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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6581 | 2025-10-06 |
Mapping the developing human immune system across organs
2022-06-03, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abo0510
PMID:35549310
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研究论文 | 通过整合九种胎儿组织的单细胞测序数据,重建了人类发育免疫系统的跨器官分布网络 | 首次系统描绘人类发育免疫系统作为跨组织分布网络的全景图谱,揭示了髓系和淋巴系细胞亚群效应功能的晚期获得机制 | 研究局限于胎儿发育阶段,未涵盖出生后免疫系统发育过程 | 重建人类发育免疫系统的跨器官分布网络 | 人类九种胎儿组织 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,抗原受体测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 九种人类胎儿组织 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
6582 | 2025-10-06 |
Molecularly defined circuits for cardiovascular and cardiopulmonary control
2022-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04760-8
PMID:35650438
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研究论文 | 通过分子和功能分析揭示小鼠心脏副交感神经控制回路的两个平行亚型 | 首次在分子层面识别出两种功能不同的脑干神经元亚型(ACV和ACP),分别对应独立的心脏控制回路和心肺协调回路 | 研究仅在小鼠模型中进行,人类系统中是否存在类似回路尚待验证 | 解析心脏副交感神经控制回路的分子和功能多样性 | 小鼠脑干疑核(Amb)中的心脏支配神经元 | 神经科学 | 心血管疾病 | 逆行神经元追踪, 单细胞RNA测序, 光遗传学, 生理学实验 | NA | 基因表达数据, 生理信号数据 | 每侧疑核约50个神经元(ACV约35个,ACP约15个) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6583 | 2025-10-06 |
Immune disease risk variants regulate gene expression dynamics during CD4+ T cell activation
2022-06, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01066-3
PMID:35618845
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析CD4+ T细胞激活过程中的基因表达动态变化及其与免疫疾病遗传风险的关联 | 首次在单细胞水平系统描绘CD4+ T细胞激活过程中基因表达的动态遗传调控,发现35%的eQTL基因在激活过程中呈现动态调控,并揭示免疫疾病风险变异显著富集于这些动态调控基因 | 研究仅针对健康个体,未直接验证在疾病状态下的调控机制;样本量相对有限(119人) | 探究遗传变异如何调控CD4+ T细胞激活过程中的基因表达动态变化及其与免疫疾病的关联机制 | CD4+ T细胞 | 单细胞基因组学 | 免疫介导疾病 | 单细胞转录组测序 | eQTL分析 | 单细胞RNA测序数据 | 119名健康个体的655,349个CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6584 | 2025-10-06 |
Transitional Anal Cells Mediate Colonic Re-epithelialization in Colitis
2022-06, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2022.02.031
PMID:35227778
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研究论文 | 本研究揭示了肛门过渡区细胞在结肠炎中介导结肠上皮再生的新机制 | 首次发现肛门过渡区细胞能够迁移至结肠损伤区域并建立永久性鳞状新上皮结构 | 研究主要基于小鼠模型,人类IBD中的验证仍需进一步研究 | 探究邻近器官上皮细胞是否参与急性结肠炎的上皮再生过程 | 转基因小鼠的结肠炎模型 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞转录组测序, 3D成像, 谱系追踪, 生物物理建模 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6585 | 2025-10-06 |
Workflow Optimization for Identification of Female Germline or Oogonial Stem Cells in Human Ovarian Cortex Using Single-Cell RNA Sequence Analysis
2022-05-27, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxac015
PMID:35263439
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研究论文 | 通过优化单细胞RNA测序分析流程,在成人卵巢皮质组织中鉴定出女性生殖系或卵原干细胞 | 优化分析工作流程参数后成功识别出与卵原干细胞基因表达谱匹配的稀有生殖系细胞,并发现成人卵巢中存在进行减数分裂I的生殖细胞证据 | 未详细说明具体优化参数和流程细节,样本量未明确说明 | 验证成人卵巢皮质组织中卵原干细胞的存在并优化鉴定方法 | 成人人类卵巢皮质组织中的细胞 | 单细胞测序分析 | 生殖生物学 | 单细胞RNA测序分析(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6586 | 2025-10-06 |
Electrical responses from human retinal cone pathways associate with a common genetic polymorphism implicated in myopia
2022-05-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2119675119
PMID:35594404
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研究论文 | 本研究通过视网膜电图分析发现人类视网膜锥细胞通路电反应与近视相关GJD2基因多态性存在关联 | 首次将GJD2基因多态性与特定视网膜锥细胞通路功能联系起来,揭示了近视发展的潜在神经机制 | 样本仅来自成年双胞胎志愿者,未包含儿童或青少年群体 | 探究近视相关基因变异对视网膜信号传导的影响机制 | 186名成年双胞胎志愿者及3名视网膜疾病患者 | 视觉神经科学 | 近视 | 视网膜电图记录,单细胞转录组分析,基因分型 | 混合线性模型 | 电生理信号,基因分型数据,转录组数据 | 186名双胞胎志愿者+3名患者 | NA | 视网膜电图,单细胞转录组测序 | NA | 国际标准ERG刺激协议 |
6587 | 2025-10-06 |
Cross-tissue immune cell analysis reveals tissue-specific features in humans
2022-05-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abl5197
PMID:35549406
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和VDJ测序分析12名成人供体16个组织的免疫细胞,揭示组织特异性免疫特征 | 开发了CellTypist机器学习工具进行快速精确的细胞类型注释,首次系统解析跨组织免疫细胞异质性 | 样本量相对有限(12名供体),组织类型覆盖范围有待扩展 | 系统解析人类不同组织中免疫细胞的异质性和组织特异性特征 | 12名成人供体的16个组织样本中的免疫细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, VDJ测序 | 机器学习 | 单细胞转录组数据, 免疫受体序列数据 | 约360,000个细胞,来自12名供体的16个组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6588 | 2025-10-06 |
A dynamic single cell-based framework for digital twins to prioritize disease genes and drug targets
2022-05-06, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01048-4
PMID:35513850
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研究论文 | 提出基于动态单细胞数据的数字孪生框架,用于优先排序疾病基因和药物靶点 | 开发了可扩展的多细胞网络模型框架,通过分析细胞类型间分子相互作用的动态变化来优先排序上游调控基因 | 模型复杂性高,缺乏线性层次结构,时间依赖性变化增加了优先排序的难度 | 建立数字孪生计算疾病模型,用于生物标志物和药物发现 | 季节性过敏性鼻炎患者的外周血单核细胞及其他炎症性疾病数据 | 计算生物学 | 过敏性鼻炎 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 多细胞网络模型 | 单细胞RNA测序数据,批量分析数据 | 季节性过敏性鼻炎患者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6589 | 2025-10-06 |
Human branching cholangiocyte organoids recapitulate functional bile duct formation
2022-05-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.04.011
PMID:35523140
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研究论文 | 本研究建立了具有分支形态的人类胆管细胞类器官模型,模拟了肝内胆管的复杂管状结构形成过程 | 首次成功培养出具有分支形态的人类胆管细胞类器官,突破了传统囊性类器官的形态限制 | 研究主要基于体外模型,需要进一步验证其在体内环境中的功能表现 | 开发更接近生理状态的人类胆管发育和疾病研究模型 | 人类胆管细胞类器官和胆管癌肿瘤类器官 | 组织工程 | 胆道疾病 | 单细胞转录组测序,功能分析 | 类器官模型 | 基因表达数据,形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6590 | 2025-10-06 |
p57Kip2 imposes the reserve stem cell state of gastric chief cells
2022-05-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.04.001
PMID:35523142
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研究论文 | 本研究揭示了p57Kip2作为胃主细胞储备干细胞状态的分子开关机制 | 首次发现p57蛋白是调控胃主细胞储备干细胞状态的分子开关,揭示了其在组织稳态和损伤修复中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类组织中验证 | 探究胃主细胞在组织稳态和损伤修复过程中的分子调控机制 | 小鼠胃主细胞 | 细胞生物学 | 胃部疾病 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,类器官培养 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6591 | 2025-10-06 |
Mapping the epithelial-immune cell interactome upon infection in the gut and the upper airways
2022-05-02, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-022-00224-x
PMID:35501398
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研究论文 | 提出一个整合计算生物学框架,模拟病毒感染如何改变上皮细胞与免疫细胞间的相互作用网络 | 开发了整合细胞内/细胞间网络与单细胞RNA-seq数据的计算框架,首次系统映射感染后上皮-免疫细胞相互作用组 | 作为概念验证研究,仅聚焦于肠道和上呼吸道上皮感染,需要进一步实验验证 | 解析病毒感染如何改变上皮-免疫细胞相互作用调控炎症反应 | SARS-CoV-2感染的人类回肠/结肠类器官和气道纤毛上皮细胞 | 计算生物学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 整合网络模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6592 | 2025-10-06 |
Replicative history marks transcriptional and functional disparity in the CD8+ T cell memory pool
2022-05, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01171-9
PMID:35393592
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研究论文 | 本研究开发了一种名为DivisionRecorder的遗传追踪方法,揭示了CD8+ T细胞记忆池中复制历史与功能差异的关系 | 首次开发了能够记录体内细胞增殖历史的遗传追踪系统,并证明复制历史可区分T细胞记忆池中的不同功能亚群 | NA | 研究复制历史与CD8+ T细胞记忆亚群形成的关系 | CD8+ T细胞记忆池 | 免疫学 | NA | 遗传追踪、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
6593 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing of human midbrain reveals glial activation and a Parkinson-specific neuronal state
2022-04-29, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awab446
PMID:34919646
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示帕金森病患者中脑的胶质细胞激活和疾病特异性神经元状态 | 生成了首个特发性帕金森病中脑单核RNA测序数据集,发现了疾病特异性神经元簇和全胶质细胞激活机制 | 样本量相对较小(6名患者和5名对照),仅使用死后组织 | 表征中脑所有细胞类型对帕金森病病理的贡献并评估细胞类型特异性风险 | 人类中脑组织 | 单细胞测序 | 帕金森病 | 单核RNA测序, 免疫标记, 激光显微切割 | NA | 单细胞转录组数据, 空间组织数据 | 6名特发性帕金森病患者和5名年龄/性别匹配对照的>41,000个单核转录组 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
6594 | 2025-10-06 |
Host cell maturation modulates parasite invasion and sexual differentiation in Plasmodium berghei
2022-04-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abm7348
PMID:35476438
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序揭示了宿主细胞成熟状态如何调控疟原虫入侵和性分化 | 首次鉴定CD71作为网织红细胞入侵的宿主受体,并发现寄生虫代谢适应宿主细胞环境,揭示了营养依赖性向性在配子体形成中的作用 | 研究使用啮齿动物疟原虫模型,结果在人类疟疾中的适用性需要进一步验证 | 探究疟原虫在造血生态位中富集的机制和宿主-寄生虫相互作用 | 啮齿动物疟原虫(Plasmodium berghei)和宿主红细胞 | 寄生虫学 | 疟疾 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6595 | 2025-10-06 |
pRB-Depleted Pluripotent Stem Cell Retinal Organoids Recapitulate Cell State Transitions of Retinoblastoma Development and Suggest an Important Role for pRB in Retinal Cell Differentiation
2022-04-29, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szac008
PMID:35325233
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研究论文 | 本研究通过建立pRB缺失的人类多能干细胞视网膜类器官模型,模拟了视网膜母细胞瘤发展过程中的细胞状态转变 | 首次发现Rb视锥细胞表达视网膜神经节细胞和水平细胞标志物,并建立了两种pRB缺失的视网膜类器官疾病模型 | 研究仅限于体外类器官模型,需要进一步体内验证 | 研究pRB在视网膜细胞分化和视网膜母细胞瘤发展中的作用 | pRB缺失的人类胚胎干细胞和患者特异性诱导多能干细胞分化的视网膜类器官 | 发育生物学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,视网膜类器官分化 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据,形态学数据 | 两种pRB缺失的干细胞系(RB1-null hESCs和RB1双等位基因突变iPSC) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6596 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq reveals cell type-specific molecular and genetic associations to lupus
2022-04-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf1970
PMID:35389781
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示狼疮患者外周血免疫细胞的分子特征和遗传关联 | 首次使用多重单细胞RNA测序技术系统分析狼疮患者外周血单核细胞,发现细胞类型特异性表达特征和遗传变异关联 | 样本量相对有限(162例患者和99例对照),仅分析外周血单核细胞 | 系统性红斑狼疮的细胞类型特异性分子机制研究 | 外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过120万个外周血单核细胞(162例患者,99例健康对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 多重单细胞RNA测序 |
6597 | 2025-10-06 |
Single-cell eQTL mapping identifies cell type-specific genetic control of autoimmune disease
2022-04-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf3041
PMID:35389779
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研究论文 | 通过单细胞eQTL图谱揭示自身免疫疾病的细胞类型特异性遗传调控机制 | 首次在单细胞水平系统绘制免疫细胞eQTL图谱,揭示等位基因效应在B细胞状态转换中的动态变化 | 仅分析健康人群外周血单个核细胞,未包含患者样本或组织特异性数据 | 解析自身免疫疾病遗传风险的细胞类型特异性机制 | 982名健康人类受试者的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化 | 单细胞转录组数据 | 1,267,758个细胞来自982名受试者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6598 | 2025-10-06 |
A zebrafish reporter line reveals immune and neuronal expression of endogenous retrovirus
2022-04-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.048921
PMID:35142349
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研究论文 | 本研究创建了首个斑马鱼内源性逆转录病毒报告基因系,揭示了ERV在免疫细胞和神经元中的表达模式 | 创建了首个跨物种的体内ERV报告基因系,结合活体成像、流式细胞术和单细胞RNA测序技术系统分析ERV表达 | 研究仅针对斑马鱼模型,结果向哺乳动物外推需谨慎 | 研究内源性逆转录病毒在健康和疾病中的功能 | 斑马鱼内源性逆转录病毒zferv | 发育生物学 | 自身炎症性疾病,神经系统疾病 | 活体成像,流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6599 | 2025-10-06 |
IL-22 Plays a Dual Role in the Amniotic Cavity: Tissue Injury and Host Defense against Microbes in Preterm Labor
2022-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100439
PMID:35304419
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研究论文 | 本研究揭示了IL-22在羊膜腔中具有组织损伤和宿主防御微生物的双重作用 | 首次阐明IL-22在母胎界面免疫中的双重功能,发现其既能独立引起胎儿损伤导致新生儿死亡,又能参与宿主防御机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外人类系统,需要进一步验证在人类妊娠中的直接作用 | 探究IL-22在妊娠晚期母胎免疫中的作用机制 | 人类母胎界面组织、小鼠妊娠模型、羊膜液样本 | 免疫学 | 早产 | 单细胞RNA测序, 体外人类系统, 动物模型 | 小鼠妊娠模型 | 基因表达数据, 临床样本数据 | 人类早产妇女样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6600 | 2025-10-06 |
Differential assembly diversifies GABAA receptor structures and signalling
2022-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04517-3
PMID:35355020
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研究论文 | 通过冷冻电镜揭示GABAA受体通过差异组装形成不同结构和信号转导特性的机制 | 首次发现GABAA受体存在四种不同的亚基组成和排列方式,并证明某些构型可作为同时响应GABA和组胺的共检测器 | 研究主要关注特定亚基组合,尚未完全揭示所有可能的受体组装形式 | 探索GABAA受体亚基组装规律及其对信号转导的影响 | 由α4、β3、δ和γ2亚基组成的GABAA受体 | 结构生物学 | 神经系统疾病 | 冷冻电镜、单细胞RNA测序、组装模拟 | NA | 结构数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |