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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6561 | 2025-10-06 |
PPMS: A framework to Profile Primary MicroRNAs from Single-cell RNA-sequencing datasets
2022-11-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac419
PMID:36209413
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研究论文 | 开发了一种从单细胞RNA测序数据中分析初级microRNAs的计算框架PPMS | 首个能够在单细胞类型分辨率下分析和定量初级microRNAs的计算方法 | NA | 开发能够从单细胞RNA测序数据中分析初级microRNAs的计算工具 | 初级microRNAs(pri-miRNAs) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | 计算框架 | RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-nuclei RNA-seq | NA | NA |
6562 | 2025-10-06 |
Systematic investigation of imprinted gene expression and enrichment in the mouse brain explored at single-cell resolution
2022-Nov-17, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-08986-8
PMID:36384442
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据系统研究印记基因在小鼠大脑中的表达和富集情况 | 首次正式验证印记基因在大脑中的过度表达现象,并识别出特定的神经细胞群体作为印记基因表达的热点区域 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类或其他物种 | 系统调查印记基因在大脑中的表达模式和富集程度 | 小鼠大脑组织、不同脑区和神经细胞类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6563 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics defines an improved, validated monoculture protocol for differentiation of human iPSC to microglia
2022-11-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-23477-2
PMID:36376339
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研究论文 | 本研究通过系统评估优化了人类iPSC向小胶质细胞分化的单培养方案 | 通过单细胞RNA测序和功能分析,识别出先前方案中冗余的培养基成分,提供了经两个实验室验证的优化方案 | NA | 建立更真实的人类小胶质细胞体外模型以研究其生理功能 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)分化的小胶质细胞 | 单细胞生物学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, qPCR, 功能分析 | NA | 基因表达数据, 功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6564 | 2025-10-06 |
Mapping the developing human cardiac endothelium at single-cell resolution identifies MECOM as a regulator of arteriovenous gene expression
2022-11-10, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac023
PMID:35212715
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序绘制人类胎儿心脏内皮细胞图谱,发现MECOM是动静脉基因表达的调控因子 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘人类胎儿心脏内皮细胞的转录组特征,揭示了MECOM在维持动脉内皮细胞身份中的新功能 | 研究主要基于胎儿样本,缺乏对成年期心脏内皮细胞的直接比较分析 | 表征人类胎儿心脏内皮细胞的转录组特征,揭示内皮细胞异质性和分化动态 | 人类胎儿心脏内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 基因调控网络分析、轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据 | 超过10,000个胎儿心脏内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6565 | 2025-10-06 |
The memory B cell response to influenza vaccination is impaired in older persons
2022-11-08, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111613
PMID:36351385
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现老年人对流感疫苗的记忆B细胞反应存在缺陷 | 首次使用索引流式分选和单细胞RNA测序技术追踪流感疫苗接种后血凝素特异性B细胞,揭示了老年人记忆B细胞区室中FcRL5非典型表型发育不足的年龄相关偏斜 | 样本量较小(仅20名健康成人),未涵盖免疫功能受损或其他疾病人群 | 研究衰老如何影响记忆B细胞对流感疫苗的免疫反应 | 20名健康成年人的记忆B细胞 | 免疫学 | 老年疾病 | 索引流式分选,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 20名健康成年人 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6566 | 2025-10-06 |
Human Plasma Proteome During Normal Pregnancy
2022-11-04, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.2c00391
PMID:36154181
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研究论文 | 本研究通过基于适配体的平台分析了91例正常妊娠期间的血浆蛋白质组动态变化 | 首次大规模分析正常妊娠期间血浆蛋白质组动态变化,发现953个与孕周相关的蛋白质变化 | 样本量相对有限(91例妊娠),仅关注正常妊娠而未涉及产科疾病 | 探索正常妊娠期间血浆蛋白质组的动态变化及其与胎盘细胞动态的关系 | 91例正常妊娠妇女的528份血浆样本 | 蛋白质组学 | 妊娠相关 | 适配体蛋白质组学分析,单细胞RNA测序 | 机器学习预测模型 | 蛋白质组数据 | 91例正常妊娠的528份血浆样本 | NA | 适配体蛋白质组学分析 | NA | 基于适配体的蛋白质组分析平台 |
6567 | 2025-10-06 |
JAK2V617F mutation drives vascular resident macrophages toward a pathogenic phenotype and promotes dissecting aortic aneurysm
2022-11-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34469-1
PMID:36329047
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研究论文 | 本研究揭示了JAK2V617F突变通过驱动血管驻留巨噬细胞向致病表型转化促进主动脉夹层动脉瘤的机制 | 首次发现JAK2V617F突变通过调控血管周围组织驻留巨噬细胞的致病性促炎表型促进主动脉疾病发展 | NA | 探究JAK2V617F突变在主动脉疾病发展和并发症中的作用机制 | 骨髓增殖性肿瘤患者队列和基因修饰小鼠模型 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 骨髓增殖性肿瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6568 | 2025-10-06 |
Targeting cancer glycosylation repolarizes tumor-associated macrophages allowing effective immune checkpoint blockade
2022-11-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abj1270
PMID:36322632
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研究论文 | 本研究通过靶向去除肿瘤微环境中的唾液酸聚糖,重塑肿瘤相关巨噬细胞表型,增强免疫检查点阻断疗法的疗效 | 首次证明靶向去唾液酸化可重编程肿瘤相关巨噬细胞,并通过单细胞RNA测序揭示Siglec-E是TAMs上识别唾液酸聚糖的主要受体 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果需进一步验证 | 开发增强免疫检查点阻断疗法效果的新免疫治疗策略 | 肿瘤微环境中的唾液酸聚糖和肿瘤相关巨噬细胞 | 免疫肿瘤学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,抗体-唾液酸酶偶联技术 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6569 | 2025-10-06 |
Anti-CTLA-4 antibodies drive myeloid activation and reprogram the tumor microenvironment through FcγR engagement and type I interferon signaling
2022-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-022-00447-1
PMID:36302895
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了抗CTLA-4抗体通过FcγR结合和I型干扰素信号通路激活髓系细胞并重塑肿瘤微环境的新机制 | 首次在单细胞水平证明抗CTLA-4抗体的治疗效果主要依赖FcγR结合和先天免疫重塑,而非单纯的T细胞耗竭或CTLA-4阻断 | 研究主要关注治疗早期(24小时)的免疫变化,长期效应和临床转化仍需进一步验证 | 阐明抗CTLA-4检查点抑制剂的分子作用机制 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 遗传性T细胞消融模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6570 | 2025-10-06 |
Adult human kidney organoids originate from CD24+ cells and represent an advanced model for adult polycystic kidney disease
2022-11, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01202-z
PMID:36303074
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研究论文 | 本研究揭示了成人肾脏类器官起源于CD24+上皮细胞亚群,并建立了成人多囊肾病的先进疾病模型 | 首次确定肾脏类器官起源于CD24+上皮细胞亚群,并成功利用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建PKD1和PKD2敲除的类器官模型 | 未明确说明样本规模和来源限制 | 探究成人肾脏类器官的细胞起源并建立成人多囊肾病疾病模型 | 成人肾脏CD24+上皮细胞、多囊肾病患者组织和对照组织 | 疾病建模 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因编辑 | 类器官模型 | 基因表达数据、表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6571 | 2025-10-06 |
DNA sensor-associated type I interferon signaling is increased in ulcerative colitis and induces JAK-dependent inflammatory cell death in colonic organoids
2022-11-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00104.2022
PMID:36165492
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研究论文 | 本研究探讨DNA传感器通路在溃疡性结肠炎发病机制中的作用,发现I型干扰素信号增强并通过JAK依赖性途径诱导结肠上皮细胞炎症性死亡 | 首次揭示I型干扰素与TNF-α协同作用可通过JAK依赖性但炎症小体非依赖性途径诱导结肠类器官炎症性细胞死亡 | 研究主要基于体外类器官模型,需要进一步在体实验验证 | 探究DNA传感器通路在溃疡性结肠炎发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎患者结肠黏膜活检组织和人类结肠类器官 | 分子生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序,基因表达分析,细胞因子检测 | NA | 基因表达数据,细胞因子数据 | 对照组31例,非活动期UC 31例,活动期UC 33例,加上单细胞RNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6572 | 2025-10-06 |
Deterministic programming of human pluripotent stem cells into microglia facilitates studying their role in health and disease
2022-10-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2123476119
PMID:36251998
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研究论文 | 开发了一种从人类多能干细胞确定性编程为小胶质细胞的方法,用于研究其在健康和疾病中的作用 | 通过瞬时过表达PU.1和C/EBPβ转录因子,可在16天内从hPSCs获得同质的成熟小胶质细胞群 | NA | 建立可扩展的人类小胶质细胞来源,研究其在神经系统健康和疾病中的功能 | 人类多能干细胞(hPSCs)、小胶质样细胞(MGLs)、皮质神经元、脑类器官 | 干细胞生物学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序、细胞编程、共培养系统 | NA | 转录组数据、形态学数据、功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6573 | 2025-10-06 |
Loss of non-motor kinesin KIF26A causes congenital brain malformations via dysregulated neuronal migration and axonal growth as well as apoptosis
2022-10-24, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.09.011
PMID:36228617
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研究论文 | 本研究揭示了非运动驱动蛋白KIF26A功能丧失通过调节神经元迁移、轴突生长和细胞凋亡导致先天性脑畸形的机制 | 首次在人类患者中鉴定KIF26A双等位基因功能丧失变异与先天性脑畸形的关联,并利用小鼠和iPSC来源的类器官模型阐明其致病机制 | 研究主要聚焦于兴奋性神经元,对其他神经元类型的影响尚未充分探索 | 探究KIF26A在脑发育中的功能及其变异导致先天性脑畸形的分子机制 | KIF26A基因变异患者、小鼠模型、人iPSC来源的脑类器官 | 神经科学 | 先天性脑畸形 | 单细胞RNA测序、iPSC类器官培养、基因敲除 | 基因敲除模型 | 基因表达数据、形态学数据 | 患者队列、小鼠模型、人iPSC类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6574 | 2025-10-06 |
Lymphatic migration of unconventional T cells promotes site-specific immunity in distinct lymph nodes
2022-10-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.07.019
PMID:36002023
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研究论文 | 本研究揭示了非常规T细胞通过淋巴管迁移至局部引流淋巴结并塑造部位特异性免疫的机制 | 首次证明组织源性非常规T细胞通过淋巴途径迁移至引流淋巴结,并形成具有组织特异性的免疫反应单元 | 研究主要基于小鼠模型,人类中的适用性需要进一步验证 | 探究非常规T细胞在淋巴结部位特异性免疫形成中的作用机制 | 非常规T细胞和淋巴结免疫微环境 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 光谱流式细胞术, 光标记转基因小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6575 | 2025-10-06 |
Mouse embryo model derived exclusively from embryonic stem cells undergoes neurulation and heart development
2022-10-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.08.013
PMID:36084657
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研究论文 | 开发了一种完全由胚胎干细胞构建的小鼠胚胎模型,能够实现神经管形成和心脏发育 | 首次通过转录因子介导的诱导,建立了能够重建着床后胚胎多能性ESC谱系和两个胚外谱系的统一模型 | 模型在某些方面与自然胚胎程序存在差异 | 开发能够更全面模拟小鼠胚胎发育的体外模型 | 小鼠胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6576 | 2025-10-06 |
Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data
2022-10, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01167-z
PMID:36050550
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研究论文 | 提出单细胞疾病相关性评分方法,将单细胞RNA测序数据与多基因疾病风险在单细胞分辨率下关联 | 开发了独立于细胞类型注释的单细胞疾病相关性评分方法,能够识别GWAS疾病相关基因过度表达的单个细胞 | NA | 建立单细胞RNA测序数据与多基因疾病风险的关联分析方法 | 74种疾病/性状和130万个单细胞基因表达谱,涵盖31个组织/器官 | 单细胞基因组学 | 炎症性肠病,精神分裂症,代谢疾病 | 单细胞RNA测序,全基因组关联研究 | scDRS | 单细胞基因表达数据 | 130万个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6577 | 2025-10-06 |
Lipopolysaccharide distinctively alters human microglia transcriptomes to resemble microglia from Alzheimer's disease mouse models
2022-10-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.049349
PMID:36254682
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了不同刺激条件下人iPSC来源小胶质细胞的转录组变化,发现LPS+IFN-γ处理能使其转录组特征更接近阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞 | 首次系统比较了不同免疫刺激对人iPSC来源小胶质细胞转录组的影响,并发现LPS能特异性诱导其转录组特征向AD小鼠模型小胶质细胞转变 | 研究仅观察了24小时和48小时两个时间点的转录组变化,未涉及更长期的效应 | 探究不同免疫刺激对人iPSC来源小胶质细胞转录组的影响及其与阿尔茨海默病的相关性 | 人诱导多能干细胞来源的小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6578 | 2025-10-06 |
A cellular hierarchy in melanoma uncouples growth and metastasis
2022-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05242-7
PMID:36131018
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研究论文 | 本研究通过整合多种技术揭示了黑色素瘤中生长与转移由不同细胞群体支持的细胞层级模型 | 发现了黑色素瘤中生长能力与转移能力分别由不同细胞群体承担,且这些表型能力可通过特定微环境信号动态获得 | 研究主要基于小鼠模型,人类黑色素瘤中的适用性需要进一步验证 | 探索黑色素瘤细胞状态多样性的起源以及生长与转移的细胞基础 | 黑色素瘤细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学,空间转录组学,谱系追踪,定量建模 | 层级模型 | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
6579 | 2025-10-06 |
Single cell and spatial transcriptomic analyses reveal microglia-plasma cell crosstalk in the brain during Trypanosoma brucei infection
2022-09-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33542-z
PMID:36180478
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示布氏锥虫感染期间大脑中微胶质细胞与浆细胞的相互作用机制 | 首次发现稳态微胶质细胞与CD138浆细胞通过IL-10和BAFF信号传导的新型相互作用 | 对慢性布氏锥虫感染期间大脑转录和功能反应的理解仍不完整 | 研究布氏锥虫感染期间大脑的分子和细胞反应机制 | 小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | 寄生虫感染疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
6580 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals activation of core transcription factors in PRC2-deficient malignant peripheral nerve sheath tumor
2022-09-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111363
PMID:36130486
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示PRC2缺陷型恶性外周神经鞘瘤中核心转录因子的激活机制 | 发现PRC2缺失通过双重致癌机制:重塑二价染色质和增强子景观,同时降低I型干扰素信号和抗原呈递 | NA | 阐明PRC2缺失在恶性外周神经鞘瘤中的致癌机制 | PRC2缺陷型恶性外周神经鞘瘤细胞和正常雪旺细胞 | 单细胞测序 | 恶性外周神经鞘瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |