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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6601 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals activation of core transcription factors in PRC2-deficient malignant peripheral nerve sheath tumor
2022-09-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111363
PMID:36130486
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示PRC2缺陷型恶性外周神经鞘瘤中核心转录因子的激活机制 | 发现PRC2缺失通过双重致癌机制:重塑二价染色质和增强子景观,同时降低I型干扰素信号和抗原呈递 | NA | 阐明PRC2缺失在恶性外周神经鞘瘤中的致癌机制 | PRC2缺陷型恶性外周神经鞘瘤细胞和正常雪旺细胞 | 单细胞测序 | 恶性外周神经鞘瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
6602 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics identifies conserved regulators of neuroglandular lineages
2022-09-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111370
PMID:36130520
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了刺胞动物神经和腺体细胞谱系的共同起源和调控机制 | 首次在刺胞动物中证明神经元、刺细胞和腺细胞来源于共同的多能祖细胞群体,并鉴定SoxC为神经腺体谱系的关键上游调控因子 | 研究仅针对一种刺胞动物模型,在其他物种中的保守性需要进一步验证 | 探究神经系统分泌细胞类型的进化起源和发育调控机制 | 海葵Nematostella vectensis的神经腺体细胞谱系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 转基因技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 海葵从胚胎到成体的多个发育阶段样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6603 | 2025-10-06 |
Benchmarking methods for detecting differential states between conditions from multi-subject single-cell RNA-seq data
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac286
PMID:35880426
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研究论文 | 对18种多主体单细胞RNA测序数据中条件间差异状态检测方法进行全面比较 | 首次对多主体scRNA-seq数据中检测条件间差异状态的所有现有方法进行系统性比较 | 研究仅针对特定类型的多主体实验设计,可能不适用于所有单细胞研究场景 | 评估不同统计方法在多主体单细胞RNA测序数据中检测条件间差异状态的性能 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性差异表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪批量方法、混合模型、潜在变量模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6604 | 2025-10-06 |
SimBu: bias-aware simulation of bulk RNA-seq data with variable cell-type composition
2022-09-16, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac499
PMID:36124800
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研究论文 | 开发了一个名为SimBu的R软件包,用于模拟具有可变细胞类型组成的bulk RNA-seq数据 | 首个能够模拟伪bulk RNA-seq数据的软件,具有独特的细胞类型特异性mRNA偏倚建模功能 | 依赖于单细胞RNA-seq数据作为输入,模拟结果的准确性受输入数据质量影响 | 为细胞类型反卷积方法评估创建计算金标准数据集 | bulk RNA-seq数据的模拟生成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | 统计模拟模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
6605 | 2025-10-06 |
Processing human skin samples for single-cell assays
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101470
PMID:35769924
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研究论文 | 本文介绍了一种从人类皮肤样本中快速分离活细胞用于单细胞测序的优化方案 | 基于Saluzzo等人(2021)的改进方案,提供了更优化的皮肤样本处理流程 | 未明确说明样本数量的统计信息或方案验证的局限性 | 开发优化的人类皮肤样本单细胞测序前处理方案 | 人类皮肤穿刺活检样本中的免疫细胞 | 单细胞测序技术 | 皮肤感染、炎症和癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq) | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
6606 | 2025-10-06 |
Biological Misinterpretation of Transcriptional Signatures in Tumor Samples Can Unknowingly Undermine Mechanistic Understanding and Faithful Alignment with Preclinical Data
2022-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1102
PMID:35792866
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤样本中转录特征可能因基质细胞影响而产生生物学误解,从而削弱临床样本与临床前数据的可靠对应关系 | 首次系统评估基质含量对基因表达特征的混淆效应,并开发了开放工具ConfoundR用于多癌种分析 | 主要关注结直肠癌,其他癌种的验证可能有限 | 评估肿瘤基质对基因表达特征解读的影响机制 | 结直肠癌样本及多种临床前模型 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 激光捕获显微切割,流式细胞术,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多区域活检临床样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
6607 | 2025-10-06 |
The spatiotemporal dynamics of microglia across the human lifespan
2022-09-12, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.07.015
PMID:35977545
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研究论文 | 本研究通过分析97例人类死后脑组织样本,揭示了小胶质细胞在人类整个生命周期中的时空动态变化 | 首次在人类大脑中系统研究小胶质细胞的发育动态,发现其在妊娠期、婴儿期和儿童期存在密度波动,并受增殖和凋亡平衡调控 | 研究基于死后组织样本,可能无法完全反映活体状态;样本数量相对有限 | 阐明小胶质细胞在人类神经发育过程中的作用机制 | 人类端脑组织中的小胶质细胞 | 神经科学 | 神经发育障碍 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 97例死后人类脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
6608 | 2025-10-06 |
Spatial profiling of early primate gastrulation in utero
2022-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04953-1
PMID:35709828
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了绒猴胚胎早期原肠形成的分子机制 | 首次在子宫内对灵长类胚胎进行空间转录组分析,建立了基于高斯过程回归的3D转录组模型 | 研究仅限于绒猴模型,可能不完全代表人类发育过程 | 阐明灵长类胚胎早期原肠形成和轴模式建立的分子框架 | 绒猴胚胎和干细胞来源的胚胎模型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,干细胞培养 | 高斯过程回归 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
6609 | 2025-10-06 |
Schwann cell precursors represent a neural crest-like state with biased multipotency
2022-09-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021108780
PMID:35815410
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示雪旺细胞前体具有类似神经嵴的多能性特征 | 首次通过单细胞转录组图谱证明雪旺细胞前体与迁移期神经嵴细胞具有相似的转录特征,并发现其多能性“枢纽”状态 | 研究主要基于胚胎发育阶段,对成年期雪旺细胞前体的特性需要进一步验证 | 探究雪旺细胞前体的发育特性和多能性维持机制 | 脊椎动物胚胎中的雪旺细胞前体和神经嵴细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序,CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6610 | 2025-10-06 |
Anti-GD2 Antibodies Conjugated to IL15 and IL21 Mediate Potent Antitumor Cytotoxicity against Neuroblastoma
2022-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-0717
PMID:35802683
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研究论文 | 本研究开发了两种新型免疫细胞因子hu14.18-IL15和hu14.18-IL21,并评估其在神经母细胞瘤中的抗肿瘤效果 | 首次将IL15和IL21两种γc细胞因子与hu14.18抗体连接,并与传统的hu14.18-IL2进行比较研究 | 临床前研究阶段,尚未进行人体临床试验 | 比较新型免疫细胞因子hu14.18-IL15和hu14.18-IL21与hu14.18-IL2在神经母细胞瘤中的抗体依赖性细胞介导的细胞毒性作用 | 神经母细胞瘤细胞系、患者来源异种移植模型、免疫健全小鼠模型 | 免疫治疗 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种神经母细胞瘤细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6611 | 2025-10-06 |
Highly Variable Expression of Merozoite Surface Protein MSPDBL2 in Diverse Plasmodium falciparum Clinical Isolates and Transcriptome Scans for Correlating Genes
2022-08-30, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01948-22
PMID:35950755
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研究论文 | 本研究分析了恶性疟原虫裂殖子表面蛋白MSPDBL2在96个西非临床分离株中的表达变异及其与配子体发育相关基因的转录组关联 | 首次在多种临床分离株中系统量化MSPDBL2蛋白表达频率,发现其高度偏态分布特征,并通过转录组分析揭示其与性发育基因的关联 | 样本量有限(96个分离株),仅关注西非地区分离株,单细胞转录组分析仅使用实验室适应克隆 | 探究恶性疟原虫MSPDBL2蛋白的自然表达规律及其与寄生虫发育分化的关系 | 96个来自西非不同地区的恶性疟原虫临床分离株 | 寄生虫学 | 疟疾 | 免疫荧光显微镜,全转录组测序,单细胞转录组分析 | NA | 图像数据,转录组数据 | 96个临床分离株(来自4个西非人群),其中17个进行转录组测序 | NA | 全转录组测序,单细胞转录组分析 | NA | NA |
6612 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-seq analysis reveals temporally-regulated and quiescence-regulated gene expression in Drosophila larval neuroblasts
2022-08-24, Neural development
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s13064-022-00163-7
PMID:36002894
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了果蝇幼虫神经母细胞中时间调控和静息状态调控的基因表达模式 | 首次在果蝇幼虫中枢神经系统中发现多个祖细胞亚型随发育时间变化的基因表达特征,并识别出静息神经母细胞对胰岛素信号通路的转录预激活状态 | 研究主要关注幼虫阶段,对胚胎期和成虫期的神经发育过程覆盖有限 | 探索发育过程中神经多样性产生的机制 | 果蝇幼虫中枢神经系统中的神经母细胞和中间祖细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个关键发育时间点的果蝇幼虫中枢神经系统样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6613 | 2025-10-06 |
Neuropeptides and small-molecule amine transmitters: cooperative signaling in the nervous system
2022-Aug-23, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04451-7
PMID:35997826
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综述 | 本文综述了神经肽与小分子胺类递质在神经系统中的协同信号传导机制 | 系统整合神经肽与经典递质的协同作用机制,为开发基于神经肽的神经治疗策略提供新视角 | 主要基于现有文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 探讨神经肽与小分子胺类递质在神经系统中的协同信号传导机制 | 哺乳动物大脑中的神经肽和小分子胺类递质 | 神经生物学 | NA | 单细胞转录组学、药理学实验、基因功能缺失与获得实验 | NA | 文本数据(文献综述) | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6614 | 2025-10-06 |
Pituitary adenomas evade apoptosis via noxa deregulation in Cushing's disease
2022-08-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111223
PMID:36001971
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了库欣病垂体腺瘤通过noxa失调逃避凋亡的机制 | 首次在库欣病垂体腺瘤中发现PMAIP1基因启动子低甲基化与转录上调但noxa蛋白下调的悖论现象 | 样本量有限(34例患者中25例),缺乏正常人类垂体腺体外模型 | 探究库欣病垂体腺瘤逃避细胞凋亡的分子机制 | 人类库欣病垂体腺瘤组织及邻近正常腺体组织 | 单细胞基因组学 | 库欣病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, DNA甲基化分析, qRT-PCR, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | 34例患者中的25例配对样本(腺瘤与邻近正常组织),共27,594个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, DNA甲基化分析 | NA | NA |
6615 | 2025-10-06 |
Systematic exploration of dynamic splicing networks reveals conserved multistage regulators of neurogenesis
2022-08-18, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2022.06.036
PMID:35914530
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研究论文 | 本研究通过筛选策略发现调控哺乳动物神经发生过程中动态剪接事件的关键因子 | 发现Rbm38和Puf60这两个先前未知的神经发生调控因子,并揭示Puf60中保守的神经差异性外显子如何重塑共因子相互作用 | NA | 探索发育转变过程中功能协调剪接程序的控制因素 | 小鼠神经发生过程中的动态剪接事件 | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6616 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Reveals the Range of Transcriptional States of Circulating Human Neutrophils
2022-08-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200154
PMID:35858733
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示人类循环中性粒细胞的转录状态异质性 | 开发改进的数据分析流程显著提高中性粒细胞检测效率,首次系统描述循环中性粒细胞在四个可重复转录簇中的分布规律 | 仅针对健康人群外周血中性粒细胞进行研究,未涉及疾病状态下的变化 | 探索人类循环中性粒细胞的转录异质性特征 | 人类外周血中性粒细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 健康人类受试者的外周血中性粒细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6617 | 2025-10-06 |
Differentiation of crescent-forming kidney progenitor cells into podocytes attenuates severe glomerulonephritis in mice
2022-08-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abg3277
PMID:35947676
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研究论文 | 本研究揭示了新月体肾小球肾炎中新月体形成的细胞来源机制,并证明组蛋白去乙酰化酶抑制剂panobinostat可通过促进肾脏祖细胞向足细胞分化来缓解疾病 | 首次发现新月体来源于单个未成熟壁层上皮细胞的克隆扩增,并证实panobinostat可诱导未成熟壁层上皮细胞亚群向足细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型,人类细胞仅进行了体外实验 | 探究新月体肾小球肾炎的分子机制和治疗策略 | Pax2Cre报告基因小鼠模型、人类肾脏祖细胞 | 肾脏病学 | 新月体肾小球肾炎 | 单细胞RNA测序, 三维共聚焦显微镜, 受激发射损耗超分辨率成像 | NA | 基因表达数据, 显微镜图像 | 两种小鼠模型和人类细胞体外实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6618 | 2025-10-06 |
SMaSH: a scalable, general marker gene identification framework for single-cell RNA-sequencing
2022-Aug-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04860-2
PMID:35941549
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研究论文 | 提出一种可扩展的通用标记基因识别框架SMaSH,用于单细胞RNA测序数据分析 | 首个强调针对特定细胞表型进行下游研究的标记基因计算方法,在空间转录组学数据中验证了其识别高度局部化细胞区室的能力 | NA | 开发高效可靠的计算框架来识别细胞类型特异性标记基因 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 基因表达数据 | 数十万细胞,跨越50多种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
6619 | 2025-10-06 |
Transcriptional variability accelerates preleukemia by cell diversification and perturbation of protein synthesis
2022-08-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn4886
PMID:35921412
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研究论文 | 本研究探讨转录变异性通过细胞多样化和蛋白质合成扰动加速前白血病进展的机制 | 首次揭示转录变异性通过破坏核糖体生物发生和蛋白质合成促进白血病进展的新机制 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究转录变异性在白血病前期向白血病转变过程中的作用机制 | 具有增强转录变异性的小鼠前白血病细胞 | 单细胞基因组学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6620 | 2025-10-06 |
Single cell multi-omics characterise discrete human tendon cells populations that persist in vitro and on fibrous scaffolds
2022-08-02, European cells & materials
IF:3.2Q1
DOI:10.22203/eCM.v044a01
PMID:35916474
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术鉴定并表征了在体外培养和纤维支架上持续存在的人类肌腱细胞亚群 | 首次结合单细胞表面蛋白质组学和单细胞转录组学(CITE-Seq)鉴定人类肌腱细胞亚群,并发现特定细胞亚群在排列电纺纤维支架上的选择性存活 | 研究仅使用健康人类腘绳肌腱细胞,未涉及病变肌腱组织;体外培养时间较短(8天) | 确定人类肌腱细胞亚群在体外培养条件下的持续性及其对纤维支架的响应 | 健康人类腘绳肌腱细胞 | 单细胞多组学 | 肌腱疾病 | CITE-Seq, 单细胞表面蛋白质组学, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 表面蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |