单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 6561 - 6580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6561 | 2024-11-06 |
Treatment of HCC with claudin-1-specific antibodies suppresses carcinogenic signaling and reprograms the tumor microenvironment
2023-02, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.10.011
PMID:36309131
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研究论文 | 研究探讨了靶向非连接区Claudin-1（CLDN1）的单克隆抗体在肝细胞癌（HCC）治疗中的作用 | 首次探索了非连接区CLDN1作为HCC治疗靶点的潜力，并展示了其在抑制肿瘤生长和重编程肿瘤微环境中的显著效果 | 研究主要基于细胞系和动物模型，尚未进行临床试验 | 研究CLDN1作为HCC治疗靶点的潜力及其在抑制肿瘤生长和重编程肿瘤微环境中的作用 | 肝细胞癌（HCC）患者来源的细胞系和动物模型 | NA | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大量患者来源的细胞系和动物模型 |
| 6562 | 2024-11-06 |
Network analysis between neuron dysfunction and neuroimmune response based on neural single-cell transcriptome of COVID-19 patients
2022-11, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106055
PMID:36137317
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研究论文 | 研究基于COVID-19患者神经单细胞转录组数据，分析神经元功能障碍与神经免疫反应之间的网络关系 | 首次揭示了星形胶质细胞在COVID-19感染中的免疫相关因子表达，并分析了其与微胶质细胞和兴奋性神经元的相互作用 | 研究主要基于单细胞转录组数据，缺乏功能实验验证 | 探讨COVID-19感染引起的神经元功能障碍与神经免疫反应之间的关系 | COVID-19患者的内侧前额叶皮层单细胞数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | RNA-seq和scRNA-seq数据 | 涉及COVID-19患者的外周血和多组织样本 |
| 6563 | 2024-11-06 |
Comparative analysis of transcriptome remodeling in plaque-associated and plaque-distant microglia during amyloid-β pathology progression in mice
2022-Sep-24, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02581-0
PMID:36153535
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研究论文 | 本研究通过结合细胞特异性激光捕获显微切割和RNA测序分析，比较了在阿尔茨海默病小鼠模型中，与淀粉样β斑块相关的微胶质细胞（PAM）和远离斑块的微胶质细胞（PCM）在疾病不同阶段的转录组重塑情况 | 本研究首次直接比较了PAM和PCM在阿尔茨海默病进展中的转录组变化，揭示了微胶质细胞在疾病不同阶段的动态变化及其潜在功能 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨微胶质细胞在阿尔茨海默病进展中的不同作用及其转录组变化 | 与淀粉样β斑块相关的微胶质细胞（PAM）和远离斑块的微胶质细胞（PCM） | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型中的微胶质细胞样本 |
| 6564 | 2024-11-04 |
Deciphering craniopharyngioma subtypes: Single-cell analysis of tumor microenvironment and immune networks
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111068
PMID:39483146
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了颅咽管瘤（包括成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型）的肿瘤微环境和免疫网络 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型颅咽管瘤的细胞组成、肿瘤组织多样性和细胞间相互作用 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示颅咽管瘤的细胞组成和免疫网络 | 成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型颅咽管瘤 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6565 | 2024-11-04 |
A modified model of PANoptosisto identify prognosis and immunotherapy response in bladder cancer
2024-Nov, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2024.106672
PMID:39368544
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研究论文 | 研究了广泛性凋亡相关修饰模式在膀胱癌中的作用机制，并构建了一个风险模型用于预测膀胱癌患者的预后和免疫治疗反应 | 提出了一个改进的PANoptosis模型，用于识别膀胱癌的预后和免疫治疗反应 | NA | 研究广泛性凋亡相关修饰模式在膀胱癌中的作用机制 | 膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | 风险模型 | 转录组数据 | NA |
| 6566 | 2024-11-04 |
Investigation of human aging at the single-cell level
2024-Nov, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2024.102530
PMID:39395577
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用 | 本文讨论了多种单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用，并探讨了多组学层在单细胞中的结合以及与空间转录组学和质谱等先进方法的整合 | NA | 探讨单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用 | 人类衰老的机制和相关疾病 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组数据 | NA |
| 6567 | 2024-11-04 |
Revealing molecular mechanisms of early-onset tongue cancer by spatial transcriptomics
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76044-2
PMID:39482351
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了早发性舌癌的分子机制 | 首次成功整合了来自FF和FFPE样本的空间转录组学数据，并揭示了早发性舌癌的独特特征 | 样本量较小，仅包括9名患者 | 探讨早发性舌癌的分子机制及其与老年患者的差异 | 早发性舌癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 舌癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 9名舌鳞状细胞癌患者，分为年轻组（5名）和老年组（4名） |
| 6568 | 2024-11-04 |
Prostaglandin E2-EP2/EP4 signaling induces immunosuppression in human cancer by impairing bioenergetics and ribosome biogenesis in immune cells
2024-Nov-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53706-3
PMID:39487111
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研究论文 | 研究了前列腺素E2（PGE2）通过EP2/EP4信号通路在人类癌症中诱导免疫抑制的机制 | 首次揭示了PGE2通过EP2/EP4信号通路影响肿瘤微环境中免疫细胞的生物能量代谢和核糖体生物发生，从而抑制免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型和人类癌症样本的单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 探讨前列腺素E2在肿瘤微环境中对免疫细胞的影响及其机制 | 人类癌症中的免疫细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类癌症样本和小鼠同基因肿瘤模型中的免疫细胞 |
| 6569 | 2024-11-04 |
Characterization of metastasis-specific macrophages in colorectal cancer for prognosis prediction and immunometabolic remodeling
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77248-2
PMID:39487182
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研究论文 | 本研究开发了一种预测结直肠癌肝转移和预后的预测模型，通过识别特定的巨噬细胞亚群 | 首次基于EEF1G+巨噬细胞基因特征构建了8基因风险模型EMGS，用于预测结直肠癌肝转移患者的预后 | 研究主要基于公开数据库的数据，缺乏临床验证 | 预测结直肠癌肝转移患者的预后并识别潜在的治疗靶点 | 结直肠癌肝转移患者的巨噬细胞亚群及其基因特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 使用了GSE231559、TCGA和GEO数据库的数据 |
| 6570 | 2024-11-04 |
Mechanism differences in the start time of sublingual immunotherapy in a mouse allergic airway inflammation model
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78062-6
PMID:39487347
|
研究论文 | 研究了在过敏性气道炎症小鼠模型中，舌下免疫疗法（SLIT）的启动时间机制差异 | 首次详细研究了SLIT在预防性和治疗性模型中的时机差异及其对免疫耐受的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 评估SLIT在预防性和治疗性模型中的疗效及其机制 | 过敏性气道炎症小鼠模型中的SLIT效果 | NA | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和T细胞受体测序 | NA | RNA序列和T细胞受体序列 | 小鼠样本 |
| 6571 | 2024-11-04 |
Genetic association between epilepsy and gliomas: Insights from Mendelian randomization and single-cell transcriptomic analyses
2024-Nov-01, Epilepsy & behavior : E&B
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.yebeh.2024.110114
PMID:39488096
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研究论文 | 研究探讨了癫痫与胶质瘤之间的遗传关联及其生物学机制 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞转录组分析揭示了癫痫与胶质瘤之间的潜在因果关系 | NA | 探讨癫痫与胶质瘤之间的遗传关联及其生物学机制 | 癫痫与胶质瘤的遗传变异及其在胶质瘤进展中的作用 | NA | 脑肿瘤 | 全基因组关联研究、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的GSE221534数据集进行分析 |
| 6572 | 2024-11-04 |
SPP1+ macrophages and FAP+ fibroblasts promote the progression of pMMR gastric cancer
2024-Oct-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76298-w
PMID:39482333
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研究论文 | 研究了错配修复状态对胃癌肿瘤免疫微环境的影响 | 首次揭示了pMMR胃癌中GC2细胞、SPP1+巨噬细胞和FAP+成纤维细胞在促进肿瘤进展中的作用 | 样本量相对较小，且仅限于特定类型的胃癌患者 | 探讨错配修复状态对胃癌肿瘤免疫微环境的影响 | 胃癌患者的肿瘤组织和正常组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 33个新鲜组织样本，来自25名患者，包括10个正常组织、6个dMMR肿瘤组织和17个pMMR肿瘤组织 |
| 6573 | 2024-11-04 |
Hyperuricemia suppresses lumican, exacerbating adverse remodeling after myocardial infarction by promoting fibroblast phenotype transition
2024-Oct-31, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05778-4
PMID:39482719
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研究论文 | 研究尿酸血症通过抑制lumican表达加剧心肌梗死后不良重塑的机制 | 首次揭示了尿酸血症通过减少lumican表达促进心肌梗死后纤维母细胞表型转变，从而加剧不良心脏重塑 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在临床患者中验证 | 探讨尿酸血症在心肌梗死病理过程中的作用及其机制 | 尿酸血症对心肌梗死后心脏重塑的影响 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 酶联免疫吸附测定、免疫荧光、单细胞RNA测序、Western blotting、实时定量PCR | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 痛风患者、心衰患者和小鼠模型的数据 |
| 6574 | 2024-11-04 |
Theoretical framework for the difference of two negative binomial distributions and its application in comparative analysis of sequencing data
2024-Oct-29, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278843.123
PMID:39406498
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研究论文 | 本文推导了两个负二项分布差异的理论框架，并将其应用于单细胞RNA测序数据中差异表达基因的检测 | 提出了一个新的计算方法DEGage，用于检测单细胞RNA测序数据中的差异表达基因，并展示了其在模拟和真实数据集上的优越性能 | NA | 推导两个负二项分布差异的理论结果，并开发新的计算方法用于差异表达基因的检测 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及17种细胞类型的前列腺癌单细胞RNA测序数据集以及小鼠神经元单细胞RNA测序数据集 |
| 6575 | 2024-11-04 |
Inhibitory Fcγ receptor deletion enhances CD8 T cell stemness increasing anti-PD-1 therapy responsiveness against glioblastoma
2024-Oct-26, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009449
PMID:39461881
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研究论文 | 研究通过删除抑制性Fcγ受体增强CD8 T细胞的干细胞特性，从而提高抗PD-1疗法对胶质母细胞瘤的响应 | 首次探讨了通过删除FcγRIIB受体来增强CD8 T细胞的干细胞特性，从而提高抗PD-1疗法对胶质母细胞瘤的响应 | 研究仅在鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 探讨通过调节CD8 T细胞的干细胞特性来提高免疫检查点阻断疗法对胶质母细胞瘤的疗效 | CD8 T细胞、FcγRIIB受体、胶质母细胞瘤 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用Fcgr2b-/-小鼠和GL261胶质母细胞瘤模型进行研究 |
| 6576 | 2024-11-04 |
Single-nucleus transcriptional and chromatin accessibility analyses of maturing mouse Achilles tendon uncover the molecular landscape of tendon stem/progenitor cells
2024-Oct-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.619991
PMID:39484401
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研究论文 | 研究通过单核转录组和染色质可及性分析，揭示了成熟小鼠跟腱中肌腱干细胞/祖细胞的分子特征 | 首次鉴定出CD55和CD248作为肌腱干细胞/祖细胞的新型表面抗原标记物 | NA | 探讨肌腱干细胞/祖细胞在不同生长阶段的特征及其在肌腱修复中的作用 | 小鼠跟腱细胞中的肌腱干细胞/祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、单核ATAC测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 2周龄和6周龄小鼠的跟腱细胞 |
| 6577 | 2024-11-04 |
SPI1+CD68+ macrophages as a biomarker for gastric cancer metastasis: a rationale for combined antiangiogenic and immunotherapy strategies
2024-Oct-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009983
PMID:39455096
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研究论文 | 本研究探讨了SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞在胃癌转移中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 首次揭示了SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞在胃癌中的高表达与转移性病变的关系，并探讨了其在免疫治疗和抗血管生成治疗中的潜在作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步的人体临床试验验证 | 评估SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞在胃癌中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 胃癌组织中的SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞及其在肿瘤进展和治疗中的作用 | NA | 胃癌 | 免疫组织化学、免疫荧光、流式细胞术、单细胞转录组分析、多重荧光免疫组织化学、染色质免疫沉淀 | NA | 组织 | NA |
| 6578 | 2024-11-04 |
Development of a humanized mouse model with functional human materno-fetal interface immunity
2024-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176527
PMID:39435662
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研究论文 | 开发了一种具有功能性人类母胎界面免疫的人源化小鼠模型 | 通过busulfan预处理，成功构建了怀孕的人类免疫系统（HIS）小鼠模型，该模型在母胎界面重构了多谱系的人类免疫子集 | NA | 研究人类母胎界面免疫的功能和特征 | 人类母胎界面免疫 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 6579 | 2024-11-04 |
Contrasting the development of larval and adult body plans during the evolution of biphasic lifecycles in sea urchins
2024-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.203015
PMID:39465623
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研究论文 | 研究了海胆在双相生命周期中幼体和成体体型的发育过程 | 使用单细胞RNA测序分析了加速的非摄食型幼体发育模式，并发现了与摄食型幼体相比的细胞类型特化变化 | NA | 探讨双相生命周期中幼体和成体发育的调控机制 | 海胆Heliocidaris erythrogramma的发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 从胚胎到变态前一天的海胆Heliocidaris erythrogramma幼体样本 |
| 6580 | 2024-11-04 |
A Part-to-Whole Circular Cell Explorer
2024-Oct-14, ArXiv
PMID:39483344
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研究论文 | 设计了一种交互式可视化分析系统，用于解决现有空间转录组学方法中的感知问题，并增加了过滤、钻取和聚类分析功能 | 提出了一种新的交互式可视化分析系统，解决了现有方法中的感知问题，并增加了多种分析功能 | NA | 帮助研究人员深入理解组织内复杂生物过程的分子机制 | 空间转录组学中的细胞测量数据，如基因表达和细胞类型 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |