单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6521 - 6540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6521 | 2025-10-06 |
Single cell transcriptomics identifies adipose tissue CD271+ progenitors for enhanced angiogenesis in limb ischemia
2023-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.09.527726
PMID:36865239
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定出脂肪组织CD271+祖细胞在肢体缺血中具有增强血管生成的能力 | 首次通过单细胞转录组技术从人类皮下脂肪组织中鉴定出CD271+祖细胞，并证明其具有优于传统脂肪基质细胞的血管生成能力 | 研究使用了异种移植模型，且发现胰岛素抵抗供体的CD271+祖细胞数量和功能显著降低 | 寻找治疗严重肢体缺血的更有效细胞疗法 | 人类皮下脂肪组织中的CD271+祖细胞 | 单细胞生物学 | 肢体缺血 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6522 | 2025-10-06 |
Genomic and microenvironmental heterogeneity shaping epithelial-to-mesenchymal trajectories in cancer
2023-02-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36439-7
PMID:36774358
|
研究论文 | 提出一种基于转录组信号评估癌症上皮-间质转化轨迹的方法，并在7180个上皮来源肿瘤中识别出三种具有预后和治疗价值的宏观状态 | 开发了稳健评估单个肿瘤EMT转化的方法，首次系统识别出三种EMT宏观状态并揭示杂交状态的稳定性与非整倍性关联 | EMT中间状态的分子特征仍需进一步验证，空间异质性分析可能受限于样本数量 | 探索癌症上皮-间质转化轨迹的分子特征和微环境影响 | 7180个上皮来源肿瘤样本 | 癌症基因组学 | 癌症 | 转录组测序, 空间转录组学, 单细胞测序 | 轨迹分析模型 | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | 7180个肿瘤样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6523 | 2025-10-06 |
An in vitro approach to understand contribution of kidney cells to human urinary extracellular vesicles
2023-02, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12304
PMID:36785873
|
研究论文 | 本研究通过体外培养人肾脏细胞系并分析其分泌的细胞外囊泡成分，探索不同肾脏细胞对尿液中细胞外囊泡的贡献 | 首次系统比较体外培养的多种人肾脏细胞系分泌的EV成分与尿液EV成分，建立体外模型解析生物体液中细胞类型特异性EV货物 | 研究基于条件永生化的细胞系，可能与原代细胞存在差异；体外环境无法完全模拟体内复杂微环境 | 理解不同肾脏细胞类型对尿液细胞外囊泡组成的贡献，探索肾脏疾病细胞类型特异性EV生物标志物 | 条件永生化的四种人肾脏细胞系（足细胞、肾小球内皮细胞、系膜细胞和近端小管细胞）及其分泌的细胞外囊泡 | 细胞生物学 | 肾脏疾病 | miRNA测序, RNA测序, 串联质量标签蛋白质组学, 电子显微镜, 纳米颗粒跟踪分析, 蛋白质印迹 | 体外细胞模型 | RNA测序数据, 蛋白质组数据, 显微镜图像 | 四种人肾脏细胞系及其分泌的EV，与人类尿液EV进行比较 | NA | RNA测序, 蛋白质组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 6524 | 2025-10-06 |
LRRC15 mediates an accessory interaction with the SARS-CoV-2 spike protein
2023-02, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001959
PMID:36735681
|
研究论文 | 本研究发现了SARS-CoV-2刺突蛋白与人类宿主因子LRRC15之间的新型辅助相互作用 | 首次发现LRRC15可作为SARS-CoV-2刺突蛋白的辅助结合受体，这种相互作用不同于已知的硫酸肝素或凝集素受体结合机制 | LRRC15单独不足以允许病毒进入，其具体作用机制需要进一步研究 | 探索SARS-CoV-2刺突蛋白与人类细胞的额外相互作用机制 | SARS-CoV-2病毒刺突蛋白和人类宿主因子 | 病毒学 | COVID-19 | 细胞筛选、蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6525 | 2025-10-06 |
A chromosome-scale epigenetic map of the Hydra genome reveals conserved regulators of cell state
2023-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277040.122
PMID:36639202
|
研究论文 | 本研究构建了水螅基因组染色体尺度的表观遗传图谱，揭示了细胞状态保守调控因子 | 发现了水螅基因组中存在包含转录共调控基因的大型染色质相互作用域，识别了两种先前未分子表征的细胞类型，并鉴定出可能自4亿年前水螅与水母分化以来保守的细胞类型特异性转录候选调控因子 | NA | 解析水螅干细胞维持和分化的转录调控机制 | 淡水息肉水螅的上皮和间质干细胞系统 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序、染色质相互作用图谱、染色质可及性分析、序列保守性分析、组蛋白修饰分析 | NA | 基因组序列、单细胞转录组、表观基因组 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6526 | 2025-10-06 |
Delayed boosting improves human antigen-specific Ig and B cell responses to the RH5.1/AS01B malaria vaccine
2023-01-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.163859
PMID:36692019
|
研究论文 | 本研究通过延迟加强免疫策略显著改善了RH5.1/AS01B疟疾疫苗的抗原特异性抗体和B细胞反应 | 首次揭示延迟分次给药方案通过增强FcRn结合、改变IgG Fc糖基化模式和减少循环短寿命浆细胞来提升抗体持久性的机制 | 研究样本量有限，且主要关注短期免疫反应变化，长期保护效果需要进一步验证 | 探索延迟加强免疫策略对疟疾疫苗免疫反应的影响机制 | 接种RH5.1/AS01B疟疾疫苗的人类受试者 | 免疫学 | 疟疾 | ELISA, 流式细胞术, 系统血清学, 单细胞RNA测序 | NA | 血清学数据, 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 临床试验受试者（NCT02927145） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6527 | 2025-10-06 |
A cellular hierarchy of Notch and Kras signaling controls cell fate specification in the developing mouse salivary gland
2023-01-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.12.009
PMID:36693323
|
研究论文 | 本研究通过结合克隆谱系追踪、三维重建和单细胞RNA测序分析，揭示了小鼠唾液腺发育中细胞命运决定的分子机制 | 首次在唾液腺发育中揭示了Notch和Kras信号通路在细胞命运决定中的层级调控作用，并识别了从多能状态向单能状态过渡的两个转录特征不同的双能状态 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究小鼠唾液腺发育过程中细胞命运决定的分子调控机制 | 发育中的小鼠唾液腺 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，克隆谱系追踪，三维重建，遗传扰动 | NA | 基因表达数据，空间重建数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6528 | 2025-10-06 |
Molecular and Cellular Characterization of the TH Pathway in the Sea Urchin Strongylocentrotus purpuratus
2023-01-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12020272
PMID:36672206
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和单细胞转录组学技术，对海胆甲状腺激素通路的分子组成和细胞特征进行了系统表征 | 首次在无脊椎动物海胆中系统鉴定了甲状腺激素通路的完整分子工具包，并确定了参与激素合成和响应的特定细胞类型 | 研究主要基于生物信息学预测和表达分析，甲状腺激素的具体功能机制仍需进一步实验验证 | 探究无脊椎动物海胆中甲状腺激素通路的分子基础和细胞特征 | 紫球海胆(Strongylocentrotus purpuratus)及其胚胎发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学, 原位杂交, 免疫组织化学, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 海胆胚胎和幼虫阶段样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6529 | 2025-10-06 |
NF-κB in monocytes and macrophages - an inflammatory master regulator in multitalented immune cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1134661
PMID:36911661
|
综述 | 本文总结了NF-κB在单核细胞和巨噬细胞中的复杂作用及其在炎症性疾病中的关键调控机制 | 整合了单细胞测序和细胞命运图谱等新技术对NF-κB研究的新发现，强调其时间动态和细胞特异性功能 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献总结 | 探讨NF-κB在先天免疫细胞中的特异性功能及其在炎症调控中的作用 | 单核细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 单细胞测序, 细胞命运图谱 | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6530 | 2025-10-06 |
Location, location, location: mapping the lymphoma tumor microenvironment using spatial transcriptomics
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1258245
PMID:37869076
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术在淋巴瘤肿瘤微环境研究中的应用与进展 | 系统总结了空间转录组学在解析淋巴瘤肿瘤微环境空间结构方面的独特优势，弥补了单细胞测序缺乏空间信息的局限 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献总结 | 探讨空间转录组学技术在淋巴瘤肿瘤微环境研究中的应用价值 | 淋巴瘤肿瘤微环境中的免疫和非免疫细胞 | 空间转录组学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6531 | 2025-10-06 |
Highly Multiplexed Spatially Resolved Proteomic and Transcriptional Profiling of the Glioblastoma Microenvironment Using Archived Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Specimens
2023-01, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2022.100034
PMID:36788070
|
研究论文 | 本研究采用多模态空间生物学方法分析胶质母细胞瘤微环境的分子异质性 | 首次在存档FFPE样本中整合空间转录组/蛋白质组分析、单细胞RNA测序和神经病理学评估来表征胶质母细胞瘤微环境 | 研究样本量未明确说明，且仅使用存档FFPE样本可能限制分析灵敏度 | 表征胶质母细胞瘤微环境的分子和细胞异质性，识别免疫治疗靶点 | 存档福尔马林固定石蜡包埋胶质母细胞瘤标本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 数字空间分析、单细胞RNA测序、神经病理学评估 | 聚类分析、混合细胞反卷积分析 | 空间蛋白质组数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NanoString | 空间转录组学、空间蛋白质组学、单细胞RNA-seq | GeoMx Digital Spatial Profiling | NanoString GeoMx数字空间分析平台 |
| 6532 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic profiling of coronary endothelial cells in SARS-CoV-2 myocarditis
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1118024
PMID:36968839
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析COVID-19重症患者冠状动脉内皮细胞和心肌组织的基因表达模式 | 首次在保持解剖结构完整的情况下对SARS-CoV-2感染的心脏组织进行原位空间转录组分析，揭示了心肌感染的异质性和独特的转录特征 | 样本量较小（对照组4例，COVID-19组8例），且仅针对尸检组织进行分析 | 探究SARS-CoV-2感染对冠状动脉内皮细胞和心肌组织基因表达的影响 | 尸检获得的心脏组织样本，包括对照组和COVID-19患者组 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 对照组4例，COVID-19组8例，共12例尸检心脏组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6533 | 2025-10-06 |
Mimicking Tumor Cell Heterogeneity of Colorectal Cancer in a Patient-derived Organoid-Fibroblast Model
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.02.014
PMID:36868311
|
研究论文 | 开发了一种包含上皮细胞和基质成纤维细胞的结直肠癌患者来源类器官模型 | 首次构建了包含匹配上皮细胞和基质成纤维细胞的结直肠癌类器官模型，模拟肿瘤微环境复杂性 | 模型仍无法完全复制体内肿瘤微环境的所有组分 | 研究结直肠癌肿瘤微环境中上皮细胞与成纤维细胞的相互作用 | 结直肠癌患者来源的肿瘤细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,蛋白质组学分析 | 类器官-成纤维细胞共培养模型 | 基因表达数据,蛋白质组数据,图像数据 | 结直肠癌标本来源的原代细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6534 | 2025-10-06 |
Tick innate immune responses to hematophagy and Ehrlichia infection at single-cell resolution
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1305976
PMID:38274813
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了孤星蜱免疫细胞对吸血和埃立克体感染的反应机制 | 首次在单细胞分辨率下系统鉴定蜱类14种不同的血细胞群体，并发现7个在感染和未感染状态下均存在的血细胞谱系 | 研究仅针对孤星蜱一种物种，血细胞功能验证仍需进一步深入 | 阐明蜱类免疫细胞在吸血过程和病原体感染中的免疫功能 | 孤星蜱(Amblyomma americanum)的血细胞(hemocytes) | 单细胞生物学 | 蜱传疾病 | 单细胞RNA测序，RNA干扰 | NA | 转录组数据 | 未吸血、部分吸血和埃立克体感染蜱的血细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 6535 | 2025-10-06 |
The slan antigen identifies the prototypical non-classical CD16+-monocytes in human blood
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1287656
PMID:37965335
|
研究论文 | 通过转录组和蛋白质组分析证明slan+/NC-单核细胞是人类血液中原型非经典单核细胞的代表 | 首次系统比较slan+/NC-和slan-/NC-单核细胞的分子特征，证明slan+/NC-单核细胞更能代表原型非经典单核细胞 | 样本来源仅限于外周血单核细胞，未涉及组织驻留单核细胞 | 确定slan抗原在非经典单核细胞分型中的生物学意义 | 人类外周血单核细胞亚群（经典、中间型和非经典单核细胞） | 免疫学 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表面标志物 | 人类外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6536 | 2025-10-06 |
Comparing engineered nuclear-localized reporter cassettes
2023, microPublication biology
DOI:10.17912/micropub.biology.001014
PMID:38021170
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9基因组工程技术比较了不同核定位报告基因盒在神经肽基因表达分析中的性能 | 首次系统比较了不同工程化核定位报告基因盒在神经肽基因表达研究中的效果，并推荐了最优报告基因盒设计 | 仅测试了6种神经肽编码基因的报告基因盒，样本规模有限 | 分析神经肽基因表达动态并解析其调控机制 | 秀丽隐杆线虫神经系统中的神经肽编码基因 | 分子生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因组工程、单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 6个神经肽编码基因（3个神经肽基因、1个神经肽基因和2个胰岛素基因） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6537 | 2025-10-06 |
Profiles of Wnt pathway gene expression during tooth morphogenesis
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1316635
PMID:38274045
|
研究论文 | 本研究通过荧光多重杂交和单细胞RNA测序技术，揭示了Wnt通路基因在牙齿形态发生过程中的时空表达模式 | 首次在牙齿发育过程中同时分析多个Wnt配体和调节因子的共定位模式，并发现Sfrp5在完全分化的成釉细胞中的表达特征 | 研究主要聚焦于特定发育阶段，对Wnt信号通路与其他信号通路的相互作用分析有限 | 阐明Wnt信号通路在牙齿形态发生过程中的表达动态和细胞间通讯机制 | 小鼠牙齿发育过程中的上皮和间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 荧光多重杂交, 单细胞RNA测序 | CellChat | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 小鼠胚胎期15.5天至出生后14天的牙齿组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6538 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals cancer stem-like cells and dynamics in tumor microenvironment during cholangiocarcinoma progression
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1250215
PMID:38020927
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胆管癌进展过程中癌症干细胞样细胞的特征及肿瘤微环境的动态变化 | 首次在YAP/AKT小鼠模型中系统揭示胆管癌形成过程中Tm4sf1高表达恶性细胞作为癌症干细胞样细胞的特性及肿瘤微环境三阶段动态变化 | 研究基于小鼠模型，在人体中的适用性需要进一步验证；样本量相对有限 | 探究胆管癌进展过程中癌症干细胞样细胞的转录特征及肿瘤微环境动态变化 | YAP/AKT小鼠模型中的胆管癌细胞及肿瘤微环境组成细胞 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | YAP/AKT小鼠模型 | 单细胞转录组数据，批量RNA测序数据 | 三个不同时间点的肿瘤发生样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6539 | 2025-10-06 |
Identification of TREM2-positive tumor-associated macrophages in esophageal squamous cell carcinoma: implication for poor prognosis and immunotherapy modulation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1162032
PMID:37187751
|
研究论文 | 本研究在食管鳞状细胞癌中发现了一种新型TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群，该亚群与不良预后和免疫治疗反应相关 | 首次在食管鳞状细胞癌中鉴定出TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群，并证明其与免疫治疗耐药性和不良预后的关联 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证 | 探索肿瘤相关巨噬细胞亚群在食管鳞状细胞癌中的作用及其对免疫治疗的影响 | 食管鳞状细胞癌患者和黑色素瘤患者 | 单细胞测序分析 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，定量实时PCR，酶联免疫吸附试验，多重免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据，转录组数据，临床数据 | 多个数据集：GSE145370和GSE160269（食管鳞癌scRNA-seq），GSE120575（48例黑色素瘤患者），GSE78220（29例黑色素瘤bulk-RNA），TCGA ESCC队列（80例），10例接受抗PD1治疗的ESCC患者 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6540 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing analysis of human Alzheimer's disease brain samples reveals neuronal and glial specific cells differential expression
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0277630
PMID:36827281
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类阿尔茨海默病脑样本，揭示神经元和胶质细胞的特异性差异表达 | 首次在阿尔茨海默病早期阶段（Braak I-II期）使用单细胞分辨率分析脑组织转录组，识别出星形胶质细胞和小胶质细胞的特异性转录程序 | 样本量较小（仅2例患者和对照），未测量APOE状态、CERAD和THAL评分 | 识别阿尔茨海默病中不同神经元群体受影响的转录调控网络 | 人类阿尔茨海默病患者和年龄性别匹配对照的海马脑组织样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 超过25,000个单细胞核，来自2例阿尔茨海默病患者和匹配对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |