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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6621 | 2025-10-06 |
Medulloblastoma group 3 and 4 tumors comprise a clinically and biologically significant expression continuum reflecting human cerebellar development
2022-08-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111162
PMID:35926460
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析发现髓母细胞瘤第3组和第4组肿瘤构成反映人类小脑发育的转录连续体 | 首次揭示髓母细胞瘤第3组和第4组构成双向转录连续体,并发现其与胎儿小脑发育细胞类型的对应关系 | NA | 探究髓母细胞瘤第3组和第4组的转录特征及其发育起源 | 髓母细胞瘤患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | 大型注释队列的髓母细胞瘤样本 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
6622 | 2025-10-06 |
Into the multiverse: advances in single-cell multiomic profiling
2022-08, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2022.03.015
PMID:35537880
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综述 | 本文综述了单细胞多组学分析技术的最新进展及其在生物学研究中的应用 | 系统总结了单细胞多组学技术的最新发展,强调从单一转录组测量向多层级组学整合的转变 | NA | 探讨单细胞多组学分析技术在揭示细胞调控机制和功能方面的潜力 | 单个细胞的基因组、表观基因组、转录组和蛋白质组 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | 基因组数据, 表观基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 数千个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
6623 | 2025-10-06 |
Pituitary corticotroph identity and receptor-mediated signaling: a transcriptomics perspective
2022-Aug, Current opinion in endocrine and metabolic research
DOI:10.1016/j.coemr.2022.100364
PMID:36177190
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综述 | 从转录组学角度探讨垂体促肾上腺皮质激素细胞的分子特征及其受体介导的信号通路 | 整合单细胞RNA测序数据与经典文献,首次系统揭示促肾上腺皮质激素细胞中G蛋白偶联受体及其下游信号通路的完整基因表达谱 | 基于已有数据的二次分析,缺乏实验验证;主要聚焦基因表达模式,未涉及蛋白功能验证 | 系统解析垂体促肾上腺皮质激素细胞的分子特征和信号传导机制 | 垂体促肾上腺皮质激素细胞及其受体信号通路相关基因 | 转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6624 | 2025-10-06 |
A root phloem pole cell atlas reveals common transcriptional states in protophloem-adjacent cells
2022-08, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-022-01178-y
PMID:35927456
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研究论文 | 通过单细胞测序技术构建根韧皮部细胞图谱,揭示原韧皮部筛管相邻细胞的共同转录状态 | 使用第二代单细胞方法对韧皮部进行超高分辨率分析,发现PAPL转录因子作为早期PSE相邻谱系的特征标记 | 特定细胞类型仍然难以捕获且代表性不足 | 研究根韧皮部细胞发育轨迹和基因调控网络 | 拟南芥根韧皮部细胞,特别是原韧皮部筛管相邻细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6625 | 2025-10-06 |
Origin and function of activated fibroblast states during zebrafish heart regeneration
2022-08, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01129-5
PMID:35864193
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和时空分析揭示了斑马鱼心脏再生过程中活化成纤维细胞状态的起源和功能 | 首次在斑马鱼心脏再生中发现表达胶原蛋白-12的成纤维细胞具有促再生功能,并确定这些细胞来源于心外膜和心内膜两个独立来源 | 研究仅限于斑马鱼模型,在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探索脊椎动物心脏再生的细胞机制和调控网络 | 斑马鱼心脏再生过程中的活化细胞状态 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, 高通量谱系追踪, 时空分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6626 | 2025-10-06 |
Circulating immune cell landscape in patients who had mild ischaemic stroke
2022-08, Stroke and vascular neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1136/svn-2021-001224
PMID:35264400
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析轻度缺血性卒中患者外周血单个核细胞的转录组变化 | 首次基于转录组分析发现轻度缺血性卒中患者NK细胞数量增加和新的单核细胞亚群 | 样本量较小(10例患者和9例对照),仅观察卒中后24小时内变化 | 了解轻度缺血性卒中后外周免疫反应机制 | 急性缺血性卒中患者和匹配对照的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例急性缺血性卒中患者和9例种族/年龄/性别匹配的对照 | Illumina, BioRad | 单细胞RNA测序 | ddSeq, Illumina NovaSeq 6000 | ddSeqTM单细胞制备系统,Illumina NovaSeq 6000测序平台 |
6627 | 2025-10-06 |
A brain precursor atlas reveals the acquisition of developmental-like states in adult cerebral tumours
2022-07-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31408-y
PMID:35853870
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研究论文 | 通过构建小鼠大脑发育图谱并与人类胶质瘤单细胞数据比较,揭示成人脑肿瘤获得胚胎样发育状态 | 首次系统绘制小鼠大脑发育时间轴单细胞图谱,并发现成人胶质瘤细胞具有胚胎期放射状胶质前体细胞的表达特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究人类脑肿瘤与神经发育阶段的关联机制 | 小鼠大脑发育细胞和人类胶质瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | 遗传小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 超过10万个小鼠大脑细胞和100多例人类胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6628 | 2025-10-06 |
Group 3 innate lymphocytes make a distinct contribution to type 17 immunity in bladder defence
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104660
PMID:35845169
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研究论文 | 本研究揭示了第3组先天淋巴细胞在膀胱防御中通过产生IL-17参与17型免疫应答的重要作用 | 首次通过活体成像和单细胞RNA测序技术证实膀胱中NCR阳性和阴性ILC3亚群在尿路致病菌感染后的局部增殖及IL-17产生机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类膀胱ILC3功能验证尚需进一步研究 | 探究膀胱防御中17型免疫应答的调控机制 | 小鼠和人类膀胱组织中的第3组先天淋巴细胞(ILC3) | 免疫学 | 膀胱感染 | 活体成像,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6629 | 2025-10-06 |
A CD4+ T cell reference map delineates subtype-specific adaptation during acute and chronic viral infections
2022-07-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76339
PMID:35829695
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学构建了CD4+ T细胞在急性和慢性病毒感染中的参考图谱,揭示了细胞状态的动态变化 | 首次系统描绘了CD4+ T细胞在病毒感染过程中的转录状态适应机制,并建立了可用于外部数据分析的参考图谱 | 研究基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明CD4+ T细胞在急性和慢性病毒感染过程中的转录状态变化规律 | 病毒感染小鼠模型中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞转录组测序, 单细胞T细胞受体分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
6630 | 2025-10-06 |
Conjunctival epithelial cells resist productive SARS-CoV-2 infection
2022-07-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.05.017
PMID:35750043
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研究论文 | 本研究通过构建结膜上皮细胞模型,发现虽然结膜细胞允许SARS-CoV-2基因组表达,但不会形成有效感染 | 首次建立可维持至分化第75天的结膜上皮气液界面模型,并揭示结膜细胞通过NF-κB信号而非干扰素信号抵抗SARS-CoV-2有效感染的机制 | 研究基于体外模型,可能与体内实际情况存在差异;未深入探讨NF-κB信号通路的具体作用机制 | 探究SARS-CoV-2在人类眼表结膜上皮细胞的感染机制和免疫反应 | 结膜上皮细胞(基底细胞、基底上层细胞和表层上皮细胞)及成纤维细胞 | 传染病学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,成像分析,病毒学检测 | 器官型气液界面模型 | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6631 | 2025-10-06 |
Cross-tissue, single-cell stromal atlas identifies shared pathological fibroblast phenotypes in four chronic inflammatory diseases
2022-07-08, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2022.05.002
PMID:35649411
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研究论文 | 通过跨组织单细胞测序构建基质细胞图谱,识别四种慢性炎症疾病中共享的致病性成纤维细胞表型 | 首次创建跨组织成纤维细胞图谱,发现两种在四种慢性炎症疾病中普遍存在的促炎性成纤维细胞亚群 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,需要进一步功能验证 | 识别多种慢性炎症疾病中共享的致病性成纤维细胞表型 | 来自滑膜、肠道、肺和唾液腺的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 慢性炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自多个组织和供体的成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6632 | 2025-10-06 |
Zebrafish transposable elements show extensive diversification in age, genomic distribution, and developmental expression
2022-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.275655.121
PMID:34987056
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研究论文 | 本研究系统描述了斑马鱼转座元件的种群特征、基因组分布及其在胚胎发育过程中的表达模式 | 首次全面揭示斑马鱼转座元件的动态基因组生态系统,发现近2000个不同家族,并鉴定其发育阶段特异性和组织特异性表达模式 | 主要基于计算分析,需要后续实验验证转座元件的功能影响 | 研究转座元件对脊椎动物胚胎发育的影响 | 斑马鱼转座元件 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
6633 | 2025-10-06 |
A comparative transcriptomic analysis of glucagon-like peptide-1 receptor- and glucose-dependent insulinotropic polypeptide receptor-expressing cells in the hypothalamus
2022-07-01, Appetite
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.appet.2022.106022
PMID:35430298
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较下丘脑中表达GLP-1R和GIPR的细胞类型及其转录组特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较下丘脑中两种肠促胰岛素受体表达细胞的异质性和分子特征 | 研究仅使用转基因小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 探究GIPR/GLP-1R共激动剂增强减肥效果的潜在机制 | 下丘脑中表达GLP-1R和GIPR的细胞群体 | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 14,091个Glp1rEYFP+和GiprEYFP+细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6634 | 2025-10-06 |
Single-cell roadmap of human gonadal development
2022-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04918-4
PMID:35794482
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学等技术构建了人类性腺发育的全面图谱 | 首次结合单细胞转录组、空间转录组、染色质可及性分析和荧光显微镜技术,系统描绘了人类性腺发育的时空图谱,并鉴定了人类特异性调控程序 | 研究主要基于第一和第二孕期的组织样本,对更早期和晚期发育阶段的覆盖有限 | 揭示人类性腺发育的细胞和分子机制 | 人类和小鼠的性腺组织 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 染色质可及性分析, 荧光显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 染色质可及性数据, 图像数据 | 人类第一和第二孕期性腺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, ATAC-seq | NA | NA |
6635 | 2025-10-06 |
Hyaluronic acid-GPRC5C signalling promotes dormancy in haematopoietic stem cells
2022-07, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-00931-x
PMID:35725769
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类骨髓造血干细胞休眠状态的连续谱系,并发现了透明质酸-GPRC5C信号轴调控休眠的新机制 | 首次发现孤儿受体GPRC5C在人类造血干细胞休眠中的关键作用,并阐明透明质酸通过GPRC5C维持干细胞休眠的分子机制 | 人类造血干细胞休眠的存在仍存在争议,研究主要基于纯化干细胞的分析 | 探究人类造血干细胞休眠状态的分子调控机制 | 人类和小鼠骨髓造血干细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 遗传功能获得和缺失分析, 结构建模, 生化检测 | NA | 单细胞转录组数据 | 高度纯化的人类骨髓造血干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6636 | 2025-10-06 |
Identification of early neurodegenerative pathways in progressive multiple sclerosis
2022-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01097-3
PMID:35726057
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学分析人类多发性硬化脑组织,揭示了进行性多发性硬化的早期神经退行性通路 | 首次利用空间转录组学和蛋白质组学技术识别进行性多发性硬化中的多细胞机制,并追踪神经退行性变的时空分布阶段 | 研究基于新鲜冷冻的人脑组织样本,样本获取和处理可能存在技术限制 | 阐明进行性多发性硬化的复杂发病机制,为药物开发提供新框架 | 人类进行性多发性硬化患者的脑组织样本 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
6637 | 2025-10-06 |
Abnormal Cyclic Nucleotide Signaling at the Outer Mitochondrial Membrane In Sympathetic Neurons During the Early Stages of Hypertension
2022-07, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究探讨高血压早期阶段交感神经元外线粒体膜环核苷酸信号传导异常及其对自主神经功能的影响 | 首次发现高血压前期神经元外线粒体膜PDE2A2过表达导致环核苷酸信号异常,并提出位点特异性抑制PDE2A和PDE6D的治疗策略 | 研究主要聚焦于星状神经节神经元,未涉及其他交感神经节;机制研究尚未完全阐明所有信号传导通路 | 探究高血压早期交感神经元环核苷酸信号传导异常的分子机制 | Wistar大鼠和自发性高血压大鼠的星状神经节交感神经元 | 神经科学 | 高血压 | 单细胞RNA测序, FRET传感器, 分子生物学技术 | NA | 基因表达数据, 分子信号数据 | 年轻Wistar大鼠和自发性高血压大鼠的星状神经节神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6638 | 2025-10-06 |
Leveraging single-cell sequencing to unravel intratumour heterogeneity and tumour evolution in human cancers
2022-07, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.5914
PMID:35438189
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在解析人类癌症瘤内异质性和肿瘤进化中的应用与进展 | 系统探讨了单细胞基因组测序技术如何揭示肿瘤发生、进展、转移和治疗抵抗的进化动力学,并涵盖空间背景下的原位测序技术和多模态单细胞测序方法 | NA | 通过单细胞测序技术深入理解肿瘤异质性和进化机制 | 人类癌症组织 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞DNA测序, 原位测序, 多模态单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
6639 | 2025-10-06 |
Epigenetic and Transcriptomic Programming of HSC Quiescence Signaling in Large for Gestational Age Neonates
2022-Jun-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23137323
PMID:35806330
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研究论文 | 通过整合单细胞表观基因组学、转录组学和体外分析,研究胎儿过度生长对造血干细胞静息信号的表观遗传编程影响 | 首次采用多模态单细胞(表观)基因组学方法揭示人类胎儿过度生长通过表观遗传编程影响造血干细胞静息信号机制 | 功能影响的具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究DNA甲基化改变与造血干细胞功能改变的功能性联系 | 大于胎龄儿造血干细胞和祖细胞 | 表观遗传学 | 胎儿生长异常 | 单细胞表观基因组学,单细胞转录组学,体外功能分析 | NA | 表观遗传数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞表观基因组学,单细胞转录组学 | NA | NA |
6640 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome and accessible chromatin dynamics during endocrine pancreas development
2022-06-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2201267119
PMID:35733248
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术分析小鼠胰腺内分泌细胞分化过程,揭示转录因子调控网络 | 首次在单细胞水平同时分析转录组和染色质可及性动态,发现Neurog3可能作为先驱转录因子调控胰腺内分泌谱系 | 研究仅针对小鼠模型,人类胰腺发育可能存在差异 | 解析胰腺内分泌细胞发育过程中的基因调控网络 | 小鼠胰腺内分泌细胞(β细胞、α细胞、δ细胞) | 发育生物学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性测定, 流式细胞分选 | NA | 单细胞RNA-seq数据, ATAC-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |