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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6661 | 2025-10-06 |
Replicative history marks transcriptional and functional disparity in the CD8+ T cell memory pool
2022-05, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01171-9
PMID:35393592
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研究论文 | 本研究开发了一种名为DivisionRecorder的遗传追踪方法,揭示了CD8+ T细胞记忆池中复制历史与功能差异的关系 | 首次开发了能够记录体内细胞增殖历史的遗传追踪系统,并证明复制历史可区分T细胞记忆池中的不同功能亚群 | NA | 研究复制历史与CD8+ T细胞记忆亚群形成的关系 | CD8+ T细胞记忆池 | 免疫学 | NA | 遗传追踪、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
6662 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing of human midbrain reveals glial activation and a Parkinson-specific neuronal state
2022-04-29, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awab446
PMID:34919646
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示帕金森病患者中脑的胶质细胞激活和疾病特异性神经元状态 | 生成了首个特发性帕金森病中脑单核RNA测序数据集,发现了疾病特异性神经元簇和全胶质细胞激活机制 | 样本量相对较小(6名患者和5名对照),仅使用死后组织 | 表征中脑所有细胞类型对帕金森病病理的贡献并评估细胞类型特异性风险 | 人类中脑组织 | 单细胞测序 | 帕金森病 | 单核RNA测序, 免疫标记, 激光显微切割 | NA | 单细胞转录组数据, 空间组织数据 | 6名特发性帕金森病患者和5名年龄/性别匹配对照的>41,000个单核转录组 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
6663 | 2025-10-06 |
Host cell maturation modulates parasite invasion and sexual differentiation in Plasmodium berghei
2022-04-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abm7348
PMID:35476438
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序揭示了宿主细胞成熟状态如何调控疟原虫入侵和性分化 | 首次鉴定CD71作为网织红细胞入侵的宿主受体,并发现寄生虫代谢适应宿主细胞环境,揭示了营养依赖性向性在配子体形成中的作用 | 研究使用啮齿动物疟原虫模型,结果在人类疟疾中的适用性需要进一步验证 | 探究疟原虫在造血生态位中富集的机制和宿主-寄生虫相互作用 | 啮齿动物疟原虫(Plasmodium berghei)和宿主红细胞 | 寄生虫学 | 疟疾 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6664 | 2025-10-06 |
pRB-Depleted Pluripotent Stem Cell Retinal Organoids Recapitulate Cell State Transitions of Retinoblastoma Development and Suggest an Important Role for pRB in Retinal Cell Differentiation
2022-04-29, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szac008
PMID:35325233
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研究论文 | 本研究通过建立pRB缺失的人类多能干细胞视网膜类器官模型,模拟了视网膜母细胞瘤发展过程中的细胞状态转变 | 首次发现Rb视锥细胞表达视网膜神经节细胞和水平细胞标志物,并建立了两种pRB缺失的视网膜类器官疾病模型 | 研究仅限于体外类器官模型,需要进一步体内验证 | 研究pRB在视网膜细胞分化和视网膜母细胞瘤发展中的作用 | pRB缺失的人类胚胎干细胞和患者特异性诱导多能干细胞分化的视网膜类器官 | 发育生物学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,视网膜类器官分化 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据,形态学数据 | 两种pRB缺失的干细胞系(RB1-null hESCs和RB1双等位基因突变iPSC) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6665 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq reveals cell type-specific molecular and genetic associations to lupus
2022-04-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf1970
PMID:35389781
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示狼疮患者外周血免疫细胞的分子特征和遗传关联 | 首次使用多重单细胞RNA测序技术系统分析狼疮患者外周血单核细胞,发现细胞类型特异性表达特征和遗传变异关联 | 样本量相对有限(162例患者和99例对照),仅分析外周血单核细胞 | 系统性红斑狼疮的细胞类型特异性分子机制研究 | 外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过120万个外周血单核细胞(162例患者,99例健康对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 多重单细胞RNA测序 |
6666 | 2025-10-06 |
Single-cell eQTL mapping identifies cell type-specific genetic control of autoimmune disease
2022-04-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf3041
PMID:35389779
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研究论文 | 通过单细胞eQTL图谱揭示自身免疫疾病的细胞类型特异性遗传调控机制 | 首次在单细胞水平系统绘制免疫细胞eQTL图谱,揭示等位基因效应在B细胞状态转换中的动态变化 | 仅分析健康人群外周血单个核细胞,未包含患者样本或组织特异性数据 | 解析自身免疫疾病遗传风险的细胞类型特异性机制 | 982名健康人类受试者的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化 | 单细胞转录组数据 | 1,267,758个细胞来自982名受试者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6667 | 2025-10-06 |
A zebrafish reporter line reveals immune and neuronal expression of endogenous retrovirus
2022-04-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.048921
PMID:35142349
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研究论文 | 本研究创建了首个斑马鱼内源性逆转录病毒报告基因系,揭示了ERV在免疫细胞和神经元中的表达模式 | 创建了首个跨物种的体内ERV报告基因系,结合活体成像、流式细胞术和单细胞RNA测序技术系统分析ERV表达 | 研究仅针对斑马鱼模型,结果向哺乳动物外推需谨慎 | 研究内源性逆转录病毒在健康和疾病中的功能 | 斑马鱼内源性逆转录病毒zferv | 发育生物学 | 自身炎症性疾病,神经系统疾病 | 活体成像,流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6668 | 2025-10-06 |
IL-22 Plays a Dual Role in the Amniotic Cavity: Tissue Injury and Host Defense against Microbes in Preterm Labor
2022-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100439
PMID:35304419
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研究论文 | 本研究揭示了IL-22在羊膜腔中具有组织损伤和宿主防御微生物的双重作用 | 首次阐明IL-22在母胎界面免疫中的双重功能,发现其既能独立引起胎儿损伤导致新生儿死亡,又能参与宿主防御机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外人类系统,需要进一步验证在人类妊娠中的直接作用 | 探究IL-22在妊娠晚期母胎免疫中的作用机制 | 人类母胎界面组织、小鼠妊娠模型、羊膜液样本 | 免疫学 | 早产 | 单细胞RNA测序, 体外人类系统, 动物模型 | 小鼠妊娠模型 | 基因表达数据, 临床样本数据 | 人类早产妇女样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6669 | 2025-10-06 |
Differential assembly diversifies GABAA receptor structures and signalling
2022-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04517-3
PMID:35355020
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研究论文 | 通过冷冻电镜揭示GABAA受体通过差异组装形成不同结构和信号转导特性的机制 | 首次发现GABAA受体存在四种不同的亚基组成和排列方式,并证明某些构型可作为同时响应GABA和组胺的共检测器 | 研究主要关注特定亚基组合,尚未完全揭示所有可能的受体组装形式 | 探索GABAA受体亚基组装规律及其对信号转导的影响 | 由α4、β3、δ和γ2亚基组成的GABAA受体 | 结构生物学 | 神经系统疾病 | 冷冻电镜、单细胞RNA测序、组装模拟 | NA | 结构数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6670 | 2025-10-06 |
Using topic modeling to detect cellular crosstalk in scRNA-seq
2022-04, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009975
PMID:35395014
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研究论文 | 提出基于主题建模的新方法检测单细胞RNA测序中的细胞间相互作用 | 首次将潜在狄利克雷分配(LDA)模型应用于单细胞RNA测序数据,无需依赖配体-受体先验知识即可检测细胞相互作用 | 方法在非专门设计捕获相互作用细胞的标准液滴协议数据集中的适用性有待进一步验证 | 开发不依赖先验知识的细胞间相互作用检测方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 主题建模 | LDA | 基因表达数据 | 多个合成数据集和两个物理相互作用细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 液滴式单细胞测序协议 |
6671 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals a distinct developmental state of KMT2A-rearranged infant B-cell acute lymphoblastic leukemia
2022-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-01720-7
PMID:35288693
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示KMT2A重排婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病的独特发育状态 | 首次发现KMT2A重排婴儿B-ALL主要由早期淋巴细胞前体状态主导,并揭示其具有可靶向的混合髓系-淋巴系特征 | 研究样本量有限,主要聚焦于婴儿B-ALL特定亚型 | 探究KMT2A重排婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病的发育状态和细胞起源 | 婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病细胞,特别是KMT2A重排列亚型 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, mRNA荟萃分析 | NA | 转录组数据, 流式细胞数据 | 未明确具体样本数量,包含婴儿B-ALL患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
6672 | 2025-10-06 |
Defining the early stages of intestinal colonisation by whipworms
2022-04-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29334-0
PMID:35365634
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研究论文 | 本研究通过小鼠鞭虫感染模型和盲肠类器官系统揭示了鞭虫早期肠道定植机制 | 首次建立鞭虫感染的体外类器官模型,揭示了幼虫通过降解黏液层并形成多细胞内隧道建立感染的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类感染机制可能有所不同 | 阐明鞭虫早期肠道定植的细胞和分子机制 | 鞭虫幼虫、小鼠肠道组织、盲肠类器官 | 寄生虫学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序, 类器官培养 | NA | 基因表达数据, 显微图像 | 小鼠感染模型和体外类器官系统 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6673 | 2025-10-06 |
Human Retinal Organoids Provide a Suitable Tool for Toxicological Investigations: A Comprehensive Validation Using Drugs and Compounds Affecting the Retina
2022-03-17, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szab010
PMID:35298655
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研究论文 | 本研究验证了人类多能干细胞衍生的视网膜类器官在药物毒性筛选中的适用性 | 首次提供视网膜类器官适用于毒理学研究的可靠实验证据,证明其药物反应与体内模型和人类相似 | 仅测试了六种已知视网膜毒性化合物,需要更多化合物验证 | 验证人类视网膜类器官作为毒性筛选平台的适用性 | 人类多能干细胞衍生的视网膜类器官 | 毒理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个人类多能干细胞系分化的视网膜类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6674 | 2025-10-06 |
Lysosomal exocytosis of HSP70 stimulates monocytic BMP6 expression in Sjögren's syndrome
2022-03-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI152780
PMID:35113815
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研究论文 | 本研究揭示了LAMP3/HSP70/BMP6轴在干燥综合征唾液腺功能障碍中的新机制 | 首次发现LAMP3通过溶酶体胞吐释放HSP70,进而刺激单核细胞表达BMP6的致病轴 | 机制研究主要基于体外实验,需要更多体内验证 | 探究干燥综合征中BMP6细胞因子产生的上游调控机制 | 干燥综合征患者唾液腺组织、人外周血单核细胞、小鼠模型 | 免疫学 | 干燥综合征 | RNA原位杂交,RNA测序,单细胞转录组学,逆转录PCR | NA | 基因表达数据,转录组数据 | 干燥综合征患者唾液腺组织、人PBMCs、小鼠模型 | NA | 单细胞转录组学,RNA测序 | NA | NA |
6675 | 2025-10-06 |
A Phase II Study of Pembrolizumab in Combination with Capecitabine and Oxaliplatin with Molecular Profiling in Patients with Advanced Biliary Tract Carcinoma
2022-03-11, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyab073
PMID:35274717
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研究论文 | 评估帕博利珠单抗联合卡培他滨和奥沙利铂治疗晚期胆道癌的II期临床研究 | 首次在晚期胆道癌中探索免疫检查点抑制剂联合化疗的疗效,并整合分子谱分析研究免疫标志物表达和肿瘤进化 | 样本量较小(仅11例患者),单臂研究设计缺乏对照组 | 评估帕博利珠单抗联合CAPOX方案在晚期胆道癌患者的反应率和临床疗效 | 经组织学确诊的晚期胆道癌成年患者 | 临床肿瘤学 | 胆道癌 | 免疫组织化学、转录组测序、外显子组测序、单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、分子谱数据 | 11例患者(其中3例未接受过系统治疗) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 外显子组测序 | NA | NA |
6676 | 2025-10-06 |
FlyPhoneDB: an integrated web-based resource for cell-cell communication prediction in Drosophila
2022-03-03, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyab235
PMID:35100387
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研究论文 | 开发了用于果蝇细胞间通讯预测的集成网络资源FlyPhoneDB | 首次为果蝇创建了高可信度配体-受体对列表和细胞间通讯预测工具 | 目前仅适用于果蝇,尚未扩展到其他无脊椎动物 | 开发果蝇细胞间通讯预测的计算工具 | 果蝇单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 量化算法 | 转录组数据 | 果蝇成虫中肠、腹部和血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6677 | 2025-10-06 |
Systematic reconstruction of cellular trajectories across mouse embryogenesis
2022-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01018-x
PMID:35288709
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研究论文 | 通过整合多个单细胞RNA测序数据集,系统重建了小鼠胚胎发生过程中的细胞轨迹 | 构建了跨越小鼠原肠胚形成和器官发生的全面细胞轨迹图谱,提出了哺乳动物胚胎发生的轨迹图 | 基于自动化程序构建的轨迹图可能不完全反映真实的发育过程 | 系统重建小鼠胚胎发生过程中的细胞发育轨迹 | 小鼠胚胎细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 有向无环图 | 单细胞转录组数据 | 约150,000个细胞核,覆盖E3.5到E13.5的19个连续阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6678 | 2025-10-06 |
Diversification of multipotential postmitotic mouse retinal ganglion cell precursors into discrete types
2022-02-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.73809
PMID:35191836
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠视网膜神经节细胞前体细胞从多能状态分化为约45种离散类型的分子机制 | 首次证明视网膜神经节细胞的转录组类型身份不是在细胞分裂退出时确定的,而是通过有丝分裂后多能前体细胞的逐渐、异步限制获得的 | 研究仅限于小鼠模型,人类视网膜神经节细胞分化机制可能有所不同 | 探究单个神经元类别如何分化为多种类型的分子机制 | 小鼠视网膜神经节细胞前体细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 最优输运推断 | 单细胞转录组数据 | 小鼠视网膜神经节细胞前体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6679 | 2025-10-06 |
Mapping the biogenesis of forward programmed megakaryocytes from induced pluripotent stem cells
2022-02-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj8618
PMID:35171685
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研究论文 | 本研究开发了从多能干细胞生产巨核细胞的系统,并通过单细胞RNA测序绘制了体外与体内巨核细胞祖细胞状态的对应关系 | 首次识别出五个能够重复纯化巨核细胞祖细胞的表面标志物,并揭示了其转录和表观遗传特征 | 研究中使用的表面标志物在传统方法中无法识别巨核细胞祖细胞,且体外状态与体内状态的对应关系先前不明确 | 开发血小板前体细胞的生产系统并阐明巨核细胞祖细胞的生物学特性 | 诱导多能干细胞分化的巨核细胞和巨核细胞祖细胞 | 单细胞生物学 | 血小板减少症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6680 | 2025-10-06 |
Mapping transcriptomic vector fields of single cells
2022-02-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.045
PMID:35108499
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研究论文 | 开发了dynamo分析框架,可从单细胞RNA测序数据推断RNA绝对速度、重建细胞命运向量场并预测基因扰动效果 | 克服传统基于剪接的RNA速度分析的基本限制,引入微分几何分析揭示调控机制,利用最小作用路径方法预测细胞命运转变驱动因子 | NA | 开发能够揭示调控功能的动力学模型,推进细胞状态转变的定量和预测理论 | 人类造血系统单细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,RNA速度分析,代谢标记 | 微分几何模型,最小作用路径方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |