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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6621 | 2025-10-06 |
Systematic exploration of dynamic splicing networks reveals conserved multistage regulators of neurogenesis
2022-08-18, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2022.06.036
PMID:35914530
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研究论文 | 本研究通过筛选策略发现调控哺乳动物神经发生过程中动态剪接事件的关键因子 | 发现Rbm38和Puf60这两个先前未知的神经发生调控因子,并揭示Puf60中保守的神经差异性外显子如何重塑共因子相互作用 | NA | 探索发育转变过程中功能协调剪接程序的控制因素 | 小鼠神经发生过程中的动态剪接事件 | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6622 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Reveals the Range of Transcriptional States of Circulating Human Neutrophils
2022-08-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200154
PMID:35858733
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示人类循环中性粒细胞的转录状态异质性 | 开发改进的数据分析流程显著提高中性粒细胞检测效率,首次系统描述循环中性粒细胞在四个可重复转录簇中的分布规律 | 仅针对健康人群外周血中性粒细胞进行研究,未涉及疾病状态下的变化 | 探索人类循环中性粒细胞的转录异质性特征 | 人类外周血中性粒细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 健康人类受试者的外周血中性粒细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6623 | 2025-10-06 |
Differentiation of crescent-forming kidney progenitor cells into podocytes attenuates severe glomerulonephritis in mice
2022-08-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abg3277
PMID:35947676
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研究论文 | 本研究揭示了新月体肾小球肾炎中新月体形成的细胞来源机制,并证明组蛋白去乙酰化酶抑制剂panobinostat可通过促进肾脏祖细胞向足细胞分化来缓解疾病 | 首次发现新月体来源于单个未成熟壁层上皮细胞的克隆扩增,并证实panobinostat可诱导未成熟壁层上皮细胞亚群向足细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型,人类细胞仅进行了体外实验 | 探究新月体肾小球肾炎的分子机制和治疗策略 | Pax2Cre报告基因小鼠模型、人类肾脏祖细胞 | 肾脏病学 | 新月体肾小球肾炎 | 单细胞RNA测序, 三维共聚焦显微镜, 受激发射损耗超分辨率成像 | NA | 基因表达数据, 显微镜图像 | 两种小鼠模型和人类细胞体外实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6624 | 2025-10-06 |
SMaSH: a scalable, general marker gene identification framework for single-cell RNA-sequencing
2022-Aug-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04860-2
PMID:35941549
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研究论文 | 提出一种可扩展的通用标记基因识别框架SMaSH,用于单细胞RNA测序数据分析 | 首个强调针对特定细胞表型进行下游研究的标记基因计算方法,在空间转录组学数据中验证了其识别高度局部化细胞区室的能力 | NA | 开发高效可靠的计算框架来识别细胞类型特异性标记基因 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 基因表达数据 | 数十万细胞,跨越50多种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
6625 | 2025-10-06 |
Transcriptional variability accelerates preleukemia by cell diversification and perturbation of protein synthesis
2022-08-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn4886
PMID:35921412
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研究论文 | 本研究探讨转录变异性通过细胞多样化和蛋白质合成扰动加速前白血病进展的机制 | 首次揭示转录变异性通过破坏核糖体生物发生和蛋白质合成促进白血病进展的新机制 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究转录变异性在白血病前期向白血病转变过程中的作用机制 | 具有增强转录变异性的小鼠前白血病细胞 | 单细胞基因组学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6626 | 2025-10-06 |
Single cell multi-omics characterise discrete human tendon cells populations that persist in vitro and on fibrous scaffolds
2022-08-02, European cells & materials
IF:3.2Q1
DOI:10.22203/eCM.v044a01
PMID:35916474
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术鉴定并表征了在体外培养和纤维支架上持续存在的人类肌腱细胞亚群 | 首次结合单细胞表面蛋白质组学和单细胞转录组学(CITE-Seq)鉴定人类肌腱细胞亚群,并发现特定细胞亚群在排列电纺纤维支架上的选择性存活 | 研究仅使用健康人类腘绳肌腱细胞,未涉及病变肌腱组织;体外培养时间较短(8天) | 确定人类肌腱细胞亚群在体外培养条件下的持续性及其对纤维支架的响应 | 健康人类腘绳肌腱细胞 | 单细胞多组学 | 肌腱疾病 | CITE-Seq, 单细胞表面蛋白质组学, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 表面蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
6627 | 2025-10-06 |
Medulloblastoma group 3 and 4 tumors comprise a clinically and biologically significant expression continuum reflecting human cerebellar development
2022-08-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111162
PMID:35926460
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析发现髓母细胞瘤第3组和第4组肿瘤构成反映人类小脑发育的转录连续体 | 首次揭示髓母细胞瘤第3组和第4组构成双向转录连续体,并发现其与胎儿小脑发育细胞类型的对应关系 | NA | 探究髓母细胞瘤第3组和第4组的转录特征及其发育起源 | 髓母细胞瘤患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | 大型注释队列的髓母细胞瘤样本 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
6628 | 2025-10-06 |
Into the multiverse: advances in single-cell multiomic profiling
2022-08, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2022.03.015
PMID:35537880
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综述 | 本文综述了单细胞多组学分析技术的最新进展及其在生物学研究中的应用 | 系统总结了单细胞多组学技术的最新发展,强调从单一转录组测量向多层级组学整合的转变 | NA | 探讨单细胞多组学分析技术在揭示细胞调控机制和功能方面的潜力 | 单个细胞的基因组、表观基因组、转录组和蛋白质组 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | 基因组数据, 表观基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 数千个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
6629 | 2025-10-06 |
Pituitary corticotroph identity and receptor-mediated signaling: a transcriptomics perspective
2022-Aug, Current opinion in endocrine and metabolic research
DOI:10.1016/j.coemr.2022.100364
PMID:36177190
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综述 | 从转录组学角度探讨垂体促肾上腺皮质激素细胞的分子特征及其受体介导的信号通路 | 整合单细胞RNA测序数据与经典文献,首次系统揭示促肾上腺皮质激素细胞中G蛋白偶联受体及其下游信号通路的完整基因表达谱 | 基于已有数据的二次分析,缺乏实验验证;主要聚焦基因表达模式,未涉及蛋白功能验证 | 系统解析垂体促肾上腺皮质激素细胞的分子特征和信号传导机制 | 垂体促肾上腺皮质激素细胞及其受体信号通路相关基因 | 转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6630 | 2025-10-06 |
A root phloem pole cell atlas reveals common transcriptional states in protophloem-adjacent cells
2022-08, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-022-01178-y
PMID:35927456
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研究论文 | 通过单细胞测序技术构建根韧皮部细胞图谱,揭示原韧皮部筛管相邻细胞的共同转录状态 | 使用第二代单细胞方法对韧皮部进行超高分辨率分析,发现PAPL转录因子作为早期PSE相邻谱系的特征标记 | 特定细胞类型仍然难以捕获且代表性不足 | 研究根韧皮部细胞发育轨迹和基因调控网络 | 拟南芥根韧皮部细胞,特别是原韧皮部筛管相邻细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6631 | 2025-10-06 |
Origin and function of activated fibroblast states during zebrafish heart regeneration
2022-08, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01129-5
PMID:35864193
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和时空分析揭示了斑马鱼心脏再生过程中活化成纤维细胞状态的起源和功能 | 首次在斑马鱼心脏再生中发现表达胶原蛋白-12的成纤维细胞具有促再生功能,并确定这些细胞来源于心外膜和心内膜两个独立来源 | 研究仅限于斑马鱼模型,在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探索脊椎动物心脏再生的细胞机制和调控网络 | 斑马鱼心脏再生过程中的活化细胞状态 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, 高通量谱系追踪, 时空分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6632 | 2025-10-06 |
Circulating immune cell landscape in patients who had mild ischaemic stroke
2022-08, Stroke and vascular neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1136/svn-2021-001224
PMID:35264400
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析轻度缺血性卒中患者外周血单个核细胞的转录组变化 | 首次基于转录组分析发现轻度缺血性卒中患者NK细胞数量增加和新的单核细胞亚群 | 样本量较小(10例患者和9例对照),仅观察卒中后24小时内变化 | 了解轻度缺血性卒中后外周免疫反应机制 | 急性缺血性卒中患者和匹配对照的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例急性缺血性卒中患者和9例种族/年龄/性别匹配的对照 | Illumina, BioRad | 单细胞RNA测序 | ddSeq, Illumina NovaSeq 6000 | ddSeqTM单细胞制备系统,Illumina NovaSeq 6000测序平台 |
6633 | 2025-10-06 |
A brain precursor atlas reveals the acquisition of developmental-like states in adult cerebral tumours
2022-07-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31408-y
PMID:35853870
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研究论文 | 通过构建小鼠大脑发育图谱并与人类胶质瘤单细胞数据比较,揭示成人脑肿瘤获得胚胎样发育状态 | 首次系统绘制小鼠大脑发育时间轴单细胞图谱,并发现成人胶质瘤细胞具有胚胎期放射状胶质前体细胞的表达特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究人类脑肿瘤与神经发育阶段的关联机制 | 小鼠大脑发育细胞和人类胶质瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | 遗传小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 超过10万个小鼠大脑细胞和100多例人类胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6634 | 2025-10-06 |
Group 3 innate lymphocytes make a distinct contribution to type 17 immunity in bladder defence
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104660
PMID:35845169
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研究论文 | 本研究揭示了第3组先天淋巴细胞在膀胱防御中通过产生IL-17参与17型免疫应答的重要作用 | 首次通过活体成像和单细胞RNA测序技术证实膀胱中NCR阳性和阴性ILC3亚群在尿路致病菌感染后的局部增殖及IL-17产生机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类膀胱ILC3功能验证尚需进一步研究 | 探究膀胱防御中17型免疫应答的调控机制 | 小鼠和人类膀胱组织中的第3组先天淋巴细胞(ILC3) | 免疫学 | 膀胱感染 | 活体成像,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6635 | 2025-10-06 |
A CD4+ T cell reference map delineates subtype-specific adaptation during acute and chronic viral infections
2022-07-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76339
PMID:35829695
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学构建了CD4+ T细胞在急性和慢性病毒感染中的参考图谱,揭示了细胞状态的动态变化 | 首次系统描绘了CD4+ T细胞在病毒感染过程中的转录状态适应机制,并建立了可用于外部数据分析的参考图谱 | 研究基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明CD4+ T细胞在急性和慢性病毒感染过程中的转录状态变化规律 | 病毒感染小鼠模型中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞转录组测序, 单细胞T细胞受体分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
6636 | 2025-10-06 |
Conjunctival epithelial cells resist productive SARS-CoV-2 infection
2022-07-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.05.017
PMID:35750043
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研究论文 | 本研究通过构建结膜上皮细胞模型,发现虽然结膜细胞允许SARS-CoV-2基因组表达,但不会形成有效感染 | 首次建立可维持至分化第75天的结膜上皮气液界面模型,并揭示结膜细胞通过NF-κB信号而非干扰素信号抵抗SARS-CoV-2有效感染的机制 | 研究基于体外模型,可能与体内实际情况存在差异;未深入探讨NF-κB信号通路的具体作用机制 | 探究SARS-CoV-2在人类眼表结膜上皮细胞的感染机制和免疫反应 | 结膜上皮细胞(基底细胞、基底上层细胞和表层上皮细胞)及成纤维细胞 | 传染病学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,成像分析,病毒学检测 | 器官型气液界面模型 | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6637 | 2025-10-06 |
Cross-tissue, single-cell stromal atlas identifies shared pathological fibroblast phenotypes in four chronic inflammatory diseases
2022-07-08, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2022.05.002
PMID:35649411
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研究论文 | 通过跨组织单细胞测序构建基质细胞图谱,识别四种慢性炎症疾病中共享的致病性成纤维细胞表型 | 首次创建跨组织成纤维细胞图谱,发现两种在四种慢性炎症疾病中普遍存在的促炎性成纤维细胞亚群 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,需要进一步功能验证 | 识别多种慢性炎症疾病中共享的致病性成纤维细胞表型 | 来自滑膜、肠道、肺和唾液腺的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 慢性炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自多个组织和供体的成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6638 | 2025-10-06 |
Zebrafish transposable elements show extensive diversification in age, genomic distribution, and developmental expression
2022-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.275655.121
PMID:34987056
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研究论文 | 本研究系统描述了斑马鱼转座元件的种群特征、基因组分布及其在胚胎发育过程中的表达模式 | 首次全面揭示斑马鱼转座元件的动态基因组生态系统,发现近2000个不同家族,并鉴定其发育阶段特异性和组织特异性表达模式 | 主要基于计算分析,需要后续实验验证转座元件的功能影响 | 研究转座元件对脊椎动物胚胎发育的影响 | 斑马鱼转座元件 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
6639 | 2025-10-06 |
A comparative transcriptomic analysis of glucagon-like peptide-1 receptor- and glucose-dependent insulinotropic polypeptide receptor-expressing cells in the hypothalamus
2022-07-01, Appetite
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.appet.2022.106022
PMID:35430298
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较下丘脑中表达GLP-1R和GIPR的细胞类型及其转录组特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较下丘脑中两种肠促胰岛素受体表达细胞的异质性和分子特征 | 研究仅使用转基因小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 探究GIPR/GLP-1R共激动剂增强减肥效果的潜在机制 | 下丘脑中表达GLP-1R和GIPR的细胞群体 | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 14,091个Glp1rEYFP+和GiprEYFP+细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6640 | 2025-10-06 |
Single-cell roadmap of human gonadal development
2022-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04918-4
PMID:35794482
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学等技术构建了人类性腺发育的全面图谱 | 首次结合单细胞转录组、空间转录组、染色质可及性分析和荧光显微镜技术,系统描绘了人类性腺发育的时空图谱,并鉴定了人类特异性调控程序 | 研究主要基于第一和第二孕期的组织样本,对更早期和晚期发育阶段的覆盖有限 | 揭示人类性腺发育的细胞和分子机制 | 人类和小鼠的性腺组织 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 染色质可及性分析, 荧光显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 染色质可及性数据, 图像数据 | 人类第一和第二孕期性腺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, ATAC-seq | NA | NA |