳞状细胞癌发展中的非编码RNA的作用 | 皮肤鳞状细胞癌中的lncRNA | 数字病理学 | 皮肤癌 | CRISPR干扰筛选 | NA | 单细胞测序数据 | 来自正常和皮肤鳞状细胞癌的人类皮肤组织样本 |
| 6689 | 2024-10-29 |
The mTOR Pathway: A Common Link Between Alzheimer's Disease and Down Syndrome
2024-Oct-17, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13206183
PMID:39458132
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研究论文 | 本文探讨了mTOR通路在阿尔茨海默病和唐氏综合症之间的共同联系 | 本文首次利用基因组学、空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学等新技术，分析mTOR通路与唐氏综合症相关阿尔茨海默病的关系 | 本文尚未完全揭示唐氏综合症相关阿尔茨海默病病理进展的机制 | 研究mTOR通路在阿尔茨海默病和唐氏综合症中的作用 | mTOR通路及其上游调控因子在唐氏综合症相关阿尔茨海默病中的作用 | NA | 阿尔茨海默病 | 基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | NA | NA |
| 6690 | 2024-10-29 |
Single-Cell Antigen Receptor Sequencing in Pigs with Influenza
2024-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.13.617920
PMID:39464079
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研究论文 | 本文开发了适用于猪的单细胞抗原受体测序方法，结合scRNAseq和TCR/BCR序列分析，研究了猪在流感感染后的肺部免疫反应 | 首次在猪中结合scRNAseq和TCR/BCR序列分析，研究了流感感染后的肺部免疫反应 | 仅限于猪模型，未在其他物种中验证 | 研究猪在流感感染后的肺部适应性免疫系统 | 猪的肺部T细胞和B细胞受体 | 数字病理学 | 流感 | 单细胞RNA测序（scRNAseq），10x Genomics VDJ测序 | NA | RNA | 来自表达和缺乏特定基因的猪的冷冻肺细胞，以及FACS分选的T细胞 |
| 6691 | 2024-10-29 |
Single-cell and spatial detection of senescent cells using DeepScence
2024-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568150
PMID:38045252
|
研究论文 | 本文开发了一种基于深度神经网络的方法DeepScence，用于在单细胞和空间转录组数据中识别衰老细胞 | DeepScence基于我们精心挑选的衰老相关基因集CoreScence，能够准确识别单细胞和空间转录组数据中的衰老细胞，显著优于现有方法 | NA | 开发一种能够准确识别衰老细胞的方法，以研究其空间和分子特征 | 衰老细胞 | 机器学习 | NA | 深度神经网络 | 深度神经网络 | 单细胞和空间转录组数据 | NA |
| 6692 | 2024-10-29 |
Obesity-Associated Changes in Immune Cell Dynamics During Alphavirus Infection Revealed by Single Cell Transcriptomic Analysis
2024-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.10.617696
PMID:39416014
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了肥胖与阿尔法病毒感染期间免疫细胞动态变化的关系 | 首次探讨了肥胖对阿尔法病毒感染期间免疫细胞功能的影响，并发现了肥胖小鼠中缺失的一种独特巨噬细胞亚群 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨肥胖对阿尔法病毒感染期间免疫细胞功能的影响 | 肥胖和正常体重小鼠在阿尔法病毒感染期间的免疫细胞动态变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 肥胖和正常体重小鼠样本 |
| 6693 | 2024-10-29 |
Integrative Omics Strategies for Understanding and Combating Brown Planthopper Virulence in Rice Production: A Review
2024-Oct-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252010981
PMID:39456764
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综述 | 本文综述了利用整合组学策略理解并对抗褐飞虱对水稻生产的危害 | 整合基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据，深入理解褐飞虱的生物学特性，并探讨了通过操纵宿主-微生物相互作用来增强植物保护的新机会 | 尚未全面开展利用下一代组学技术对褐飞虱的遗传相互作用和种群动态进行全面研究 | 总结近期利用组学数据对抗褐飞虱的进展和新视角，以开发更可持续的害虫管理策略 | 褐飞虱及其与水稻的相互作用 | NA | NA | 基因组测序、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞RNA测序、元基因组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | NA |
| 6694 | 2024-10-29 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Cellular Heterogeneity and Drivers in Serrated Pathway-Driven Colorectal Cancer Progression
2024-Oct-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252010944
PMID:39456726
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了锯齿状病变在结直肠癌进展中的细胞异质性和驱动因素 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了锯齿状病变在结直肠癌进展中的细胞异质性和驱动因素 | 研究样本量有限，可能影响结果的普适性 | 阐明锯齿状病变在结直肠癌进展中的机制 | 正常结肠组织和锯齿状病变组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三份正常结肠组织和十五份锯齿状病变组织 |
| 6695 | 2024-10-29 |
Statistical batch-aware embedded integration, dimension reduction, and alignment for spatial transcriptomics
2024-Oct-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae611
PMID:39400541
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研究论文 | 本文提出了一种分层隐马尔可夫随机场模型STADIA，用于空间转录组学数据的批次效应校正、维度降低和空间域识别 | STADIA模型通过联合建模多个步骤，增强了技术伪影和生物信号之间复杂相互作用的理解，从而提高了结果的准确性和洞察力 | NA | 解决空间转录组学数据中批次效应和空间域识别的问题 | 空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 隐马尔可夫随机场模型 | 基因表达数据 | 五个来自不同物种（人类和老鼠）、不同器官（大脑、皮肤和肝脏）以及不同平台（10x Visium、ST和Slice-seqV2）的数据集 |
| 6696 | 2024-10-29 |
Utilization of Microfluidic Droplet-Based Methods in Diagnosis and Treatment Methods of Hepatocellular Carcinoma: A Review
2024-Sep-25, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15101242
PMID:39457366
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综述 | 本文综述了微流控液滴技术在肝细胞癌诊断和治疗中的应用 | 介绍了微流控液滴技术在肝细胞癌研究中的新应用，如单细胞RNA测序和其他单细胞分析方法 | 微流控技术的应用仍有限，尤其是在肝细胞癌的分子机制研究中 | 探讨微流控液滴技术在肝细胞癌研究中的优势和局限性 | 肝细胞癌的诊断和治疗 | 数字病理学 | 肝癌 | 微流控液滴技术 | NA | 基因组和转录组数据 | 单细胞 |
| 6697 | 2024-10-29 |
An integrated approach identifies the molecular underpinnings of murine anterior visceral endoderm migration
2024-Sep-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.05.014
PMID:38843837
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研究论文 | 本文通过综合单细胞RNA测序、磷酸蛋白质组学、高分辨率活体成像和短期谱系标记与干预，研究了小鼠前脏内胚层迁移的分子基础 | 本文首次揭示了前脏内胚层迁移过程中基因表达的短暂性及其与细胞位置的紧密耦合，并识别了调控前脏内胚层迁移的分子控制器 | NA | 研究小鼠前脏内胚层迁移的分子基础 | 小鼠前脏内胚层及其迁移行为 | NA | NA | 单细胞RNA测序、磷酸蛋白质组学、高分辨率活体成像、短期谱系标记与干预 | NA | RNA序列、磷酸蛋白质数据、活体成像数据 | 小鼠胚胎中的前脏内胚层细胞 |
| 6698 | 2024-10-29 |
CONSORT article: Single-cell sequencing analysis revealed CMKLR1+ macrophage as a subpopulation of macrophage with tumor-suppressive characteristics in oral squamous cell carcinoma
2024-Aug-23, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039399
PMID:39183397
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研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示了CMKLR1+巨噬细胞作为口腔鳞状细胞癌中具有肿瘤抑制特性的巨噬细胞亚群 | 首次发现CMKLR1+巨噬细胞在口腔鳞状细胞癌中具有抑制肿瘤进展的特性 | 研究基于公共数据库的数据，缺乏临床样本的验证 | 探索口腔鳞状细胞癌中免疫细胞的组成及其在肿瘤抑制中的作用 | 口腔鳞状细胞癌患者的肿瘤组织中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 基于Gene Expression Omnibus数据库的肿瘤组织样本 |
| 6699 | 2024-10-29 |
Targeting CEBPA to restore cellular identity and tissue homeostasis in pulmonary fibrosis
2024-Jul-16, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.175290
PMID:39012710
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研究论文 | 研究通过RNA-Seq数据挖掘和多种实验方法，探讨CEBPA在肺纤维化中的作用及其恢复细胞身份和组织稳态的机制 | 首次揭示CEBPA抑制与AT2细胞身份受损、组织稳态破坏和肺纤维化之间的直接机制联系 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人体中验证 | 阐明CEBPA在肺纤维化中的作用及其恢复细胞身份和组织稳态的机制 | CEBPA在肺纤维化中的作用及其对AT2细胞和组织稳态的影响 | NA | 肺纤维化 | RNA-Seq、scRNA-Seq、肺类器官、小分子抑制剂、基因操作 | NA | RNA | 条件性KO小鼠、肺类器官 |
| 6700 | 2024-10-29 |
Single-cell transcriptomics reveal the remodeling landscape of bladder in patients with obstruction-induced detrusor underactivity
2024-Mar, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.490
PMID:38414668
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组测序揭示了膀胱在阻塞性逼尿肌活动低下患者中的重塑景观 | 首次构建了阻塞性逼尿肌活动低下的单细胞图谱，揭示了细胞异质性和功能变化 | 样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 揭示逼尿肌活动低下的潜在病理生理机制 | 膀胱功能障碍患者的膀胱细胞 | 数字病理学 | 泌尿系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 69,973个细胞，包括5个对照组和9个患者组 |