单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 27574 篇文献,本页显示第 6661 - 6680 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
6661 2024-11-09
Regulating Astrocytes via Short Fibers for Spinal Cord Repair
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究通过全转录组测序识别出VIM基因在脊髓损伤小鼠模型中的关键调节作用,并构建3D可注射电纺短纤维抑制反应性星形胶质细胞增生,促进脊髓神经功能恢复 首次通过全转录组测序揭示VIM基因在反应性星形胶质细胞中的关键作用,并设计3D电纺短纤维抑制其异常扩张 NA 研究抑制反应性星形胶质细胞增生以促进脊髓损伤修复的机制 脊髓损伤小鼠模型中的反应性星形胶质细胞 生物材料 脊髓损伤 全转录组测序 NA RNA 脊髓损伤小鼠模型
6662 2024-11-09
CCL5/CCR5/CYP1A1 pathway prompts liver cancer cells to survive in the combination of targeted and immunological therapies
2024-Nov, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 研究揭示了CCL5/CCR5/CYP1A1通路在肝癌细胞对抗靶向和免疫联合治疗中的作用 发现CCL5/CCR5/CYP1A1通路在肝癌细胞对抗靶向和免疫联合治疗中的作用,并验证了bergamottin作为CYP1A1竞争性抑制剂可以增强治疗效果 NA 探讨肝癌细胞在靶向和免疫联合治疗中的生存机制 肝癌细胞、CD8 T细胞、CCL5/CCR5/CYP1A1通路 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RNA测序(RNA-seq) NA RNA 治疗前后的肿瘤样本、CCL5刺激的Huh7细胞、携带肿瘤的小鼠
6663 2024-11-09
Spatial Transcriptomic Study Reveals Heterogeneous Metabolic Adaptation and a Role of Pericentral PPARα/CAR/Ces2a Axis During Fasting in Mouse Liver
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究通过空间转录组学分析小鼠肝脏在不同营养状态下的基因表达变化,揭示了肝脏代谢适应的异质性和PPARα/CAR/Ces2a轴在禁食期间的作用 首次通过空间转录组学技术揭示了小鼠肝脏在不同营养状态下的动态基因表达变化,并确定了PPARα/CAR/Ces2a轴在禁食期间的关键作用 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 探讨肝脏在不同营养状态下代谢适应的异质性和机制 小鼠肝脏在喂食、禁食和再喂食状态下的基因表达 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 基因表达数据 小鼠肝脏样本在喂食、禁食和再喂食状态下的数据
6664 2024-11-09
SHP2-Triggered Endothelial Cell Activation Fuels Estradiol-Independent Endometrial Sterile Inflammation
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究了SHP2在雌激素非依赖性子宫内膜无菌炎症中的作用 首次揭示了SHP2在子宫内膜内皮细胞中的上调促进炎症激活和巨噬细胞迁移,从而维持无菌炎症 研究主要在动物模型中进行,需要进一步在人体中验证 探讨雌激素诱导的无菌炎症如何调节子宫内膜增生 子宫内膜内皮细胞和巨噬细胞 NA 子宫内膜增生 单细胞RNA测序、RNA测序、磷酸化蛋白质组分析 NA RNA 小鼠模型
6665 2024-11-09
Epigenetic Dynamics in Reprogramming to Dopaminergic Neurons for Parkinson's Disease
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究通过单细胞RNA测序分析多巴胺能神经元重编程的轨迹,揭示了重编程过程中的关键调控因子Arid4b 首次揭示了Arid4b在多巴胺能神经元重编程中的关键作用,并通过过表达Arid4b提高了重编程效率 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人类中验证 揭示多巴胺能神经元重编程的分子机制,为帕金森病的治疗提供新策略 多巴胺能神经元的重编程过程及其关键调控因子 数字病理学 帕金森病 单细胞RNA测序 NA RNA序列 小鼠脑组织样本
6666 2024-11-09
Differentiating visceral sensory ganglion organoids from induced pluripotent stem cells
2024-Nov, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文介绍了从诱导多能干细胞(iPS细胞)生成内脏感觉神经元(VSN)的方法,并探讨了其在神经系统疾病中的应用 本文首次建立了从人类iPS细胞分化出内脏感觉神经节类器官(VSGOs)的协议,并将其应用于阿尔茨海默病的研究 NA 研究内脏感觉神经元在神经系统疾病中的作用 内脏感觉神经元(VSN)和内脏感觉神经节类器官(VSGOs) NA 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA NA NA
6667 2024-11-09
Egfl6 promotes ovarian cancer progression by enhancing the immunosuppressive functions of tumor-associated myeloid cells
2024-Nov-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 研究揭示了Egfl6通过增强肿瘤相关髓系细胞的免疫抑制功能促进卵巢癌进展的机制 首次发现Egfl6通过结合β3整合素并激活p38和SYK信号通路,促进髓系细胞迁移并分化为免疫抑制状态 研究主要基于小鼠模型和人类卵巢癌组织样本,需进一步验证在其他癌症类型中的适用性 探讨Egfl6在卵巢癌中的免疫抑制机制及其作为治疗靶点的潜力 卵巢癌、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)和髓源性抑制细胞(MDSCs) 免疫学 卵巢癌 scRNA-Seq NA 组织样本 小鼠模型和人类卵巢癌组织样本
6668 2024-11-09
Single-cell transcriptomics reveal individual and synergistic effects of Trisomy 21 and GATA1s on hematopoiesis
2024-Oct-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究使用单细胞转录组测序分析唐氏综合症和GATA1s对造血作用的个体和协同效应 首次使用同基因人诱导多能干细胞研究唐氏综合症和GATA1s对造血祖细胞的个体和协同效应 研究仅限于同基因人诱导多能干细胞,未涉及临床样本 探讨唐氏综合症和GATA1s对造血作用的个体和协同效应 造血祖细胞 数字病理学 唐氏综合症 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 同基因人诱导多能干细胞的造血祖细胞
6669 2024-11-09
Multi-omics revealed that ELAVL3 regulates MYCN in neuroblastoma via immunogenic cell death: Risk stratification and experimental research
2024-Oct-31, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了ELAVL3通过免疫原性细胞死亡调节神经母细胞瘤中的MYCN,并进行了风险分层和实验研究 首次报道了免疫原性细胞死亡相关指数(ICDR-Index),并发现ELAVL3在神经母细胞瘤中的关键作用 研究主要基于批量转录组数据和单细胞RNA测序数据,未涉及临床试验 研究神经母细胞瘤的风险分层和免疫原性细胞死亡机制 神经母细胞瘤患者及其免疫治疗反应 数字病理学 神经母细胞瘤 单细胞RNA测序 机器学习 转录组数据 1244个神经母细胞瘤样本和16个单细胞RNA测序数据集
6670 2024-11-09
Learning antibody sequence constraints from allelic inclusion
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文研究了从等位基因包含现象中学习抗体序列约束的方法 利用大规模单细胞测序数据,发现数千个幼稚B细胞中的轻链等位基因包含现象,并训练机器学习模型识别这些异常序列,结果模型与未训练的抗体特性(如多反应性、表面表达和亲和力成熟中的突变使用)相关性更高 NA 研究抗体序列约束 抗体和B细胞受体(BCR)的序列约束 机器学习 NA 单细胞测序 机器学习模型 序列数据 数千个幼稚B细胞
6671 2024-11-09
FlyRNAi.org 2025 update-expanded resources for new technologies and species
2024-Oct-22, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了FlyRNAi.org数据库2025年的更新,扩展了支持新技术和物种的资源 扩展了数据库以包括新的数据中心资源,支持单细胞转录组学的挖掘和分析,并将CRISPR试剂和基因中心生物信息学方法应用于Drosophila和其他节肢动物病媒 NA 推进生物学和生物医学理解的'omics研究设计、分析和挖掘 Drosophila和其他节肢动物的功能基因组学研究 生物信息学 NA 单细胞转录组学、CRISPR NA 基因组数据 NA
6672 2024-11-09
Heterotypic macrophages/microglia differentially contribute to retinal ischaemia and neovascularisation
2024-Oct, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 研究了异型巨噬细胞/小胶质细胞在视网膜缺血和新生血管形成中的不同作用 揭示了异型巨噬细胞/小胶质细胞在视网膜缺血和新生血管形成中的不同作用,为针对特定细胞的治疗方法提供了新的基础 NA 阐明巨噬细胞/小胶质细胞在增生性缺血性视网膜病变发病机制中的不同作用 巨噬细胞和小胶质细胞在糖尿病视网膜病变中的作用 数字病理学 糖尿病视网膜病变 免疫染色、定量实时RT-PCR、流式细胞术和单细胞RNA测序 NA 图像 NA
6673 2024-11-09
Utilizing epigenetic regulators to improve HSC-based lentiviral gene therapy
2024-09-24, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本文探讨了利用表观遗传调节剂优化培养条件,以提高造血干细胞(HSC)为基础的慢病毒基因治疗效果 本文首次探索了使用组蛋白去乙酰化酶抑制剂和溴域抑制剂来增强HSC的体外扩增和基因转导效率 NA 优化HSC的体外扩增条件,以提高基于HSC的基因治疗效果 造血干细胞(HSC)及其早期祖细胞 基因治疗 NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
6674 2024-11-09
scDTL: enhancing single-cell RNA-seq imputation through deep transfer learning with bulk cell information
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种基于深度迁移学习的单细胞RNA测序数据插补方法scDTL,通过利用批量细胞信息来增强插补效果 scDTL利用批量RNA测序数据训练的去噪自编码器作为初始插补模型,并通过领域适应框架将批量插补模型的知识迁移到单细胞RNA测序学习任务中,同时采用1D U-Net去噪模型进行并行操作,捕捉单细胞RNA测序数据的粗粒度和细粒度特征,并通过交叉通道注意力机制融合特征 NA 解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题,提高下游分析的准确性 单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 生物信息学 NA RNA测序 去噪自编码器、1D U-Net RNA测序数据 NA
6675 2024-11-09
PAC1 constrains type 2 inflammation through promotion of CGRP signaling in ILC2s
2024-Sep-17, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 研究探讨了PAC1通过促进CGRP信号传导在ILC2中调节2型炎症的作用 首次揭示了PAC1在ILC2中通过细胞内在机制促进CGRP信号传导,从而调节2型炎症 研究主要基于小鼠模型和人类循环ILC2,未来需进一步验证在其他物种和疾病模型中的适用性 探讨PAC1在ILC2中调节2型炎症的机制 PAC1在ILC2中的作用及其对CGRP信号传导的影响 免疫学 哮喘 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠和人类循环ILC2样本
6676 2024-11-09
Epigenetic regulation of cell state by H2AFY governs immunogenicity in high-risk neuroblastoma
2024-Sep-10, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 研究探讨了H2AFY在高度风险神经母细胞瘤中的表观遗传调控作用及其对免疫原性的影响 通过全基因组CRISPR/Cas9筛选识别出H2AFY作为PD-1阻断抗体nivolumab的耐药基因,并揭示了其在单细胞RNA-Seq数据中的富集及其与患者生存的关联 NA 阐明H2AFY在高度风险神经母细胞瘤中的表观遗传调控作用及其对免疫原性的影响 H2AFY在神经母细胞瘤中的作用及其对PD-1阻断疗法的耐药性 NA 神经母细胞瘤 CRISPR/Cas9筛选、单细胞RNA-Seq、多组学分析 NA RNA-Seq数据 NA
6677 2024-11-09
Single-cell sequencing analysis confirms the association of ANRIL with the increased smooth muscle cell proliferation and migration gene signatures in pulmonary artery hypertension in silico
2024-Sep, Advances in medical sciences IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞测序分析,探讨了肺动脉高压中平滑肌细胞的异质性及其与ANRIL表达的关系 首次通过单细胞测序技术分析了肺动脉高压中平滑肌细胞的异质性,并证实了ANRIL表达与平滑肌细胞增殖和迁移基因特征的关联 研究样本量较小,仅包括三名肺动脉高压患者和三名健康对照 探讨肺动脉高压中平滑肌细胞的异质性及其与ANRIL表达的关系 肺动脉高压患者的肺动脉平滑肌细胞 数字病理学 肺动脉高压 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 三名肺动脉高压患者和三名健康对照的肺动脉样本
6678 2024-11-09
Early Injury Landscape in Vein Harvest by Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2024-Jun-21, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 研究通过单细胞和空间转录组学技术,揭示了静脉移植在采集和植入后的早期损伤反应 首次应用单细胞和空间转录组学技术研究静脉病理,揭示了静脉移植在采集和植入后的早期损伤反应及其分子机制 研究仅在犬模型中进行,结果的普适性需进一步验证 阐明静脉移植在采集和植入后的早期损伤反应,识别潜在的治疗靶点 静脉移植在采集和植入后的早期损伤反应及其分子机制 心血管疾病 心血管疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据 4只犬
6679 2024-11-09
Study on the mechanism of heterogeneous tumor-associated macrophages in three subtypes of breast cancer through the integration of single-cell RNA sequencing and in vitro experiments
2024-Jun-01, Molecular biology reports IF:2.6Q3
研究论文 研究了异质性肿瘤相关巨噬细胞在三种乳腺癌亚型中的机制,通过单细胞RNA测序和体外实验的整合 揭示了异质性肿瘤相关巨噬细胞在不同乳腺癌亚型中的作用机制,并通过特定的配体-受体对调控下游通路 NA 阐明肿瘤相关巨噬细胞在三种乳腺癌亚型中的作用 三种乳腺癌亚型(三阴性乳腺癌、腔内型和HER2型)中的肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 三种乳腺癌细胞系(MDA-MB-231、MCF-7和SKBR3)和巨噬细胞
6680 2024-11-09
Pan-cancer scRNA-seq analysis reveals immunological and diagnostic significance of the peripheral blood mononuclear cells
2024-02-01, Human molecular genetics IF:3.1Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了癌症患者和健康供者外周血单核细胞的组成和状态差异,并探讨了这些特征在癌症诊断中的潜力 首次系统性地分析了癌症患者外周血单核细胞的免疫激活和分化状态,并基于这些特征构建了高敏感性的癌症诊断模型 研究样本量相对较小,且仅限于特定类型的癌症和健康对照 探讨外周血单核细胞在癌症进展中的免疫反应及其在癌症诊断中的应用潜力 癌症患者和健康供者的外周血单核细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 逻辑回归 RNA 262,025个外周血单核细胞,来自68个癌症样本和14个健康样本
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