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当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2026-06-06 |
Culture-specific transcriptional drifts limit the fidelity of organoid infection models
2026-Jun-04, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014321
PMID:42241455
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研究论文 | 通过时间序列转录组分析揭示培养诱导的转录漂移影响了患者源回肠类器官在分枝杆菌感染模型中的保真度 | 首次使用人类肠道类器官模拟副结核分枝杆菌感染并表征上皮转录组反应，发现培养相关转录漂移是基因表达变化的主要驱动因素，并通过空间转录组学揭示感染可选择性抵消培养诱导的基因表达变化 | 培养诱导的转录漂移和福斯克林处理均对类器官感染模型产生显著干扰，可能掩盖病原体特异性响应 | 探究培养诱导的人工产物对肠道类器官感染模型的影响 | 患者源回肠类器官 | 数字病理学 | 克罗恩病 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 患者源回肠类器官，包含MAP感染、FSK处理和未处理对照组的48小时时间序列样本 | NA | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 642 | 2026-06-06 |
DEHP-induced male reproductive toxicity: Evidence from population studies, animal experiments, and multi-omics profiling
2026-Jun-04, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120320
PMID:42241798
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研究论文 | 通过人群研究、动物实验和多组学分析评估DEHP暴露与男性生殖毒性的关联 | 采用多层次整合策略，结合NHANES人群数据、大鼠实验、转录组机器学习和单细胞RNA-seq网络推断，系统揭示DEHP生殖毒性机制并预测候选化合物 | 熊果酸的验证仅基于计算模拟，缺乏实验验证 | 探究DEHP暴露与男性睾酮缺乏的关联及分子机制 | 成年男性（NHANES 2013-2016）和雄性SD大鼠 | 机器学习 | 男性生殖毒性 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接, 分子动力学模拟 | 逻辑回归, 集成机器学习 | 文本, 基因表达数据 | NHANES 2013-2016成年男性（具体数量未提及）；Sprague-Dawley大鼠（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 643 | 2026-06-06 |
Rheumatoid arthritis synovial fibroblasts promote the glycolysis of myeloid-derived suppressor cells via TREM1/mTOR axis
2026-Jun-04, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116961
PMID:42242136
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和流式细胞术，发现类风湿关节炎滑膜成纤维细胞通过TREM1/mTOR轴促进髓系抑制性细胞的糖酵解重编程，从而加剧炎症表型 | 首次揭示TREM1信号在类风湿关节炎中介导滑膜成纤维细胞与髓系抑制性细胞之间的代谢串扰，并证明TREM1是恢复MDSC代谢稳态的潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性 | 研究类风湿关节炎中髓系抑制性细胞的代谢重编程机制及其与滑膜成纤维细胞的相互作用 | 类风湿关节炎患者的髓系抑制性细胞、成纤维样滑膜细胞MH7a细胞系 | 数字病理学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、空间转录组学、糖酵解检测 | NA | 基因表达数据、图像 | 未具体说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序和空间转录组学分析 |
| 644 | 2026-06-06 |
scTACL: A multitask topology-aware contrastive learning approach for single-cell transcriptomics analysis
2026-Jun-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag361
PMID:42242168
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研究论文 | 提出scTACL方法，通过多任务拓扑感知对比学习分析单细胞转录组数据，以处理噪声和缺失事件 | 创新性地使用细胞相似性图与细胞嵌入相似性图之间的对比学习，并采用零膨胀负二项分布建模重建数据，无需空间信息即可区分空间转录组中的区域 | 未明确提及局限性，但可能依赖于数据质量和模型参数选择 | 开发新方法改善单细胞转录组数据分析，包括数据填充、聚类、批次效应校正和细胞间相互作用 | 单细胞转录组数据及空间转录组数据 | 机器学习 | 肺癌（肺腺癌）、肝癌 | scRNA-seq | 对比学习 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 645 | 2026-06-06 |
Widespread transcriptional memory shapes heritable states and functional heterogeneity in cancer and stem cells
2026-Jun-04, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101621
PMID:42242211
|
研究论文 | 通过谱系解析的单细胞转录组学揭示癌症和干细胞中广泛的转录记忆塑造可遗传状态和功能异质性 | 首次利用谱系追踪的单细胞转录组学区分可遗传细胞状态与瞬时波动，将转录记忆定义为可遗传异质性的新基础，并揭示聚类状态和潜在状态两类可遗传状态 | 转录记忆的跨细胞类型保守性仅部分观察到，且其维持机制尚未完全阐明，对潜在状态基因的功能优势解释有限 | 解析非遗传异质性的机制，特别是通过可遗传状态促进癌症进化和发育轨迹的分子基础 | 癌症细胞和干细胞中的可遗传细胞状态及其转录记忆 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞转录组学, 谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 谱系解析的单细胞转录组学 |
| 646 | 2026-06-06 |
Agility training enhances motor temporal precision by reweighting spinal phase-locked commissural inhibition
2026-Jun-04, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2026.05.013
PMID:42242212
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研究论文 | 本研究揭示了敏捷训练通过增强脊髓相位锁定交叉抑制来重塑慢速运动神经元活动，从而提升运动时间精确性的机制 | 首次发现敏捷训练通过增强交叉抑制而非均匀增强兴奋来选择性压缩慢速运动神经元活动，并阐明其分子基础为甘氨酸受体表达上调 | 未说明 | 探究敏捷训练改善运动时间精确性的神经回路和分子机制 | 成年斑马鱼的脊髓运动回路 | 计算神经科学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 647 | 2026-06-06 |
CD157+ vascular endothelial stem cells represent a conserved subpopulation with an angiogenic gene expression profile
2026-Jun-04, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.102931
PMID:42242216
|
研究论文 | 鉴定表达CD157抗原的血管内皮干细胞是一个保守的亚群，具有与血管生成相关的基因表达谱，并在血管再生中发挥作用 | 首次系统揭示了小鼠和人类CD157阳性内皮细胞的保守转录谱，发现NFAT通路在血管网络形成中的作用，并识别出人类内皮细胞中类似小鼠CD157阳性细胞的亚群及其定位 | 未充分探讨CD157内皮细胞的临床应用潜力，以及其在疾病模型中的功能验证 | 阐明CD157阳性血管内皮干细胞的分子特征及其在血管再生中的保守机制 | 小鼠和人类组织中的CD157阳性血管内皮细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类多个组织样本（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序的10x Chromium平台 |
| 648 | 2026-06-06 |
Hypoxia shapes both therapeutic response and resistance in metastatic clear cell renal cell carcinoma
2026-Jun-04, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.05.007
PMID:42242232
|
研究论文 | 探究缺氧在转移性透明细胞肾细胞癌中如何影响治疗效果和耐药性 | 揭示了缺氧反应性SPP1肿瘤相关巨噬细胞在VEGFR-TKI/aPD-1联合治疗中的双重作用，以及治疗前缺氧预测不良预后的新机制 | 未明确说明，但从摘要推断可能包括小鼠模型的局限性以及人类队列的样本量问题 | 研究VEGFR-TKI、aPD-1及联合治疗在透明细胞肾细胞癌中肿瘤微环境的演变机制 | 转基因透明细胞肾细胞癌小鼠模型及人类治疗队列 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、成像质谱流式 | NA | 单细胞RNA测序数据、成像质谱数据 | 小鼠模型及人类队列，未具体说明数量 | 10x Genomics, Fluidigm | 单细胞RNA测序, 成像质谱流式 | 10x Chromium, Fluidigm CyTOF | 10x Chromium单细胞RNA测序，Fluidigm成像质谱流式系统 |
| 649 | 2026-06-06 |
Pathogenesis of diffuse large B cell lymphoma proteogenotypes
2026-Jun-04, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.05.008
PMID:42242231
|
研究论文 | 通过对478例弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤的蛋白质组、转录组和基因组数据整合分析，识别出七种反映特定病理生理特征的DLBCL蛋白质基因组型 | 首次通过多组学整合方法识别出独立于传统风险因素的DLBCL预后相关蛋白质基因组型PG4，并揭示其MYC活化机制及免疫微环境特征 | 未明确说明研究样本的种族多样性及外部验证队列结果 | 阐明弥漫性大B细胞淋巴瘤的临床和分子异质性机制 | 478例弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤样本及其微环境细胞 | 数字病理学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 蛋白质组学、转录组学、基因组学分析，单细胞测序，空间转录组学 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、基因组数据、单细胞测序数据、空间转录组数据 | 478例弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 650 | 2026-06-06 |
Human primary antibody response to vaccination follows a partially sequential class-switching program with a checkpoint at IGHG2
2026-Jun-04, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102848
PMID:42242228
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研究论文 | 研究人类首次对疫苗接种反应中抗体类别转换的部分有序程序，并在IGHG2处发现检查点 | 首次在人体初次免疫反应中，通过单细胞和批量测序结合，揭示类别转换遵循部分有序程序，并在IGHG2处存在检查点，挑战了单基因无菌转录的普遍观点 | 该研究仅关注SARS-CoV-2疫苗接种后的前三周反应，可能无法完全代表长期或不同抗原刺激下的类别转换动力学 | 阐明人类初次免疫应答中抗体类别转换的动力学和机制 | COVID-19未感染的健康志愿者在SARS-CoV-2疫苗接种后前21天的外周血B细胞 | 自然语言处理 | COVID-19 | B细胞受体库测序, 单细胞转录组测序, 免疫表型分析, IGHC无菌转录分析 | NA | 文本, 图像 | COVID-19未感染的健康志愿者，每两天采样一次，持续三周 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell B Cell Receptor和转录组测序平台 |
| 651 | 2026-06-06 |
High Uric Acid Promotes Stem Leydig Cell Senescence by CCDC90B Mediates Mitochondrial Quality Control Imbalance
2026-Jun-04, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70237
PMID:42242294
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研究论文 | 揭示高尿酸通过CCDC90B介导线粒体质量控制失衡促进干细胞莱迪希细胞衰老 | 首次在单细胞RNA测序水平揭示高尿酸条件下干细胞莱迪希细胞衰老现象，并发现CCDC90B作为关键调控靶点，AAV介导的基因治疗为低睾酮水平提供新思路 | 未提及具体限制 | 探究高尿酸影响干细胞莱迪希细胞功能的分子机制 | 干细胞莱迪希细胞 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 652 | 2026-06-06 |
Luminal-basal stratification of the native human pancreatic duct is differentially represented in pancreatic cancers
2026-Jun-04, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-337970
PMID:42242908
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示人类胰腺导管细胞群在正常组织和胰腺癌中的管腔-基底分层差异 | 首次生成人类胰腺导管细胞在正常组织和肿瘤中的空间分辨图谱，发现角蛋白5+细胞群包含ΔNp63+基底细胞和ΔNp63-管腔B细胞，并揭示MUC4和MUC16在管腔B细胞中的新表达 | 未明确提及，但可能包括样本量有限或空间转录组学平台间的技术差异 | 生成人类胰腺导管细胞群在正常组织和肿瘤中的空间分辨图谱，并评估其与胰腺导管腺癌和腺鳞癌的相关性 | 人类胰腺导管细胞群，包括角蛋白5+细胞、ΔNp63+基底细胞、ΔNp63-管腔B细胞，以及胰腺导管腺癌和腺鳞癌标本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | 无 | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、多重免疫荧光图像 | 使用多个空间转录组学平台获取新数据集，并与公共单细胞RNA测序数据集整合，具体样本数未提及 | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 多个空间转录组学平台，包括10x Visium，并结合公共单细胞RNA测序数据集（如10x Chromium） |
| 653 | 2026-06-06 |
Identifying fate-determining transcription factors with single-cell omics
2026-Jun-04, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2026.05.005
PMID:42242982
|
综述 | 系统综述了利用单细胞组学数据识别细胞命运决定转录因子的计算方法，从三个视角组织这些方法 | 首次从细胞状态定义与转变、离散与连续过程、独立与组合作用三个维度系统分类关键转录因子识别方法 | 未提供具体方法的性能比较基准或标准评估数据集 | 综述单细胞组学中识别细胞命运决定转录因子的计算方法并指导工具选择 | 细胞命运决定转录因子（关键转录因子） | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 654 | 2026-06-06 |
Mitochondrial-impaired ductal epithelium fuels TLS formation in Sjögren's disease
2026-Jun-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.05.014
PMID:42243007
|
研究论文 | 发现线粒体功能受损的导管上皮细胞在干燥综合征中促进三级淋巴结构形成 | 首次揭示干燥综合征中纹状导管上皮细胞线粒体功能障碍是三级淋巴结构形成的关键触发因素，并识别出SD-C1亚型作为潜在治疗靶点 | 研究未明确线粒体功能障碍直接导致三级淋巴结构形成的具体分子机制，且动物模型验证主要基于NOD/ShiLtj小鼠，结果外推至人类可能有限 | 探究干燥综合征进展中三级淋巴结构形成的初始驱动因素 | 干燥综合征患者和非干燥综合征患者的唇腺活检组织 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 批量转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、透射电子显微镜 | NA | 转录组数据、空间转录数据、超微结构图像、组织学图像 | 848例唇腺活检样本（668例干燥综合征，180例非干燥综合征） | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 透射电子显微镜用于超微结构分析 |
| 655 | 2026-06-06 |
Integrative genomic analysis of 21 orofacial diseases identifies shared genetic architecture with systemic diseases
2026-Jun-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73925-0
PMID:42243103
|
研究论文 | 通过对英国生物银行中21种口面部疾病的整合基因组分析，发现48个新基因座并优先筛选出160个推定致病基因，揭示了口面部疾病与全身疾病之间的遗传结构和因果关系 | 首次系统性地对21种口面部疾病进行全基因组、全转录组、罕见变异关联研究和孟德尔随机化的整合分析，发现了ALDH1A2基因同义变异通过影响翻译效率与牙周炎相关，并利用单细胞RNA测序揭示了牙周炎组织中视黄酸信号受损及Th17偏斜的免疫表型 | 未明确提及局限性，但可能包括因果关系验证的样本选择偏差或UK Biobank人群代表性不足等问题 | 探究口面部疾病与全身疾病的遗传结构和因果关系 | 21种口面部疾病（如牙周炎、龋齿、舍格伦综合征等）及全身疾病（如肺癌、脑卒中） | 机器学习 | 老年性疾病 | 全基因组关联分析、全转录组关联分析、罕见变异关联研究、孟德尔随机化、CRISPR-Cas9编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、遗传变异数据、单细胞表达数据 | 英国生物银行（UK Biobank）中21种口面部疾病患者及对照组数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 656 | 2026-06-06 |
Inference of spatial chromatin accessibility via integration of spatial transcriptomics and single-cell multi-omics data
2026-Jun-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73948-7
PMID:42243114
|
研究论文 | 提出了一个统一的计算方法ISON，通过整合空间转录组学和单细胞多组学数据，推断空间染色质可及性 | ISON能够准确预测空间位点的染色质可及性图谱，并重建空间分辨的基因调控网络，且在时间和内存上具有可扩展性；其预测的染色质可及性可捕捉顺式和反式调控信息，并能估计位点水平的转录因子活性，区分同一家族内的转录因子，这是仅依靠染色质可及性数据的方法所不具备的特点 | 当前尚无商用试剂盒可同时进行空间多组学分析，阻碍了广泛数据生成 | 开发一种统一的计算方法，通过整合空间转录组学和单细胞多组学数据，实现空间多组学分析 | 空间转录组数据和单细胞多组学数据（基因表达和染色质可及性） | 计算生物学、机器学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞多组学、空间转录组学、计算建模 | 深度学习模型 | 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 阿尔茨海默病数据（样本数量未在摘要中明确） | 不适用 | 空间转录组学、单细胞多组学（单细胞RNA-seq与单细胞ATAC-seq联合分析） | 不适用 | 不适用 |
| 657 | 2026-06-06 |
Insights gained from single-cell transcriptomics on the cellular identity and plasticity of prostate epithelial cells
2026-Jun-04, Prostate cancer and prostatic diseases
IF:5.1Q1
DOI:10.1038/s41391-026-01127-2
PMID:42243465
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 658 | 2026-06-06 |
Microglia and neuroinflammation: function, heterogeneity, and crosstalk
2026-Jun-04, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-026-01438-3
PMID:42243476
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综述 | 综述了小胶质细胞在中枢神经系统中介导神经炎症的功能、异质性及其与其他细胞间的相互作用 | 整合了单细胞测序揭示的小胶质细胞激活状态谱（如DAMs、IRMs、LDAMs），超越了传统的促炎/抗炎二分法，并突出了小胶质细胞在神经炎症网络中的核心通信枢纽作用 | 未说明 | 综述小胶质细胞的起源、发育、分类及其在神经炎症中的动态细胞状态，以及其与其他中枢神经系统细胞的相互作用机制 | 小胶质细胞及其与神经元、星形胶质细胞、少突胶质细胞和外周免疫细胞的相互作用 | 机器学习 | 神经炎症疾病 | 单细胞测序 | 未说明 | 未说明 | 未说明 | 未说明 | 单细胞RNA测序 | 未说明 | 未说明 |
| 659 | 2026-06-06 |
Human microglial transitions at the Aβ-tau inflection point associate with divergent pathways to dementia and resilience
2026-Jun-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-026-04393-8
PMID:42243549
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研究论文 | 结合空间转录组学和单核RNA测序，研究人类小胶质细胞在Aβ-tau拐点处的转变与痴呆和韧性不同路径的关联 | 首次在人类大脑中识别出Aβ-tau拐点，并发现小胶质细胞状态转变是该拐点的关键特征，同时揭示了老年痴呆患者与认知健康百岁老人不同的韧性机制 | 研究样本量有限，仅来自高龄人群，可能无法代表更广泛的AD患者群体 | 解析大脑细胞对淀粉样蛋白-β和tau蛋白的反应，理解阿尔茨海默病的动态过程及韧性机制 | 老年痴呆患者、无痴呆的八旬老人以及认知健康的百岁老人 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 转录组数据,组织图像数据 | 来自老年痴呆患者、无痴呆八旬老人和认知健康百岁老人的样本 | 10x Genomics | 空间转录组学,单核RNA测序 | 10x Visium,10x Chromium | 10x Visium空间转录组学平台和10x Chromium单核RNA测序平台 |
| 660 | 2026-06-06 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing reveals regulated necrosis-associated heterogeneity in pancreatic cancer
2026-Jun-04, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-026-04437-y
PMID:42243587
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序，揭示了胰腺癌中调控性坏死相关的异质性 | 首次在单细胞分辨率下发现非恶性细胞的调控性坏死状态对胰腺癌异质性有显著贡献，并识别出免疫抑制功能的免疫细胞表现出更高的调控性坏死活性 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在批次效应和样本选择偏差；候选基因A2ML1的功能验证尚未在实验中进行 | 确定调控性坏死相关基因在胰腺癌中的异质性及其预后价值 | 胰腺癌患者样本的单细胞RNA测序数据、转录组数据、体细胞突变和拷贝数变异数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和ICGC数据库的胰腺癌样本 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 从GEO数据库下载的单细胞RNA测序数据，TCGA和ICGC数据库的批量RNA测序数据 |