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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6501 | 2025-10-06 |
Connexin 43-mediated neurovascular interactions regulate neurogenesis in the adult brain subventricular zone
2023-04-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112371
PMID:37043357
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研究论文 | 本研究揭示了连接蛋白43介导的神经干细胞与内皮细胞相互作用调控成年大脑脑室下区神经发生的机制 | 首次发现Cx43通过非通道依赖方式(借助胞质尾端和ERK激活)调控神经干细胞静息状态 | 具体信号通路细节仍需进一步阐明 | 探究成年大脑脑室下区神经干细胞与内皮细胞相互作用的调控机制 | 成年小鼠脑室下区的神经干细胞和内皮细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 体外实验 | 基因敲除模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6502 | 2025-10-06 |
Anti-Cancer Activity of Verteporfin in Cholangiocarcinoma
2023-Apr-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15092454
PMID:37173920
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研究论文 | 本研究探讨了YAP1通路抑制剂维替泊芬在胆管癌小鼠模型中的抗肿瘤活性及其对免疫细胞和肿瘤干细胞的影响 | 首次在YAP1/AKT小鼠模型中验证维替泊芬通过调节肿瘤相关巨噬细胞极化和激活CD8 T细胞发挥抗胆管癌作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 研究维替泊芬在胆管癌中的抗肿瘤机制 | YAP1/AKT水动力尾静脉注射小鼠模型 | 癌症研究 | 胆管癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 小鼠模型分组比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6503 | 2025-10-06 |
Pseudotime dynamics of T cells in pancreatic ductal adenocarcinoma inform distinct functional states within the regulatory and cytotoxic T cells
2023-Apr-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106324
PMID:36968070
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和RNA速度分析研究胰腺导管腺癌中T细胞的功能动态 | 首次在PDAC中应用基于RNA速度的拟时序分析揭示T细胞功能状态转变轨迹 | 研究基于手术切除样本,可能无法完全反映疾病进展全过程 | 理解PDAC微环境中T细胞的功能动态以开发新的治疗策略 | 人类胰腺导管腺癌手术切除标本中的T细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, RNA速度分析, 拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6504 | 2025-10-06 |
Novel Candidate Regulators and Developmental Trajectory of Pituitary Thyrotropes
2023-04-17, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad076
PMID:37183548
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究小鼠垂体促甲状腺激素细胞的发育轨迹和新型调控因子 | 发现了同时表达促甲状腺激素和促性腺激素标记物的细胞群体,确定了Nr5a1祖细胞在促甲状腺激素发育中的作用,并识别了Shox2b和Sox14等新型调控因子 | 研究仅使用P7幼年小鼠垂体细胞,未涵盖其他发育阶段 | 探究垂体干细胞分化为特定细胞类型,特别是促甲状腺激素细胞的分子机制 | 幼年P7小鼠垂体细胞,重点关注促甲状腺激素细胞和稀有亚型 | 发育生物学 | 内分泌系统疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 幼年P7小鼠垂体细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6505 | 2025-10-06 |
Spatially Resolved Transcriptomics Deconvolutes Prognostic Histological Subgroups in Patients with Colorectal Cancer and Synchronous Liver Metastases
2023-04-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2794
PMID:37057593
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术解析结直肠癌肝转移患者预后相关的组织学亚群 | 首次将空间转录组学应用于同步结直肠癌肝转移研究,揭示了转移瘤边缘和中心的空间异质性特征与预后的关联 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 确定组织学评估在预测结直肠癌肝转移患者同步切除术后预后的实际应用价值 | 接受同步切除的原发性结直肠癌和肝转移患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学, 免疫组织化学, 基因组panel测序, 批量转录组测序 | NA | 空间转录组数据, 组织图像, 基因组数据, 转录组数据 | 同步切除的结直肠癌肝转移患者样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组分析平台 |
6506 | 2025-10-06 |
Low-dose IL-2 enhances the generation of IL-10-producing immunoregulatory B cells
2023-04-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37424-w
PMID:37045832
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研究论文 | 本研究证明低剂量IL-2能增强人类B细胞产生IL-10的能力,并通过单细胞RNA测序揭示了其分子机制 | 首次发现低剂量IL-2可治疗性诱导人类调节性B细胞,并揭示BACH2转录抑制因子在此过程中的关键作用 | 研究样本量有限,机制研究主要基于体外实验和转录组分析 | 探究低剂量IL-2对调节性B细胞的诱导作用及其分子机制 | 人类外周血和脾脏B细胞,接受低剂量IL-2治疗的患者 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序,体外细胞培养,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 未明确样本数量,包括患者外周血细胞和脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6507 | 2025-10-06 |
Tissue-Resident Memory T Cells in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Coexpress PD-1 and TIGIT and Functional Inhibition Is Reversible by Dual Antibody Blockade
2023-04-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0121
PMID:36689623
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了胰腺导管腺癌中组织驻留记忆T细胞共表达PD-1和TIGIT的耗竭表型,并证明双抗体阻断可逆转其功能抑制 | 首次在PDAC中发现大量TRM细胞共表达PD-1和TIGIT,并证实双检查点阻断能有效增强T细胞功能 | 研究样本量有限,未进行体内功能验证实验 | 阐明PDAC肿瘤免疫微环境中T细胞的特征及免疫检查点阻断的治疗潜力 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤浸润T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 飞行时间质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据, 蛋白质表达数据 | PDAC患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
6508 | 2025-10-06 |
Transcriptomic landscapes of effective and failed liver regeneration in humans
2023-Apr, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100683
PMID:36950091
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研究论文 | 本研究通过转录组分析探索人类肝脏再生过程中功能性再生与功能障碍性再生的分子机制差异 | 首次在人类中系统评估肝脏再生早期转录变化,发现功能障碍性再生患者存在DUSP4表达降低和过度炎症反应的新机制 | 样本量相对有限(21例用于RNA测序),主要关注早期转录变化,长期再生过程未涉及 | 系统评估人类肝脏再生早期转录变化及其在功能障碍性再生中的差异 | 接受肝切除术的154例患者血液样本和46例患者术中组织样本 | 转录组学 | 肝脏疾病 | RNA测序, 空间转录组学, 细胞因子检测 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 细胞因子数据 | 154例患者血液样本, 46例患者组织样本, 其中21例匹配队列用于RNA测序 | NA | RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
6509 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling to explore pancreatic cancer heterogeneity, plasticity and response to therapy
2023-04, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00526-x
PMID:36959420
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综述 | 本文综述了单细胞分析技术在胰腺导管腺癌研究中的应用,探讨肿瘤异质性、可塑性及治疗反应机制 | 整合高分辨率单细胞测序与空间转录组学技术,系统解析PDAC在稳态和治疗扰动下的细胞类型特征 | NA | 通过单细胞多组学方法阐明胰腺癌生物学特性及治疗反应机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的恶性细胞和宿主细胞类型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
6510 | 2025-10-06 |
Brassinosteroid gene regulatory networks at cellular resolution in the Arabidopsis root
2023-03-31, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf4721
PMID:36996230
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析拟南芥根中油菜素甾醇激素响应基因的细胞类型特异性调控网络 | 首次在单细胞分辨率下揭示油菜素甾醇在特定细胞类型(皮层细胞)中介导从增殖向伸长转变的调控网络 | NA | 阐明油菜素甾醇在植物根发育过程中的时空特异性基因调控机制 | 拟南芥根的不同细胞类型和发育阶段 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6511 | 2025-10-06 |
Species-specific regulation of XIST by the JPX/FTX orthologs
2023-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad029
PMID:36727460
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研究论文 | 本研究探讨了XIST基因在人类和小鼠中受JPX/FTX同源基因调控的物种特异性差异 | 揭示了同源长链非编码RNA基因在不同物种中功能保守但作用机制多样化的现象 | 研究主要集中于人类和小鼠的比较,未涵盖更多哺乳动物物种 | 探究X染色体失活过程中XIST基因调控机制的物种特异性差异 | 人类和小鼠的多能干细胞及分化后XCI细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 功能测定 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 早期人类胚胎发生的单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6512 | 2025-10-06 |
IBRAP: integrated benchmarking single-cell RNA-sequencing analytical pipeline
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad061
PMID:36847692
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研究论文 | 开发了一个集成基准测试的单细胞RNA测序分析流程IBRAP,用于比较和优化不同分析工具的组合 | 提出了首个包含可互换分析组件和多种基准测试指标的单细胞RNA测序分析流程,支持用户根据数据特性确定最优分析方案 | 未明确说明该工具在处理超大规模数据集时的计算效率限制 | 开发一个标准化的单细胞RNA测序数据分析流程,解决分析工具选择困难的问题 | 单细胞RNA测序数据分析方法和工具 | 生物信息学 | 胰腺疾病,癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 原代胰腺组织、癌细胞系和模拟数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6513 | 2025-10-06 |
Apoptotic cell fragments locally activate tingible body macrophages in the germinal center
2023-03-16, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.02.004
PMID:36868219
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研究论文 | 本研究揭示了生发中心内凋亡细胞片段如何局部激活可染体巨噬细胞以清除细胞碎片 | 首次通过多种互补方法证明可染体巨噬细胞来源于淋巴结驻留的CD169谱系前体细胞,并发现其采用'懒惰'搜索策略捕获凋亡片段 | NA | 探究生发中心内凋亡细胞清除机制及可染体巨噬细胞的来源和功能 | 小鼠淋巴组织中的可染体巨噬细胞和凋亡B细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6514 | 2025-10-06 |
Accurate estimation of rare cell type fractions from tissue omics data via hierarchical deconvolution
2023-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.15.532820
PMID:36993280
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研究论文 | 提出一种基于单细胞RNA测序参考和层次细胞类型树的新方法HiDecon,用于准确估计组织组学数据中稀有细胞类型的比例 | 使用层次细胞类型树建模细胞类型相似性和分化关系,通过跨层次协调细胞比例来校正估计偏差 | NA | 开发能够准确估计高度相关或稀有细胞类型比例的细胞反卷积方法 | 组织样本中的细胞类型比例 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,细胞反卷积 | 层次模型 | 批量转录组数据,单细胞RNA测序参考数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
6515 | 2025-10-06 |
Skin γδ T cell inflammatory responses are hardwired in the thymus by oxysterol sensing via GPR183 and calibrated by dietary cholesterol
2023-03-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.01.025
PMID:36842431
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研究论文 | 本研究揭示了胆固醇代谢物氧固醇通过GPR183受体调控皮肤γδ T细胞的胸腺发育和炎症功能 | 首次发现氧固醇通过GPR183受体在胸腺中程序化地塑造皮肤γδ T细胞的炎症反应能力,并证明饮食胆固醇可通过此途径加剧银屑病炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类中的相关性需要进一步验证 | 探究胆固醇代谢物氧固醇如何通过GPR183受体影响γδ T细胞的组织驻留和功能 | 小鼠皮肤中产生IL-17的γδ T细胞 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6516 | 2025-10-06 |
Loss of MC1R signaling implicates TBX3 in pheomelanogenesis and melanoma predisposition
2023-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532018
PMID:37090624
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示MC1R信号缺失导致红色毛发特征和黑色素瘤易感性的分子机制 | 首次发现TBX3作为红色素基因特征的关键调控因子,连接色素生成与衰老逃逸机制 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明MC1R信号通路调控色素生成和黑色素瘤易感性的分子机制 | 携带红色毛发特征突变的小鼠模型黑色素细胞 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 红色毛发特征小鼠模型的黑色素细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6517 | 2025-10-06 |
Myocardial Milieu Favors Local Differentiation of Regulatory T Cells
2023-03-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.122.322183
PMID:36744467
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研究论文 | 本研究揭示了心肌微环境如何促进抗原特异性调节性T细胞的局部分化及其在心肌梗死后修复中的作用 | 首次证明心脏及其引流淋巴结通过促进具有抑制功能的抗原特异性调节性T细胞分化来主动塑造局部免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 研究心肌微环境如何影响抗原特异性T辅助细胞的分化 | 小鼠心肌梗死模型中的抗原特异性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序,流式细胞术,T细胞受体测序 | 转基因T细胞受体模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 小鼠心肌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6518 | 2025-10-06 |
Pioneer factor ASCL1 cooperates with the mSWI/SNF complex at distal regulatory elements to regulate human neural differentiation
2023-03-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.350269.122
PMID:36931659
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研究论文 | 本研究揭示了先驱转录因子ASCL1在人类神经分化过程中通过与mSWI/SNF复合物在远端调控元件合作调控染色质重塑的新机制 | 发现ASCL1不仅作为经典先驱因子发挥作用,还能作为非先驱重塑因子与BAF SWI/SNF染色质重塑复合物相互作用,揭示其染色质重塑功能依赖于伴侣ATPase活性的新机制 | 研究主要关注ASCL1在神经分化中的功能,可能不适用于其他发育过程或细胞类型 | 探索先驱转录因子ASCL1在人类神经分化过程中调控染色质重塑的分子机制 | 人类神经分化过程中的先驱转录因子ASCL1及其与mSWI/SNF复合物的相互作用 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6519 | 2025-10-06 |
Zinc Supplementation Induced Transcriptional Changes in Primary Human Retinal Pigment Epithelium: A Single-Cell RNA Sequencing Study to Understand Age-Related Macular Degeneration
2023-02-28, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12050773
PMID:36899910
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析锌补充对人类原代视网膜色素上皮细胞转录组的影响,探索其对年龄相关性黄斑变性的保护机制 | 首次在单细胞水平揭示锌补充通过调控ID1/ID3转录调节影响RPE细胞分化动态的分子机制 | 研究基于体外细胞培养模型,可能与体内实际情况存在差异;细胞培养时间较长(19周)可能引入额外变量 | 阐明锌补充延缓年龄相关性黄斑变性进展的分子机制 | 人类原代视网膜色素上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析,伪时间排序 | 单细胞转录组数据 | 在培养2、9、19周时分离的细胞,使用125 µM锌处理一周 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6520 | 2025-10-06 |
A program of successive gene expression in mouse one-cell embryos
2023-02-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112023
PMID:36729835
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研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞RNA测序揭示了小鼠单细胞胚胎中胚胎基因组激活的早期基因表达程序 | 首次在脊椎动物中精确描述了受精后4小时内启动的即时胚胎基因组激活程序,并发现其受癌症相关转录因子调控 | 研究仅限于小鼠模型,在其他哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 阐明哺乳动物胚胎发育起始阶段的转录调控机制 | 小鼠单细胞胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 精确同步化的小鼠单细胞胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 高分辨率单细胞RNA测序 |