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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6661 | 2025-11-23 |
Cellf-deception: human microglia clone 3 (HMC3) cells exhibit more astrocyte-like than microglia-like gene expression
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1681811
PMID:41262332
|
研究论文 | 本研究通过基因表达分析发现HMC3细胞系更类似星形胶质细胞而非小胶质细胞 | 首次使用基因对比例方法揭示HMC3细胞系的真实细胞类型特征 | 研究基于基因表达数据,未进行功能验证实验 | 评估HMC3细胞系作为人类小胶质细胞模型的可靠性 | 人类小胶质细胞克隆3(HMC3)细胞系 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | 预测模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6662 | 2025-11-23 |
Neutrophil-Fibroblast Crosstalk Drives Immunofibrosis in Sequelae of Pelvic Inflammatory Disease Through Neutrophil Extracellular Traps
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/3113542
PMID:41262541
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研究论文 | 本研究探讨中性粒细胞与子宫成纤维细胞通过中性粒细胞胞外诱捕网在盆腔炎性疾病后遗症免疫纤维化中的相互作用机制 | 首次揭示自噬促进NETs生成并通过NETs-成纤维细胞相互作用驱动盆腔组织纤维化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,临床样本验证不足 | 阐明盆腔炎性疾病后遗症组织纤维化的发病机制 | SPID大鼠模型、HL-60来源的中性粒细胞样细胞、子宫成纤维细胞 | 单细胞测序 | 盆腔炎性疾病 | 单细胞RNA测序、细胞共培养、动物模型构建 | 大鼠疾病模型、dHL-60细胞模型 | 单细胞测序数据、体外实验数据 | 公共数据库GSE223639单细胞数据、实验动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6663 | 2025-11-23 |
Single-Cell Transcriptomics Uncover EEF1A1-Driven Ubiquitination Dysregulation in T Cell Exhaustion and SLE Pathogenesis via STAT1-Mediated Th1/Th2 Imbalance
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/3708640
PMID:41262540
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了EEF1A1通过STAT1介导的Th1/Th2失衡在T细胞耗竭和系统性红斑狼疮发病机制中的作用 | 首次发现EEF1A1作为泛素化相关枢纽基因通过STAT1磷酸化调控T细胞功能失调和Th1/Th2失衡 | 研究主要基于GSE135779数据集和MRL/lpr小鼠模型,需要更多临床样本验证 | 探究EEF1A1在系统性红斑狼疮发病机制中的作用机制 | 系统性红斑狼疮患者T细胞和MRL/lpr小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, hdWGCNA, LASSO回归, 功能验证实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | GSE135779数据集中的SLE样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6664 | 2025-11-23 |
BCL6, DUSP3, and IL6R Are Identified as Shared Druggable Immune-Regulatory Axis in Atrial Fibrillation and Atherosclerosis Through Integrative In Silico and In Vitro Analysis
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/7388320
PMID:41262879
|
研究论文 | 通过整合计算分析和体外实验鉴定BCL6、DUSP3和IL6R作为心房颤动和动脉粥样硬化共有的免疫调节枢纽基因 | 首次通过多平台转录组学分析识别出AF和ATH共有的免疫调节枢纽基因,并通过体外实验验证其致病机制 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞模型,缺乏体内实验验证 | 探索心房颤动和动脉粥样硬化的共同免疫炎症分子机制 | 心房颤动和动脉粥样硬化患者转录组数据、小鼠心脏成纤维细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 微阵列转录组分析、单细胞RNA测序、siRNA基因敲降、RT-qPCR、蛋白质印迹 | LASSO回归、转录调控网络建模、细胞通讯分析 | 转录组数据、基因表达数据 | 来自公共数据库的多个微阵列数据集 | Thermo Fisher | 单细胞RNA-seq | NA | Thermo Fisher验证的试剂盒和试剂 |
| 6665 | 2025-11-22 |
Epigenomics-guided precision oncology: Chromatin variants in prostate tumor evolution
2026-Jan-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.35327
PMID:39853587
|
综述 | 探讨表观基因组异质性在前列腺癌中的作用,重点关注染色质变异如何促进肿瘤进化和治疗耐药性 | 提出染色质变异作为表观基因组异质性的基本单位,强调其在细胞可塑性和治疗耐药性中的关键作用 | NA | 支持精准肿瘤学新时代,利用表观基因组学见解改善前列腺癌患者预后 | 前列腺癌及其染色质变异 | 表观基因组学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、液体活检表观基因组分析 | NA | 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6666 | 2025-11-22 |
Mechanisms underlying the therapeutic effects of Amygdalin in treating Cervical Cancer based on multi-omics analysis
2026-Jan-15, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jpba.2025.117232
PMID:41202397
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析系统验证了苦杏仁苷通过靶向CA9和HK2调控多通路发挥抗宫颈癌作用的机制 | 首次结合WGCNA、PPI网络、单细胞RNA测序、分子对接和分子动力学模拟等多种方法系统揭示苦杏仁苷抗宫颈癌的分子机制 | 研究主要基于细胞实验和计算分析,缺乏动物模型验证 | 探究苦杏仁苷治疗宫颈癌的作用机制 | 宫颈癌HeLa和SiHa细胞系 | 多组学分析 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,RNA-seq转录组学,分子对接,分子动力学模拟,酶活性检测 | WGCNA,PPI网络,MCODE算法 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,转录组数据 | 宫颈癌组织样本和HeLa、SiHa细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,RNA-seq | NA | NA |
| 6667 | 2025-11-22 |
A 30-gene classifier distinguishes low-risk MDS HSPCs from healthy HSPCs
2025-Dec, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.105252
PMID:40972808
|
研究论文 | 本研究开发了一个30基因分类器,用于区分低风险骨髓增生异常综合征的造血干细胞与健康造血干细胞 | 利用单细胞转录组学首次在低风险MDS的HSPC-髓系分化谱系中开发了30基因评分系统,并揭示了囊泡运输通路的功能障碍 | 研究主要关注低风险MDS,结果可能不适用于高风险MDS患者 | 阐明低风险骨髓增生异常综合征的病理生理学机制并发现潜在治疗靶点 | 低风险骨髓增生异常综合征患者的造血干细胞和祖细胞 | 单细胞转录组学 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞转录组测序 | 基因分类器 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6668 | 2025-11-22 |
Unveiling macrophage-fibroblast-driven inflammatory networks mediated pan-cancer immune features by integrated single-cell and bulk RNA sequencing
2025-Nov-20, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004102
PMID:41263399
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,揭示了巨噬细胞-成纤维细胞驱动的炎症网络在泛癌免疫特征中的作用,并开发了用于预测免疫检查点抑制剂反应和生存预后的基因标记 | 首次在单细胞分辨率下识别巨噬细胞和成纤维细胞亚型中的炎症相关基因特征,构建了少于10个基因的预测模型,并在体内模型中验证了靶向这些特征可增强PD-1抑制剂疗效 | 研究主要基于回顾性数据分析,体内验证仅针对卵巢癌这一种冷肿瘤类型 | 构建能够预测泛癌生存和免疫检查点抑制剂反应的基因标记模型 | 17种癌症类型的单细胞和bulk RNA测序数据,卵巢癌体内模型 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,机器学习,多重免疫组织化学,体内模型 | 机器学习模型 | RNA测序数据,图像数据 | 17种癌症类型,34个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6669 | 2025-11-22 |
Denoising single-cell RNA-seq data with a deep learning-embedded statistical framework
2025-Nov-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06296-w
PMID:41257571
|
研究论文 | 提出一种结合深度学习和统计框架的ZILLNB方法,用于单细胞RNA测序数据的去噪和插补 | 将零膨胀负二项回归与深度生成模型集成,通过变分自编码器和生成对抗网络学习细胞和基因层面的潜在表示 | 在样本量有限的情况下可能存在过拟合风险,方法缺乏机制可解释性 | 解决单细胞RNA测序数据中的技术噪声和零计数问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | InfoVAE, GAN, ZINB回归 | 基因表达数据 | 多个数据集(小鼠皮层、人类PBMC、IPF数据集) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6670 | 2025-11-22 |
Nitidine chloride inhibits colorectal cancer by targeting BUB1: mechanistic insights from molecular dynamics simulation, spatial transcriptomics, and single-cell RNA sequencing
2025-Nov-19, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-025-04423-8
PMID:41257608
|
研究论文 | 研究白屈菜红碱通过靶向BUB1抑制结直肠癌的作用机制 | 结合分子动力学模拟、空间转录组学和单细胞RNA测序多组学技术揭示NC-BUB1-RAD21轴在结直肠癌中的调控机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证有限 | 探究白屈菜红碱在结直肠癌中的抗肿瘤作用机制 | 结直肠癌细胞系HCT116和异种移植小鼠模型 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子动力学模拟,RNA测序 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,单细胞测序数据 | 1293个结直肠癌样本与2299个对照样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 6671 | 2025-11-20 |
Single-cell transcriptomics uncovering a critical AKT-LONP1-STAR axis in ovarian hyperandrogenism of PCOS
2025-Nov-19, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01837-6
PMID:41257877
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6672 | 2025-11-22 |
Decoding intratumoral cyclooxygenase-2 signaling through multi-omics: insights from esophageal cancer and beyond
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01919-1
PMID:41249574
|
研究论文 | 通过多组学方法研究环氧合酶-2在食管癌等肿瘤中的信号传导机制及其治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质对接分析和实验验证,系统揭示COX-2在肿瘤微环境中的调控作用 | NA | 探究COX-2在癌症进展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 食管癌及其他多种癌症类型 | 多组学分析 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质对接分析, 功能验证实验 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6673 | 2025-11-22 |
Single-cell transcriptomics identifies SOCS3+ exhausted T cells as a biomarker facilitating clear cell renal cell carcinoma progression
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01894-7
PMID:41249578
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析鉴定SOCS3+耗竭T细胞作为促进透明细胞肾细胞癌进展的生物标志物 | 首次发现SOCS3+耗竭T细胞在ccRCC中的关键作用,并构建了包含SOCS3和N4BP1的预后预测模型 | 基于现有数据集的重新分析,需要进一步实验验证 | 研究耗竭T细胞如何驱动透明细胞肾细胞癌进展 | 透明细胞肾细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归分析, Kaplan-Meier生存分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6674 | 2025-11-22 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomic profiling reveals NECTIN-TIGIT interaction underlies T cell exhaustion in papillary thyroid carcinoma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01937-z
PMID:41249602
|
研究论文 | 通过整合bulk和单细胞转录组数据,揭示NECTIN-TIGIT相互作用是甲状腺乳头状癌中T细胞耗竭的潜在驱动机制 | 首次在甲状腺乳头状癌中系统阐明NECTIN-TIGIT轴通过抑制CD226共刺激信号促进T细胞耗竭的免疫调控机制 | 需要未来湿实验室验证和临床研究来确认该轴在甲状腺癌管理中的转化相关性 | 阐明甲状腺乳头状癌中T细胞耗竭的免疫学机制 | 甲状腺乳头状癌肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | 差异基因表达分析,细胞类型注释,配体-受体相互作用分析 | 转录组数据 | 来自GEO数据库的公共数据集 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6675 | 2025-11-22 |
Comprehensive analysis reveals prognostic gene set that could impacts the response to chemotherapy and immunotherapy outcomes in malignant pleural mesothelioma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01949-9
PMID:41249691
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据开发了一个恶性胸膜间皮瘤的预后基因集模型,用于预测患者生存和治疗反应 | 首次整合转录组、DNA甲基化和SNP数据构建MPM预后模型,并验证其在化疗、放疗和免疫治疗反应预测中的价值 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发可靠的恶性胸膜间皮瘤预后评估工具,改善临床治疗效果 | 恶性胸膜间皮瘤患者 | 生物信息学 | 恶性胸膜间皮瘤 | 多组学整合分析,LASSO-Cox回归,单细胞RNA-seq | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据,DNA甲基化数据,SNP数据,单细胞RNA-seq数据 | TCGA和GEO数据库中的恶性胸膜间皮瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6676 | 2025-11-22 |
CDKN1A and cellular senescence are associated with immune resistance in advanced lung adenocarcinoma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01926-2
PMID:41249682
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研究论文 | 本研究探讨CDKN1A和细胞衰老在晚期肺腺癌免疫治疗耐药中的作用机制 | 首次在晚期肺腺癌中系统揭示CDKN1A通过促进细胞衰老和免疫抑制微环境导致免疫治疗耐药的机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探究CDKN1A在晚期肺腺癌免疫治疗疗效中的影响和作用机制 | 晚期肺腺癌患者和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | 多变量Cox回归模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA和SU2C-MARK队列的晚期肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | GSE148071数据集 |
| 6677 | 2025-11-22 |
Integrated machine learning and single-cell analysis identify chromatin-remodeling gene signature for diagnosis and prognosis in nasopharyngeal carcinoma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01953-z
PMID:41249704
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习和单细胞分析,识别染色质重塑基因特征用于鼻咽癌的诊断和预后 | 首次整合机器学习与单细胞RNA测序分析染色质重塑基因在鼻咽癌中的作用,并开发了六基因诊断预后特征 | 研究依赖于公共数据集,需要进一步实验验证和临床前瞻性研究 | 探索染色质重塑基因在鼻咽癌中的诊断和预后价值 | 鼻咽癌患者基因表达数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序,差异表达分析,加权基因共表达网络分析,功能富集分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 多个数据集(GSE12452, GSE53819, GSE61218, GSE102349)的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6678 | 2025-11-22 |
Adenylosuccinate lyase (ADSL) is a pan-cancer prognostic and immune biomarker with distinct roles in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03749-9
PMID:41251948
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析探讨ADSL基因作为预后和免疫生物标志物的潜力,特别聚焦于肝细胞癌 | 首次全面揭示ADSL在多种癌症中的过表达特征及其与预后的关联,并在单细胞水平分析ADSL高表达对细胞通讯网络的影响 | 需要进一步研究验证这些发现并阐明ADSL影响癌症发展的具体机制 | 探索ADSL基因在恶性肿瘤中的生物学作用及其作为广谱预测标志物的可行性 | 多种癌症类型,特别关注肝细胞癌(HCC) | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组分析,甲基化评估,免疫浸润评估,细胞通讯分析,诺莫图建模 | 诺莫图模型 | 转录组数据,甲基化数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6679 | 2025-11-22 |
Utilizing a novel mitochondrial-related gene signature for predicting the prognosis and immunological impact in bladder cancer
2025-Nov-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03927-9
PMID:41252049
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研究论文 | 本研究构建并验证了一个基于线粒体相关基因的膀胱癌预后特征模型 | 首次将线粒体相关基因特征与膀胱癌预后和免疫治疗疗效进行系统性关联分析 | 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证 | 探索线粒体相关基因在膀胱癌中的作用并构建预后预测模型 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | LASSO回归,Cox回归,非负矩阵分解 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA-BLCA队列和GEO数据集的多中心膀胱癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 6680 | 2025-11-22 |
Transcription factor 4 regulates the interhemispheric midline remodeling through neuron-astroglia communications during corpus callosum formation
2025-Nov-18, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-025-03696-7
PMID:41253748
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子TCF4通过神经元-星形胶质细胞通讯调控大脑半球间中线重塑及胼胝体形成的关键机制 | 首次发现TCF4介导的神经元-星形胶质细胞通讯对胼胝体形成的调控作用,并鉴定Sema7a为关键介质 | NA | 探究TCF4在胼胝体形成过程中的分子机制 | 小鼠大脑半球间中线组织 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序,体外移植实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |