单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 6541 - 6560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6541 | 2024-11-08 |
Pan-cancer analysis of CDKN2A alterations identifies a subset of gastric cancer with a cold tumor immune microenvironment
2024-05-31, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-024-00615-7
PMID:38822443
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研究论文 | 研究探讨了CDKN2A突变和缺失与泛癌种中免疫检查点抑制剂治疗反应及总体生存期的关联 | 发现CDKN2A突变和缺失与免疫检查点抑制剂治疗反应及总体生存期的关联，并揭示了CDKN2A突变和缺失对肿瘤免疫微环境的影响 | 研究样本主要来自四个队列，可能存在样本偏倚；未详细探讨CDKN2A突变和缺失的具体机制 | 确定CDKN2A突变和缺失与泛癌种中总体生存期及免疫检查点抑制剂治疗反应的关联 | CDKN2A突变和缺失在泛癌种中的作用及其对免疫检查点抑制剂治疗反应的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 肿瘤测序 | NA | 基因组数据 | 45,000名肿瘤患者 |
| 6542 | 2024-11-08 |
Characterization of the responses of brain macrophages to focused ultrasound-mediated blood-brain barrier opening
2024-May, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-023-01107-0
PMID:37857722
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研究论文 | 研究聚焦超声介导的血脑屏障开放对脑巨噬细胞的影响 | 首次使用单细胞测序技术分析了微胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞在聚焦超声介导的血脑屏障开放后的不同反应 | 研究仅在老鼠模型中进行，结果可能不适用于人类 | 探讨聚焦超声介导的血脑屏障开放对脑巨噬细胞的影响及其在神经退行性疾病治疗中的潜在应用 | 微胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 老鼠模型 |
| 6543 | 2024-11-08 |
A Multimodal Omics Framework to Empower Target Discovery for Cardiovascular Regeneration
2024-Apr, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07484-7
PMID:37421484
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在多物种和多发育阶段中研究健康和受损心脏的发现，并提出了一种多物种、多组学的元分析框架，以推动心血管再生新靶点的发现 | 提出了一个多物种、多组学的元分析框架，以推动心血管再生新靶点的发现 | NA | 推动心血管再生新靶点的发现 | 健康和受损心脏的细胞转录组 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组 | 多物种和多发育阶段的样本 |
| 6544 | 2024-11-08 |
InPACT: a computational method for accurate characterization of intronic polyadenylation from RNA sequencing data
2024-Mar-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46875-8
PMID:38519498
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研究论文 | 提出了一种名为InPACT的计算方法，用于从RNA测序数据中准确表征内含子多聚腺苷酸化 | InPACT能够从常规RNA-seq数据中精确表征内含子多聚腺苷酸化，并成功识别出许多先前未注释的内含子多聚腺苷酸化转录本 | NA | 开发一种可靠的方法来准确表征内含子多聚腺苷酸化 | 内含子多聚腺苷酸化转录本及其在不同细胞类型中的表达 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类细胞、单细胞RNA测序数据 |
| 6545 | 2024-11-08 |
Light and dopamine impact two circadian neurons to promote morning wakefulness
2024-Mar-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.04.583333
PMID:38496661
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研究论文 | 研究探讨了光线和多巴胺如何影响果蝇的昼夜节律神经元，促进早晨的清醒 | 首次揭示了光线通过调节多巴胺受体Dop1R1的mRNA水平，影响果蝇早晨清醒的机制 | 研究仅限于果蝇模型，尚未在哺乳动物中验证 | 探讨光线和多巴胺对果蝇早晨清醒的影响机制 | 果蝇的昼夜节律神经元和多巴胺受体Dop1R1 | 神经科学 | NA | 单细胞测序、CRISPR/Cas9基因编辑、活体成像 | NA | mRNA表达数据 | 17组昼夜节律神经元，包括两组特定的侧神经元(LNs) |
| 6546 | 2024-11-08 |
Enhancing prognostic power in multiple myeloma using a plasma cell signature derived from single-cell RNA sequencing
2024-03-06, Blood cancer journal
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41408-024-01024-8
PMID:38443358
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据开发了一种新的浆细胞基因特征，并评估了其在多发性骨髓瘤中的预后能力 | 开发了一种新的浆细胞基因特征（PBM评分），该评分在多发性骨髓瘤中的预后效果独立于现有的国际分期系统（ISS）和修订ISS（R-ISS） | NA | 提高多发性骨髓瘤的预后能力 | 多发性骨髓瘤及其相关浆细胞恶性肿瘤 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2115个样本，包括1978个多发性骨髓瘤、65个意义未明的单克隆丙种球蛋白病、35个冒烟型多发性骨髓瘤和37个健康对照 |
| 6547 | 2024-11-08 |
PPARγ Attenuates Cellular Senescence of Alveolar Macrophages in Asthma- COPD Overlap
2024-Mar-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4009724/v1
PMID:38496493
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研究论文 | 研究探讨了哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠（ACO）中肺泡巨噬细胞的细胞衰老及其调控基因PPARγ的作用 | 首次揭示了PPARγ在调节ACO患者肺泡巨噬细胞衰老中的关键作用，并提出其作为潜在治疗靶点的可能性 | 研究主要基于公共单细胞RNA测序数据和独立队列研究的bulk RNA-Seq及CyTOF数据，缺乏体内实验验证 | 探讨ACO中主要炎症细胞及其细胞衰老情况，并揭示调控衰老的关键基因 | ACO患者的肺组织和支气管肺泡灌洗液中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、bulk RNA-Seq、CyTOF | NA | RNA序列数据 | ACO患者肺组织样本及支气管肺泡灌洗液样本 |
| 6548 | 2024-11-08 |
Diverse macrophage populations contribute to distinct manifestations of human cutaneous graft-versus-host disease
2024-02-16, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad402
PMID:38010706
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研究论文 | 研究了不同巨噬细胞群体在人类皮肤移植物抗宿主病中的不同表现 | 首次详细描述了单核吞噬细胞在急性皮肤移植物抗宿主病中的身份、起源和功能，并揭示了其在不同临床亚型中的动态作用 | 研究样本量较小，且仅限于急性皮肤移植物抗宿主病，可能无法全面反映所有类型移植物抗宿主病的情况 | 研究单核吞噬细胞在急性皮肤移植物抗宿主病中的作用，以期为治疗提供新策略 | 急性皮肤移植物抗宿主病患者中的单核吞噬细胞 | NA | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序和多重组织免疫荧光 | NA | RNA | 36名急性皮肤移植物抗宿主病患者 |
| 6549 | 2024-11-08 |
Inflammatory Mediators Suppress FGFR2 Expression in Human Keratinocytes to Promote Inflammation
2024, Molecular and cellular biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1080/10985549.2024.2399766
PMID:39340759
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研究论文 | 研究探讨了炎症介质如何抑制人角质形成细胞中FGFR2的表达以促进炎症 | 首次揭示了FGFR2在人角质形成细胞中抑制炎症的关键作用，并提出了FGFR2下调在特应性皮炎及其他炎症性疾病发病机制中的潜在作用 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探讨FGFR2在人角质形成细胞中的功能及其在炎症性疾病中的作用 | 人角质形成细胞及特应性皮炎患者皮肤样本 | NA | 特应性皮炎 | CRISPR/Cas9基因编辑技术，RNA测序 | NA | RNA | 体外培养的人角质形成细胞及特应性皮炎患者皮肤样本 |
| 6550 | 2024-11-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals STAT1 Drives LHPP Downregulation in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression
2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338241293485
PMID:39497541
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学数据探讨了食管鳞状细胞癌（ESCC）中STAT1对LHPP下调的驱动作用 | 发现了STAT1在ESCC发病机制中对LHPP表达的调控作用，揭示了STAT1与LHPP之间的复杂调控回路 | NA | 探索食管鳞状细胞癌（ESCC）的分子机制和细胞动力学，特别是转录因子STAT1及其与LHPP的调控关系 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者及其细胞系 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 21名ESCC患者 |
| 6551 | 2024-11-08 |
Approaches for Benchmarking Single-Cell Gene Regulatory Network Methods
2024, Bioinformatics and biology insights
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11779322241287120
PMID:39502448
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研究论文 | 本文讨论了单细胞基因调控网络方法的基准测试方法 | 本文首次全面讨论了基准测试方法，并提出了替代的基准数据集和额外的考虑因素 | 本文未具体讨论每种方法的优缺点，而是集中在基准测试方法的讨论上 | 探讨单细胞基因调控网络方法的基准测试方法 | 单细胞基因调控网络方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | NA |
| 6552 | 2024-11-08 |
Ustekinumab affects myofibroblast metabolism to alleviate intestinal fibrosis by targeting KDELC1 in Crohn's disease through multi-machine learning combined with single-cell sequencing analysis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1476592
PMID:39502647
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研究论文 | 本研究通过多机器学习结合单细胞测序分析，探讨了乌司奴单抗通过靶向KDELC1基因缓解克罗恩病肠道纤维化的机制 | 首次揭示了乌司奴单抗通过靶向KDELC1基因影响肌成纤维细胞代谢，从而缓解肠道纤维化的机制 | 研究样本量较小，且仅限于克罗恩病患者，未来需扩大样本量并验证在其他疾病中的适用性 | 探讨乌司奴单抗在克罗恩病中缓解肠道纤维化的遗传机制 | 克罗恩病患者的肠道组织及健康对照组的肠道组织 | 生物信息学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 克罗恩病患者和健康对照组的内镜手术标本 |
| 6553 | 2024-11-08 |
Histamine and Th2 cytokines independently and synergistically upregulate MMP12 expression in human M2 macrophages
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1429009
PMID:39502691
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研究论文 | 研究探讨了组胺和Th2细胞因子在人M2巨噬细胞中独立及协同上调MMP12表达的机制 | 揭示了Th2细胞因子和组胺调控MMP12表达的新机制，可能影响特应性皮炎皮肤屏障稳态 | NA | 研究MMP12在特应性皮炎皮肤病变中的表达及其调控机制 | 特应性皮炎患者的皮肤病变和健康个体的M2巨噬细胞 | NA | 特应性皮炎 | RNA测序 (scRNA-seq), 定量PCR, ELISA | NA | RNA | 特应性皮炎患者和健康个体的M2巨噬细胞样本 |
| 6554 | 2024-11-08 |
Wound-healing plasticity enables clonal expansion of founder progenitor cells in colitis
2023-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.011
PMID:37652012
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研究论文 | 研究揭示了急性小鼠结肠炎中，伤口愈合过程中的克隆扩展机制 | 首次通过三维成像、定量命运图谱和单细胞转录组学揭示了伤口愈合过程中上皮细胞的非增殖可塑状态及其对克隆扩展的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨慢性结肠损伤和炎症中克隆扩展的机制 | 急性小鼠结肠炎中的上皮细胞和创始前体细胞 | NA | NA | 三维成像、定量命运图谱、单细胞转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 小鼠模型 |
| 6555 | 2024-11-08 |
Reconstructing human brown fat developmental trajectory in vitro
2023-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.001
PMID:37647896
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术，分析了小鼠肩胛间棕色脂肪的发育过程，并成功在体外重现了人类棕色脂肪细胞的分化轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了棕色脂肪细胞分化过程中GATA6转录因子的表达，并成功在体外重现了人类棕色脂肪细胞的分化 | 研究主要集中在小鼠模型上，人类棕色脂肪细胞的分化过程可能存在差异 | 揭示棕色脂肪细胞的发育轨迹，并探索在体外重现人类棕色脂肪细胞分化的方法 | 小鼠肩胛间棕色脂肪和人类多能干细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肩胛间棕色脂肪和人类多能干细胞的单细胞样本 |
| 6556 | 2024-11-08 |
Combined inactivation of RB and Hippo converts differentiating Drosophila photoreceptors into eye progenitor cells through derepression of homothorax
2023-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.09.003
PMID:37848027
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研究论文 | 研究了RB和Hippo通路在果蝇光感受器细胞分化中的相互作用 | 揭示了RB和Hippo通路通过抑制homothorax表达来维持光感受器细胞分化的机制 | NA | 探讨RB和Hippo通路在细胞增殖和分化中的相互作用机制 | 果蝇光感受器细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 6557 | 2024-11-08 |
Bayesian-frequentist hybrid inference framework for single cell RNA-seq analyses
2023-Oct-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3384541/v1
PMID:37886581
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研究论文 | 本文提出了一种贝叶斯-频率主义混合推断框架用于单细胞RNA测序分析 | 本文的创新点在于提出了贝叶斯-频率主义混合框架，以提高单细胞RNA测序数据中差异表达基因的识别能力 | 本文的局限性在于仅在一个特例（特发性肺纤维化）中进行了验证，尚未在其他疾病或数据集中进行广泛验证 | 本文的研究目的是提高单细胞RNA测序数据中差异表达基因的识别能力 | 本文的研究对象是单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯-频率主义混合框架 | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 6558 | 2024-11-08 |
Single-nucleus chromatin accessibility identifies a critical role for TWIST1 in idiopathic pulmonary fibrosis myofibroblast activity
2023-07, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00474-2022
PMID:37142338
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研究论文 | 研究通过单核染色质可及性分析，揭示了TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞活性中的关键作用 | 首次通过单核染色质可及性分析结合单细胞RNA测序数据，精确识别了TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞中的关键转录因子活性 | 研究样本量较小，仅包括3例特发性肺纤维化患者和2例供体对照 | 探讨TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞活性中的调控作用 | 特发性肺纤维化患者的肺组织和肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、单核染色质可及性测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 3例特发性肺纤维化患者和2例供体对照的肺组织，以及10例特发性肺纤维化和8例对照的单细胞RNA测序数据 |
| 6559 | 2024-11-08 |
Single-cell transcriptomics reveals that tumor-infiltrating natural killer cells are activated by localized ablative immunotherapy and share anti-tumor signatures induced by immune checkpoint inhibitors
2023-May-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.02.539163
PMID:37205468
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学揭示肿瘤浸润自然杀伤细胞在局部消融免疫疗法激活下与免疫检查点抑制剂诱导的抗肿瘤特征共享 | 首次揭示局部消融免疫疗法激活自然杀伤细胞的细胞毒性，并发现上调基因与癌症患者的有益临床结果正相关 | NA | 探讨自然杀伤细胞在癌症治疗中的激活基因特征和通路 | 自然杀伤细胞在肿瘤微环境中的转录变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用MMTV-PyMT小鼠模型和人类样本进行分析 |
| 6560 | 2024-11-08 |
M-CSFR/CSF1R signaling regulates myeloid fates in zebrafish via distinct action of its receptors and ligands
2022-03-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021005459
PMID:34979548
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研究论文 | 研究了斑马鱼中M-CSFR/CSF1R信号通路在髓系细胞分化、增殖和存活中的作用 | 揭示了Csf1rb在斑马鱼粒细胞生成中的未知作用，并发现Il34信号通过Csf1rb对粒细胞的重要性 | NA | 探讨斑马鱼中Csf1rs及其配体在胚胎和成年髓系生成中的作用 | 斑马鱼的Csf1rs及其配体（Csf1a、Csf1b和Il34）在髓系生成中的作用 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年斑马鱼的全肾骨髓（WKM）造血细胞 |