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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2026-04-12 |
Nanoplastics Enhance F-53B Uptake and Synergistically Induce Colonic Inflammation via Activation of the B Cell Receptor Pathway
2026-Apr-08, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2026.128096
PMID:41962818
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研究论文 | 本研究探讨了纳米塑料(NPs)和微塑料(MPs)作为载体增强F-53B的摄入,并通过激活B细胞受体(BCR)信号通路协同诱导结肠炎症的机制 | 揭示了NPs相较于MPs具有更高的生物利用度,能吸附并增强F-53B的细胞内水平,并通过单细胞RNA测序首次阐明NPs与F-53B共暴露通过激活肠道B细胞的BCR-NF-κB通路促进炎症的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和Caco-2细胞系,在人体中的直接相关性尚需进一步验证;NPs和F-53B的长期暴露效应及与其他环境污染物的相互作用未涉及 | 评估纳米塑料和微塑料作为载体对持久性有机污染物F-53B的生物分布、肠道毒性及协同炎症效应的健康风险 | 20 nm纳米塑料(NPs)、2 μm微塑料(MPs)、6:2氯化多氟醚磺酸(F-53B)、Caco-2细胞系、小鼠 | 环境毒理学 | 结肠炎/肠道炎症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体外细胞毒性实验、体内生物分布分析、细胞因子表达检测 | NA | 基因表达数据、细胞毒性数据、组织病理学数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠模型和Caco-2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 642 | 2026-04-12 |
An Artificial Intelligence Optimized Hepatic Differentiation Unveils NR5A2 and AP-1 Transcriptional Regulation in Hepatic Maturation
2026-Apr-08, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.111435
PMID:41962865
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的AI工具,利用肝祖细胞的相差图像优化肝细胞分化,揭示了NR5A2和AP-1转录因子在肝细胞成熟中的关键调控作用 | 首次结合AI算法和计算基因组学优化肝细胞分化协议,无需免疫染色或谱系追踪即可提高成功率,并发现NR5A2和AP-1在肝细胞成熟中的新调控机制 | 未明确说明AI工具的具体算法细节或在不同细胞系中的普适性验证 | 优化人类多能干细胞向肝细胞样细胞的分化协议,并研究肝细胞分化的基因调控机制 | 人类多能干细胞(hPSCs)、肝祖细胞(HPCs)和肝细胞样细胞(HLCs) | 机器学习 | 肝病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学、表观基因组学 | 机器学习模型(具体未指定) | 图像(相差图像)、转录组数据、表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 643 | 2026-04-12 |
Structure-preserving multivariate hypothesis testing for mass spectrometry imaging and single-cell data
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag137
PMID:41863333
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研究论文 | 本文介绍了一种名为block-SAM的结构保持多变量假设检验方法,用于处理质谱成像和单细胞RNA测序数据,以减少假阳性发现 | 提出block-SAM方法,考虑像素或细胞的嵌套样本结构,避免传统方法因忽略此结构而导致的样本量膨胀和假阳性增加问题 | 未明确讨论方法在极端数据分布或小样本情况下的性能,且主要针对特定数据类型(MSI和scRNA-seq) | 开发一种统计方法,以更准确地识别质谱成像和单细胞RNA测序数据中的差异特征,同时保留空间或细胞分辨率 | 质谱成像数据和单细胞RNA测序数据,包括肾脏、肺、卵巢肿瘤的DESI-MSI数据以及转移性肾细胞癌的scRNA-seq数据 | 生物信息学 | 肾癌、肺癌、卵巢癌 | 质谱成像(MSI)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | block-SAM(一种多变量假设检验方法) | 图像数据(质谱成像)、基因表达数据(单细胞RNA测序) | 未明确指定具体样本数量,但涉及多个肿瘤数据集和患者比较 | NA | 质谱成像(DESI-MSI)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 644 | 2026-04-12 |
AutoGERN: single-cell RNA-seq gene regulatory network inference via explicit link modeling and adaptive architectures
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag143
PMID:41871930
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研究论文 | 本文提出了AutoGERN,一种专为单细胞RNA测序数据设计的图神经网络框架,用于推断基因调控网络 | AutoGERN通过显式建模调控信息在消息传递空间中的表达,学习链接嵌入,并采用自适应架构搜索以适应不同数据集分布 | 未在摘要中明确提及 | 开发一个能够从单细胞RNA测序数据中准确推断基因调控网络的图神经网络框架 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 645 | 2026-04-12 |
Targeted inhibition of microglial C5aR1 by PMX205 mitigates post-ischemic stroke neuroinflammation and promotes functional recovery
2026-Apr-06, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,发现并验证了靶向抑制小胶质细胞C5aR1可减轻缺血性卒中后的神经炎症并促进功能恢复 | 利用单细胞RNA测序识别缺血性卒中后小胶质细胞的关键调控因子C5aR1,并通过分子对接和体内实验验证其靶向抑制剂PMX205的治疗潜力 | 研究主要基于动物模型,其结论向临床转化的有效性仍需进一步验证 | 识别缺血性卒中后神经炎症的关键调控因子,并开发潜在的治疗靶点 | 小鼠缺血性卒中模型中的小胶质细胞 | 神经科学,生物信息学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,定量免疫印迹,分子对接,ELISA,TTC染色,TUNEL/Nissl染色,行为学测试 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据,行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 646 | 2026-04-12 |
UBTF-HSP90A-MIF stress circuit drives lenvatinib resistance and immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2026-Apr-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.04.002
PMID:41946392
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研究论文 | 本研究揭示了肝细胞癌中UBTF/HSP90A/MIF调控环路介导乐伐替尼耐药和免疫排斥的分子机制 | 首次阐明UBTF/HSP90A/MIF应激环路在肝细胞癌乐伐替尼耐药和免疫微环境重塑中的核心作用,并验证MIF作为预测生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于临床前模型,临床验证队列样本量有限,需进一步大规模临床试验验证 | 阐明肝细胞癌中乐伐替尼-PD-1联合治疗的适应性耐药和免疫排斥机制 | 肝细胞癌细胞系、患者来源类器官、异种移植模型、免疫活性小鼠模型及临床患者队列 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | RNA测序、启动子下拉实验、染色质免疫沉淀、荧光素酶报告基因检测、邻近连接分析、流式细胞术、单细胞RNA测序、多重免疫组化 | NA | 基因组学数据、转录组学数据、蛋白质组学数据、临床数据 | 配对乐伐替尼敏感和耐药HCC模型、患者来源类器官、异种移植模型、免疫活性小鼠模型及独立临床队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 647 | 2026-04-12 |
TMBIM6 enhances dopaminergic neuron survival by modulating the IRE1a pathway in Parkinson's disease
2026-Apr-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08391-5
PMID:41932887
|
研究论文 | 本研究探讨了TMBIM6通过调节IRE1a通路在帕金森病中增强多巴胺能神经元存活的作用机制 | 首次揭示了TMBIM6在帕金森病中通过直接结合并抑制IRE1a来调节内质网应激反应,从而保护多巴胺能神经元,并证明了TMBIM6/IRE1a轴作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于细胞和动物模型,人类样本数据有限,且未详细探讨TMBIM6在其他神经退行性疾病中的普遍性 | 探究TMBIM6在帕金森病多巴胺能神经元存活中的作用及其分子机制 | 多巴胺能神经元、帕金森病细胞模型、果蝇和小鼠动物模型、人类死后脑组织样本 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞RNA-seq、基因敲低、过表达、AAV介导的基因传递、药理学抑制 | NA | RNA-seq数据、蛋白质水平数据、行为学数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及细胞模型、动物模型和人类组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 648 | 2026-04-12 |
Exploring Parkinson's through the Lens of Genomics and Bioinformatics
2026-Apr-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041621
PMID:39929729
|
综述 | 本文综述了基因组学和生物信息学技术在帕金森病研究中的应用进展 | 系统总结了近三十年来基因组学技术(从风险基因鉴定到单细胞转录组学)如何革新对帕金森病分子机制的理解,并强调了细胞类型特异性失调的新发现 | 作为一篇综述文章,未提出新的原始数据或实验验证,主要基于已有研究进行归纳总结 | 探讨如何运用神经基因组学和生物信息学解析帕金森病的复杂本质,以发现新的治疗靶点 | 帕金森病的遗传位点、分子通路、细胞类型特异性失调(特别是多巴胺能神经元以外的细胞) | 生物信息学 | 帕金森病 | 基因分型、基因组测序、转录组学、单细胞转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 大规模人类群体或模式生物队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 649 | 2026-04-12 |
Spatial Transcriptomics Reveals Injured Cells, Signature Genes, and Communication Patterns in the Cyst Microenvironment of Polycystic Kidney Disease
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000894
PMID:41071604
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了多囊肾病囊肿微环境中受损细胞、特征基因及细胞通讯模式 | 首次将空间转录组学应用于多囊肾病研究,结合单细胞测序数据提升分辨率,识别了囊肿相关的基因特征和细胞通讯网络 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类疾病;空间转录组学的分辨率仍有局限 | 探究多囊肾病囊肿微环境的细胞组成、基因表达变化及细胞间通讯机制 | 野生型和Pkd1缺陷型小鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium Spatial Gene Expression平台 |
| 650 | 2026-04-12 |
Hmx2 and Dmrt2 Coordinate the Differentiation of Intercalated Cell Subtypes in Kidney
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000885
PMID:41051882
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子Hmx2和Dmrt2在调控肾脏集合管闰细胞亚型分化中的关键作用及其相互排斥的表达模式 | 首次阐明了Hmx2和Dmrt2作为相互排斥的转录因子,分别调控B型和A型闰细胞的分化命运,并发现Dmrt2缺失时Hmx3表达激活以促进B型闰细胞分化的补偿机制 | 研究未在Foxp1缺陷小鼠中通过Dmrt2敲入挽救闰细胞分化缺陷,表明可能存在其他调控通路;主要依赖小鼠模型,人类数据验证有限 | 探究转录因子Dmrt2和Hmx2在肾脏闰细胞亚型分化中的具体作用机制 | 小鼠肾脏闰细胞及其前体细胞 | 发育生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除,基因敲入 | NA | 基因表达数据,尿液酸化数据 | 小鼠模型及人类肾脏单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 651 | 2026-04-12 |
PPAR-γ suppresses macrophage senescence and allergic airway inflammation through controlling lipid metabolic pathways
2026-Apr, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106226
PMID:41864062
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞衰老在过敏性气道炎症中的致病作用,并确立了PPAR-γ作为调控巨噬细胞衰老和稳态的关键因子 | 首次通过单细胞RNA测序在过敏性哮喘模型中鉴定单核吞噬细胞的衰老特征,并利用巨噬细胞谱系特异性PPAR-γ条件敲除模型及脂质体靶向递送技术,阐明了PPAR-γ通过调控脂质代谢通路抑制巨噬细胞衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的直接适用性尚需进一步验证;靶向递送系统的长期安全性和疗效有待评估 | 探究PPAR-γ在过敏性气道炎症中通过调控巨噬细胞衰老的作用机制 | 过敏性哮喘小鼠模型、巨噬细胞(特别是肺泡巨噬细胞) | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质结合与转录组学整合分析 | 条件敲除小鼠模型(PpargΔCD11c) | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 652 | 2026-04-12 |
A single-cell and spatial transcriptomic atlas of human tuberculous constrictive pericardium
2026-Apr, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106233
PMID:41875497
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研究论文 | 本研究构建了人类结核性缩窄性心包炎的单细胞和空间转录组图谱,揭示了其细胞景观和关键的细胞间通讯网络 | 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学,结合组织学和免疫荧光技术,在空间原位解析了结核性缩窄性心包炎的细胞结构、信号通路和免疫-基质微环境 | 样本量相对较小(6例患者和3例对照),且为横断面研究,无法动态观察疾病进程 | 阐明结核性心包炎进展为纤维化缩窄性心包炎的细胞机制和细胞间通讯网络 | 手术切除的结核性缩窄性心包炎患者心包组织及正常对照心包组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 组织学, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 6名结核性缩窄性心包炎患者和3名正常对照的心包组织,共81,634个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 653 | 2026-04-12 |
Generation of spatially patterned human neural tube-like structures using microfluidic gradient devices
2026-Apr, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01266-1
PMID:41062703
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研究论文 | 本研究介绍了一种利用微流控梯度装置生成具有空间模式的人源神经管样结构的方法 | 开发了一种新型微流控梯度装置,能够在受控化学梯度下生成管状或球状的人多能干细胞集落,模拟神经管形成和区域模式化过程 | 需要研究人员具备聚二甲基硅氧烷软光刻和细胞培养经验,实验周期较长(8-41天),且神经结构类型和发育阶段影响完成时间 | 研究人类神经管形成和区域模式化,开发人类神经发育和疾病研究的模型系统 | 人多能干细胞 | 生物医学工程 | NA | 微流控技术、软光刻技术、免疫荧光染色、单细胞测序 | 微流控神经管样结构模型、微流控前脑样结构模型 | 图像数据、测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 654 | 2026-04-12 |
Spatial Transcriptomics of the Cyst Microenvironment in an Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease Model
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001050
PMID:41920711
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 655 | 2026-04-12 |
Single-Cell Profiling Reveals RAB13+ Endothelial Cells and Profibrotic Mesenchymal Cells in Aged Human Bone Marrow
2026-Apr, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70475
PMID:41954292
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类骨髓中衰老相关的内皮细胞和间充质细胞的转录变化,包括RAB13+内皮细胞亚群和促纤维化间充质细胞 | 识别出衰老个体中新型的RAB13+动脉内皮细胞亚群,并发现THY1促纤维化间充质细胞亚群在衰老过程中的作用 | NA | 探索人类骨髓微环境在衰老过程中的分子变化 | 人类骨髓内皮细胞和间充质基质细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光成像,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 656 | 2026-04-12 |
Multiscale domain identification for spatial transcriptomics via persistent homology
2026-Mar-30, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101376
PMID:41916308
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研究论文 | 本研究提出了一种基于持续同调的多尺度空间域识别方法,用于分析空间转录组数据 | 首次将拓扑数据分析(TDA)中的持续同调方法应用于空间转录组学,能够识别跨多个形态尺度的组织空间结构 | 未明确说明方法对计算资源的需求及在处理超大规模数据集时的可扩展性 | 开发能够识别多尺度空间域的算法,以更全面地解析组织结构的层次性 | 空间转录组数据中的基因表达空间模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 持续同调(拓扑数据分析) | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 657 | 2026-04-12 |
Amygdalin alleviates MAFLD via inhibiting cytoplasmic calcium ion overload-induced liver sinusoidal endothelial cell defenestration
2026-Mar-28, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158135
PMID:41962269
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研究论文 | 本研究通过质谱分析鉴定苦杏仁苷为桃仁的关键活性成分,并利用高脂饮食诱导的MAFLD小鼠模型和原代肝窦内皮细胞,结合单细胞RNA测序和代谢组学分析,揭示了苦杏仁苷通过抑制IP3诱导的胞质钙离子过载来改善肝窦内皮细胞窗孔化,从而缓解代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 首次系统鉴定苦杏仁苷为桃仁缓解MAFLD的关键活性成分,并整合单细胞转录组和代谢组学揭示了其通过调控花生四烯酸代谢和内质网钙信号通路来改善肝窦内皮细胞窗孔化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人体中进行验证;对苦杏仁苷的具体分子靶点及其长期安全性仍需进一步探索 | 鉴定桃仁中缓解MAFLD的关键活性成分并阐明其作用机制 | 高脂饮食诱导的MAFLD小鼠模型和原代肝窦内皮细胞 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 质谱分析、单细胞RNA测序、非靶向代谢组学分析、扫描电子显微镜、钙离子染色 | NA | 图像、文本 | 高脂饮食诱导的MAFLD小鼠模型及原代肝窦内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 658 | 2026-04-12 |
Hh and EGFR-Ras signaling promote distinct steps of tumor progression in the Drosophila follicle epithelium
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70844-y
PMID:41876551
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学与遗传学、成像分析,探究EGFR-Ras和Hedgehog信号通路在果蝇滤泡干细胞谱系稳态中的作用 | 首次揭示Hedgehog信号同时维持未分化状态并通过激活Zfh1诱导分化,EGFR-Ras过激活通过Pointed和E2f1引起细胞周期缺陷,双通路共激活导致肿瘤样生长 | 研究基于果蝇模型,在哺乳动物系统中的普适性需进一步验证 | 探究EGFR-Ras和Hedgehog信号通路在组织稳态和肿瘤发生中的作用机制 | 果蝇滤泡上皮干细胞谱系 | 发育生物学与肿瘤生物学 | 肿瘤发生 | 单细胞RNA-seq, 遗传学分析, 成像分析 | 果蝇遗传模型 | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 659 | 2026-04-12 |
Myeloid-derived immunosuppression of chimeric antigen receptor T cells in the neuronal microenvironment of glioblastoma
2026-Mar-13, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04783-2
PMID:41827001
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研究论文 | 本研究利用人脑切片模型探究了CAR-T细胞在胶质母细胞瘤微环境中的免疫抑制机制 | 首次在保留复杂肿瘤微环境的人脑切片模型中,结合单细胞测序和空间转录组学技术,系统分析了CAR-T细胞与胶质母细胞瘤生态系统的相互作用 | 研究基于体外脑切片模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的动态变化 | 探究胶质母细胞瘤微环境中CAR-T细胞快速失效的机制 | NKG2D CAR-T细胞与胶质母细胞瘤微环境中的免疫细胞及肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | PIC-seq, 空间转录组学, 基因调控网络重建 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 660 | 2026-04-12 |
Expression of CD25 in human lung mast cells and its regulation by IL-33
2026-Mar-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.03.003
PMID:41825599
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研究论文 | 本研究探讨了IL-33对人类肺肥大细胞中CD25表达的调控作用 | 首次揭示了IL-33在正常成熟组织驻留肥大细胞中调控CD25表达的机制,并利用单细胞RNA测序数据识别了IL2RA+肥大细胞亚群 | 研究主要基于体外实验和公开数据集,体内功能验证可能有限 | 研究IL-33对肺肥大细胞CD25表达的调控及其在免疫反应中的作用 | 纯化的人类肺肥大细胞 | 免疫学 | 肺部炎症 | RNA测序,实时定量PCR,流式细胞术,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |