单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6601 - 6620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6601 | 2025-10-06 |
A zebrafish reporter line reveals immune and neuronal expression of endogenous retrovirus
2022-04-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.048921
PMID:35142349
|
研究论文 | 本研究创建了首个斑马鱼内源性逆转录病毒报告基因系，揭示了ERV在免疫细胞和神经元中的表达模式 | 创建了首个跨物种的体内ERV报告基因系，结合活体成像、流式细胞术和单细胞RNA测序技术系统分析ERV表达 | 研究仅针对斑马鱼模型，结果向哺乳动物外推需谨慎 | 研究内源性逆转录病毒在健康和疾病中的功能 | 斑马鱼内源性逆转录病毒zferv | 发育生物学 | 自身炎症性疾病,神经系统疾病 | 活体成像,流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6602 | 2025-10-06 |
IL-22 Plays a Dual Role in the Amniotic Cavity: Tissue Injury and Host Defense against Microbes in Preterm Labor
2022-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100439
PMID:35304419
|
研究论文 | 本研究揭示了IL-22在羊膜腔中具有组织损伤和宿主防御微生物的双重作用 | 首次阐明IL-22在母胎界面免疫中的双重功能，发现其既能独立引起胎儿损伤导致新生儿死亡，又能参与宿主防御机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外人类系统，需要进一步验证在人类妊娠中的直接作用 | 探究IL-22在妊娠晚期母胎免疫中的作用机制 | 人类母胎界面组织、小鼠妊娠模型、羊膜液样本 | 免疫学 | 早产 | 单细胞RNA测序, 体外人类系统, 动物模型 | 小鼠妊娠模型 | 基因表达数据, 临床样本数据 | 人类早产妇女样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6603 | 2025-10-06 |
Differential assembly diversifies GABAA receptor structures and signalling
2022-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04517-3
PMID:35355020
|
研究论文 | 通过冷冻电镜揭示GABAA受体通过差异组装形成不同结构和信号转导特性的机制 | 首次发现GABAA受体存在四种不同的亚基组成和排列方式，并证明某些构型可作为同时响应GABA和组胺的共检测器 | 研究主要关注特定亚基组合，尚未完全揭示所有可能的受体组装形式 | 探索GABAA受体亚基组装规律及其对信号转导的影响 | 由α4、β3、δ和γ2亚基组成的GABAA受体 | 结构生物学 | 神经系统疾病 | 冷冻电镜、单细胞RNA测序、组装模拟 | NA | 结构数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6604 | 2025-10-06 |
Using topic modeling to detect cellular crosstalk in scRNA-seq
2022-04, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009975
PMID:35395014
|
研究论文 | 提出基于主题建模的新方法检测单细胞RNA测序中的细胞间相互作用 | 首次将潜在狄利克雷分配(LDA)模型应用于单细胞RNA测序数据，无需依赖配体-受体先验知识即可检测细胞相互作用 | 方法在非专门设计捕获相互作用细胞的标准液滴协议数据集中的适用性有待进一步验证 | 开发不依赖先验知识的细胞间相互作用检测方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 主题建模 | LDA | 基因表达数据 | 多个合成数据集和两个物理相互作用细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 液滴式单细胞测序协议 |
| 6605 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals a distinct developmental state of KMT2A-rearranged infant B-cell acute lymphoblastic leukemia
2022-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-01720-7
PMID:35288693
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示KMT2A重排婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病的独特发育状态 | 首次发现KMT2A重排婴儿B-ALL主要由早期淋巴细胞前体状态主导，并揭示其具有可靶向的混合髓系-淋巴系特征 | 研究样本量有限，主要聚焦于婴儿B-ALL特定亚型 | 探究KMT2A重排婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病的发育状态和细胞起源 | 婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病细胞，特别是KMT2A重排列亚型 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, mRNA荟萃分析 | NA | 转录组数据, 流式细胞数据 | 未明确具体样本数量，包含婴儿B-ALL患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6606 | 2025-10-06 |
Defining the early stages of intestinal colonisation by whipworms
2022-04-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29334-0
PMID:35365634
|
研究论文 | 本研究通过小鼠鞭虫感染模型和盲肠类器官系统揭示了鞭虫早期肠道定植机制 | 首次建立鞭虫感染的体外类器官模型，揭示了幼虫通过降解黏液层并形成多细胞内隧道建立感染的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类感染机制可能有所不同 | 阐明鞭虫早期肠道定植的细胞和分子机制 | 鞭虫幼虫、小鼠肠道组织、盲肠类器官 | 寄生虫学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序, 类器官培养 | NA | 基因表达数据, 显微图像 | 小鼠感染模型和体外类器官系统 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6607 | 2025-10-06 |
Human Retinal Organoids Provide a Suitable Tool for Toxicological Investigations: A Comprehensive Validation Using Drugs and Compounds Affecting the Retina
2022-03-17, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szab010
PMID:35298655
|
研究论文 | 本研究验证了人类多能干细胞衍生的视网膜类器官在药物毒性筛选中的适用性 | 首次提供视网膜类器官适用于毒理学研究的可靠实验证据，证明其药物反应与体内模型和人类相似 | 仅测试了六种已知视网膜毒性化合物，需要更多化合物验证 | 验证人类视网膜类器官作为毒性筛选平台的适用性 | 人类多能干细胞衍生的视网膜类器官 | 毒理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个人类多能干细胞系分化的视网膜类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6608 | 2025-10-06 |
Lysosomal exocytosis of HSP70 stimulates monocytic BMP6 expression in Sjögren's syndrome
2022-03-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI152780
PMID:35113815
|
研究论文 | 本研究揭示了LAMP3/HSP70/BMP6轴在干燥综合征唾液腺功能障碍中的新机制 | 首次发现LAMP3通过溶酶体胞吐释放HSP70，进而刺激单核细胞表达BMP6的致病轴 | 机制研究主要基于体外实验，需要更多体内验证 | 探究干燥综合征中BMP6细胞因子产生的上游调控机制 | 干燥综合征患者唾液腺组织、人外周血单核细胞、小鼠模型 | 免疫学 | 干燥综合征 | RNA原位杂交,RNA测序,单细胞转录组学,逆转录PCR | NA | 基因表达数据,转录组数据 | 干燥综合征患者唾液腺组织、人PBMCs、小鼠模型 | NA | 单细胞转录组学,RNA测序 | NA | NA |
| 6609 | 2025-10-06 |
A Phase II Study of Pembrolizumab in Combination with Capecitabine and Oxaliplatin with Molecular Profiling in Patients with Advanced Biliary Tract Carcinoma
2022-03-11, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyab073
PMID:35274717
|
研究论文 | 评估帕博利珠单抗联合卡培他滨和奥沙利铂治疗晚期胆道癌的II期临床研究 | 首次在晚期胆道癌中探索免疫检查点抑制剂联合化疗的疗效，并整合分子谱分析研究免疫标志物表达和肿瘤进化 | 样本量较小（仅11例患者），单臂研究设计缺乏对照组 | 评估帕博利珠单抗联合CAPOX方案在晚期胆道癌患者的反应率和临床疗效 | 经组织学确诊的晚期胆道癌成年患者 | 临床肿瘤学 | 胆道癌 | 免疫组织化学、转录组测序、外显子组测序、单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、分子谱数据 | 11例患者（其中3例未接受过系统治疗） | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 外显子组测序 | NA | NA |
| 6610 | 2025-10-06 |
FlyPhoneDB: an integrated web-based resource for cell-cell communication prediction in Drosophila
2022-03-03, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyab235
PMID:35100387
|
研究论文 | 开发了用于果蝇细胞间通讯预测的集成网络资源FlyPhoneDB | 首次为果蝇创建了高可信度配体-受体对列表和细胞间通讯预测工具 | 目前仅适用于果蝇，尚未扩展到其他无脊椎动物 | 开发果蝇细胞间通讯预测的计算工具 | 果蝇单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 量化算法 | 转录组数据 | 果蝇成虫中肠、腹部和血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6611 | 2025-10-06 |
Systematic reconstruction of cellular trajectories across mouse embryogenesis
2022-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01018-x
PMID:35288709
|
研究论文 | 通过整合多个单细胞RNA测序数据集，系统重建了小鼠胚胎发生过程中的细胞轨迹 | 构建了跨越小鼠原肠胚形成和器官发生的全面细胞轨迹图谱，提出了哺乳动物胚胎发生的轨迹图 | 基于自动化程序构建的轨迹图可能不完全反映真实的发育过程 | 系统重建小鼠胚胎发生过程中的细胞发育轨迹 | 小鼠胚胎细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 有向无环图 | 单细胞转录组数据 | 约150,000个细胞核，覆盖E3.5到E13.5的19个连续阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6612 | 2025-10-06 |
Diversification of multipotential postmitotic mouse retinal ganglion cell precursors into discrete types
2022-02-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.73809
PMID:35191836
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠视网膜神经节细胞前体细胞从多能状态分化为约45种离散类型的分子机制 | 首次证明视网膜神经节细胞的转录组类型身份不是在细胞分裂退出时确定的，而是通过有丝分裂后多能前体细胞的逐渐、异步限制获得的 | 研究仅限于小鼠模型，人类视网膜神经节细胞分化机制可能有所不同 | 探究单个神经元类别如何分化为多种类型的分子机制 | 小鼠视网膜神经节细胞前体细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 最优输运推断 | 单细胞转录组数据 | 小鼠视网膜神经节细胞前体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6613 | 2025-10-06 |
Mapping the biogenesis of forward programmed megakaryocytes from induced pluripotent stem cells
2022-02-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj8618
PMID:35171685
|
研究论文 | 本研究开发了从多能干细胞生产巨核细胞的系统，并通过单细胞RNA测序绘制了体外与体内巨核细胞祖细胞状态的对应关系 | 首次识别出五个能够重复纯化巨核细胞祖细胞的表面标志物，并揭示了其转录和表观遗传特征 | 研究中使用的表面标志物在传统方法中无法识别巨核细胞祖细胞，且体外状态与体内状态的对应关系先前不明确 | 开发血小板前体细胞的生产系统并阐明巨核细胞祖细胞的生物学特性 | 诱导多能干细胞分化的巨核细胞和巨核细胞祖细胞 | 单细胞生物学 | 血小板减少症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6614 | 2025-10-06 |
Mapping transcriptomic vector fields of single cells
2022-02-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.045
PMID:35108499
|
研究论文 | 开发了dynamo分析框架，可从单细胞RNA测序数据推断RNA绝对速度、重建细胞命运向量场并预测基因扰动效果 | 克服传统基于剪接的RNA速度分析的基本限制，引入微分几何分析揭示调控机制，利用最小作用路径方法预测细胞命运转变驱动因子 | NA | 开发能够揭示调控功能的动力学模型，推进细胞状态转变的定量和预测理论 | 人类造血系统单细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA速度分析，代谢标记 | 微分几何模型，最小作用路径方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6615 | 2025-10-06 |
Discordant Genome Assemblies Drastically Alter the Interpretation of Single-Cell RNA Sequencing Data Which Can Be Mitigated by a Novel Integration Method
2022-02-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11040608
PMID:35203259
|
研究论文 | 本研究揭示了不同基因组组装版本对单细胞RNA测序数据解读的显著影响，并提出了一种新的整合方法以缓解此问题 | 首次系统评估不同基因组组装对scRNAseq数据解读的影响，并提出多基因组组装对齐与数据集成的创新方法 | 研究主要关注非模式生物，在模式生物中的适用性需要进一步验证 | 解决多基因组组装版本对单细胞RNA测序数据解读的一致性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6616 | 2025-10-06 |
Complement activation induces excessive T cell cytotoxicity in severe COVID-19
2022-02-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.040
PMID:35032429
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术发现严重COVID-19中补体激活诱导CD16 T细胞产生过度细胞毒性 | 首次发现CD16 T细胞在COVID-19中具有免疫复合物介导的T细胞受体非依赖性细胞毒性功能 | 研究样本量有限，需要更大规模验证 | 探究严重COVID-19中T细胞的致病机制 | COVID-19患者的T细胞和微血管内皮细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学, 单细胞蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | COVID-19患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 6617 | 2025-10-06 |
Human embryonic genome activation initiates at the one-cell stage
2022-02-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.11.012
PMID:34936886
|
研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞RNA测序揭示了人类胚胎基因组激活在一细胞阶段即已开始 | 发现人类胚胎转录在一细胞阶段就开始启动，比传统认为的八细胞阶段更早 | 研究样本类型有限，主要关注正常和异常原核形态的胚胎 | 确定人类胚胎基因组激活的确切时间和表达特征 | 人类中期II卵母细胞和双原核一细胞胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类卵母细胞和一细胞胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6618 | 2025-10-06 |
Urine Single-Cell RNA Sequencing in Focal Segmental Glomerulosclerosis Reveals Inflammatory Signatures
2022-Feb, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2021.11.005
PMID:35155868
|
研究论文 | 通过尿液单细胞RNA测序分析局灶节段性肾小球硬化症患者的炎症特征 | 首次在FSGS患者尿液中鉴定出单细胞亚型和足细胞上皮-间质转化特征基因 | 样本量较小（12名患者，17份尿液样本），缺乏纵向随访数据 | 探索尿液细胞分子特征作为肾病综合征诊断和预后工具的潜力 | 局灶节段性肾小球硬化症患者的尿液细胞 | 单细胞组学 | 肾病综合征/局灶节段性肾小球硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12名FSGS患者的17份尿液样本，捕获为23个尿液细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6619 | 2025-10-06 |
Tumor-specific T cells support chemokine-driven spatial organization of intratumoral immune microaggregates needed for long survival
2022-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004346
PMID:35217577
|
研究论文 | 本研究通过多模态分析揭示了肿瘤特异性T细胞通过分泌趋化因子驱动肿瘤内免疫微聚集体的空间组织，从而促进长期生存的机制 | 首次在头颈鳞癌中系统解析了免疫应答阳性患者肿瘤微环境的空间组织结构特征，发现肿瘤特异性T细胞通过分泌CCL4和LTB等趋化因子形成正反馈环路 | 研究样本量相对有限，主要聚焦于口咽鳞状细胞癌，结论在其他癌种中的普适性需要进一步验证 | 解析与肿瘤特异性T细胞应答相关的肿瘤免疫微环境蓝图特征 | 口咽鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理 | 头颈癌 | bulk RNA测序,成像质谱流式,单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | 空间相互作用分析 | 基因表达数据,空间表型数据,单细胞转录组数据 | 前瞻性口咽鳞癌队列患者 | NanoString,Fluidigm,10x Genomics | bulk RNA测序,成像质谱流式,单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NanoString nCounter,Hyperion,10x Chromium | NanoString基因表达分析,Hyperion组织成像系统,10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 6620 | 2025-10-06 |
The threat of programmed DNA damage to neuronal genome integrity and plasticity
2022-02, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-01001-y
PMID:35145299
|
综述 | 探讨神经元中程序性DNA损伤对基因组完整性和可塑性的威胁及其修复机制 | 提出神经元程序性DNA断裂的新范式，揭示其与生理代谢过程及神经退行性疾病的关联 | 程序性DNA断裂在神经元生理和疾病中的作用尚未充分探索 | 研究神经元DNA修复机制以保护基因组免受程序性断裂的错误影响 | 神经元基因组 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序, bulk测序 | NA | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞测序, bulk测序 | NA | NA |