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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2025-10-05 |
Impact of Data Quality on Deep Learning Prediction of Spatial Transcriptomics from Histology Images
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.04.674228
PMID:40964396
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研究论文 | 研究数据质量对从组织学图像预测空间转录组学的深度学习模型性能的影响 | 首次系统评估分子数据和图像数据质量对空间转录组学预测模型的影响，而非仅关注模型架构改进 | 插补方法提供的改进有限且无法泛化到测试集之外 | 探索数据质量对基于深度学习的空间基因表达预测性能的影响 | 空间转录组学数据和H&E染色组织学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，深度学习 | 深度学习模型 | 图像，基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium, Visium | 成像技术(Xenium)与测序技术(Visium)的空间转录组学平台 |
| 642 | 2025-10-05 |
Spatial Transcriptomics to Study Virus-Host Interactions
2025-Sep, Annual review of virology
IF:8.1Q1
|
综述 | 探讨空间转录组学在研究病毒-宿主相互作用及其在病毒致病机制研究中的变革潜力 | 强调空间转录组技术对病毒致病机制研究的变革性潜力，解析相关技术细节与实施方法 | NA | 开发新型抗病毒疗法和诱导保护性免疫的策略 | 植物、动物和人类中的病毒性疾病 | 空间转录组学 | 病毒性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 643 | 2025-10-05 |
SWIFT-seq enables comprehensive single-cell transcriptomic profiling of circulating tumor cells in multiple myeloma and its precursors
2025-Sep, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-01006-0
PMID:40781193
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研究论文 | 开发了一种名为SWIFT-seq的单细胞测序工作流程，用于全面分析多发性骨髓瘤及其前体病变中循环肿瘤细胞的转录组特征 | 首次建立了基于测序的CTC计数策略和CTC分类器，能够推断细胞遗传学异常，并提出了循环动力学模型 | 样本量相对有限（101例患者和健康供者），BM活检技术限制可能导致部分结果不明确 | 开发非侵入性方法用于多发性骨髓瘤的诊断、监测和预后评估 | 多发性骨髓瘤患者和健康供者的骨髓和循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，B细胞受体测序 | CTC分类器，循环动力学模型 | 单细胞转录组数据 | 101例患者和健康供者 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | NA | SWIFT-seq工作流程 |
| 644 | 2025-10-05 |
Innate immunity and the NF-κB pathway control prostate stem cell plasticity, reprogramming and tumor initiation
2025-Sep, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00994-3
PMID:40550901
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研究论文 | 本研究揭示先天免疫和NF-κB通路通过调控前列腺干细胞可塑性影响肿瘤起始机制 | 发现Pten缺失通过激活先天免疫通路诱导基底细胞重编程为hillock样状态，并首次证明NF-κB通路在此过程中的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类前列腺癌中的适用性需进一步验证 | 探索前列腺基底细胞可塑性和肿瘤起始的分子调控机制 | 前列腺基底细胞及其在Pten缺失后的命运变化 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 原位表征 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 组织学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 645 | 2025-10-05 |
Assessing the impact of perfluoroalkyl substances on liver health: a comprehensive study using multi-donor human liver spheroids
2025-Sep, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109763
PMID:40914107
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研究论文 | 本研究使用多供体人类肝脏球体模型评估全氟烷基物质对肝脏健康的影响 | 首次在多细胞类型人类肝脏球体模型中系统比较不同PFAS化合物的性别特异性肝毒性机制 | 研究仅采用体外模型，浓度固定为20μM，暴露时间较短 | 阐明不同PFAS导致人类肝脏功能障碍的具体细胞和分子机制 | 多供体人类肝脏球体模型（包含多种细胞类型） | 毒理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序，脂质染色 | 肝脏球体模型 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 多供体人类肝脏球体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 646 | 2025-10-05 |
Zebrafish optic nerve injury results in systemic retinal ganglion cell dedifferentiation
2025-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011879
PMID:40971959
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼视网膜神经节细胞在视神经损伤后的去分化现象 | 首次发现斑马鱼所有RGC亚型均对损伤具有抵抗力，并揭示其通过去分化为未成熟状态的独特生存机制 | 研究结果基于斑马鱼模型，与哺乳动物存在物种差异，临床应用前景需进一步验证 | 探索视网膜神经节细胞在视神经损伤后的分子响应机制和神经保护途径 | 斑马鱼视网膜神经节细胞 | 单细胞转录组学 | 视神经病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 647 | 2025-10-05 |
Stereo-cell: Advancing spatial single-cell biology towards clinical translation
2025-Sep, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70480
PMID:40984816
|
研究论文 | 介绍新开发的空间单细胞测序平台Stereo-cell的技术创新及其在精准医学中的应用潜力 | 开发了整合形态学、转录组学和蛋白质组学的高分辨率空间单细胞测序平台，弥合先进组学与传统病理学之间的鸿沟 | 数据整合、监管合规性和数字建模方面存在重要挑战 | 推动空间单细胞生物学向临床转化发展 | 空间单细胞生物学平台 | 空间组学 | NA | 空间单细胞测序 | NA | 形态学、转录组学、蛋白质组学数据 | NA | NA | 空间单细胞测序 | Stereo-cell | 整合形态学、转录组学和蛋白质组学的高分辨率空间单细胞测序平台 |
| 648 | 2025-10-05 |
CD103+CD8+ tissue-resident memory T lymphocytes of melanoma boost anti-tumour immunity and predict immunotherapy outcomes
2025-Sep, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70464
PMID:40985995
|
研究论文 | 本研究揭示了CD103+CD8+组织驻留记忆T细胞在黑色素瘤中的抗肿瘤作用及其作为免疫治疗疗效预测标志物的价值 | 首次系统阐明CD103作为黑色素瘤中CD8+组织驻留记忆T细胞的标志物，并揭示其通过整合素依赖的PI3K/AKT信号通路增强抗肿瘤免疫的机制 | NA | 探究CD103+CD8+组织驻留记忆T细胞在黑色素瘤抗肿瘤免疫中的作用及其作为免疫治疗预测标志物的潜力 | 黑色素瘤患者样本、CD8+组织驻留记忆T细胞、小鼠模型 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 多重免疫组织化学、单细胞RNA测序、空间转录组学、体内/体外实验 | NA | 基因表达数据、空间分布数据、临床数据 | 多个独立队列的黑色素瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 649 | 2025-10-05 |
Multi-Omics Integrated Analysis of the Protective Effect of Tertiary Lymphoid Structures and Associated Key Regulatory Genes in Human Gallbladder Cancer
2025-Sep, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.70037
PMID:40997892
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合分析探讨三级淋巴结构及其关键调控基因在人类胆囊癌中的保护作用 | 首次在胆囊癌中系统研究三级淋巴结构的预后价值，并通过单细胞RNA测序、批量RNA测序和深度学习筛选出6个TLS相关关键基因 | 样本量相对较小（85例患者），需要更大规模研究验证 | 探究三级淋巴结构在胆囊癌中的预后关联及其相关基因的调控机制 | 85例胆囊癌患者组织样本 | 生物信息学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 深度学习, 细胞实验验证 | 深度学习 | 基因表达数据, 临床数据 | 85例胆囊癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 650 | 2025-10-05 |
CREB Drives Acinar to Ductal Cells Reprogramming and Promotes Pancreatic Cancer Progression in Preclinical Models of Alcoholic Pancreatitis
2025-Aug-12, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101606
PMID:40812683
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研究论文 | 本研究探讨CREB在酒精性胰腺炎模型中驱动腺泡细胞向导管细胞重编程并促进胰腺癌进展的机制 | 首次揭示CREB与致癌Kras在慢性炎症环境下协同促进胰腺癌进展的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明CREB在酒精性胰腺炎促进胰腺癌发展中的作用机制 | 遗传修饰小鼠模型（Ptf1aCreERTM/+;LSL-KrasG12D/+）和腺泡细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 磷酸激酶阵列, 定量PCR, 谱系追踪 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学图像, 蛋白质印迹数据 | 多种遗传背景的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 651 | 2025-10-05 |
Microglia-neuron crosstalk through Hex-GM2-MGL2 maintains brain homeostasis
2025-Aug-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09477-y
PMID:40769205
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研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞通过Hex-GM2-MGL2通路与神经元进行双向通讯的新机制，维持大脑稳态 | 发现了一种先前未知的小胶质细胞与神经元相互作用模式，即小胶质细胞向神经元递送β-己糖胺酶以降解GM2神经节苷脂 | NA | 探究小胶质细胞与神经元之间维持大脑稳态的通讯机制 | 小鼠和神经退行性Sandhoff病患者 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 无偏脂质组学、高分辨率空间脂质成像、深度单细胞转录组分析、细胞类型特异性突变体 | NA | 脂质组学数据、空间成像数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 652 | 2025-10-05 |
Giardia-induced Type 2 mucosal immunity attenuates intestinal inflammation caused by co-infection or colitis in mice
2025-Aug, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02051-2
PMID:40629110
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研究论文 | 本研究揭示了贾第鞭毛虫通过诱导2型黏膜免疫反应减轻肠道炎症的机制 | 首次证明贾第鞭毛虫感染通过STAT6依赖性IL-10产生型Th2细胞扩增，在促进寄生虫持续感染的同时提供抗炎保护 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究贾第鞭毛虫感染如何调节黏膜免疫并影响肠道炎症 | 尼日利亚学龄儿童和小鼠模型 | 免疫学 | 肠道感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 多参数流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 尼日利亚学龄儿童群体和小鼠实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 653 | 2025-10-05 |
A multi-omics approach reveals dysregulated TNF-related signaling pathways in circulating NK and T cell subsets of young children with autism
2025-Jul-30, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00349-z
PMID:40739030
|
研究论文 | 通过多组学方法揭示自闭症幼儿外周血NK和T细胞亚群中TNF相关信号通路的失调 | 首次在阿拉伯幼儿自闭症队列中整合转录组、蛋白质组和单细胞RNA-seq数据，发现JAK3、CUL2和CARD11基因与症状严重度负相关，并鉴定出TRAIL、RANKL和TWEAK信号通路在特定免疫细胞中的失调 | 研究样本仅限于2-4岁阿拉伯儿童，结果可能受种族和年龄因素影响 | 探索自闭症谱系障碍中外周免疫失调的分子机制 | 自闭症幼儿（2-4岁）和匹配对照的外周血单个核细胞（PBMCs）及血浆样本 | 多组学分析 | 自闭症谱系障碍 | 转录组分析, 蛋白质组分析, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | 年轻阿拉伯自闭症儿童队列（2-4岁）及匹配对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组分析, 蛋白质组分析 | NA | NA |
| 654 | 2025-10-05 |
Immune dysfunction during S. aureus biofilm-associated implant infections: opportunities for novel therapeutic strategies
2025-Jul-25, NPJ biofilms and microbiomes
IF:7.8Q1
DOI:10.1038/s41522-025-00782-y
PMID:40715142
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综述 | 探讨金黄色葡萄球菌生物膜感染引起的免疫功能障碍机制及新型治疗策略 | 结合最新细菌单细胞测序研究，揭示生物膜通过改变细菌代谢和毒素产生诱导免疫功能障碍的新机制 | NA | 分析金黄色葡萄球菌生物膜感染中免疫功能障碍的机制并探索治疗策略 | 金黄色葡萄球菌生物膜及宿主免疫系统 | 微生物免疫学 | 细菌感染性疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 655 | 2025-10-05 |
Gene-regulatory programs that specify age-related differences during thymocyte development
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115903
PMID:40570375
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研究论文 | 本研究构建了新生和成年小鼠T细胞发育的转录和染色质可及性图谱，揭示了年龄相关差异的基因调控程序 | 首次系统揭示胸腺细胞发育中年龄相关的基因调控程序差异，并发现Zbtb20这一保守转录调控因子在年龄依赖性T细胞发育差异中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，人类中的相关性需要进一步验证 | 阐明T细胞发育过程中年龄相关差异的基因调控机制 | 新生和成年小鼠的胸腺细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑, 染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 新生和成年小鼠胸腺细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 656 | 2025-10-05 |
Meta-Analysis of Gene Expression in Bulk-Processed Post-Mortem Spinal Cord from ALS Patients and Normal Controls
2025-Jul-16, NeuroSci
IF:1.6Q4
DOI:10.3390/neurosci6030065
PMID:40700130
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荟萃分析 | 对ALS患者和正常对照者尸检脊髓组织的基因表达数据集进行荟萃分析 | 通过荟萃分析减弱了个体研究中的差异表达偏倚，识别出213个差异表达基因并揭示了白质是mRNA丰度变化最显著的脊髓区域 | 基于批量处理的尸检组织数据，可能无法完全解析细胞类型特异性表达模式 | 分析ALS患者脊髓组织的基因表达变化特征 | ALS患者和正常对照者的尸检脊髓组织样本 | 生物信息学 | 肌萎缩侧索硬化 | 基因表达分析，空间转录组学 | 荟萃分析 | 基因表达数据 | 569个样本（454个ALS，115个对照），来自348个个体（262个ALS，86个对照） | NA | 批量RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 657 | 2025-10-05 |
Spatially aware adjusted Rand index for evaluating spatial transcriptomics clustering
2025-Jul-03, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf127
PMID:41001748
|
研究论文 | 提出了一种考虑空间信息的评估指标spARI，用于评估空间转录组学聚类方法 | 首次将空间距离信息整合到Rand指数中，提出了空间感知的调整Rand指数(spARI) | 未提及具体的技术实现限制或计算复杂度分析 | 开发更准确评估空间转录组学聚类方法性能的指标 | 空间转录组学数据聚类结果 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 658 | 2025-10-05 |
Human brain cell types shape host-rabies virus transcriptional interactions revealing a preexisting pro-viral astrocyte subpopulation
2025-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.18.629263
PMID:40661514
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究狂犬病毒与人类脑细胞类型的转录相互作用，揭示存在预先存在的促病毒星形胶质细胞亚群 | 发现狂犬病毒基因表达受宿主细胞类型影响，并鉴定出一个罕见的促病毒星形胶质细胞亚群，该亚群在先天免疫信号解除抑制后病毒转录反而增加 | 研究基于人类脑细胞共培养系统，可能与体内真实情况存在差异 | 研究病毒-宿主细胞相互作用和先天免疫拮抗如何影响狂犬病毒在不同脑细胞类型中的感染动态 | 人类脑细胞共培养系统中的不同脑细胞类型 | 单细胞生物学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类脑细胞共培养样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 659 | 2025-10-05 |
HemaScope: A Tool for Analyzing Single-cell and Spatial Transcriptomics Data of Hematopoietic Cells
2025-May-30, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf002
PMID:39862439
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研究论文 | 开发用于造血细胞单细胞和空间转录组数据分析的专业生物信息学工具包HemaScope | 首个专门针对造血细胞设计的集成分析工具包，整合单细胞RNA测序和空间转录组分析功能，提供多种用户友好部署形式 | 工具主要针对造血细胞设计，在其他细胞类型中的应用可能需要调整 | 开发专门用于造血细胞单细胞和空间转录组数据分析的生物信息学工具 | 造血细胞，包括人类骨髓细胞、小鼠急性髓系白血病细胞、血管免疫母细胞T细胞淋巴瘤和原发性中枢神经系统淋巴瘤 | 生物信息学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 660 | 2025-10-05 |
Resolving Leukemia Heterogeneity and Lineage Aberrations with HematoMap
2025-May-30, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf005
PMID:39945785
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了正常造血系统的参考层级结构，并开发了HematoMap工具用于解析白血病细胞的异质性和谱系异常 | 开发了基于余弦距离算法的相似性评分策略，建立了综合的造血参考层级，并创建了用户友好的R软件包用于白血病谱系异常分析 | 研究样本数量相对有限，仅包含25名健康供体和白血病患者样本 | 解析白血病异质性并将白血病细胞精确映射到造血层级结构中 | 急性髓系白血病(AML)和B细胞前体急性淋巴细胞白血病(BCP-ALL)患者样本及健康供体骨髓单核细胞 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(bulk RNA-seq) | LASSO回归模型, 余弦距离算法 | 基因表达数据 | 超过100,000个骨髓单核细胞，来自25名健康供体和白血病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |