单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 6521 - 6540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6521 | 2024-11-06 |
Hypoxic Upregulation of IER2 Increases Paracrine GMFG Signaling of Endoplasmic Reticulum Stress-CAF to Promote Chordoma Progression via Targeting ITGB1
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405421
PMID:39207055
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研究论文 | 研究揭示了缺氧环境下IER2上调通过靶向ITGB1促进脊索瘤进展的分子机制 | 首次阐明了缺氧微环境通过IER2上调促进脊索瘤进展的分子机制，并揭示了ERS-CAF通过IER2/GMFG/ITGB1轴调节SPP1巨噬细胞加剧脊索瘤进展 | 研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内实验验证 | 揭示脊索瘤中ERS-CAF亚群的致癌机制 | 脊索瘤中的ERS-CAF亚群及其在肿瘤进展中的作用 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、GeoMx数字空间分析仪、数据独立采集蛋白质组学、批量RNA测序、多重定量免疫荧光 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 多个脊索瘤样本 |
| 6522 | 2024-11-06 |
Single-cell genomics details the maturation block in BCP-ALL and identifies therapeutic vulnerabilities in DUX4-r cases
2024-09-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021705
PMID:38968149
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研究论文 | 本文利用多模态单细胞测序技术，详细描述了B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）的成熟阻滞现象，并识别了DUX4重排（DUX4-r）亚型的治疗脆弱性 | 首次通过多模态单细胞测序技术，详细描绘了不同BCP-ALL亚型的转录组、表观遗传和免疫表型特征，并发现了DUX4-r亚型的多谱系启动和PI3K/AKT信号通路的激活 | 研究样本仅限于23例儿童BCP-ALL病例，可能无法完全代表所有BCP-ALL患者的情况 | 揭示BCP-ALL的生物学特性和治疗脆弱性，为开发新的治疗策略提供依据 | B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）及其DUX4重排（DUX4-r）亚型 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 转录组、表观遗传和免疫表型数据 | 23例儿童BCP-ALL病例 |
| 6523 | 2024-11-06 |
NK cells with adhesion defects and reduced cytotoxic functions are associated with a poor prognosis in multiple myeloma
2024-09-19, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023023529
PMID:38875515
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研究论文 | 研究分析了多发性骨髓瘤患者中NK细胞的粘附缺陷和细胞毒性功能降低与预后不良的关系 | 通过单细胞RNA测序分析了多发性骨髓瘤患者和健康供体中NK细胞的转录组变化，发现MM患者中CD56dim NK细胞亚群减少，而晚期NK细胞亚群增加，这些细胞具有低CD16和CD226表达和较差的细胞毒性功能 | 研究样本量较小，且仅限于特定患者群体，可能影响结果的普适性 | 探讨多发性骨髓瘤患者中NK细胞的功能变化及其与预后的关系 | 多发性骨髓瘤患者和健康供体中的NK细胞 | NA | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10名多发性骨髓瘤患者和10名年龄/性别匹配的健康供体 |
| 6524 | 2024-11-06 |
Upregulated expression of ubiquitin ligase TRIM21 promotes PKM2 nuclear translocation and astrocyte activation in experimental autoimmune encephalomyelitis
2024-Sep-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98181
PMID:39264698
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研究论文 | 研究揭示了泛素连接酶TRIM21通过促进PKM2核转位和星形胶质细胞活化在实验性自身免疫性脑脊髓炎中的作用 | 首次揭示了TRIM21通过泛素化介导的机制调控PKM2核转位，从而影响星形胶质细胞活化和神经炎症 | NA | 探讨代谢重编程在星形胶质细胞活化中的作用及其分子机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型中的星形胶质细胞 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | RNA | 实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠及小鼠原代星形胶质细胞 |
| 6525 | 2024-11-06 |
HA-1-targeted T-cell receptor T-cell therapy for recurrent leukemia after hematopoietic stem cell transplantation
2024-09-05, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024105
PMID:38683966
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研究论文 | 本文报道了一项针对复发性白血病的HA-1靶向T细胞受体T细胞疗法的I期临床试验 | 开发了一种新的TCR-T产品，靶向HA-1抗原，用于治疗或巩固治疗复发性白血病和骨髓增生性肿瘤 | 研究未设计评估疗效，且样本量较小 | 评估HA-1 TCR-T在造血干细胞移植后治疗复发性白血病的可行性和安全性 | 复发性白血病和骨髓增生性肿瘤患者 | NA | 白血病 | T细胞受体（TCR）基因转移 | NA | RNA测序 | 9名造血干细胞移植后复发性白血病患者 |
| 6526 | 2024-11-06 |
Activation of cGAS/STING Drives Inflammation and Cellular Senescence of Macrophages in Ovarian Endometrioma Induced by Endometriotic Cyst Fluid
2024-Sep, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300711
PMID:38864247
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研究论文 | 研究探讨了卵巢子宫内膜异位囊肿液对卵巢功能的影响及其机制 | 发现cGAS/STING信号通路的激活在卵巢子宫内膜异位囊肿液诱导的炎症和细胞衰老中的作用，并验证了STING抑制剂H-151的缓解效果 | NA | 探讨卵巢子宫内膜异位囊肿液对卵巢功能的影响及其分子和细胞机制 | 卵巢子宫内膜异位囊肿液、卵巢功能、巨噬细胞 | NA | 卵巢疾病 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | NA |
| 6527 | 2024-11-06 |
Loss of NLRP6 increases the severity of kidney fibrosis
2024-Sep, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31347
PMID:38934623
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研究论文 | 研究探讨了NLRP6在慢性肾脏疾病（CKD）中的作用及其在肾脏纤维化中的分子机制 | 首次揭示了NLRP6在肾脏纤维化中的保护作用，并阐明了其通过调节p38 MAPK信号通路影响纤维化进程的机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞培养，缺乏人类临床数据的支持 | 探讨NLRP6在慢性肾脏疾病中的作用及其分子机制 | NLRP6在肾脏纤维化中的作用及其分子机制 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 野生型和Nlrp6缺陷小鼠，以及培养的近端小管细胞 |
| 6528 | 2024-11-06 |
Expression patterns of keratin family members during tooth development and the role of keratin 17 in cytodifferentiation of stratum intermedium and stellate reticulum
2024-Sep, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31387
PMID:39014890
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研究论文 | 研究分析了角质蛋白家族成员在牙齿发育过程中的时空表达模式，并探讨了角质蛋白17在中间层和星网状结构细胞分化中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了角质蛋白家族成员在牙齿发育过程中的表达模式，并揭示了角质蛋白17在中间层细胞分化中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨角质蛋白家族成员在牙齿发育中的表达模式及其在细胞分化中的作用 | 角质蛋白家族成员在牙齿发育中的表达及其对细胞分化的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自出生后第1天小鼠臼齿的单细胞RNA测序数据 |
| 6529 | 2024-11-06 |
Integrative single-cell chromatin and transcriptome analysis of human plasma cell differentiation
2024-08-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023023237
PMID:38643512
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞染色质和转录组分析，揭示了人类浆细胞分化的时空表观遗传和转录程序 | 本文首次将单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq）结合，解析了浆细胞分化的轨迹，并识别了关键的转录因子 | 本文主要依赖于体外培养系统，可能无法完全反映体内浆细胞分化的复杂性 | 揭示驱动浆细胞分化早期阶段的时空表观遗传和转录程序 | 人类浆细胞分化过程中的表观遗传和转录变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞数据 | 未具体说明样本数量 |
| 6530 | 2024-11-06 |
Identification of estrogen response-associated STRA6+ granulosa cells within high-grade serous ovarian carcinoma by single-cell sequencing
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27790
PMID:38509903
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了高级别浆液性卵巢癌中的细胞异质性，并识别出与雌激素反应相关的STRA6+颗粒细胞 | 首次在高级别浆液性卵巢癌中发现STRA6+颗粒细胞，并揭示其通过雌激素反应促进肿瘤生长的潜力 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据，未涉及其他类型的实验验证 | 揭示高级别浆液性卵巢癌中的细胞异质性，并探索潜在的治疗靶点 | 高级别浆液性卵巢癌中的细胞亚群及其生物学功能 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 高级别浆液性卵巢癌的单细胞RNA测序数据 |
| 6531 | 2024-11-06 |
Cellular heterogeneity and dynamics of the human uterus in healthy premenopausal women
2024-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.07.583985
PMID:38559249
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研究论文 | 本文应用单细胞RNA测序技术分析了5名健康育龄女性子宫内膜和子宫肌层的细胞异质性和动态变化 | 本文构建了一个包含超过167,000个细胞的正常子宫细胞图谱，并提出了一个包含39个子类型的共识注释系统 | 本文仅分析了健康育龄女性的子宫细胞，未涉及其他年龄段或疾病状态 | 研究健康育龄女性子宫的细胞异质性和动态变化 | 子宫内膜和子宫肌层的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5名健康育龄女性 |
| 6532 | 2024-11-06 |
In situ tissue profile of rat trigeminal nerve in trigeminal neuralgia using spatial transcriptome sequencing
2024-Mar-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001110
PMID:38270619
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研究论文 | 本研究通过空间转录组测序技术分析了三叉神经痛大鼠模型中三叉神经组织的细胞间相互作用 | 揭示了三叉神经节对施万细胞脱髓鞘和再髓鞘化反应的影响机制，并发现了新的重要靶基因和调控通路 | NA | 探讨三叉神经痛中不同类型细胞间的相互作用，特别是脱髓鞘对三叉神经节的影响及其内在机制 | 三叉神经痛大鼠模型的三叉神经组织 | NA | 三叉神经痛 | 空间转录组测序 | NA | 基因表达矩阵 | 三叉神经痛大鼠模型的三叉神经组织样本 |
| 6533 | 2024-11-06 |
Integrative analysis of COL6A3 in lupus nephritis: insights from single-cell transcriptomics and proteomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1309447
PMID:38855105
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和蛋白质组学分析，揭示了COL6A3在狼疮性肾炎中的关键作用 | 首次通过单细胞转录组学和蛋白质组学整合分析，揭示了COL6A3在狼疮性肾炎中的显著上调及其在关键信号通路中的重要作用 | 样本量较小，可能影响结果的普适性 | 识别狼疮性肾炎相关的新型生物标志物和治疗靶点，以改善患者的治疗效果和预后 | 狼疮性肾炎患者和健康对照组的单细胞表达数据及蛋白质组学数据 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 狼疮性肾炎患者21例，健康对照组3例，狼疮性肾炎患者9例，无狼疮性肾炎的系统性红斑狼疮患者11例 |
| 6534 | 2024-11-06 |
Oncofetal TRIM71 drives liver cancer carcinogenesis through remodeling CEBPA-mediated serine/glycine metabolism
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.99633
PMID:39267787
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研究论文 | 研究揭示了TRIM71通过重塑CEBPA介导的丝氨酸/甘氨酸代谢在肝癌发生中的关键作用 | 首次发现TRIM71在肝癌中的特异性表达及其与不良预后的关联，并揭示了其通过与IGF2BP1形成蛋白复合物，依赖m6A修饰稳定CEBPA mRNA，增强丝氨酸/甘氨酸代谢途径，从而促进肝癌进展的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步的临床验证 | 揭示肝癌中肿瘤生态系统的核心调控因子及其分子机制 | 肝癌及其相关样本的单细胞和批量RNA测序数据，以及小鼠模型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 包括胎儿肝脏、正常肝脏、肝癌及其邻近样本的单细胞和批量RNA测序数据，以及小鼠模型 |
| 6535 | 2024-11-06 |
Six3 and Six6 jointly control diverse target genes in multiple cell populations over developmental trajectories of mouse embryonic retinal progenitor cells
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0308839
PMID:39446806
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研究论文 | 研究了Six3和Six6转录因子在鼠胚胎视网膜祖细胞发育轨迹中对多种细胞群体目标基因的共同调控作用 | 首次揭示了Six3和Six6在视网膜祖细胞发育过程中对多种细胞群体目标基因的共同调控机制 | 仅限于鼠胚胎视网膜祖细胞的研究，未涉及其他物种或组织 | 探讨组织特异性祖细胞在器官发生中生成成体组织的分子机制 | 鼠胚胎视网膜祖细胞及其发育轨迹 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 控制组和Six3与Six6复合突变鼠胚胎眼杯样本 |
| 6536 | 2024-11-06 |
Tertiary lymphoid structure-related score as a predictor for survival prognosis and immunotherapy response in head and neck squamous cell carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1483497
PMID:39493749
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研究论文 | 研究构建了一个基于三级淋巴结构相关基因的评分系统，用于预测头颈部鳞状细胞癌患者的生存预后和免疫治疗反应 | 首次构建了基于三级淋巴结构相关基因的评分系统，并验证了其在预测头颈部鳞状细胞癌患者生存预后和免疫治疗反应中的有效性 | 研究主要基于生物信息学方法和体外实验，缺乏大规模临床验证 | 研究旨在开发一种新的预测模型，用于评估三级淋巴结构的存在及其在头颈部鳞状细胞癌患者中的预后和免疫治疗反应 | 头颈部鳞状细胞癌患者及其三级淋巴结构 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序、单细胞测序、流式细胞术 | 评分模型 | 基因数据、单细胞数据 | 23个三级淋巴结构相关基因，头颈部鳞状细胞癌患者样本 |
| 6537 | 2024-11-06 |
eMCI: An Explainable Multimodal Correlation Integration Model for Unveiling Spatial Transcriptomics and Intercellular Signaling
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0522
PMID:39494219
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研究论文 | 本文介绍了一种名为eMCI的可解释多模态相关性集成模型，用于揭示空间转录组学和细胞间信号传导 | eMCI通过融合单细胞RNA测序和空间转录组数据，实现了对空间表达模式和细胞间通信的复杂关系的全面分析 | NA | 开发一种新的集成分析框架，以更好地解析空间转录组并阐明细胞间信号传导机制 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 数据融合 | 包括斑马鱼黑色素瘤、大豆根瘤成熟和人类胚胎肺在内的3个跨物种数据集 |
| 6538 | 2024-11-06 |
Prognostic and therapeutic potential of gene profiles related to tertiary lymphoid structures in colorectal cancer
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18401
PMID:39494300
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研究论文 | 本研究开发了一种新的三级淋巴结构（TLS）量化系统，用于预测结直肠癌的预后和治疗反应，并全面描绘了TLS的景观 | 首次建立了TLS评分系统，并验证了其在预测免疫治疗效果中的有效性 | NA | 探讨三级淋巴结构在结直肠癌中的预后和治疗潜力 | 结直肠癌患者的三级淋巴结构及相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 1184名结直肠癌患者 |
| 6539 | 2024-11-06 |
Targeting PLCG2 Suppresses Tumor Progression, Orchestrates the Tumor Immune Microenvironment and Potentiates Immune Checkpoint Blockade Therapy for Colorectal Cancer
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.98200
PMID:39494327
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研究论文 | 研究探讨了PLCG2在结直肠癌进展、肿瘤微环境和增强免疫检查点阻断疗法中的作用 | 首次发现PLCG2可作为预测结直肠癌预后、优化个体化治疗、逆转免疫逃逸和克服免疫检查点阻断疗法耐药性的精确生物标志物和潜在治疗靶点 | NA | 探索PLCG2在结直肠癌进展、肿瘤微环境和增强免疫检查点阻断疗法中的作用 | PLCG2在结直肠癌中的表达、预后意义、临床相关性及其生物学功能 | 癌症研究 | 结直肠癌 | RNA-seq, 蛋白质印迹, qRT-PCR, 多色免疫荧光, 多重免疫组化, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组, 空间转录组 | NA |
| 6540 | 2024-11-06 |
Reconstruction of the Hepatic Microenvironment and Pathological Changes Underlying Type II Diabetes through Single-Cell RNA Sequencing
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.99176
PMID:39494341
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术重建了2型糖尿病小鼠肝脏微环境及其病理变化 | 揭示了肝星状细胞的激活加剧了代谢相关脂肪性肝病向脂肪性肝炎的发展，并发现了新的Kupffer细胞亚群及其在糖尿病小鼠肝脏炎症中的潜在作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨2型糖尿病对肝脏微环境的影响及其病理变化 | 2型糖尿病小鼠的肝脏 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个2型糖尿病小鼠模型 |