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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2026-03-13 |
A Cell Cycle-aware Network for Data Integration and Label Transferring of Single-cell RNA-seq and ATAC-seq
2024-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.31.578213
PMID:38352302
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研究论文 | 本文开发了一种细胞周期感知网络(CCAN),用于在整合单细胞多组学数据时去除细胞周期效应,同时保留细胞类型特异性变异 | 这是首个研究单细胞多组学数据整合中细胞周期效应的计算模型 | NA | 研究单细胞多组学数据整合中的细胞周期效应,并开发去除该效应的方法 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞ATAC测序(scATAC-seq)数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 细胞周期感知网络(CCAN) | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 642 | 2026-03-13 |
Tracking early mammalian organogenesis - prediction and validation of differentiation trajectories at whole organism scale
2024-02-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201867
PMID:37982461
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序追踪小鼠早期器官发生过程,结合计算预测和实验验证,揭示了细胞分化轨迹 | 整合了高密度时间点单细胞数据(从E6.5到E9.5),首次在整体生物尺度上预测并验证了分化轨迹,发现了新的体节来源内皮程序 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于其他物种;时间范围限于早期器官发生阶段 | 追踪早期哺乳动物器官发生过程,建立细胞状态与命运关系的高分辨率图谱 | 小鼠胚胎(E6.5至E9.5阶段) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 计算谱系重建模型 | 单细胞转录组数据 | 超过400,000个细胞(包括300,000个新采样细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 643 | 2026-03-13 |
Loss of p73 Expression Contributes to Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-01-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0503OC
PMID:37931077
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研究论文 | 本研究探讨了p73表达缺失在慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的作用,通过小鼠模型和人类样本分析揭示了p73缺失导致多纤毛细胞损失并促进COPD样病理 | 首次在小鼠模型中证明p73功能缺失导致多纤毛细胞缺失并自发发展出COPD样病理,同时发现吸烟和COPD患者中p73表达降低 | 样本量相对有限(人类样本n=82/69/11/12),机制研究仍需深入,动物模型与人类疾病的直接对应性有待验证 | 确定p73缺失是否导致小鼠出现COPD样表型,并探索吸烟或COPD是否影响p73表达 | 小鼠模型(p73缺陷小鼠)、人类气道上皮细胞、吸烟者和COPD患者的气道样本 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、电子显微镜、流式细胞术、形态计量学、强迫振荡技术 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、形态学图像数据、生理功能数据 | 小鼠模型未指定具体数量,人类样本包括当前吸烟者82例、既往吸烟者69例、COPD患者11例、非COPD对照12例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 644 | 2026-03-13 |
scFED: Clustering Identifying Cell Types of scRNA-Seq Data Based on Feature Engineering Denoising
2023-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00574-y
PMID:37402002
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研究论文 | 本研究提出了一种基于特征工程去噪的单细胞RNA测序数据聚类方法scFED,用于识别细胞类型 | 提出了一种结合特征工程去噪和组织特异性细胞分类参考数据库(CellMatch)的基因选择框架,通过重建方法减少噪声并放大关键信息 | 仅在四个真实单细胞数据集上进行了验证,未提及方法在更大规模或更复杂数据集上的适用性 | 提高单细胞RNA测序数据的聚类效果和细胞类型识别准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 特征工程框架 | 基因表达数据 | 四个真实单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 645 | 2026-03-13 |
Understanding cervical cancer at single-cell resolution
2023-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216408
PMID:37769795
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术解析宫颈癌生态系统异质性的最新进展 | 通过单细胞测序技术高分辨率地解析宫颈癌生态系统的演变,为靶向治疗和个性化医疗提供新视角 | NA | 深入理解宫颈癌生态系统以改善患者预后 | 宫颈癌 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 646 | 2026-03-13 |
Multi-omics analysis defines a cuproptosis-related prognostic model for ovarian cancer: Implication of WASF2 in cuproptosis resistance
2023-Nov-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.122081
PMID:37717621
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研究论文 | 本研究通过多组学分析构建了一个与铜死亡相关的卵巢癌预后模型,并验证了WASF2基因在铜死亡抵抗中的作用 | 首次将单细胞测序与批量转录组数据结合,构建了基于铜死亡相关基因的卵巢癌预后模型,并实验验证了WASF2在铜死亡抵抗和铂类耐药中的功能 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证部分可能样本量有限,需要进一步扩大临床样本验证 | 探索铜死亡相关特征在卵巢癌中的作用,构建预后预测模型 | 卵巢癌患者样本(包括单细胞和批量转录组数据) | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,基因集富集分析,随机森林建模 | 随机森林 | 单细胞测序数据,批量转录组数据,临床数据 | 单细胞数据来自GSE154600,批量数据包括TCGA的378例,GSE140082的379例和GSE53963的173例卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 647 | 2026-03-13 |
Single-cell profiling reveals the heterogeneity of NK cells during anti-PD-1 therapy in non-small-cell lung cancer
2023-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110743
PMID:37657247
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了非小细胞肺癌抗PD-1治疗期间NK细胞的异质性及其与治疗反应的关联 | 首次在NSCLC抗PD-1治疗背景下,通过单细胞测序识别出6个不同的NK细胞亚群,并发现未成熟NK细胞在应答组中的富集及其与免疫调节过程的关联 | 研究基于患者活检样本的单细胞数据,样本量可能有限,且机制验证主要在转录组层面进行 | 探索NK细胞在非小细胞肺癌抗PD-1治疗疗效中的作用及机制 | 接受抗PD-1治疗的非小细胞肺癌患者的肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 648 | 2026-03-13 |
Two distinct molecular faces of preeclampsia revealed by single-cell transcriptomics
2023-Oct-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.07.005
PMID:37572658
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了子痫前期的两种不同分子亚型,重点关注胎盘细胞类型中的基因表达失调 | 首次使用单细胞和单核转录组学系统比较早发和晚发子痫前期的胎盘分子变化,揭示了早发子痫前期中广泛的细胞自主性基因失调,而晚发子痫前期影响较小 | 研究样本可能有限,未详细说明样本数量或人口统计学特征,且主要关注转录组层面,可能未涵盖蛋白质或表观遗传变化 | 解析子痫前期两种形式中胎盘功能的影响,通过分子变化区分疾病亚型 | 早发和晚发子痫前期患者的胎盘细胞,包括合胞体、基质细胞、血管系统和免疫细胞 | 数字病理学 | 子痫前期 | 单细胞转录组学,单核转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 649 | 2026-03-13 |
Determination of key events in mouse hepatocyte maturation at the single-cell level
2023-10-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.07.006
PMID:37557173
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单核RNA测序,探索了小鼠肝细胞成熟过程中的关键事件和调控因子 | 定义了肝细胞成熟的三个阶段,揭示了多倍体肝细胞在分区分布和成熟异步性中的偏好,并结合基因调控网络分析与体内遗传操作鉴定了关键转录因子 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类肝细胞中的适用性需进一步验证 | 深入探究肝细胞成熟过程中的关键事件和调控机制 | 小鼠肝细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 650 | 2026-03-13 |
DNA damage repair profiling of esophageal squamous cell carcinoma uncovers clinically relevant molecular subtypes with distinct prognoses and therapeutic vulnerabilities
2023-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104801
PMID:37725855
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研究论文 | 本研究通过分析食管鳞状细胞癌的DNA损伤修复特征,识别出两种具有不同预后和治疗脆弱性的分子亚型 | 首次在食管鳞状细胞癌中基于DNA损伤修复特征定义分子亚型,并验证了其预后价值和指导联合免疫治疗策略的潜力 | 研究主要基于转录组学数据,缺乏蛋白质水平验证;且结果在转移性食管鳞状细胞癌中未显示预后价值 | 表征食管鳞状细胞癌的DNA损伤修复特征,评估其预后价值,并探索个性化治疗策略 | 食管鳞状细胞癌患者样本和同基因小鼠模型 | 数字病理学 | 食管癌 | bulk转录组学, single-cell转录组学 | NA | 转录组数据 | 377例食管鳞状细胞癌病例 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 651 | 2026-03-13 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Optimal Time Window for Anti-Inflammatory Treatment in Spinal Cord Injury
2023-Oct, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300098
PMID:37085744
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析脊髓损伤后不同时间点的组织,揭示了抗炎治疗的最佳时间窗口为损伤后1-3天,并验证了甲基强的松龙琥珀酸钠的机制 | 首次利用单细胞测序技术结合组织化学观察,提出针对脊髓损伤的抗炎治疗精确时间窗口,并阐明典型抗炎药物的作用机制 | 未明确说明样本来源(如动物模型或人类组织),且可能未涵盖所有炎症相关细胞类型或长期效应 | 确定脊髓损伤后抗炎治疗的最佳时间窗口,并探索抗炎药物的作用机制 | 脊髓损伤部位附近组织中的细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 652 | 2026-03-13 |
Sodium glucose co-transporter 2 inhibition increases epidermal growth factor expression and improves outcomes in patients with type 2 diabetes
2023-10, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.07.007
PMID:37543256
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研究论文 | 本研究探讨了SGLT2抑制剂对2型糖尿病患者肾脏保护作用的分子机制,重点关注尿表皮生长因子(uEGF)与肾脏结局的关联 | 首次在大型临床试验(CANVAS)中结合单细胞RNA测序,揭示了SGLT2抑制剂(卡格列净)通过上调肾脏EGF表达并逆转内皮素-1介导的损伤通路来发挥肾脏保护作用的新机制 | 单细胞RNA测序样本量较小(仅22例),且主要针对年轻2型糖尿病患者,结果可能无法完全推广到所有患者群体 | 阐明SGLT2抑制剂对2型糖尿病患者肾脏保护作用的分子机制 | 2型糖尿病患者(来自CANVAS试验的3521名参与者)及肾脏活检组织(来自22名年轻患者和健康对照) | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | 3521名临床试验参与者 + 22例肾脏活检样本(10例SGLT2i治疗、6例标准治疗、6例健康对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 653 | 2026-03-13 |
Advanced Progression for the Heterogeneity and Homeostasis of Intestinal Stem Cells
2023-Oct, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-023-10578-2
PMID:37351833
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综述 | 本文综述了肠道干细胞异质性和稳态的最新研究进展,重点关注其在肠道肿瘤发生、化疗耐药和结肠癌复发中的复杂作用 | 利用类器官和单细胞RNA测序技术模拟腺体发育并阐明细胞异质性,识别了多种潜在肠道干细胞类型,并系统阐述了代谢、炎症和Wnt信号通路相关因子在干细胞稳态中的作用 | NA | 阐明肠道干细胞的异质性和稳态机制,为治疗开发创造新机会 | 肠道干细胞 | 自然语言处理 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 654 | 2026-03-13 |
Ferroptosis and WDFY4 as novel targets for immunotherapy of lung adenocarcinoma
2023-Sep-19, Aging
DOI:10.18632/aging.205042
PMID:37728413
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研究论文 | 本研究通过分析铁死亡指数和单细胞RNA测序数据,探索了肺腺癌免疫治疗的潜在靶点,并验证了WDFY4基因在其中的关键作用 | 首次将铁死亡与B细胞免疫浸润联系起来,并鉴定出WDFY4作为调控B细胞分化和肺腺癌进展的核心基因,为肺腺癌免疫治疗提供了新靶点 | 研究主要基于生物信息学分析和体外、体内实验,缺乏大规模临床队列验证,且WDFY4的具体作用机制仍需进一步阐明 | 探索肺腺癌免疫治疗的潜在靶点,改善患者预后 | 肺腺癌患者组织样本、A549细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 生物信息学与肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、流式细胞术、Transwell迁移实验、裸鼠移植瘤模型 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、组织图像数据 | 肺腺癌组织微阵列样本、单细胞RNA测序数据(癌与癌旁组织) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 655 | 2026-03-13 |
Integrative Single-Cell and Bulk Transcriptomes Analyses Identify Intrinsic HNSCC Subtypes with Distinct Prognoses and Therapeutic Vulnerabilities
2023-Aug-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-3563
PMID:37192003
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,定义了头颈鳞状细胞癌的内在分子亚型,并评估了其临床意义和治疗脆弱性 | 首次通过单细胞RNA测序分析提出HNSCC的三个内在共识分子亚型,并开发了基于机器学习的预后和治疗预测签名 | NA | 定义HNSCC的内在上皮亚型,以改善患者分层、个性化治疗和预后预测 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 来自多个队列的1,325名患者 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 656 | 2026-03-13 |
Immunosuppressive tumor microenvironment contributes to tumor progression in diffuse large B-cell lymphoma upon anti-CD19 chimeric antigen receptor T therapy
2023-Aug, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-022-0972-8
PMID:37060525
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了抗CD19 CAR-T细胞疗法在弥漫性大B细胞淋巴瘤患者中的肿瘤微环境变化,揭示了M2亚型巨噬细胞在治疗失败和疾病进展中的关键作用 | 首次在CAR-T细胞治疗背景下,利用单细胞RNA测序技术系统分析了DLBCL患者治疗前后肿瘤微环境的动态变化,并明确了M2巨噬细胞在介导免疫抑制微环境和治疗抵抗中的核心机制 | 样本量相对较小(22例可评估患者),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证结论 | 探究抗CD19 CAR-T细胞疗法在DLBCL患者中失败的根本机制,特别是肿瘤微环境的变化如何影响治疗效果 | 接受抗CD19 CD28z CAR-T细胞疗法(FKC876)治疗的复发或难治性弥漫性大B细胞淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 22例可评估的DLBCL患者(其中7例完全缓解,10例部分缓解,4例疾病稳定) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 657 | 2026-03-13 |
Disease-Associated Oligodendrocyte: New Player in Alzheimer's Disease and CNS Pathologies
2023-Jul-07, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/j.jin2204090
PMID:37519162
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综述 | 本文综述了少突胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用及其分子特征,并探讨了靶向少突胶质细胞作为治疗或预防新策略的可能性 | 提出了少突胶质细胞功能障碍可能是阿尔茨海默病早期进展的第一步,并引入了通过单细胞测序技术发现的“疾病相关少突胶质细胞”这一新概念 | NA | 探讨少突胶质细胞在阿尔茨海默病认知衰退中的可能作用及其分子特征 | 少突胶质细胞、髓鞘、阿尔茨海默病 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 658 | 2026-03-13 |
[Evaluation of peripheral blood T-lymphocyte subpopulations features in patients with hepatitis B virus-related acute-on-chronic liver failure based on single-cell sequencing technology]
2023-Apr-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,评估了乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭患者外周血T淋巴细胞亚群的特征 | 首次在HBV-ACLF患者中,基于单细胞测序技术系统描绘了外周血T淋巴细胞的分化轨迹,并鉴定出具有高度耗竭特征的CD4(+)TIGIT(+)和CD8(+)LAG3(+)亚群 | 样本量较小(6例患者和3例健康对照),且为单中心研究,需要更大样本验证 | 探索HBV-ACLF患者外周血耗竭T淋巴细胞的特征,为ACLF免疫功能障碍寻找潜在的治疗靶点分子 | 乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭患者的外周血T淋巴细胞 | 单细胞组学 | 肝衰竭 | 单细胞RNA测序 | 拟时序分析 | 单细胞转录组数据 | 6例HBV-ACLF患者和3例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 659 | 2026-03-13 |
[Research progress of single-cell sequencing technology in liver diseases]
2023-Feb-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肝脏疾病研究中的进展 | 总结了单细胞测序作为一种新兴测序方法在揭示肝脏疾病复杂机制方面的应用潜力 | NA | 综述单细胞测序技术在肝脏疾病研究中的应用进展 | 肝脏疾病 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 660 | 2026-03-13 |
Deciphering cell-cell interactions and communication in the tumor microenvironment and unraveling intratumoral genetic heterogeneity via single-cell genomic sequencing
2022 Jul-Dec, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2023.2185434
PMID:37105769
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术的发展、检测原理、流程及其在肿瘤研究中的应用,并探讨了其潜在的临床应用前景 | 系统性地回顾了scRNA-seq技术如何革新对肿瘤微环境中细胞间相互作用、通讯以及瘤内遗传异质性的理解,并展望了新的癌症治疗策略 | 作为一篇综述文章,未提出新的实验数据或模型,主要基于现有文献进行总结和展望 | 理解肿瘤异质性、克隆起源、进展、干性及耐药性,并探索单细胞测序技术在肿瘤研究和临床治疗中的应用 | 肿瘤微环境中的细胞(包括肿瘤细胞和免疫细胞)及其基因表达模式 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |