单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6601 - 6620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6601 | 2025-10-06 |
Deterministic programming of human pluripotent stem cells into microglia facilitates studying their role in health and disease
2022-10-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2123476119
PMID:36251998
|
研究论文 | 开发了一种从人类多能干细胞确定性编程为小胶质细胞的方法，用于研究其在健康和疾病中的作用 | 通过瞬时过表达PU.1和C/EBPβ转录因子，可在16天内从hPSCs获得同质的成熟小胶质细胞群 | NA | 建立可扩展的人类小胶质细胞来源，研究其在神经系统健康和疾病中的功能 | 人类多能干细胞(hPSCs)、小胶质样细胞(MGLs)、皮质神经元、脑类器官 | 干细胞生物学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序、细胞编程、共培养系统 | NA | 转录组数据、形态学数据、功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6602 | 2025-10-06 |
Loss of non-motor kinesin KIF26A causes congenital brain malformations via dysregulated neuronal migration and axonal growth as well as apoptosis
2022-10-24, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.09.011
PMID:36228617
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研究论文 | 本研究揭示了非运动驱动蛋白KIF26A功能丧失通过调节神经元迁移、轴突生长和细胞凋亡导致先天性脑畸形的机制 | 首次在人类患者中鉴定KIF26A双等位基因功能丧失变异与先天性脑畸形的关联，并利用小鼠和iPSC来源的类器官模型阐明其致病机制 | 研究主要聚焦于兴奋性神经元，对其他神经元类型的影响尚未充分探索 | 探究KIF26A在脑发育中的功能及其变异导致先天性脑畸形的分子机制 | KIF26A基因变异患者、小鼠模型、人iPSC来源的脑类器官 | 神经科学 | 先天性脑畸形 | 单细胞RNA测序、iPSC类器官培养、基因敲除 | 基因敲除模型 | 基因表达数据、形态学数据 | 患者队列、小鼠模型、人iPSC类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6603 | 2025-10-06 |
Lymphatic migration of unconventional T cells promotes site-specific immunity in distinct lymph nodes
2022-10-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.07.019
PMID:36002023
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研究论文 | 本研究揭示了非常规T细胞通过淋巴管迁移至局部引流淋巴结并塑造部位特异性免疫的机制 | 首次证明组织源性非常规T细胞通过淋巴途径迁移至引流淋巴结，并形成具有组织特异性的免疫反应单元 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的适用性需要进一步验证 | 探究非常规T细胞在淋巴结部位特异性免疫形成中的作用机制 | 非常规T细胞和淋巴结免疫微环境 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 光谱流式细胞术, 光标记转基因小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6604 | 2025-10-06 |
Mouse embryo model derived exclusively from embryonic stem cells undergoes neurulation and heart development
2022-10-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.08.013
PMID:36084657
|
研究论文 | 开发了一种完全由胚胎干细胞构建的小鼠胚胎模型，能够实现神经管形成和心脏发育 | 首次通过转录因子介导的诱导，建立了能够重建着床后胚胎多能性ESC谱系和两个胚外谱系的统一模型 | 模型在某些方面与自然胚胎程序存在差异 | 开发能够更全面模拟小鼠胚胎发育的体外模型 | 小鼠胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6605 | 2025-10-06 |
Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data
2022-10, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01167-z
PMID:36050550
|
研究论文 | 提出单细胞疾病相关性评分方法，将单细胞RNA测序数据与多基因疾病风险在单细胞分辨率下关联 | 开发了独立于细胞类型注释的单细胞疾病相关性评分方法，能够识别GWAS疾病相关基因过度表达的单个细胞 | NA | 建立单细胞RNA测序数据与多基因疾病风险的关联分析方法 | 74种疾病/性状和130万个单细胞基因表达谱，涵盖31个组织/器官 | 单细胞基因组学 | 炎症性肠病,精神分裂症,代谢疾病 | 单细胞RNA测序,全基因组关联研究 | scDRS | 单细胞基因表达数据 | 130万个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6606 | 2025-10-06 |
Lipopolysaccharide distinctively alters human microglia transcriptomes to resemble microglia from Alzheimer's disease mouse models
2022-10-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.049349
PMID:36254682
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了不同刺激条件下人iPSC来源小胶质细胞的转录组变化，发现LPS+IFN-γ处理能使其转录组特征更接近阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞 | 首次系统比较了不同免疫刺激对人iPSC来源小胶质细胞转录组的影响，并发现LPS能特异性诱导其转录组特征向AD小鼠模型小胶质细胞转变 | 研究仅观察了24小时和48小时两个时间点的转录组变化，未涉及更长期的效应 | 探究不同免疫刺激对人iPSC来源小胶质细胞转录组的影响及其与阿尔茨海默病的相关性 | 人诱导多能干细胞来源的小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6607 | 2025-10-06 |
A cellular hierarchy in melanoma uncouples growth and metastasis
2022-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05242-7
PMID:36131018
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研究论文 | 本研究通过整合多种技术揭示了黑色素瘤中生长与转移由不同细胞群体支持的细胞层级模型 | 发现了黑色素瘤中生长能力与转移能力分别由不同细胞群体承担，且这些表型能力可通过特定微环境信号动态获得 | 研究主要基于小鼠模型，人类黑色素瘤中的适用性需要进一步验证 | 探索黑色素瘤细胞状态多样性的起源以及生长与转移的细胞基础 | 黑色素瘤细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学，空间转录组学，谱系追踪，定量建模 | 层级模型 | 单细胞基因表达数据，空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 6608 | 2025-10-06 |
Single cell and spatial transcriptomic analyses reveal microglia-plasma cell crosstalk in the brain during Trypanosoma brucei infection
2022-09-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33542-z
PMID:36180478
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示布氏锥虫感染期间大脑中微胶质细胞与浆细胞的相互作用机制 | 首次发现稳态微胶质细胞与CD138浆细胞通过IL-10和BAFF信号传导的新型相互作用 | 对慢性布氏锥虫感染期间大脑转录和功能反应的理解仍不完整 | 研究布氏锥虫感染期间大脑的分子和细胞反应机制 | 小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | 寄生虫感染疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 6609 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals activation of core transcription factors in PRC2-deficient malignant peripheral nerve sheath tumor
2022-09-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111363
PMID:36130486
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示PRC2缺陷型恶性外周神经鞘瘤中核心转录因子的激活机制 | 发现PRC2缺失通过双重致癌机制：重塑二价染色质和增强子景观，同时降低I型干扰素信号和抗原呈递 | NA | 阐明PRC2缺失在恶性外周神经鞘瘤中的致癌机制 | PRC2缺陷型恶性外周神经鞘瘤细胞和正常雪旺细胞 | 单细胞测序 | 恶性外周神经鞘瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6610 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics identifies conserved regulators of neuroglandular lineages
2022-09-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111370
PMID:36130520
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了刺胞动物神经和腺体细胞谱系的共同起源和调控机制 | 首次在刺胞动物中证明神经元、刺细胞和腺细胞来源于共同的多能祖细胞群体，并鉴定SoxC为神经腺体谱系的关键上游调控因子 | 研究仅针对一种刺胞动物模型，在其他物种中的保守性需要进一步验证 | 探究神经系统分泌细胞类型的进化起源和发育调控机制 | 海葵Nematostella vectensis的神经腺体细胞谱系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 转基因技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 海葵从胚胎到成体的多个发育阶段样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6611 | 2025-10-06 |
Benchmarking methods for detecting differential states between conditions from multi-subject single-cell RNA-seq data
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac286
PMID:35880426
|
研究论文 | 对18种多主体单细胞RNA测序数据中条件间差异状态检测方法进行全面比较 | 首次对多主体scRNA-seq数据中检测条件间差异状态的所有现有方法进行系统性比较 | 研究仅针对特定类型的多主体实验设计，可能不适用于所有单细胞研究场景 | 评估不同统计方法在多主体单细胞RNA测序数据中检测条件间差异状态的性能 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性差异表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪批量方法、混合模型、潜在变量模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6612 | 2025-10-06 |
SimBu: bias-aware simulation of bulk RNA-seq data with variable cell-type composition
2022-09-16, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac499
PMID:36124800
|
研究论文 | 开发了一个名为SimBu的R软件包，用于模拟具有可变细胞类型组成的bulk RNA-seq数据 | 首个能够模拟伪bulk RNA-seq数据的软件，具有独特的细胞类型特异性mRNA偏倚建模功能 | 依赖于单细胞RNA-seq数据作为输入，模拟结果的准确性受输入数据质量影响 | 为细胞类型反卷积方法评估创建计算金标准数据集 | bulk RNA-seq数据的模拟生成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | 统计模拟模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6613 | 2025-10-06 |
Processing human skin samples for single-cell assays
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101470
PMID:35769924
|
研究论文 | 本文介绍了一种从人类皮肤样本中快速分离活细胞用于单细胞测序的优化方案 | 基于Saluzzo等人(2021)的改进方案，提供了更优化的皮肤样本处理流程 | 未明确说明样本数量的统计信息或方案验证的局限性 | 开发优化的人类皮肤样本单细胞测序前处理方案 | 人类皮肤穿刺活检样本中的免疫细胞 | 单细胞测序技术 | 皮肤感染、炎症和癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq) | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 6614 | 2025-10-06 |
Biological Misinterpretation of Transcriptional Signatures in Tumor Samples Can Unknowingly Undermine Mechanistic Understanding and Faithful Alignment with Preclinical Data
2022-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1102
PMID:35792866
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤样本中转录特征可能因基质细胞影响而产生生物学误解，从而削弱临床样本与临床前数据的可靠对应关系 | 首次系统评估基质含量对基因表达特征的混淆效应，并开发了开放工具ConfoundR用于多癌种分析 | 主要关注结直肠癌，其他癌种的验证可能有限 | 评估肿瘤基质对基因表达特征解读的影响机制 | 结直肠癌样本及多种临床前模型 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 激光捕获显微切割,流式细胞术,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多区域活检临床样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 6615 | 2025-10-06 |
The spatiotemporal dynamics of microglia across the human lifespan
2022-09-12, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.07.015
PMID:35977545
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研究论文 | 本研究通过分析97例人类死后脑组织样本，揭示了小胶质细胞在人类整个生命周期中的时空动态变化 | 首次在人类大脑中系统研究小胶质细胞的发育动态，发现其在妊娠期、婴儿期和儿童期存在密度波动，并受增殖和凋亡平衡调控 | 研究基于死后组织样本，可能无法完全反映活体状态；样本数量相对有限 | 阐明小胶质细胞在人类神经发育过程中的作用机制 | 人类端脑组织中的小胶质细胞 | 神经科学 | 神经发育障碍 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 97例死后人类脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6616 | 2025-10-06 |
Spatial profiling of early primate gastrulation in utero
2022-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04953-1
PMID:35709828
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了绒猴胚胎早期原肠形成的分子机制 | 首次在子宫内对灵长类胚胎进行空间转录组分析，建立了基于高斯过程回归的3D转录组模型 | 研究仅限于绒猴模型，可能不完全代表人类发育过程 | 阐明灵长类胚胎早期原肠形成和轴模式建立的分子框架 | 绒猴胚胎和干细胞来源的胚胎模型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，干细胞培养 | 高斯过程回归 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6617 | 2025-10-06 |
Schwann cell precursors represent a neural crest-like state with biased multipotency
2022-09-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021108780
PMID:35815410
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示雪旺细胞前体具有类似神经嵴的多能性特征 | 首次通过单细胞转录组图谱证明雪旺细胞前体与迁移期神经嵴细胞具有相似的转录特征，并发现其多能性“枢纽”状态 | 研究主要基于胚胎发育阶段，对成年期雪旺细胞前体的特性需要进一步验证 | 探究雪旺细胞前体的发育特性和多能性维持机制 | 脊椎动物胚胎中的雪旺细胞前体和神经嵴细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序，CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6618 | 2025-10-06 |
Anti-GD2 Antibodies Conjugated to IL15 and IL21 Mediate Potent Antitumor Cytotoxicity against Neuroblastoma
2022-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-0717
PMID:35802683
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研究论文 | 本研究开发了两种新型免疫细胞因子hu14.18-IL15和hu14.18-IL21，并评估其在神经母细胞瘤中的抗肿瘤效果 | 首次将IL15和IL21两种γc细胞因子与hu14.18抗体连接，并与传统的hu14.18-IL2进行比较研究 | 临床前研究阶段，尚未进行人体临床试验 | 比较新型免疫细胞因子hu14.18-IL15和hu14.18-IL21与hu14.18-IL2在神经母细胞瘤中的抗体依赖性细胞介导的细胞毒性作用 | 神经母细胞瘤细胞系、患者来源异种移植模型、免疫健全小鼠模型 | 免疫治疗 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种神经母细胞瘤细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6619 | 2025-10-06 |
Highly Variable Expression of Merozoite Surface Protein MSPDBL2 in Diverse Plasmodium falciparum Clinical Isolates and Transcriptome Scans for Correlating Genes
2022-08-30, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01948-22
PMID:35950755
|
研究论文 | 本研究分析了恶性疟原虫裂殖子表面蛋白MSPDBL2在96个西非临床分离株中的表达变异及其与配子体发育相关基因的转录组关联 | 首次在多种临床分离株中系统量化MSPDBL2蛋白表达频率，发现其高度偏态分布特征，并通过转录组分析揭示其与性发育基因的关联 | 样本量有限（96个分离株），仅关注西非地区分离株，单细胞转录组分析仅使用实验室适应克隆 | 探究恶性疟原虫MSPDBL2蛋白的自然表达规律及其与寄生虫发育分化的关系 | 96个来自西非不同地区的恶性疟原虫临床分离株 | 寄生虫学 | 疟疾 | 免疫荧光显微镜，全转录组测序，单细胞转录组分析 | NA | 图像数据，转录组数据 | 96个临床分离株（来自4个西非人群），其中17个进行转录组测序 | NA | 全转录组测序，单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 6620 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-seq analysis reveals temporally-regulated and quiescence-regulated gene expression in Drosophila larval neuroblasts
2022-08-24, Neural development
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s13064-022-00163-7
PMID:36002894
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了果蝇幼虫神经母细胞中时间调控和静息状态调控的基因表达模式 | 首次在果蝇幼虫中枢神经系统中发现多个祖细胞亚型随发育时间变化的基因表达特征，并识别出静息神经母细胞对胰岛素信号通路的转录预激活状态 | 研究主要关注幼虫阶段，对胚胎期和成虫期的神经发育过程覆盖有限 | 探索发育过程中神经多样性产生的机制 | 果蝇幼虫中枢神经系统中的神经母细胞和中间祖细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个关键发育时间点的果蝇幼虫中枢神经系统样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |