单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
6521	2024-11-07	Genomic and immune signatures predict clinical outcome in newly diagnosed multiple myeloma treated with immunotherapy regimens 2023-Dec, Nature cancer IF:23.5Q1 DOI:10.1038/s43018-023-00657-1 PMID:37945755	研究论文	研究通过整合肿瘤全基因组和微环境单细胞RNA测序数据，探讨了新诊断的多发性骨髓瘤患者在接受包含达雷妥尤单抗的免疫治疗方案后的临床结果预测因素	首次通过整合肿瘤全基因组和微环境单细胞RNA测序数据，揭示了特定的基因驱动因素和免疫细胞变化对临床结果的影响	研究仅基于前瞻性2期试验数据，样本量有限，可能影响结果的普适性	探讨新诊断的多发性骨髓瘤患者在接受包含达雷妥尤单抗的免疫治疗方案后的临床结果预测因素	新诊断的多发性骨髓瘤患者及其在接受免疫治疗后的临床结果	数字病理学	多发性骨髓瘤	全基因组测序、单细胞RNA测序	NA	基因组数据、RNA数据	NA
6522	2024-11-07	Transcriptional Landscape of Cotton Roots in Response to Salt Stress at Single-cell Resolution 2023-Oct-27, Plant communications IF:9.4Q1 DOI:10.1016/j.xplc.2023.100740 PMID:39492159	研究论文	本研究通过单细胞转录组技术系统分析了棉花根系对盐胁迫的响应	首次在单细胞分辨率下描绘了盐胁迫下棉花根系的转录图谱，揭示了细胞异质性和分化轨迹	NA	探究盐胁迫下棉花根系的分子机制	棉花根系在盐胁迫下的响应	NA	NA	单细胞转录组技术	NA	转录组数据	从自然生长和不同盐处理条件下的5天龄侧根尖中获得了56,281个高质量细胞
6523	2024-11-07	SOX9 Modulates the Transformation of Gastric Stem Cells Through Biased Symmetric Cell Division 2023-06, Gastroenterology IF:25.7Q1 DOI:10.1053/j.gastro.2023.01.037 PMID:36740200	研究论文	研究探讨了SOX9基因在胃干细胞通过偏向性对称细胞分裂进行恶性转化中的作用	提出了SOX9+SOX2+细胞在胃癌发生中的重要作用，并开发了一种新的鼠模型来研究这一过程	研究主要基于鼠模型和胃癌患者样本，可能无法完全反映人类胃癌的复杂性	研究胃干细胞在胃癌发生初期的行为，并探讨SOX9基因在这一过程中的作用	胃干细胞和胃癌	NA	胃癌	单细胞RNA测序、免疫染色、CRISPR/Cas9基因编辑	NA	组织样本	鼠模型和胃癌患者样本
6524	2024-11-07	NF-κB activation in cardiac fibroblasts results in the recruitment of inflammatory Ly6Chi monocytes in pressure-overloaded hearts 2021-Oct-12, Science signaling IF:6.7Q1 DOI:10.1126/scisignal.abe4932 PMID:34637330	研究论文	研究揭示了心脏纤维母细胞在压力超负荷下通过NF-κB激活招募炎症性Ly6C单核细胞的机制	首次揭示了心脏纤维母细胞在压力超负荷下通过NF-κB激活招募炎症性Ly6C单核细胞的机制	研究仅在老鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探讨心脏纤维母细胞在压力超负荷下招募炎症性Ly6C单核细胞的机制	心脏纤维母细胞和Ly6C单核细胞	NA	心血管疾病	单细胞测序分析	NA	基因表达数据	老鼠模型
6525	2024-11-07	Control of the Anterior Pituitary Cell Lineage Regulator POU1F1 by the Stem Cell Determinant Musashi 2021-03-01, Endocrinology IF:3.8Q2 DOI:10.1210/endocr/bqaa245 PMID:33373440	研究论文	本文研究了脂肪因子瘦素通过调节前垂体细胞系调控因子POU1F1的表达，影响能量稳态的机制	首次报道了干细胞标志物Musashi1对POU1F1 mRNA翻译的抑制作用，并揭示了瘦素信号通过逆转Musashi介导的POU1F1 mRNA翻译调控，协调前垂体生长激素细胞功能与代谢状态的机制	NA	探讨瘦素信号对前垂体细胞系调控因子POU1F1表达的调控机制	前垂体生长激素细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	mRNA	来自对照雌性小鼠的垂体细胞
6526	2024-11-06	Single-Cell RNA Sequencing Reveals Metabolic Stress-Dependent Activation of Cardiac Macrophages in a Model of Dyslipidemia-Induced Diastolic Dysfunction 2024-Nov-05, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.122.062984 PMID:38126199	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术分析了高脂饮食诱导的ApoE敲除小鼠模型中心脏细胞的表达谱，揭示了代谢应激对心脏巨噬细胞的激活作用及其在舒张功能障碍中的作用	首次揭示了代谢应激通过内质网应激途径直接激活心脏巨噬细胞，并提出了钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂作为治疗HFpEF特定表型的潜在疗法	NA	探讨代谢应激对心脏炎症细胞的影响，特别是巨噬细胞，并评估钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂的潜在治疗效果	ApoE敲除小鼠模型中的心脏细胞和巨噬细胞	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	ApoE敲除小鼠
6527	2024-11-06	Angiotensin-Converting Enzyme-Dependent Intrarenal Angiotensin II Contributes to CTP: Phosphoethanolamine Cytidylyltransferase Downregulation, Mitochondrial Membranous Disruption, and Reactive Oxygen Species Overgeneration in Diabetic Tubulopathy 2024-Nov-04, Antioxidants & redox signaling IF:5.9Q1 DOI:10.1089/ars.2024.0637 PMID:39495586	研究论文	研究探讨了血管紧张素转换酶（ACE）依赖的肾内血管紧张素II在糖尿病肾小管病变中的作用	揭示了ACE依赖的肾内血管紧张素II在糖尿病肾小管病变中的关键作用，为治疗提供了新的见解	NA	测试ACE依赖的肾内血管紧张素II是否破坏肾小管线粒体膜稳态并导致过量ROS生成	糖尿病肾小管病变中的线粒体膜稳态和ROS生成	NA	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠模型
6528	2024-11-06	Multiple Machine Learning Identifies Key Gene PHLDA1 Suppressing NAFLD Progression 2024-Nov-04, Inflammation IF:4.5Q2 DOI:10.1007/s10753-024-02164-6 PMID:39496918	研究论文	本研究通过多重机器学习策略识别出关键基因PHLDA1，该基因在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）进展中起抑制作用	本研究首次通过多重机器学习策略识别出PHLDA1基因，并验证其在NAFLD进展中的抑制作用	本研究主要基于细胞和小鼠模型进行验证，尚未在人体临床试验中验证PHLDA1的疗效	识别和验证新的NAFLD生物标志物，以促进其预测、预防和个性化治疗	NAFLD相关基因和免疫细胞	机器学习	非酒精性脂肪肝病	加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CIBERSORT分析	多种机器学习模型	基因表达数据	三个NAFLD数据集中的23个重叠差异表达基因（DEGs），以及细胞和小鼠NAFLD模型
6529	2024-11-06	The study of Alzheimer's disease risk diagnosis based on natural killer cell marker genes in the multi-omics data 2024-Nov-03, Journal of Alzheimer's disease : JAD DOI:10.1177/13872877241295316 PMID:39497294	研究论文	研究基于自然杀伤细胞标记基因的多组学数据进行阿尔茨海默病风险诊断	提出了一种新的特征选择算法ADGCN，并基于17个特征基因构建了诊断模型	NA	识别与阿尔茨海默病相关的特征基因，构建诊断模型并探索其潜在的生物学机制	自然杀伤细胞标记基因	生物信息学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序	ADGCN-XGBoost	多组学数据	NA
6530	2024-11-06	Single-cell transcriptomics reveals IRF7 regulation of the tumor microenvironment in isocitrate dehydrogenase wild-type glioma 2024-Nov, MedComm IF:10.7Q1 DOI:10.1002/mco2.754 PMID:39492838	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组测序分析了IDH突变型和野生型胶质瘤患者的细胞亚群基因表达调控网络，揭示了IRF7在IDH野生型胶质瘤微环境中的调控作用	首次系统地建立了IDH转录活性在胶质瘤中的单细胞水平调控机制，并绘制了相应的细胞图谱	NA	探讨IDH突变型和野生型胶质瘤的基因表达调控网络及其在肿瘤微环境中的作用	IDH突变型和野生型胶质瘤患者的细胞亚群	数字病理学	脑肿瘤	单细胞RNA测序、空间转录组测序	机器学习模型	RNA	IDH突变型和野生型胶质瘤患者
6531	2024-11-06	Identification of immune feature genes and intercellular profiles in diabetic cardiomyopathy 2024-Oct-15, World journal of diabetes IF:4.2Q1 DOI:10.4239/wjd.v15.i10.2093 PMID:39493556	研究论文	研究探讨了糖尿病心肌病（DCM）中的免疫分子机制，并基于免疫特征基因构建了诊断和预后模型	首次识别出Proenkephalin（Penk）和retinol binding protein 7（Rbp7）作为潜在的DCM生物标志物，并揭示了间质细胞与免疫细胞之间的异常表型转换和信号交流	NA	探讨糖尿病心肌病中的免疫分子机制并构建诊断和预后模型	糖尿病心肌病患者的免疫特征基因和细胞间相互作用	数字病理学	心血管疾病	RNA测序（RNA-seq）、单样本基因集富集分析（ssGSEA）、实时定量聚合酶链反应和蛋白质印迹技术	机器学习	RNA测序数据、单细胞RNA测序数据	验证队列中的样本数量未明确提及
6532	2024-11-06	Loss of Smek1 Induces Tauopathy and Triggers Neurodegeneration by Regulating Microtubule Stability 2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202400584 PMID:39206808	研究论文	研究探讨了Smek1在tauopathy中防止神经退行性变的作用	首次证明Smek1缺乏通过加剧tau病理和线粒体功能障碍以年龄依赖性方式逐渐诱导神经退行性变	NA	研究Smek1在tauopathy和神经退行性变中的生理和病理作用	Smek1在tauopathy中的作用及其对神经退行性变的影响	NA	阿尔茨海默病	单细胞测序	NA	蛋白质相互作用分析	Smek1敲除小鼠和shSmek1细胞
6533	2024-11-06	Myeloid Cells and Sensory Nerves Mediate Peritendinous Adhesion Formation via Prostaglandin E2 2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202405367 PMID:39207041	研究论文	研究探讨了骨髓细胞和感觉神经通过前列腺素E2介导腱周粘连形成的机制	首次通过单细胞RNA测序分析结合条件性敲除小鼠模型，揭示了COX2在骨髓细胞和EP4基因在感觉神经中的作用，以及PGE2在腱修复中的复杂作用	研究主要基于小鼠模型和人类样本的单细胞RNA测序，可能无法完全反映人类临床情况	阐明前列腺素E2在腱周粘连形成和腱修复中的复杂作用	骨髓细胞、感觉神经、腱周粘连、腱修复	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	人类和小鼠样本，以及八种条件性敲除小鼠
6534	2024-11-06	Hypoxic Upregulation of IER2 Increases Paracrine GMFG Signaling of Endoplasmic Reticulum Stress-CAF to Promote Chordoma Progression via Targeting ITGB1 2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202405421 PMID:39207055	研究论文	研究揭示了缺氧环境下IER2上调通过靶向ITGB1促进脊索瘤进展的分子机制	首次阐明了缺氧微环境通过IER2上调促进脊索瘤进展的分子机制，并揭示了ERS-CAF通过IER2/GMFG/ITGB1轴调节SPP1巨噬细胞加剧脊索瘤进展	研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内实验验证	揭示脊索瘤中ERS-CAF亚群的致癌机制	脊索瘤中的ERS-CAF亚群及其在肿瘤进展中的作用	数字病理学	脊索瘤	单细胞RNA测序、空间转录组学、GeoMx数字空间分析仪、数据独立采集蛋白质组学、批量RNA测序、多重定量免疫荧光	NA	基因表达数据、蛋白质组数据	多个脊索瘤样本
6535	2024-11-06	Single-cell genomics details the maturation block in BCP-ALL and identifies therapeutic vulnerabilities in DUX4-r cases 2024-09-26, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2023021705 PMID:38968149	研究论文	本文利用多模态单细胞测序技术，详细描述了B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）的成熟阻滞现象，并识别了DUX4重排（DUX4-r）亚型的治疗脆弱性	首次通过多模态单细胞测序技术，详细描绘了不同BCP-ALL亚型的转录组、表观遗传和免疫表型特征，并发现了DUX4-r亚型的多谱系启动和PI3K/AKT信号通路的激活	研究样本仅限于23例儿童BCP-ALL病例，可能无法完全代表所有BCP-ALL患者的情况	揭示BCP-ALL的生物学特性和治疗脆弱性，为开发新的治疗策略提供依据	B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）及其DUX4重排（DUX4-r）亚型	数字病理学	白血病	单细胞测序	NA	转录组、表观遗传和免疫表型数据	23例儿童BCP-ALL病例
6536	2024-11-06	NK cells with adhesion defects and reduced cytotoxic functions are associated with a poor prognosis in multiple myeloma 2024-09-19, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2023023529 PMID:38875515	研究论文	研究分析了多发性骨髓瘤患者中NK细胞的粘附缺陷和细胞毒性功能降低与预后不良的关系	通过单细胞RNA测序分析了多发性骨髓瘤患者和健康供体中NK细胞的转录组变化，发现MM患者中CD56dim NK细胞亚群减少，而晚期NK细胞亚群增加，这些细胞具有低CD16和CD226表达和较差的细胞毒性功能	研究样本量较小，且仅限于特定患者群体，可能影响结果的普适性	探讨多发性骨髓瘤患者中NK细胞的功能变化及其与预后的关系	多发性骨髓瘤患者和健康供体中的NK细胞	NA	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	10名多发性骨髓瘤患者和10名年龄/性别匹配的健康供体
6537	2024-11-06	Upregulated expression of ubiquitin ligase TRIM21 promotes PKM2 nuclear translocation and astrocyte activation in experimental autoimmune encephalomyelitis 2024-Sep-12, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.98181 PMID:39264698	研究论文	研究揭示了泛素连接酶TRIM21通过促进PKM2核转位和星形胶质细胞活化在实验性自身免疫性脑脊髓炎中的作用	首次揭示了TRIM21通过泛素化介导的机制调控PKM2核转位，从而影响星形胶质细胞活化和神经炎症	NA	探讨代谢重编程在星形胶质细胞活化中的作用及其分子机制	实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型中的星形胶质细胞	NA	多发性硬化症	单细胞RNA测序、免疫荧光染色	NA	RNA	实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠及小鼠原代星形胶质细胞
6538	2024-11-06	HA-1-targeted T-cell receptor T-cell therapy for recurrent leukemia after hematopoietic stem cell transplantation 2024-09-05, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024024105 PMID:38683966	研究论文	本文报道了一项针对复发性白血病的HA-1靶向T细胞受体T细胞疗法的I期临床试验	开发了一种新的TCR-T产品，靶向HA-1抗原，用于治疗或巩固治疗复发性白血病和骨髓增生性肿瘤	研究未设计评估疗效，且样本量较小	评估HA-1 TCR-T在造血干细胞移植后治疗复发性白血病的可行性和安全性	复发性白血病和骨髓增生性肿瘤患者	NA	白血病	T细胞受体（TCR）基因转移	NA	RNA测序	9名造血干细胞移植后复发性白血病患者
6539	2024-11-06	Activation of cGAS/STING Drives Inflammation and Cellular Senescence of Macrophages in Ovarian Endometrioma Induced by Endometriotic Cyst Fluid 2024-Sep, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202300711 PMID:38864247	研究论文	研究探讨了卵巢子宫内膜异位囊肿液对卵巢功能的影响及其机制	发现cGAS/STING信号通路的激活在卵巢子宫内膜异位囊肿液诱导的炎症和细胞衰老中的作用，并验证了STING抑制剂H-151的缓解效果	NA	探讨卵巢子宫内膜异位囊肿液对卵巢功能的影响及其分子和细胞机制	卵巢子宫内膜异位囊肿液、卵巢功能、巨噬细胞	NA	卵巢疾病	单细胞测序	NA	临床样本	NA
6540	2024-11-06	Loss of NLRP6 increases the severity of kidney fibrosis 2024-Sep, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1 DOI:10.1002/jcp.31347 PMID:38934623	研究论文	研究探讨了NLRP6在慢性肾脏疾病（CKD）中的作用及其在肾脏纤维化中的分子机制	首次揭示了NLRP6在肾脏纤维化中的保护作用，并阐明了其通过调节p38 MAPK信号通路影响纤维化进程的机制	研究主要基于小鼠模型和细胞培养，缺乏人类临床数据的支持	探讨NLRP6在慢性肾脏疾病中的作用及其分子机制	NLRP6在肾脏纤维化中的作用及其分子机制	NA	肾脏疾病	单细胞转录组学	NA	转录组数据	野生型和Nlrp6缺陷小鼠，以及培养的近端小管细胞