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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2025-11-29 |
Integrative Multi-Omics and Functional Validation Reveal the Role of the TACE Refractoriness-Associated Gene ATP1B3 in Hepatocellular Carcinoma
2025, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S537990
PMID:41293558
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和功能验证,揭示了ATP1B3基因在肝细胞癌TACE耐药性和肿瘤进展中的关键作用 | 首次将ATP1B3鉴定为与TACE耐药性相关的关键基因,并通过单细胞RNA测序揭示了其在肿瘤-免疫细胞相互作用中的功能 | 样本量相对有限(104例患者),需要在更大队列中进一步验证 | 识别与肝细胞癌TACE耐药性相关的基因并探索其功能机制 | 104例接受TACE治疗的肝细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 功能验证实验 | 无监督聚类, Cox回归, lasso回归 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 104例肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 642 | 2025-11-29 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals CCL3+ Classical Monocyte Subset Linked to Autoimmune Pathogenesis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S547283
PMID:41293646
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研究论文 | 通过整合六种自身免疫性疾病的单细胞RNA测序数据,揭示了CCL3+经典单核细胞亚群在自身免疫发病机制中的关键作用 | 首次在多种自身免疫性疾病中发现并鉴定了一个新的CCL3+经典单核细胞亚群,该亚群具有强烈的炎症特性和趋化作用 | 研究主要基于外周血单核细胞,未深入探讨组织特异性变化 | 表征自身免疫疾病中单核巨噬细胞的共享和疾病特异性改变,以增进对自身免疫疾病免疫景观的理解 | 自身免疫疾病患者和健康对照者的外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学染色,免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 350,043个外周血免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 643 | 2025-11-29 |
Relationship between SPP1 (Osteopontin) and extracellular matrix dynamics: a comprehensive review
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1700652
PMID:41293726
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综述 | 本综述系统总结了SPP1(骨桥蛋白)在细胞外基质动态调控中的核心作用及其在多种疾病中的病理机制 | 首次提出SPP1作为病理性ECM动态的主调控因子,强调保守的SPP1+巨噬细胞-ECM相互作用机制 | 缺乏体内验证数据,特别是在骨关节炎模型中的验证 | 阐明SPP1介导的细胞外基质失调机制及其作为中心病理枢纽的作用 | SPP1(骨桥蛋白)及其与胶原蛋白和其他ECM组分的相互作用 | 生物医学研究 | 纤维化疾病、转移性疾病、骨关节炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、机器学习、体内/体外实验 | NA | 多组学数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 644 | 2025-11-29 |
Advancing toward a unified eosinophil signature from transcriptional profiling
2024-Nov-27, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae188
PMID:39213186
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综述 | 本文总结了嗜酸性粒细胞转录谱研究的现状,探讨了技术挑战、现有研究成果和未来研究方向 | 首次系统性地总结了嗜酸性粒细胞转录谱研究的各种方法,提出了统一技术标准和跨研究比较的重要性 | 嗜酸性粒细胞存在细胞脆弱性和RNA提取困难等技术挑战,人类样本研究相对有限 | 建立统一的嗜酸性粒细胞转录特征,提高嗜酸性粒细胞相关疾病的诊断和治疗精准度 | 小鼠和人类嗜酸性粒细胞 | 单细胞组学 | 嗜酸性粒细胞相关疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 微阵列 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 645 | 2025-11-29 |
Childhood-onset lupus nephritis is characterized by complex interactions between kidney stroma and infiltrating immune cells
2024-11-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adl1666
PMID:39602512
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研究论文 | 通过空间转录组学技术构建儿童狼疮性肾炎肾脏组织的单细胞分辨率图谱,揭示肾脏基质细胞与浸润免疫细胞间的复杂相互作用 | 首次在单细胞分辨率下结合空间信息分析儿童狼疮性肾炎肾脏组织,发现了免疫细胞特异性定位模式和基因表达的空间依赖性 | 样本量较小(8例患者和4例对照),组织学评分与肾小球细胞转录特征相关性较弱 | 解析儿童狼疮性肾炎的免疫发病机制和分子异质性 | 儿童狼疮性肾炎患者和对照个体的肾脏组织 | 空间转录组学 | 狼疮性肾炎 | 空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据,单细胞转录组数据 | 8例儿童狼疮性肾炎患者,4例对照个体 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 646 | 2025-11-29 |
Craters on the melanoma surface facilitate tumor-immune interactions and demonstrate pathologic response to checkpoint blockade in humans
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.18.613595
PMID:39345527
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼和人黑色素瘤模型发现表面凹陷结构促进肿瘤-免疫相互作用并预测免疫检查点阻断治疗反应 | 首次发现黑色素瘤表面凹陷结构是CD8 T细胞识别抗原和杀伤肿瘤的主要场所,并证明其预测免疫治疗反应的价值 | 研究主要基于斑马鱼模型,人类样本验证仍需扩大 | 探索免疫治疗中促进免疫应答的肿瘤微环境结构域 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 长期活体成像、高分辨率空间转录组学、多重成像 | 斑马鱼肿瘤模型 | 图像、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 647 | 2025-11-29 |
Combinatorial Immunotherapy with Agonistic CD40 Activates Dendritic Cells to Express IL12 and Overcomes PD-1 Resistance
2023-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0699
PMID:37478171
|
研究论文 | 本研究通过组合免疫疗法激活CD40使树突状细胞表达IL12,从而克服PD-1耐药性 | 发现CCL22+CCL5+ IL12分泌型树突状细胞亚群是三联疗法的关键早期效应因子,并证明新型IL12 mRNA疗法单独使用即可克服PD-1耐药 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者数据仅限于系统性细胞因子谱比较 | 探索克服抗PD-1耐药性的免疫治疗策略 | 小鼠黑色素瘤模型和人类患者样本 | 免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞细胞因子分泌分析,微孔检测 | 小鼠黑色素瘤模型 | 单细胞RNA测序数据,细胞因子分泌数据 | 多数小鼠显示完全肿瘤消退 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞细胞因子分泌分析 | NA | 新型微孔检测法 |
| 648 | 2025-11-29 |
Low TCR Binding Strength Results in Increased Progenitor-like CD8+ Tumor-Infiltrating Lymphocytes
2023-05-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0761
PMID:36787375
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研究论文 | 本研究探讨TCR结合强度对肿瘤微环境中CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能分化的影响 | 首次在內源性多克隆T细胞反应中揭示TCR结合强度与祖细胞样表型分化的关联 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚不充分 | 阐明TCR结合强度如何影响T细胞在肿瘤微环境中的功能分化 | 肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)和TCR转基因小鼠模型 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,MHC四聚体标记 | NA | 转录组数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 649 | 2025-11-29 |
Checkpoint Blockade-Induced Dermatitis and Colitis Are Dominated by Tissue-Resident Memory T Cells and Th1/Tc1 Cytokines
2022-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0362
PMID:35977003
|
研究论文 | 本研究通过多参数免疫荧光、空间转录组学和RNA原位杂交技术分析免疫检查点抑制剂引发的皮炎和结肠炎患者组织 | 首次揭示免疫检查点阻断相关不良反应主要由组织驻留记忆T细胞和Th1/Tc1细胞因子主导,而非传统认为的Th17通路 | 样本量有限,仅分析了皮炎和结肠炎两种不良反应类型 | 阐明免疫检查点抑制剂相关不良反应的免疫学机制 | 免疫检查点抑制剂治疗引发皮炎和结肠炎的患者组织样本 | 空间转录组学 | 皮肤炎症和结肠炎 | 多参数免疫荧光、空间转录组学、RNA原位杂交 | NA | 组织图像、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 650 | 2025-11-28 |
Perfluorooctanoic acid disrupts splenic immunity and antiviral responses in the LCMV model: Insights from single-cell transcriptomics
2026-Jan-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.127367
PMID:41224070
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了全氟辛酸对脾脏免疫功能和抗病毒反应的破坏机制 | 首次在LCMV病毒感染模型中系统阐明PFOA通过细胞类型特异性机制导致免疫抑制 | 研究仅使用雌性C57BL/6J小鼠,样本量相对有限 | 探究全氟辛酸对免疫系统的影响及其在病毒感染中的细胞特异性机制 | 雌性C57BL/6J小鼠的脾脏免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 对照组5522个细胞 vs 高剂量组4741个细胞,共13个注释细胞簇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 651 | 2025-11-28 |
Unraveling Diabetes Mechanisms: A Computational scRNA-Seq Approach to Inflammation and Diabetes
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03398-7_50
PMID:41273592
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研究论文 | 本研究通过计算分析单细胞RNA测序数据探索营养、炎症与糖尿病之间的分子机制关系 | 采用单细胞RNA测序数据和先进计算方法揭示饮食条件如何影响免疫反应并促进糖尿病发展的分子通路 | NA | 探索炎症与糖尿病之间的分子机制,识别关键基因表达谱和分子通路 | 单细胞RNA测序数据集GSE161872中的基因表达数据 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 计算方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 652 | 2025-11-28 |
Spatially resolved single-cell transcriptome analysis of murine Salmonella infection reveals the role of distal colonocytes in the inflammatory response
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2579909
PMID:41277366
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研究论文 | 通过整合多种转录组测序技术,揭示了小鼠沙门氏菌感染期间结肠的时空单细胞转录组景观,发现远端结肠细胞在炎症反应中的关键作用 | 首次结合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间RNA-seq数据,系统描绘了肠道感染过程中的时空转录组动态,并鉴定出远端结肠细胞的关键响应作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证相对有限 | 阐明肠道对病原体感染的区室化反应的细胞和分子基础 | 小鼠结肠组织和人类肠道单细胞转录组数据 | 空间转录组学 | 肠道感染 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间RNA-seq | NA | 转录组数据 | 一周感染时间过程的小鼠结肠样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 653 | 2025-11-28 |
Epidermal Loss of PRMT5 Leads to the Emergence of an Atypical Basal Keratinocyte-Like Cell Population and Defective Epidermal Stratification
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.008
PMID:40339790
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠模型揭示了PRMT5在表皮发育中的关键作用,发现其缺失会导致基底角质形成细胞出现衰老样表型和表皮分层缺陷 | 首次在体内证明PRMT5通过抑制Cdkn1a(p21)防止基底角质形成细胞衰老,并鉴定出一群非典型的基底角质形成细胞样细胞群体 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类皮肤中验证;PRMT5的具体下游靶标和分子机制仍需进一步阐明 | 探究PRMT5在表皮发育和角质形成细胞维持中的作用机制 | 条件性敲除Prmt5的小鼠模型及其表皮组织 | 发育生物学 | 先天性皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 654 | 2025-11-28 |
ENO1 promotes cancer metastasis via stimulating metabolism reprogramming in osteosarcoma
2025-Dec, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03182-3
PMID:40983627
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示ENO1基因通过刺激代谢重编程促进骨肉瘤转移的机制 | 首次在单细胞水平揭示ENO1通过调控糖酵解促进骨肉瘤转移的作用机制 | 样本量较小(仅10例儿科骨肉瘤样本),需要更大样本验证 | 阐明骨肉瘤转移的潜在分子机制 | 儿科骨肉瘤患者组织样本 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 10例儿科骨肉瘤样本(分为原发无转移组、原发有转移组和转移灶组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 655 | 2025-11-28 |
Functional role of granulocytic myeloid-derived suppressor cells in CAR-T therapy: insights from single-cell RNA sequencing in multiple myeloma
2025-Dec, Immunopharmacology and immunotoxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/08923973.2025.2585083
PMID:41198058
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤患者CAR-T治疗中粒细胞样髓源抑制细胞的功能作用 | 首次在CAR-T治疗背景下系统分析G-MDSCs的免疫抑制机制,发现PTGS1作为关键标志物并构建了高精度预后预测模型 | 样本量有限且患者间存在异质性,结果具有探索性,需要更大更多样化的队列验证 | 全面分析G-MDSCs在多发性骨髓瘤CAR-T治疗中的功能作用 | 多发性骨髓瘤患者 | 单细胞转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,基因集富集分析,体外功能实验 | 风险预测模型 | 单细胞转录组数据,RNA-seq数据,生存数据 | 7例多发性骨髓瘤患者(单细胞数据),713例多发性骨髓瘤患者(验证队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 656 | 2025-11-28 |
Single cell RNA seq of the major cell types in the larva of the sea star, Patiria miniata
2025-Nov-27, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.70100
PMID:41306072
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了海星Patiria miniata幼虫发育过程中的主要细胞类型及其基因表达轨迹 | 首次提供了海星幼虫发育的单细胞转录组图谱,发现原始生殖细胞与体腔囊细胞具有相似的基因表达谱,并揭示了外胚层上皮的高度异质性 | 研究主要聚焦于第3天幼虫,其他发育时间点的分析相对有限 | 研究海星发育过程中细胞类型分化和基因表达机制 | 海星Patiria miniata受精后1-4天的幼虫 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,原位RNA杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 海星幼虫发育1-4天的细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 657 | 2025-11-28 |
The Dynamic UPR Rheostat Orchestrates Single-Cell Plasticity in Glioblastoma
2025-Nov-27, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-025-02447-z
PMID:41307600
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析揭示了胶质母细胞瘤中未折叠蛋白反应三臂的动态调控机制 | 首次在单细胞水平提出UPR变阻器概念,开发了臂特异性指标来量化三臂协调性,发现IRE1/ATF6紧密耦合而PERK相对独立的调控模式 | 研究基于转录组数据推断UPR臂协调性,需要扰动实验和蛋白水平验证 | 探究胶质母细胞瘤中UPR三臂在单细胞分辨率下是否作为分级控制系统运作 | 胶质母细胞瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 随机效应模型,转录因子活性推断 | 单细胞转录组数据 | 发现队列871个细胞,验证队列11,877个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, SMART-seq | SMART-seq和10x Chromium单细胞测序平台 |
| 658 | 2025-11-28 |
Single-cell sequencing reveals the complexity of cutaneous T-cell lymphoma
2025-Nov-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04063-0
PMID:41307784
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在揭示皮肤T细胞淋巴瘤复杂基因组和微环境方面的研究进展 | 系统总结单细胞测序在解析CTCL肿瘤异质性、微环境组成和细胞状态转变中的创新应用 | NA | 通过单细胞测序技术深入理解皮肤T细胞淋巴瘤的发病机制 | 皮肤T细胞淋巴瘤及其微环境 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 659 | 2025-11-28 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular and molecular changes in EGFR-positive lung adenocarcinoma before and after Furmonertinib treatment
2025-Nov-27, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01706-y
PMID:41307822
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示EGFR阳性肺腺癌在福莫替尼治疗前后的细胞和分子变化 | 首次在EGFR阳性肺腺癌中整合治疗前后配对样本的单细胞转录组数据,系统分析福莫替尼对肿瘤微环境的重塑作用 | 样本量有限,耐药机制仍需进一步验证 | 探究福莫替尼治疗EGFR阳性肺腺癌的细胞分子机制及肿瘤微环境变化 | EGFR阳性肺腺癌患者的肿瘤组织及癌旁组织 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | EGFR阳性肺腺癌患者治疗前后配对样本(数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 660 | 2025-11-28 |
Exploring tumor heterogeneity and drug resistance in cervical cancer through single-cell and bulk transcriptomics
2025-Nov-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04037-2
PMID:41307828
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学技术探索宫颈癌肿瘤异质性和耐药机制 | 发现PI3+NEO和SLC40A1+NEO细胞群在耐药性中的关键作用,并揭示LGALS9通过抑制T细胞功能促进免疫抑制微环境 | NA | 探索宫颈癌肿瘤异质性和耐药机制以改善治疗效果 | 宫颈癌组织和HSIL样本中的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 伪时序分析, 细胞通讯分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |