单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 37711 篇文献，本页显示第 6561 - 6580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6561 | 2025-11-30 |
FSTL1 is a prognostic marker and promotes invasion and metastasis of colon cancer
2025-Nov-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03989-9
PMID:41296128
|
研究论文 | 本研究探讨FSTL1在结直肠癌中的表达特征、预后价值及其促进肿瘤侵袭转移的机制 | 首次系统揭示FSTL1在结直肠癌中的多组学特征，发现其通过APP-CD74通路影响肿瘤微环境重塑，并鉴定阿西替尼作为潜在靶向治疗药物 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证部分仅限于体外细胞实验 | 阐明FSTL1在结直肠癌发病机制中的作用及其临床意义 | 结直肠癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,基因集富集分析,蛋白质相互作用网络分析 | ESTIM算法,TIDE数据库分析 | 基因表达数据,单细胞测序数据,蛋白质表达数据 | 来自GEO数据库的多个结直肠癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6562 | 2025-11-30 |
A biomimetic senotherapy replenishing MAT2A promotes wound regeneration in preclinical models
2025-Nov-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65659-2
PMID:41298385
|
研究论文 | 本研究揭示了MAT2A在糖尿病伤口愈合中的关键作用，并开发了一种基于仿生策略的靶向衰老治疗方法 | 发现MAT2A下调通过影响HMGCS1表达和辅酶Q合成诱导周细胞衰老，并首次开发了包裹自扩增RNA纳米颗粒的周细胞膜仿生疗法 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中得到验证 | 探究糖尿病伤口中持续炎症浸润的机制并开发促进伤口再生的治疗方法 | 周细胞、巨噬细胞、糖尿病伤口模型 | 细胞生物学 | 糖尿病伤口 | 单细胞测序，基因编辑小鼠模型，纳米颗粒技术 | Cspg4-CreER/+; Mat2a基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6563 | 2025-11-30 |
Single-cell and bulk transcriptomics reveal Fusobacterium nucleatum promotes colorectal cancer metastasis by upregulating LAMC2 in in vitro and in vivo models
2025-Nov-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26249-w
PMID:41298762
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组学分析，揭示具核梭杆菌通过上调LAMC2促进结直肠癌转移的分子机制 | 首次阐明具核梭杆菌通过下调hsa-miRNA-7977解除对LAMC2的转录抑制，进而激活FAK-PI3K-AKT信号通路和调节H3K27组蛋白乙酰化的新机制 | 研究主要基于体外和动物模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究LAMC2在具核梭杆菌诱导的结直肠癌转移中的作用机制 | 结直肠癌细胞系、动物模型和临床组织样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序, 批量转录组测序, 免疫组织化学, 透射电子显微镜, 伤口愈合实验, Transwell迁移实验 | Cox回归模型 | 基因表达数据, 组织图像数据 | 多个独立队列的临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6564 | 2025-11-30 |
Comprehensive single-cell RNA analysis reveals intertumoral microenvironment heterogeneity and hub niche of carcinogenesis in thyroid cancer
2025-Nov-26, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00924-7
PMID:41298873
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析甲状腺癌肿瘤微环境的细胞异质性和关键生态位 | 首次在甲状腺癌中鉴定出CD4+HSPA1A+T细胞等新型细胞亚群，并揭示APOE+巨噬细胞、EMT样癌症相关成纤维细胞和RBP7+内皮细胞构成的关键生态位 | 样本量相对有限（50个癌组织和14个正常组织），需要更大规模验证 | 解析甲状腺癌肿瘤微环境的细胞异质性和分子机制 | 甲状腺癌患者组织样本（包括乳头状癌、间变性癌和转移性肿瘤）及正常甲状腺组织 | 单细胞转录组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫组织化学 | PCA，UMAP，AUCell，CellChat，NicheNet | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 50个甲状腺癌样本和14个正常甲状腺组织，共405,077个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6565 | 2025-11-30 |
Spatial omics in 3D culture model systems: decoding cellular positioning mechanisms and microenvironmental dynamics
2025-Nov-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07390-6
PMID:41299674
|
综述 | 探讨空间组学技术与3D培养模型系统的整合应用，解析细胞定位机制和微环境动态 | 聚焦前沿空间组学技术与3D培养模型的无缝整合，提供基因、蛋白质、代谢物和染色质景观的空前图谱 | 复杂多模态数据集的系统整合及其向临床可用生物标志物的转化仍面临巨大挑战 | 深化对组织模式、疾病进展和治疗干预空间动态的理解 | 类器官、肿瘤球体、3D生物打印构建体等3D培养模型 | 空间组学 | 肿瘤 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间表观基因组学 | NA | 分子信息、空间定位数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 空间表观基因组学 | NA | 高分辨率空间组学平台与生物打印组织、微流体器官芯片等精密工程3D模型结合 |
| 6566 | 2025-11-30 |
Single-cell RNA-seq of small-intestinal neuroendocrine tumors reveals the cell of origin and gene expression of early tumor development
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116500
PMID:41175375
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小肠神经内分泌肿瘤的细胞起源和早期肿瘤发展的基因表达轨迹 | 首次在遗传性SI-NET患者中鉴定出位于隐窝+4位置及以下的CES1(+)、LCN15(-)肠嗜铬细胞亚群为肿瘤起源细胞，并发现PRODH2作为前体细胞的关键生物标志物 | 研究聚焦于遗传性SI-NET患者，结果在散发性病例中的普适性需进一步验证 | 阐明小肠神经内分泌肿瘤的细胞起源和早期发展机制 | 遗传性小肠神经内分泌肿瘤患者的多发性同步肿瘤和前体病变 | 单细胞组学 | 小肠神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 遗传性SI-NET患者的多发性肿瘤和前体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6567 | 2025-11-30 |
Monocyte-derived cells promote transient insult-induced brain injury by enhancing CD8+ T cell response
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116528
PMID:41205172
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现单核来源细胞通过增强CD8+ T细胞反应促进短暂损伤诱导的脑损伤 | 首次揭示单核来源的cDC2样细胞在脑损伤中通过CD28-CD80/CD86共刺激信号调控CD8+ T细胞反应的新机制 | 研究主要基于辐射诱导脑损伤模型，其他类型脑损伤的普适性需要进一步验证 | 探究短暂损伤诱导脑损伤中免疫细胞的调控机制 | 辐射诱导脑损伤患者和实验性脑卒中模型 | 单细胞测序分析 | 脑损伤 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 辐射诱导脑损伤患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 6568 | 2025-11-30 |
Multi-omics analyses reveal DjTcf4 critical for proper timing of differentiation in planarian regeneration
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116551
PMID:41231672
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示DjTcf4在涡虫再生过程中对细胞分化时机的关键调控作用 | 构建了首个涡虫基因组重注释、3D空间转录组、单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序的多组学图谱，发现DjTcf4在再生过程中具有非经典功能 | 研究局限于日本三角涡虫模型，未在其他再生生物中进行验证 | 阐明涡虫再生过程中芽基细胞组成和转录景观的动态变化机制 | 日本三角涡虫(Dugesia japonica)的再生过程 | 发育生物学,再生医学 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,空间转录组,基因组重注释 | NA | 基因组数据,转录组数据,表观基因组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,空间转录组 | NA | NA |
| 6569 | 2025-11-30 |
Intermediate filaments promote glioblastoma cell invasion by controlling nuclear deformations and mechanosensitive expression of MMP14
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116553
PMID:41241939
|
研究论文 | 本研究揭示中间丝通过调控核变形和机械敏感性MMP14表达促进胶质母细胞瘤细胞侵袭的机制 | 发现中间丝在降低细胞变形性的同时反而促进3D侵袭，并阐明其通过缓冲核变形和上调MMP14表达的机械敏感机制 | NA | 探究中间丝在胶质母细胞瘤细胞侵袭中的作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6570 | 2025-11-30 |
Epigenetic and transcriptional programming of murine eosinophils in the esophagus
2025-Nov-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65440-5
PMID:41290588
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序、表观基因组图谱和流式细胞术分析小鼠食管嗜酸性粒细胞在过敏性炎症中的表观遗传和转录编程 | 首次揭示食管嗜酸性粒细胞的组织特异性是通过局部环境信号诱导全基因组表观遗传重编程实现的，并建立了小鼠组织嗜酸性粒细胞的公开表观遗传数据库 | 研究主要基于小鼠模型，虽然显示与人类存在保守性，但需要进一步的人类样本验证 | 探究食管嗜酸性粒细胞在过敏性炎症中的表观遗传和转录调控机制 | 小鼠食管嗜酸性粒细胞 | 单细胞组学 | 过敏性疾病 | 单细胞测序,表观基因组图谱,流式细胞术,基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据,表观基因组数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,表观基因组学 | NA | NA |
| 6571 | 2025-11-30 |
The AML cellular state space unveils NPM1 immune evasion subtypes with distinct clinical outcomes
2025-Nov-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66546-6
PMID:41290664
|
研究论文 | 通过基因组和转录组分析揭示急性髓系白血病的细胞状态空间，发现NPM1突变亚型具有不同的免疫逃逸机制和临床结局 | 首次在单细胞水平将NPM1突变AML分为两个具有不同免疫特征和临床预后的亚型 | 样本量相对有限(120例AML)，需要更大规模验证 | 解析急性髓系白血病的细胞异质性并完善其分类系统 | 120例急性髓系白血病患者样本 | 单细胞基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,基因组分析,转录组分析 | 聚类分析 | 单细胞RNA测序数据,基因组数据,转录组数据 | 120例AML患者，包含超过90,000个未成熟AML细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6572 | 2025-11-30 |
Pharmacological induction of acetyl-CoA carboxylase 1 autophagic degradation attenuates lipid accumulation and cholangiocarcinoma progression
2025-Nov-25, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03564-8
PMID:41291880
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高通量筛选发现Withaferin A可通过诱导ACC1自噬降解抑制脂质积累和胆管癌进展 | 首次揭示Withaferin A通过抑制ACC1活性并诱导其自噬降解来阻断脂质合成的分子机制 | 临床前研究阶段，尚未进行人体临床试验 | 探索靶向脂质代谢的胆管癌治疗新策略 | 胆管癌细胞系和动物模型 | 癌症代谢研究 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序, 高通量筛选, 液相色谱-串联质谱 | NA | 基因表达数据, 代谢组学数据 | 994种生物活性化合物筛选 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 6573 | 2025-11-30 |
Biphasic inflammation control by fibroblasts enables spinal cord regeneration in zebrafish
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116469
PMID:41134665
|
研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼成纤维细胞通过双相炎症控制促进脊髓再生的机制 | 首次发现成纤维细胞具有诱导和消退炎症的双重功能，并鉴定出瞬时cthrc1a成纤维细胞状态 | 研究仅限于斑马鱼模型，未在哺乳动物中验证 | 探究中枢神经系统再生过程中成纤维细胞与免疫细胞的相互作用机制 | 斑马鱼脊髓损伤模型 | 发育生物学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6574 | 2025-11-30 |
Oncogenic Ras activation in permissive somatic cells triggers rapid-onset phenotypic plasticity and elicits a tumor-promoting neutrophil response
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116478
PMID:41138187
|
研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型揭示了致癌Ras激活在24小时内诱导表型可塑性并触发促肿瘤中性粒细胞反应的机制 | 首次在单细胞水平实时观察致癌Ras激活后24小时内的细胞内在反应和先天免疫响应，揭示了表型可塑性与促肿瘤炎症之间的早期关联 | 研究基于斑马鱼模型，在哺乳动物系统中的适用性需要进一步验证 | 探究致癌突变如何触发表型可塑性和肿瘤促进性炎症的早期机制 | 斑马鱼模型中的基底角质形成细胞和中性粒细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序, 活体实时成像 | 斑马鱼HRAS介导的皮肤肿瘤模型 | 单细胞RNA测序数据, 活体成像数据 | 斑马鱼模型中的基底角质形成细胞亚群 | NA | 单细胞RNA-seq, 活体成像 | NA | NA |
| 6575 | 2025-11-30 |
Exploring the role of β2-microglobulin in the relationship between physical activity and DNAm-predicted PhenoAge: Evidence from a population-based and mice single-cell RNA-sequencing study
2025-Nov-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.11.047
PMID:41285310
|
研究论文 | 本研究通过人群数据和单细胞测序探索β2-微球蛋白在体力活动与表观遗传年龄关系中的中介作用 | 首次结合人群流行病学研究和动物单细胞测序揭示β2M在体力活动延缓衰老中的分子机制 | 观察性研究设计无法确定因果关系，样本量相对有限 | 探究体力活动通过β2M影响表观遗传衰老的分子机制 | 936名美国人群和运动干预的小鼠 | 表观遗传学 | 衰老相关疾病 | DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序 | 加权多元回归, 中介效应模型 | 血液样本, 表观遗传数据, 单细胞转录组数据 | 936名人群参与者+小鼠外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 6576 | 2025-11-30 |
Applications of Genome-wide Screening of CRISPR/Cas9 Knockout Library in Identifying Novel Molecular Targets for Xenobiotics
2025-Nov-21, Environment & health (Washington, D.C.)
DOI:10.1021/envhealth.5c00072
PMID:41306301
|
综述 | 本文综述了全基因组CRISPR/Cas9敲除库筛选在识别外源性物质新型分子靶点中的应用 | 系统总结了CRISPR/Cas9文库筛选技术在外源性致病因子机制研究中的创新应用，包括与单细胞测序和类器官技术的结合 | 未提及具体实验数据或案例研究的局限性 | 探讨全基因组CRISPR/Cas9敲除库筛选在识别外源性物质分子靶点中的应用价值 | 外源性致病因子（环境致癌物、病原体、化学污染物） | 基因组编辑技术 | 肿瘤、感染性疾病、中毒性疾病 | CRISPR/Cas9基因组编辑、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 全基因组筛选、单细胞测序 | NA | NA |
| 6577 | 2025-11-30 |
TGFB2/IGFBP5 activated by transcription factors STAT2 and SMAD3 initiate granulosa cell degeneration and cause follicular atresia in chickens
2025-Nov, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105747
PMID:40902342
|
研究论文 | 本研究通过鉴定TGFB2和IGFBP5的启动子区域，结合DNA pull-down和单细胞RNA测序数据分析，揭示了STAT2和SMAD3转录因子在鸡卵泡闭锁过程中调控颗粒细胞退化的分子机制 | 首次发现STAT2是TGFB2和IGFBP5的共同转录因子，并揭示了JAK/STAT与TGF-β/SMAD信号通路在卵泡闭锁中的协同调控作用 | NA | 阐明鸡卵泡闭锁过程中颗粒细胞退化的分子调控机制 | 鸡颗粒细胞和卵泡闭锁过程 | 分子生物学 | 生殖系统疾病 | DNA pull-down, 质谱分析, 单细胞RNA测序, SCENIC分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6578 | 2025-11-30 |
Construction and differential analysis of testicular atlas between 10-week-old and 23-week-old ducks using single-cell RNA sequencing
2025-Nov, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105715
PMID:40884870
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了10周龄和23周龄鸭睾丸细胞图谱并进行差异分析 | 首次建立了禽类精子发生的高分辨率细胞图谱，发现了新的分子标记物和调控网络 | 仅研究了两个发育阶段，未涵盖完整的发育过程 | 探索鸭睾丸发育和精子发生的分子机制 | 10周龄和23周龄鸭睾丸细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 54,702个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6579 | 2025-11-30 |
Cleanet: Robust Doublet Detection in Cytometry Data Based on Protein Expression Patterns
2025-Nov, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24961
PMID:41065042
|
研究论文 | 提出了一种基于蛋白质表达模式的自动化双联体检测方法Cleanet，用于流式细胞术和质谱流式细胞术数据 | 首次将单细胞转录组学中的双联体模拟方法应用于细胞术领域，能够自动检测同型和异型双联体并进行分类 | NA | 开发自动化双联体检测方法以改进细胞术数据分析 | 流式细胞术和质谱流式细胞术数据中的双联体事件 | 生物信息学 | 免疫学相关疾病 | 质谱流式细胞术，流式细胞术，成像流式细胞术 | 基于蛋白质表达模式的相似性检测算法 | 蛋白质表达数据，细胞图像数据 | NA | Luminex, Millipore Sigma | 质谱流式细胞术，流式细胞术，成像流式细胞术 | ImageStream, Discover A8 | 成像流式细胞术平台 |
| 6580 | 2025-11-30 |
Tumor-intrinsic MHC-II activation in pancreatic ductal adenocarcinoma enhances immune response and treatment efficacy
2025-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.21.683745
PMID:41278823
|
研究论文 | 本研究探讨胰腺导管腺癌中恶性细胞固有MHC-II表达对免疫微环境和治疗效果的调控作用 | 首次系统揭示恶性细胞固有MHC-II表达在PDAC中的预后价值及其通过增强抗原呈递促进抗肿瘤免疫的机制 | 研究主要基于临床前模型，需要在更大规模的人类队列中验证 | 探究MHC-II在PDAC恶性细胞中的表达特征及其对免疫治疗疗效的影响 | 人类PDAC样本和KPC小鼠PDAC模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,多重免疫组织化学,体外培养实验 | NA | 基因表达数据,空间定位数据,组织切片图像 | 人类PDAC样本和KPC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |