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当前共找到 40810 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2026-06-17 |
Single-cell RNA sequencing of terminal ileal biopsies identifies signatures of Crohn's disease pathogenesis
2026-Jun-15, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02634-7
PMID:42298187
|
研究论文 | 通过对末端回肠活检进行单细胞RNA测序，识别克罗恩病发病机制的特征 | 构建了大规模scRNA-seq数据集IBDverse，整合发现与验证队列，揭示干扰素驱动的上皮细胞MHC-I上调及ITGA4巨噬细胞作为关键炎症驱动因素 | 未提及 | 探索克罗恩病（CD）的分子基础，建立全面的细胞和分子框架 | 克罗恩病（CD）患者和健康对照者的末端回肠活检组织 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 111名克罗恩病患者和232名健康对照者，超过110万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 642 | 2026-06-17 |
Bisphenol A exacerbates diabetic foot ulcers through disruption of immune microenvironment and repair processes: a multi-omics analysis of environmental exposure mechanisms
2026-Jun-15, Drug and chemical toxicology
IF:2.1Q3
DOI:10.1080/01480545.2026.2685282
PMID:42298305
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研究论文 | 通过多组学分析揭示双酚A通过破坏免疫微环境和修复过程加重糖尿病足溃疡的分子机制 | 首次系统分析环境污染物双酚A与糖尿病足溃疡的因果关系及其分子机制，并筛选出潜在拮抗剂药物 | 仅基于公共数据库的转录组数据，缺乏体外或体内实验验证 | 探索双酚A在糖尿病足溃疡中的分子机制并筛选拮抗剂 | 双酚A作用靶点和糖尿病足溃疡差异表达基因（来自GEO数据库） | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | NA | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 643 | 2026-06-17 |
Phylogenetic tree inference from single-cell RNA sequencing data with SCITE-RNA
2026-Jun-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04123-w
PMID:42298641
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据的系统发育树推断方法SCITE-RNA | 引入最大似然随机扫描贪婪搜索算法，在细胞谱系树和突变树表示之间交替优化以逃逸局部最优 | 标题和摘要中未提供 | 开发适用于单细胞RNA测序数据的系统发育树推断方法 | 单细胞RNA测序数据中的单核苷酸变异 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 最大似然随机扫描贪婪搜索 | 单细胞RNA测序数据 | 模拟数据、癌症单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 644 | 2026-06-17 |
Analysis and validation of abnormal signaling pathways and immune cell infiltration characteristics in digestive system cancers based on peroxisome-related genes
2026-Jun-15, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00861-w
PMID:42298691
|
研究论文 | 基于过氧化物酶体相关基因分析消化系统癌症中异常信号通路和免疫细胞浸润特征并验证其作用 | 首次系统构建并验证了以过氧化物酶体相关基因为基础的消化系统肿瘤特异性预后特征，并通过实验证实过氧化物酶体功能障碍可通过重编程脂质代谢克服肝细胞癌和结直肠癌的治疗抵抗 | 部分结果基于生物信息学分析，需进一步在更大队列或多癌种中验证 | 研究过氧化物酶体在消化系统癌症中的功能及其与肿瘤微环境和治疗抵抗的关系 | 消化系统癌症，包括肝细胞癌、结肠腺癌、直肠腺癌、胰腺腺癌、胃腺癌、食管腺癌、食管鳞状细胞癌和胆管癌 | 机器学习 | 消化系统癌症 | NA | Cox回归模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 包含多个癌症队列数据，具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 645 | 2026-06-17 |
YAP/TAZ Drive Oral Leukoplakia Progression and Confer Ferroptosis Vulnerability
2026-Jun-15, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345261451778
PMID:42298963
|
研究论文 | 本研究发现YAP/TAZ过度激活驱动口腔白斑进展，并揭示其介导的铁死亡脆弱性，为治疗提供新策略 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出口腔白斑特异性细胞群体，揭示YAP/TAZ激活的双重作用：维持恶性特性同时赋予铁死亡脆弱性，并提出利用临床可用药物组合诱导铁死亡来间接靶向YAP/TAZ | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限或机制验证需进一步临床转化研究 | 阐明YAP/TAZ在口腔白斑进展和恶性转化中的机制，并探索铁死亡诱导治疗的可能性 | 口腔白斑患者样本及转基因小鼠模型中的口腔白斑恶性细胞 | 机器学习 | 口腔白斑 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 口腔白斑患者样本（具体数量未提及）及转基因小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 646 | 2026-06-17 |
Glioma microenvironment: Cellular crosstalk, immunosuppression, and novel therapeutic perspectives
2026-Jun-15, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000004151
PMID:42299115
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 647 | 2026-06-17 |
Developmental and transcriptional programs that define the initiation of the forelimb
2026-Jun-12, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205397
PMID:42281473
|
研究论文 | 该研究利用高通量测序技术定义了小鼠前肢起始的发育和转录程序，鉴定出四个不同阶段，并发现一组受TBX5调控的候选早期转录靶基因 | 首次通过RNA-seq、scRNA-seq、ChIP-seq和Ribo-ITP等多种测序方法系统表征前肢起始的时序性转录程序，并鉴定出区别于其他细胞类型的前肢特征基因集，其中包含参与神经投射和细胞粘附的基因 | 未明确说明局限，但可能包括仅在小鼠胚胎中研究，以及未在功能上验证候选基因的调控机制 | 阐明脊椎动物前肢起始的分子机制，特别是TBX5依赖性转录调控 | 小鼠胚胎中体壁侧板中胚层（体壁LPM）的前肢起始过程 | 数字病理学 | 不适用 | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, Ribo-ITP | 不适用 | 转录组数据 | 小鼠胚胎，具体样本量未在摘要中说明 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 |
| 648 | 2026-06-17 |
A spatial and temporal atlas of tubulin isotype gene expression during vertebrate embryonic development
2026-Jun-11, Molecular biology of the cell
IF:3.1Q3
DOI:10.1091/mbc.E26-03-0116
PMID:42275208
|
研究论文 | 构建了脊椎动物胚胎发育过程中微管蛋白同型基因表达的时空图谱 | 首次在空间分辨率下描绘了脊椎动物神经嵴上皮-间充质转化过程中α-和β-微管蛋白同型基因的表达谱，并整合单细胞RNA测序数据揭示其多样性 | 需要进一步研究以确定转录模式与微管组成的关联 | 阐明脊椎动物胚胎发育过程中微管蛋白同型基因的时空表达模式 | 鸡胚中神经嵴上皮-间充质转化过程中的细胞和组织 | 数字病理学 | 不适用 | RNA-seq，单细胞RNA测序，荧光杂交链式反应 | 不适用 | 基因表达数据，图像 | 鸡胚不同发育阶段的多个组织样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 649 | 2026-06-17 |
Scalable hypothalamic neuron differentiation from human pluripotent stem cells suitable for modeling metabolic disorders
2026-Jun-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.102958
PMID:42276059
|
研究论文 | 提出一种化学定义、可扩展的方法，从人多能干细胞分化出富含POMC细胞的下丘脑神经元，用于代谢疾病模型研究 | 开发了与机器人细胞培养平台兼容的化学定义、可扩展分化方法，通过MERFISH、RNA-Seq、ATAC-Seq等多组学验证神经元身份，并展示与代谢疾病相关的特征 | 人工神经元可能无法完全复制体内成熟下丘脑的完整多样性及长期功能 | 建立可扩展、可重复的人下丘脑神经元模型，以研究代谢疾病并支持治疗开发 | 人多能干细胞分化的下丘脑神经元（富含POMC细胞） | 数字病理学 | 代谢疾病 | RNA-Seq, ATAC-Seq, MERFISH单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 染色质开放性数据, 图像（MERFISH） | 多个hPSC细胞系 | 10x Genomics (MERFISH), Illumina (测序) | 单细胞转录组学, 染色质可及性分析, 空间转录组学 | 10x Chromium (假设用于MERFISH), Illumina NovaSeq (假设用于测序) | MERFISH单细胞空间转录组, RNA-Seq全转录组测序, ATAC-Seq开放染色质分析 |
| 650 | 2026-06-17 |
Prognostic value and spatial transcriptomic landscape of histopathological growth patterns in synchronous colorectal liver metastases
2026-Jun-11, European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology
DOI:10.1016/j.ejso.2026.111951
PMID:42296573
|
研究论文 | 本研究验证了组织学生长模式在结直肠癌肝转移中的预后价值，并利用空间转录组学揭示了不同生长模式背后的分子机制 | 首次将空间转录组学与组织学生长模式结合，发现两种截然不同的分子适应策略（血管生成限制 vs 代谢共选），为精准风险分层和靶向治疗提供了形态-分子基础 | 样本量相对有限（182例），且仅聚焦于同时性肝转移，空间转录组学数据来源于公共数据集而非本队列 | 验证组织学生长模式在同时性结直肠癌肝转移中的预后价值并探索其空间转录组学基础 | 同时性结直肠癌肝转移患者的手术切除组织标本 | 数字病理学 | 结直肠癌肝转移 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | 182例患者的手术切除标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 651 | 2026-06-17 |
CellBouncer, a unified toolkit for single-cell demultiplexing and ambient RNA analysis, reveals hominid mitochondrial incompatibilities
2026-Jun-10, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2026.101275
PMID:42269616
|
研究论文 | CellBouncer是一个用于单细胞解复用和背景RNA分析的综合工具包，揭示了人类与黑猩猩线粒体之间的不兼容性 | 开发了统一的计算工具包CellBouncer，能同时进行多物种和多个体细胞混合物的分离与定量，量化每细胞中的背景RNA污染，并推断个体对背景RNA库的贡献 | 未在文中明确提及局限性 | 开发和完善针对单细胞测序池化实验的解复用和背景RNA分析方法 | 单细胞测序数据（包括多物种、多个体细胞混合物，脂质偶联条形码，CRISPR单引导RNA等） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及十个细胞融合系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 652 | 2026-06-17 |
Single-cell transcriptomics reveals differences between chorionic and basal plate cytotrophoblasts and 2D-cultured trophoblast stem cells
2026-Jun-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10460-0
PMID:42270938
|
研究论文 | 单细胞转录组学揭示了绒毛膜和基底板细胞滋养层与二维培养滋养层干细胞之间的差异 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学系统比较了早期和晚期妊娠早期胎盘绒毛细胞滋养层（vCTB）以及基底板和绒毛膜区域CTB的转录多样性，并发现滋养层干细胞（TSC）最类似于EVT前体细胞，且TSC在体外培养过程中失去了体内初始状态标记 | 研究仅基于早期妊娠胎盘（6-14周），未涵盖更晚孕期或病理状态，且TSC系可能偏向于EVT谱系，未能完全代表所有CTB状态 | 探索早期妊娠胎盘绒毛细胞滋养层的转录多样性及其与滋养层干细胞的关系 | 早期妊娠胎盘的绒毛细胞滋养层、基底板CTB、绒毛膜CTB、以及从6-8周胎盘衍生的滋养层干细胞系 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据，空间转录组数据 | 早期（6-8周）和晚期（12-14周）妊娠第一期胎盘绒毛组织，三个滋养层干细胞系 | 10x Genomics, NanoString | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, GeoMx | 10x Chromium Single Cell 3', GeoMx Digital Spatial Profiler |
| 653 | 2026-06-17 |
Translational potential of GMP-grade human umbilical cord-derived mesenchymal stem cells (UC-MSCs) in traumatic spinal cord injury: a preclinical study in rat
2026-Jun-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08373-x
PMID:42271443
|
研究论文 | 研究GMP级人脐带间充质干细胞在大鼠创伤性脊髓损伤中的治疗效果与机制 | 首次使用GMP级UC-MSCs在大鼠脊髓损伤模型中全面评估其疗效，包括高剂量（3×10⁷细胞/kg）的显著改善效果，并通过单细胞RNA测序和sRNA测序揭示其免疫调节、神经保护和抗炎机制 | 仅使用大鼠模型，缺乏临床人体试验证据；样本量相对较小（50只大鼠）；未探讨最佳给药时间窗口 | 评估GMP级人脐带间充质干细胞在创伤性脊髓损伤中的治疗潜力和作用机制 | 50只Sprague-Dawley大鼠，建立T10级脊髓损伤模型 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq、sRNA测序、ELISA、免疫荧光、MRI | NA | 影像、文本、组学数据 | 50只Sprague-Dawley大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 654 | 2026-06-17 |
Aberrant STAT signaling and T cell dysregulation define a targetable pediatric sepsis endotype
2026-Jun-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI202867
PMID:42262868
|
研究论文 | 该研究通过整合深度免疫表型分析、血浆蛋白质组学、单细胞转录组学和磷酸流式细胞术，在前瞻性队列中识别出儿科脓毒症的一种异常STAT信号和T细胞失调的内型 | 首次定义了由IL-6和IFN-γ驱动的儿科脓毒症T细胞功能障碍内型，并揭示JAK/STAT轴作为免疫调节治疗的潜在靶点 | 信息未明确提供 | 阐明儿科脓毒症中免疫异质性的机制并寻找可靶向治疗的内型 | 88名危重病患儿的免疫细胞和血浆样本 | 数字病理学 | 儿科脓毒症 | 血浆蛋白质组学、单细胞RNA测序、磷酸流式细胞术 | 无监督聚类（对血浆细胞因子进行聚类） | 转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 | 88名危重病患儿 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 655 | 2026-06-17 |
Single-cell spatial transcriptomics of formalin-fixed, paraffin-embedded biopsies reveals colitis-associated cell networks
2026-Jun-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI202488
PMID:42262875
|
研究论文 | 利用成像型单细胞空间转录组学对福尔马林固定石蜡包埋活检组织进行分析，揭示了与结肠炎相关的细胞网络 | 首次将成像型单细胞空间转录组学应用于临床福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检样本，并识别出与维多珠单抗治疗反应相关的两种不同抗性原型 | 未提供 | 探究溃疡性结肠炎病理机制并识别治疗反应生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者、免疫检查点抑制剂诱导性结肠炎患者和健康对照者的福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检组织 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 成像型单细胞空间转录组学 | 未提供 | 图像 | 包括溃疡性结肠炎患者、免疫检查点抑制剂诱导性结肠炎患者和健康对照者的福尔马林固定石蜡包埋黏膜活检样本 | 10x Genomics | 单细胞空间转录组学 | 10x Xenium | 自定义Xenium基因面板 |
| 656 | 2026-06-17 |
Rexiao Kuining decoction ameliorates ulcerative colitis by restoring immune homeostasis via the protein kinase C alpha-FMS-like tyrosine kinase 3 ligand axis: multi-omics evidence
2026-Jun-08, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121985
PMID:42264446
|
研究论文 | 本文通过整合多组学（包括UHPLC-MS、网络药理学、孟德尔随机化、转录组机器学习和单细胞RNA测序）及实验验证，发现热泻困宁汤通过调节PKCα-FLT3L轴恢复免疫稳态，从而改善溃疡性结肠炎 | 首次结合孟德尔随机化、转录组机器学习和单细胞RNA测序等多组学方法系统阐明热泻困宁汤治疗溃疡性结肠炎的分子机制，并发现PKCα-FLT3L轴在免疫稳态恢复中的关键作用 | 未提及明确局限性 | 研究热泻困宁汤对溃疡性结肠炎的治疗效果及其分子机制 | 溃疡性结肠炎患者、DSS诱导的小鼠结肠炎模型和LPS刺激的树突状细胞 | 自然语言处理（指转录组机器学习）、数字病理学（指标签注释） | 溃疡性结肠炎 | UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS、网络药理学、孟德尔随机化、转录组机器学习、单细胞RNA测序、分子对接与动力学模拟 | 机器学习模型（用于基因筛选） | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、质谱数据 | 训练集和验证集（AUC分别为0.97和0.93）涉及患者数据；小鼠和细胞实验样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 657 | 2026-06-17 |
Single-cell and spatial transcriptomics unveil myeloid-lymphoid cross talk and the dermal immune niche underlying palmoplantar pustulosis
2026-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.028
PMID:41740929
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示掌跖脓疱病中髓系-淋巴系交叉对话及其皮肤免疫微环境 | 首次通过单细胞转录组与空间转录组联合分析，系统描绘PPP进展过程中的免疫动态网络，并鉴定出CCL19+真皮上层淋巴样免疫微环境及CXCL1/6/8-ACKR1信号在诱导中性粒细胞募集中的关键作用 | 样本仅来自足部病变，未涉及手掌部位；功能验证和药物预测尚需进一步实验证实 | 探究掌跖脓疱病的免疫微环境及其发病机制 | 掌跖脓疱病患者的脓疱及非脓疱足部病灶样本 | 数字病理学 | 掌跖脓疱病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 来自PPP患者的脓疱及非脓疱足部病变组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于单细胞RNA测序，10x Visium用于高分辨率空间转录组分析 |
| 658 | 2026-06-17 |
Spatially resolved ex vivo drug response profiling in SMARCB1-deficient sinonasal carcinoma
2026-Jun, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00437-1
PMID:42070010
|
研究论文 | 结合单核RNA测序、空间转录组学和离体患者来源组织切片培养，解析SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的瘤内异质性、微环境组织及治疗脆弱性，并发现mTOR抑制剂Sapanisertib能诱导肿瘤坏死并消耗特定恶性细胞亚群 | 首次为SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌建立了综合性的离体药物反应图谱，结合单核RNA测序、空间转录组学和患者来源组织切片培养，揭示了肿瘤内异质性和微环境组织，并鉴定出对mTOR抑制剂Sapanisertib敏感的恶性细胞亚群 | 研究主要基于一个指标病例，虽然补充了12例回顾性队列，但样本量仍然较小，可能无法完全代表该罕见肿瘤的多样性 | 解析SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的瘤内异质性和微环境组织，并评估其治疗脆弱性 | SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的肿瘤组织和细胞 | 数字病理学 | 鼻腔鼻窦癌 | snRNAseq, 空间转录组学, 离体组织切片培养 | NA | 单核RNA测序数据, 空间转录组学数据, 组织切片培养数据 | 1例指标病例和12例回顾性队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 659 | 2026-06-17 |
anndataR improves interoperability between R and Python in single-cell transcriptomics
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag288
PMID:42108549
|
研究论文 | anndataR 提升了单细胞转录组学中 R 和 Python 之间的互操作性 | 提供了一个原生 R 包，允许 R 用户直接读取和写入 H5AD 文件，并轻松转换为 SingleCellExperiment 或 Seurat 对象，无需依赖 Python 环境 | 仅描述了对兼容性的严格测试，未明确提及潜在的性能瓶颈或功能局限性 | 解决单细胞转录组数据在 R 和 Python 之间互操作性困难的问题 | H5AD 文件格式及 R 语言环境中的数据处理对象 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞 RNA-seq | NA | NA |
| 660 | 2026-06-17 |
CeSpGRN: inferring cell-specific gene regulatory networks from single-cell multi-omics and spatial data
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag324
PMID:42225598
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研究论文 | 提出了从单细胞多组学和空间数据推断细胞特异性基因调控网络的方法CeSpGRN | 利用核加权高斯图模型实现细胞级别的基因调控网络推断，能有效整合多组学和空间位置信息 | 未明确说明局限性，但可能对数据质量要求高且计算复杂度较大 | 开发可从单细胞RNA-seq、配对scRNA-seq与scATAC-seq或空间转录组数据中推断细胞特异性基因调控网络的方法 | 单细胞多组学和空间转录组数据中的基因调控关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学 | 核加权高斯图模型 | 基因表达、染色质可及性和空间位置数据 | 模拟数据集和多个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学 | NA | NA |