单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32540 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2025-11-05 |
Inhibition of DKK-1 by WAY262611 Inhibits Osteosarcoma Metastasis
2025-May-02, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-24-0744
PMID:39781890
|
研究论文 | 本研究验证小分子抑制剂WAY262611通过抑制DKK-1激活Wnt信号通路，从而抑制骨肉瘤转移 | 首次证明小分子DKK-1抑制剂在体内外均能抑制骨肉瘤转移并诱导成骨分化 | NA | 评估DKK-1抑制剂对骨肉瘤转移的抑制作用 | 骨肉瘤细胞系和患者来源的骨肉瘤异种移植模型 | NA | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 642 | 2025-11-05 |
Integrated Spheroid-to-Population Framework for Evaluating PFHpA-Associated Metabolic Dysfunction and Steatotic Liver Disease
2025-Mar-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5960979/v1
PMID:40092438
|
研究论文 | 本研究通过整合3D肝球体模型和人群队列数据，评估PFHpA暴露与代谢功能障碍相关脂肪性肝病的关系 | 开发了从球体到人群的整合框架，结合单细胞转录组学和多组学数据揭示PFHpA诱导MASLD的分子机制 | 研究主要基于肥胖青少年队列，结果可能不适用于其他人群 | 阐明短链PFAS同系物PFHpA在MASLD发病机制中的作用 | 肥胖青少年队列和3D人肝球体模型 | 生物医学研究 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞转录组学, 多组学分析, 3D球体培养 | LUCID模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 临床数据 | Teen-LABS队列中接受减肥手术的肥胖青少年 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 643 | 2025-11-05 |
STEAM: Spatial Transcriptomics Evaluation Algorithm and Metric for clustering performance
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.636505
PMID:40027655
|
研究论文 | 提出了一种用于评估空间转录组学数据聚类性能的计算框架STEAM | 开发了首个专门针对空间转录组学数据聚类性能评估的计算流程，结合机器学习分类和预测方法，支持多样本训练和跨重复样本的聚类一致性评估 | NA | 解决空间转录组学数据聚类结果验证困难的问题，提供标准化评估框架 | 空间转录组学数据的聚类算法性能 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学，机器学习分类 | 机器学习分类算法 | 空间转录组学数据，空间蛋白质组学数据 | 多个公共数据集，涵盖多细胞到单细胞分辨率 | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 644 | 2025-11-05 |
Deconvolution and Phylogeny Inference of Diverse Variant Types Integrating Bulk DNA-seq with Single-cell RNA-seq
2025-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.24.634791
PMID:39975330
|
研究论文 | 开发了一种整合bulk DNA-seq和单细胞RNA-seq数据的方法TUSV-int，用于反卷积和系统发育推断 | 首次整合bulk DNA-seq和scRNA-seq数据，同时支持SNV、CNA和SV多种变异类型的反卷积和系统发育树重建 | 依赖于数据质量，scDNA-seq成本和技术挑战限制了大规模应用 | 解决肿瘤系统发育重建中不同测序技术的局限性，提高克隆结构解析能力 | 肿瘤细胞克隆和变异类型 | 生物信息学 | 乳腺癌 | DNA测序, RNA测序, 整数线性规划 | 整数线性规划(ILP) | 基因组测序数据, 转录组测序数据 | 已发表的乳腺癌数据集 | NA | bulk DNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 645 | 2025-11-05 |
MetaLigand: A database for predicting non-peptide ligand mediated cell-cell communication
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633094
PMID:39868215
|
研究论文 | 开发了一个用于预测非肽配体介导的细胞间通讯的数据库和工具MetaLigand | 首个专门针对非肽配体的数据库工具，整合了从头合成和补救合成途径，改进了预测准确性 | NA | 研究非肽配体介导的细胞间通讯机制 | 233种非肽配体及其生物合成酶、转运蛋白基因和受体基因 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | 转录组数据分析，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据，scRNA-seq数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 646 | 2025-11-05 |
Combined statistical-biophysical modeling links ion channel genes to physiology of cortical neuron types
2025-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.02.530774
PMID:39803528
|
研究论文 | 开发了一种结合统计和生物物理模型的混合方法，从基因表达模式预测皮层神经元类型的电生理活动 | 首次将统计模型与基于Hodgkin-Huxley的生物物理模型相结合，通过可解释的稀疏线性回归模型将离子通道基因表达与生物物理模型参数直接关联 | 面临数学模型与实验数据不匹配的挑战，模型验证依赖于多模态Patch-seq数据的质量和完整性 | 建立基因表达与皮层神经元类型生理特性之间的联系机制 | 多种皮层细胞类型的神经元 | 计算神经科学 | NA | 单细胞转录组学, Patch-seq, 模拟推理 | Hodgkin-Huxley模型, 稀疏线性回归模型 | 多模态电生理和基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 647 | 2025-11-05 |
Longitudinal Multi-omic Immune Profiling Reveals Age-Related Immune Cell Dynamics in Healthy Adults
2024-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.10.612119
PMID:39314416
|
研究论文 | 通过纵向多组学分析揭示健康成年人年龄相关的免疫细胞动态变化 | 首次在300多名健康成年人中进行长达两年的纵向多组学免疫分析，建立了包含1600多万个PBMCs单细胞RNA测序数据的免疫健康图谱 | 研究样本仅包括健康成年人，未涵盖疾病状态或更广泛年龄范围的人群 | 探究健康人类免疫系统在生命周期中的基础性变化 | 300多名健康成年人，其中96名年轻和老年成年人接受为期两年的年度疫苗接种跟踪 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质组数据,流式细胞数据 | 300多名健康成年人，1600多万个PBMCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 648 | 2025-11-05 |
A second wave of Notch signaling diversifies the intestinal secretory lineage
2024-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.15.603542
PMID:39071399
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了小肠中罕见分泌细胞CHEs的命运特化机制 | 发现Notch信号通路在分泌谱系中发生第二波激活以特化CHEs细胞群体 | CHEs细胞在大鼠和人类中存在但小鼠中缺失，限制了部分实验模型的适用性 | 探究小肠分泌细胞谱系多样化的分子机制 | 大鼠和人类小肠中的C FTR高表达细胞(CHEs) | 单细胞生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序, 伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 649 | 2025-11-05 |
GZMK+CD8+ T cells Target A Specific Acinar Cell Type in Sjögren's Disease
2024-Jul-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3601404/v2
PMID:38196575
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析健康与疾病状态下的人类小唾液腺，揭示了干燥综合征中特定腺泡细胞被靶向的机制 | 首次发现新型浆黏液腺泡细胞类型，并鉴定出GZMK+CD8+ T细胞特异性靶向其中一类腺泡细胞的免疫机制 | 未明确说明样本数量和技术平台的详细配置信息 | 解析干燥综合征的发病机制和细胞靶向特性 | 人类小唾液腺组织 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 650 | 2025-11-05 |
Early events marking lung fibroblast transition to profibrotic state in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Apr-21, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02419-0
PMID:37085855
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学识别了特发性肺纤维化中成纤维细胞向促纤维化状态转变的早期事件 | 首次发现核糖体蛋白全局下调和铜结合蛋白显著上调标志着IPF转变，并识别了新的过渡性成纤维细胞亚群 | 研究样本量有限，且主要关注成纤维细胞而忽略了其他细胞类型在疾病进展中的作用 | 探究特发性肺纤维化中成纤维细胞从正常向促纤维化状态转变的早期分子事件 | 健康对照和IPF患者肺组织中的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序，免疫荧光检测 | NA | 单细胞RNA测序数据，免疫荧光图像 | 健康对照和IPF患者肺组织样本（上下肺叶） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 651 | 2025-11-04 |
Short-chain fatty acids regulate T cell heterogeneity to alleviate recurrent spontaneous abortion
2025-Dec, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70155
PMID:40759431
|
研究论文 | 本研究探讨肠道微生物源性短链脂肪酸通过调节T细胞异质性改善复发性流产的机制 | 首次揭示短链脂肪酸通过GPR43受体调控CD4+ T细胞分化在复发性流产中的作用机制，并开发了结肠靶向短链脂肪酸纳米递送系统 | 动物模型与人类病理生理存在差异，临床转化需要进一步验证 | 探究肠道微生物代谢产物短链脂肪酸在复发性流产免疫耐受中的作用 | 复发性流产患者和小鼠模型 | 免疫学 | 复发性流产 | 单细胞测序, 16S rDNA测序, 粪便微生物移植, 分子生物学方法 | NA | 单细胞数据, 微生物组数据 | 复发性流产患者和小鼠模型 | NA | 单细胞测序, 16S rDNA测序 | NA | NA |
| 652 | 2025-11-04 |
Cytotoxic CD8+ T Cells Downregulate GPX4 to Promote Ferroptosis in Melanoma That Drives Antitumor Immunity
2025-Nov-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1952
PMID:40828991
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD8+ T细胞通过下调GPX4促进黑色素瘤铁死亡，从而驱动抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示CD8+ T细胞通过直接接触下调GPX4表达诱导肿瘤细胞铁死亡的新机制 | 主要基于小鼠模型，人类数据验证仍需进一步研究 | 探究铁死亡在抗肿瘤免疫中的作用机制 | 小鼠黑色素瘤模型和人类黑色素瘤样本 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成功和不成功免疫反应的小鼠黑色素瘤样本及人类黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 653 | 2025-11-04 |
Identification of a CD138-Negative Therapy-Resistant Subpopulation in Multiple Myeloma with Vulnerability to Splicing Factor Inhibition
2025-Nov-03, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-24-0340
PMID:40890913
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别多发性骨髓瘤中CD138阴性的耐药亚群及其对剪接因子抑制的敏感性 | 发现CD138阴性多发性骨髓瘤细胞中存在耐药亚群，并首次揭示该亚群对剪接通路抑制具有特异性脆弱性 | 研究样本量有限，耐药机制需进一步验证 | 探索多发性骨髓瘤治疗抵抗的分子机制 | 从患者骨髓中纯化的原代多发性骨髓瘤细胞 | 单细胞测序 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, VDJ靶向测序, CRISPR/Cas9筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 654 | 2025-11-04 |
Depletion of Sorcs3 Activates Totipotency in Mouse Embryonic Stem Cells by Modulating Key Signaling Pathways
2025-Nov-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509151
PMID:41178446
|
研究论文 | 通过敲除Sorcs3基因激活小鼠胚胎干细胞全能性并揭示相关信号通路机制 | 首次发现Sorcs3缺失可诱导胚胎干细胞获得全能性状态，并阐明Tfap2c基因和特定信号通路在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞模型，尚未在人类细胞中验证 | 建立可持续的全能性干细胞并研究其调控机制 | 小鼠胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 基因敲除、单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 655 | 2025-11-04 |
Vasculogenic Precedes Neurogenic Differentiation in Dental Pulp Stem Cells
2025-Nov-03, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251379776
PMID:41178677
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了牙髓干细胞分化过程中血管生成先于神经生成的时间顺序 | 首次在单细胞水平证明牙髓干细胞在体内分化时血管生成先于神经生成的时间顺序 | 研究样本量有限，且仅在免疫缺陷小鼠模型中进行验证 | 探究人牙髓干细胞的分化机制和时序 | 人牙髓干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 动物移植模型 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 656 | 2025-11-04 |
Integrative Multi-Omics Analysis Prioritizes Candidate Genes for Essential Tremor and Reveals a Gap Between Computational Prediction and Experimental Validation
2025-Nov-03, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society
IF:7.4Q1
DOI:10.1002/mds.70101
PMID:41178806
|
研究论文 | 本研究通过多阶段计算框架识别原发性震颤的高置信度候选基因，并评估计算预测与实验验证之间的差异 | 开发了整合多组学数据的计算框架，提出了原发性震颤的皮质假说，揭示了计算预测与实验验证之间的关键差距 | 在死后小脑组织中未发现显著差异表达，计算预测与实验验证存在不一致 | 识别原发性震颤的效应基因以阐明疾病机制并开发靶向治疗 | 原发性震颤患者和对照组的基因组和转录组数据 | 生物信息学 | 原发性震颤 | GWAS, TWAS, 孟德尔随机化, 共表达网络分析, 空间转录组学 | 多阶段计算框架 | 基因组数据, 转录组数据 | 两个独立的死后脑组织数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 657 | 2025-11-04 |
Molecular and cellular morphology of placenta unveils new mechanisms of reproductive immunology
2025-Nov, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.01.025
PMID:39842636
|
研究论文 | 通过空间转录组学和多色免疫组化等技术研究胎盘分子和细胞形态，揭示生殖免疫新机制 | 发现胚胎滋养细胞在植入前就表达免疫检查点蛋白，揭示母胎界面存在免疫排斥与抑制的平衡机制 | NA | 研究人类生殖过程中胎盘细胞和分子特征的免疫调控机制 | 正常和异位妊娠胎盘组织及动物模型 | 生殖免疫学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学,多重免疫组织化学,免疫组化-荧光原位杂交双标记 | NA | 空间转录组数据,组织图像,蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 658 | 2025-11-04 |
Clinical application of single-cell RNA sequencing in disease and therapy
2025-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70512
PMID:41169094
|
综述 | 系统概述单细胞RNA测序技术在疾病机制研究和临床应用中的进展 | 整合单细胞与空间转录组技术，结合人工智能和机器学习算法分析大数据 | 存在技术挑战和数据分析障碍 | 探讨单细胞RNA测序在疾病研究和精准医疗中的应用 | 人类疾病中的体细胞进化、生物标志物发现和药物开发 | 自然语言处理 | 多种疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 659 | 2025-11-02 |
Parental Specific Expression by scRNA-Seq Reveals HaWRKY40 Contributing to Heterosis of Sunflower
2025-Nov, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70266
PMID:41170640
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 660 | 2025-11-04 |
Integrated analysis identifies CD276 in fibroblasts as a malignancy predictor and regulator of neutrophil infiltration in hepatoblastoma
2025-Nov-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000826
PMID:41171428
|
研究论文 | 本研究通过整合分析发现成纤维细胞中的CD276是肝母细胞瘤恶性程度的预测因子和中性粒细胞浸润的调节因子 | 首次系统表征CD276在肝母细胞瘤中的表达谱，发现其在癌相关成纤维细胞中高表达，并揭示其通过调节CXCL2调控中性粒细胞浸润的新机制 | 研究样本量有限，机制研究主要在动物模型中进行，需要更多临床验证 | 探究免疫检查点配体CD276在肝母细胞瘤中的临床意义及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 肝母细胞瘤患者组织和细胞，小鼠模型 | 生物信息学，肿瘤免疫学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，多重免疫组织化学，去卷积分析，相关性分析 | 逻辑回归模型，风险评分模型，列线图 | RNA-seq数据，单细胞RNA-seq数据，图像数据 | 肝母细胞瘤患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |