单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6541 - 6560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6541 | 2025-10-06 |
Fast intratumor heterogeneity inference from single-cell sequencing data
2022-Sep, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00298-x
PMID:38177468
|
研究论文 | 介绍了一种从单细胞测序数据推断肿瘤内异质性的计算方法HUNTRESS | 提出运行时间与细胞数量呈线性、与突变数量呈二次方关系的高效算法，能在合理条件下以高概率计算肿瘤真实进展历史 | NA | 从单细胞测序数据推断肿瘤内异质性 | 肿瘤细胞 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | HUNTRESS算法 | 基因型矩阵 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6542 | 2025-10-06 |
Cellular mechanisms of oligoclonal vascular smooth muscle cell expansion in cardiovascular disease
2023-05-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac138
PMID:35994249
|
研究论文 | 本研究探讨了心血管疾病中血管平滑肌细胞寡克隆扩张的细胞机制 | 首次揭示了健康动脉中罕见SCA1+ VSMCs具有更高的增殖能力，并证明VSMC低频率增殖激活是其细胞固有特征 | 研究主要基于动物模型，人类样本验证有限 | 理解血管平滑肌细胞寡克隆性产生的细胞机制 | 血管平滑肌细胞(VSMCs) | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 共聚焦显微镜，单细胞RNA测序 | VSMC谱系追踪动物模型 | 图像，单细胞转录组数据 | VSMC谱系追踪动物模型，健康人类主动脉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6543 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics for the assessment of cardiac disease
2023-05, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-022-00805-7
PMID:36539452
|
综述 | 概述单细胞转录组学在心脏疾病研究中的应用与挑战 | 整合单细胞数据与空间转录组学技术，揭示心脏细胞微环境在稳态和疾病进展中的调控作用 | 指出心脏细胞注释缺乏标准化是当前领域亟待解决的问题 | 探讨单细胞转录组学技术对心脏疾病机制研究和临床诊疗的推动作用 | 心脏主要细胞类型（从发育到成年期的健康与疾病状态） | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, 单核转录组测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6544 | 2025-10-06 |
Placental Inflammation Leads to Abnormal Embryonic Heart Development
2023-03-21, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过建立胎盘炎症模型，揭示了中性粒细胞驱动的胎盘炎症如何通过改变胎盘屏障功能导致胚胎心脏发育异常 | 首次阐明了胎盘炎症通过母源炎症单核细胞迁移至胚胎心脏，改变心脏巨噬细胞组成和心脏结构的机制 | 研究仅使用小鼠模型，人类临床相关性尚需验证 | 探究胎盘发育异常导致先天性心脏病的机制 | 妊娠期小鼠及其胚胎 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 流式细胞术, 组织学分析, 批量RNA测序, 单细胞测序, 超声心动图 | NA | 基因表达数据, 细胞组成数据, 组织图像, 心脏功能数据 | 妊娠期小鼠模型，在胚胎期4.5、7.5和14.5天以及出生后5和28天进行分析 | NA | 单细胞测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6545 | 2025-10-06 |
MARVEL: an integrated alternative splicing analysis platform for single-cell RNA sequencing data
2023-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac1260
PMID:36631981
|
研究论文 | 开发了一个用于单细胞RNA测序数据的综合可变剪接分析平台MARVEL | 首个适用于平板和液滴法的综合单细胞剪接分析R包，能系统整合剪接和基因表达分析 | NA | 解决单细胞分辨率下剪接动态分析计算工具缺乏的问题 | 多种细胞类型（包括疾病状态）的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个公开数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 适用于平板和液滴法的单细胞RNA测序数据 |
| 6546 | 2025-10-06 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Inflammation and Antitumor Immunity
2023-03-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1031
PMID:36399325
|
综述 | 本文系统阐述了癌症相关成纤维细胞在肿瘤相关炎症和抗肿瘤免疫中的双重作用 | 通过单细胞测序技术揭示了CAF的异质性和可塑性，并系统总结了其在肿瘤促进性炎症和免疫抑制中的新机制 | 作为综述文章，不涉及原始实验数据，主要基于已有研究进行总结和分析 | 探讨癌症相关成纤维细胞在肿瘤微环境炎症反应和免疫调节中的作用机制 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的功能 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6547 | 2025-10-06 |
Transcriptomic analyses reveal neuronal specificity of Leigh syndrome associated genes
2023-03, Journal of inherited metabolic disease
IF:4.2Q2
DOI:10.1002/jimd.12578
PMID:36502462
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了Leigh综合征相关基因在大脑中的神经元特异性表达模式 | 首次系统性地分析了所有Leigh综合征相关基因在大脑不同细胞类型中的表达特异性，并发现了与帕金森病和癫痫的遗传共通性 | 研究依赖于现有的公共数据库数据，缺乏实验验证 | 确定Leigh综合征相关基因在大脑中的细胞特异性，并探索与其他神经疾病的遗传共通性 | Leigh综合征相关基因和大脑不同细胞类型 | 生物信息学 | Leigh综合征 | 共表达网络分析, 表达加权细胞类型富集分析, 单细胞RNA测序 | CoExp网络分析, EWCE分析 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 基于英国大脑表达联盟数据的分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组分析 | NA | NA |
| 6548 | 2025-10-06 |
Preparation of single-cell suspensions from the human placenta
2023-03, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-022-00772-w
PMID:36451054
|
研究论文 | 开发了一种从人类胎盘组织制备高质量单细胞悬液的实验方案 | 首次描述了从胎盘组织制备单细胞悬液的标准化流程，填补了该领域的方法空白 | 需要具备胎盘结构基础知识的合格研究人员操作，未在多种实验条件下验证 | 建立适用于单细胞RNA测序的胎盘组织单细胞悬液制备方法 | 人类胎盘组织（基板、胎盘绒毛和绒毛膜羊膜） | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞悬液 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序技术 |
| 6549 | 2025-10-06 |
Regulators of male and female sexual development are critical for the transmission of a malaria parasite
2023-02-08, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2022.12.011
PMID:36634679
|
研究论文 | 本研究通过条形码突变体筛选和单细胞转录组分析，鉴定了疟原虫性别决定的关键基因及其调控机制 | 首次系统鉴定了疟原虫雄性和雌性性别决定的关键基因，揭示了LOTUS/OST-HTH结构域蛋白在雄性决定和锌指蛋白在雌性决定中的新功能 | 研究主要基于啮齿类疟原虫模型，在人类疟原虫中的保守性需要进一步验证 | 阐明疟原虫有性生殖发育的分子调控机制 | 伯氏疟原虫(Plasmodium berghei) | 分子生物学 | 疟疾 | 条形码突变体筛选,单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据,突变表型数据 | 10种突变体寄生虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 高分辨率单细胞转录组分析 |
| 6550 | 2025-10-06 |
PD-1 and TIM-3 differentially regulate subsets of mouse IL-17A-producing γδ T cells
2023-02-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20211431
PMID:36480166
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术揭示了小鼠肺中产生IL-17A的γδ T细胞亚群在稳态和癌症状态下受PD-1和TIM-3差异性调控的机制 | 首次发现Vγ6+和Vγ4+ γδ T细胞亚群分别通过PD-1和TIM-3受到差异性调控，并证明这些细胞导致免疫检查点抑制剂治疗耐药 | 研究局限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究小鼠产生IL-17A的γδ T细胞亚群在稳态和癌症状态下的调控机制 | 小鼠肺组织中的Vγ6+组织驻留型和Vγ4+循环型γδ T细胞 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 肿瘤游离和荷瘤小鼠的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6551 | 2025-10-06 |
Spatial Gene Expression Changes in the Mouse Heart After Base-Targeted Irradiation
2023-02-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2022.08.031
PMID:35985456
|
研究论文 | 本研究使用空间转录组学技术分析小鼠心脏基底区域靶向照射后的基因表达变化 | 首次在辐照组织中报告空间分辨的基因表达变化 | 仅使用两只小鼠（一只照射组，一只假照射对照组），样本量较小 | 表征心脏基底区域放射敏感性模型中基因表达的晚期变化 | 老年雌性C57BL/6小鼠 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据 | 2只小鼠（1只照射组，1只假照射对照组） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6552 | 2025-10-06 |
The astroglial and stem cell functions of adult rat folliculostellate cells
2023-02, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24267
PMID:36093576
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫组织荧光分析揭示成年大鼠垂体滤泡星状细胞的星形胶质细胞和干细胞功能 | 首次在单细胞水平识别出垂体滤泡星状细胞的两个功能亚群，并发现其中一个亚群具有干细胞样特征 | 研究仅针对成年雌性大鼠，样本来源单一 | 解析垂体非激素产生细胞的转录组特征和功能 | 成年雌性大鼠垂体细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组织荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 成年雌性大鼠全垂体及分离的前后叶细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6553 | 2025-10-06 |
Nuclear factor I-C overexpression promotes monocytic development and cell survival in acute myeloid leukemia
2023-02, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-022-01801-z
PMID:36572750
|
研究论文 | 本研究揭示核因子I-C在急性髓系白血病中的过表达现象及其对单核细胞分化和细胞存活的影响 | 首次发现NFIC在69%AML患者中过表达，并证实其通过调控MLL-1等信号通路促进单核细胞分化和白血病细胞存活 | 研究主要基于细胞系和体外模型，缺乏体内动物模型的验证 | 探讨NFIC在急性髓系白血病发生发展中的生物学功能 | 急性髓系白血病患者样本、HSPCs、AML细胞系（THP-1）和小鼠MLL::AF9前白血病干细胞模型 | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, shRNA基因敲低 | NA | 基因表达数据 | AML患者样本（69%过表达NFIC） | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6554 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas of murine reproductive tissues during preterm labor
2023-01-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111846
PMID:36599348
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建感染诱导早产小鼠生殖组织的单细胞图谱 | 首次在感染诱导早产模型中系统描绘小鼠子宫、蜕膜和宫颈的单细胞转录组图谱，揭示早产相关的细胞间通讯信号通路 | 研究仅限于小鼠模型，需进一步验证人类组织的相关性 | 解析早产过程中生殖组织的细胞组成和分子机制 | 小鼠子宫、蜕膜和宫颈组织 | 单细胞组学 | 早产 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6555 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic characterization of COVID-19 pneumonitis identifies immune circuits related to tissue injury
2023-Jan-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.157837
PMID:36472908
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学方法揭示了COVID-19肺炎中免疫细胞与基质细胞相互作用的免疫回路 | 首次利用空间转录组学技术系统描绘COVID-19肺组织损伤区域的免疫细胞信号回路，发现细胞毒性淋巴细胞与促炎巨噬细胞之间的关键相互作用 | 样本量较小（仅3例患者），存在显著的个体间异质性 | 解析COVID-19肺炎中导致组织损伤的免疫机制 | COVID-19患者的肺组织样本 | 空间转录组学 | COVID-19肺炎 | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 相关性网络分析 | 基因表达数据，空间转录组数据 | 3例患者的46个感兴趣区域，覆盖超过62,000个细胞 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6556 | 2025-10-06 |
Entropy sorting of single-cell RNA sequencing data reveals the inner cell mass in the human pre-implantation embryo
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.09.007
PMID:36240776
|
研究论文 | 提出熵排序(ES)数学框架用于单细胞RNA测序数据分析，成功识别人类胚胎植入前内细胞团 | 开发无需用户定义显著性阈值的无监督特征选择方法，能够区分随机噪声与真实生物学信号 | 方法仅在合成数据和人类胚胎scRNA-seq数据上验证，需要更多应用场景测试 | 开发单细胞基因表达数据分析方法以更好识别细胞异质性 | 人类植入前胚胎单细胞RNA测序数据 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 熵排序(ES)数学框架 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6557 | 2025-10-06 |
Epsin Nanotherapy Regulates Cholesterol Transport to Fortify Atheroma Regression
2023-01-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.122.321723
PMID:36444722
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向巨噬细胞Epsins的纳米疗法，通过调节胆固醇运输促进动脉粥样硬化斑块消退 | 开发了S2P偶联脂质纳米颗粒靶向递送siRNA沉默Epsins的创新方法，并揭示了Epsins通过调控CD36和ABCG1影响胆固醇代谢的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证疗效和安全性 | 探究Epsins在巨噬细胞介导的代谢调控中的作用，并开发靶向Epsins的动脉粥样硬化治疗方法 | 髓系特异性Epsin双敲除小鼠和ABCG1基因减量小鼠模型，以及动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, MEBOCOST算法, 纳米颗粒递送系统, siRNA技术 | NA | 基因表达数据, 代谢物通讯数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6558 | 2025-10-06 |
Molecular and spatial signatures of mouse brain aging at single-cell resolution
2023-01-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.12.010
PMID:36580914
|
研究论文 | 通过空间分辨单细胞转录组学构建小鼠大脑衰老的高分辨率细胞图谱，揭示非神经元细胞在衰老过程中的显著变化 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘小鼠大脑衰老的分子和空间特征，特别关注非神经元细胞的空间组织变化 | 研究仅限于小鼠前额叶皮层和纹状体区域，未涵盖全脑所有区域 | 系统表征大脑衰老过程中的细胞和分子结构变化，理解大脑功能衰退的机制 | 小鼠大脑前额叶皮层和纹状体区域的主要细胞类型 | 空间转录组学 | 衰老相关脑功能衰退 | 空间分辨单细胞转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据和空间位置信息 | 覆盖小鼠整个寿命周期的多个时间点样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6559 | 2025-10-06 |
A New Understanding, Guided by Single-Cell Sequencing, of the Establishment and Maintenance of the Ovarian Reserve in Mammals
2023, Sexual development : genetics, molecular biology, evolution, endocrinology, embryology, and pathology of sex determination and differentiation
IF:2.4Q2
DOI:10.1159/000526426
PMID:36122567
|
综述 | 通过单细胞测序技术探讨哺乳动物卵巢储备建立与维持机制的研究综述 | 聚焦单细胞测序技术在卵巢发育研究中的应用，揭示卵巢储备的新型分子调控机制 | NA | 理解卵巢储备建立和维持的细胞与分子动力学，为调控生殖健康提供基础 | 哺乳动物卵巢发育过程，特别是生殖细胞巢形成、分解及原始卵泡形成与激活阶段 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6560 | 2025-10-06 |
Profiling Transcriptional Heterogeneity with Seq-Well S3: A Low-Cost, Portable, High-Fidelity Platform for Massively Parallel Single-Cell RNA-Seq
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2756-3_3
PMID:36495445
|
研究论文 | 介绍Seq-Well S3平台——一种低成本、便携式、高保真度的单细胞RNA测序技术 | 通过引入第二链合成步骤增强转录本检测能力，解决了传统单细胞RNA测序技术在成本、便携性和可扩展性方面的限制 | NA | 开发改进的单细胞RNA测序平台以更好地分析细胞转录异质性 | 单细胞转录组 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 数千个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | Seq-Well S3 | 基于皮升孔板的高通量单细胞RNA测序平台，具有第二链合成功能 |