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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6501 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Unifies Developmental Programs of Esophageal and Gastric Intestinal Metaplasia
2023-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-0824
PMID:36929873
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示食管和胃肠化生的共同发育轨迹 | 首次构建涵盖整个胃肠道的单细胞转录组图谱,发现食管和胃肠化生具有分子相似性及表型嵌合特征 | 未明确说明样本量大小及具体测序平台细节 | 探究食管和胃肠化生的发育轨迹与分子特征 | 胃肠道组织样本(包括正常生理状态和病理状态) | 单细胞组学 | 食管腺癌、胃腺癌 | 单细胞RNA测序、蛋白表达研究 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6502 | 2025-10-06 |
Antigen-driven colonic inflammation is associated with development of dysplasia in primary sclerosing cholangitis
2023-Jun, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02372-x
PMID:37322120
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研究论文 | 通过多组学分析揭示原发性硬化性胆管炎患者结肠炎症与异型增生发展的抗原驱动机制 | 首次发现PSC患者结肠中存在独特的适应性炎症转录特征,其特征为抗原驱动的IL-17A+FOXP3+ CD4 T细胞和IgG分泌浆细胞扩增 | 样本量有限(共221例),未验证干预措施效果 | 探究PSC患者结肠异型增生发展的分子机制 | 65例PSC患者、108例IBD患者和48例健康个体的右结肠组织 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 流式细胞术, 批量转录组测序, 单细胞转录组测序, T/B细胞受体谱分析 | NA | 组织样本, 基因表达数据, 免疫受体序列 | 221例(65例PSC+108例IBD+48例健康对照) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
6503 | 2025-10-06 |
Transcriptomics for Clinical and Experimental Biology Research: Hang on a Seq
2023-Jun, Advanced genetics (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/ggn2.202200024
PMID:37288167
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评论 | 比较现代微阵列与RNA测序技术在转录组研究中的优劣 | 提出需要重新评估批量转录组方法,强调现代高密度微阵列在准确量化基因表达方面的优势 | 主要关注批量转录组技术,对单细胞测序和长读长测序仅作简要讨论 | 比较不同转录组技术的性能并推动现有RNA参考图谱的修订 | 蛋白质编码基因和长链非编码RNA(lncRNA) | 转录组学 | NA | 微阵列, RNA测序(RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
6504 | 2025-10-06 |
Late-onset enteric virus infection associated with hepatitis (EVAH) in transplanted SCID patients
2023-06, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.12.822
PMID:36638922
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研究论文 | 本研究探讨移植后严重联合免疫缺陷患者中与肠道病毒感染相关的迟发性肝炎的发病机制和风险因素 | 首次将移植后SCID患者的持续性肝炎与肠道病毒慢性感染联系起来,并命名为EVAH综合征 | 样本量较小(11例患者),为单中心研究 | 表征移植SCID患者中持续性肝炎的患病率和病理生理学,评估风险因素和治疗方法 | 接受造血干细胞移植或基因治疗的严重联合免疫缺陷患者 | 数字病理学 | 免疫缺陷疾病 | 病理学评估、宏基因组学、单细胞转录组学、飞行时间细胞术 | NA | 组织样本、粪便样本、多组学数据 | 23例患者(11例SCIDH+组,12例SCIDH-组) | NA | 单细胞转录组学, 飞行时间细胞术, 宏基因组学 | NA | NA |
6505 | 2025-10-06 |
Single-cell gene and isoform expression analysis reveals signatures of ageing in haematopoietic stem and progenitor cells
2023-05-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04936-6
PMID:37225862
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研究论文 | 通过整合长短读长单细胞RNA测序分析造血干细胞和祖细胞,揭示衰老过程中的基因和亚型表达特征 | 首次在单细胞水平整合长短读长RNA测序分析,揭示造血系统中超过半数基因表达多种功能不同的亚型 | 主要关注造血系统,可能不适用于其他组织类型 | 研究造血干细胞和祖细胞在衰老过程中的基因和亚型表达变化 | 造血干细胞和祖细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 整合短读长和长读长单细胞RNA测序技术 |
6506 | 2025-10-06 |
Evaluating the transcriptional landscape and cell-cell communication networks in chronically irradiated parotid glands
2023-May-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106660
PMID:37168562
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析评估慢性辐射后小鼠腮腺的转录景观和细胞间通讯网络 | 首次在慢性辐射损伤腮腺中鉴定出具有特定标志物表达的分泌细胞群体,并揭示细胞间通讯网络的失调机制 | 研究仅基于小鼠模型,样本收集时间点固定为辐射后10个月 | 理解辐射后慢性唾液功能减退的转录机制并开发再生疗法 | 辐射处理10个月后的小鼠腮腺组织 | 单细胞组学 | 唾液腺功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照组和辐射组小鼠腮腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6507 | 2025-10-06 |
The role of CD8+ T-cell clones in immune thrombocytopenia
2023-05-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022018380
PMID:36749920
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研究论文 | 本研究通过多维度方法揭示了CD8+ T细胞克隆在免疫性血小板减少症中通过细胞毒性作用直接破坏血小板的抗体非依赖性机制 | 首次发现ITP患者中存在克隆性扩增的CD8+ TEMRA细胞,并证实其通过TCR介导的细胞毒性颗粒释放直接导致血小板活化和凋亡 | 研究样本量有限,主要关注慢性ITP成人患者,未涵盖所有ITP亚型 | 探索细胞毒性CD8+ T细胞在免疫性血小板减少症发病机制中的作用 | 慢性免疫性血小板减少症患者和年龄匹配的对照个体 | 免疫学 | 免疫性血小板减少症 | 免疫表型分析、T细胞受体基因二代测序、单细胞RNA测序、功能测定 | NA | 基因组测序数据、单细胞转录组数据、功能实验数据 | 未明确具体样本数量,包括ITP患者和年龄匹配对照 | NA | 单细胞RNA测序, 二代测序 | NA | NA |
6508 | 2025-10-06 |
Spatial and molecular profiling of the mononuclear phagocyte network in classic Hodgkin lymphoma
2023-05-11, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022015575
PMID:36758207
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多重免疫荧光技术,揭示了经典霍奇金淋巴瘤中单核吞噬细胞网络的复杂组成和空间分布特征 | 首次在单细胞和空间分辨率水平系统解析cHL中单核吞噬细胞网络的组成、空间分布和相互作用机制 | 样本数量相对有限,需要更大规模的研究验证发现 | 探究经典霍奇金淋巴瘤中单核吞噬细胞网络的组成、空间分布及其在免疫抑制微环境中的作用 | 经典霍奇金淋巴瘤和非淋巴瘤淋巴结组织 | 数字病理学 | 经典霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 未明确具体样本数量,包括cHL和非淋巴瘤淋巴结组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
6509 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptional changes of human choroidal and retinal pigment epithelium cells during fetal development, in healthy adult and intermediate age-related macular degeneration
2023-05-05, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddad007
PMID:36645183
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人脉络膜和视网膜色素上皮细胞在胎儿发育期、健康成人和中期年龄相关性黄斑变性中的转录变化 | 首次在单细胞水平系统描绘RPE-脉络膜组织从胎儿到成年的发育轨迹,并比较AMD患者与健康个体的细胞差异 | 单细胞RNA测序所需组织处理复杂且易产生技术假象,结果需在更多AMD患者和对照中通过其他技术验证 | 探究年龄相关性黄斑变性的发病机制和细胞分子变化 | 人胎儿和成人视网膜色素上皮-脉络膜组织 | 单细胞组学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胎儿和成人RPE-脉络膜组织样本,包括AMD患者和未患病对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6510 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Conserved Regulatory Networks in Human and Mouse Interneuron Development
2023-May-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24098122
PMID:37175835
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示人类和小鼠中间神经元发育中保守的调控网络 | 首次对人类胚胎期中间神经元发育进行单细胞转录组分析,并识别出物种间保守的调控程序和新候选转录调控因子 | 仅分析了10-15周孕期的胚胎组织,未覆盖更广泛的发育阶段 | 研究抑制性GABA能中间神经元的发育机制 | 人类和小鼠胚胎期内侧神经节隆起组织 | 单细胞生物学 | 癫痫、自闭症、精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胚胎10-15周孕期的MGE组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6511 | 2025-10-06 |
Identification of GPI-anchored protein LYPD1 as an essential factor for odontoblast differentiation in tooth development
2023-05, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.104638
PMID:36963497
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研究论文 | 本研究通过微阵列和单细胞RNA测序技术,发现GPI锚定蛋白LYPD1是牙本质细胞分化的关键调控因子 | 首次鉴定LYPD1作为前成牙本质细胞的特异性标志物,并揭示其通过调控BMP信号通路中Smad1/5/8磷酸化促进牙本质细胞分化的新机制 | 研究主要基于体外器官培养系统和小鼠牙髓细胞,尚未进行完整的体内功能验证 | 探究脂筏成分在牙齿发育过程中对牙本质细胞分化的调控作用 | 小鼠牙胚和牙髓细胞 | 发育生物学 | 牙齿发育异常 | 微阵列, 单细胞RNA测序, 体外器官培养 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6512 | 2025-10-06 |
Connexin 43-mediated neurovascular interactions regulate neurogenesis in the adult brain subventricular zone
2023-04-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112371
PMID:37043357
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研究论文 | 本研究揭示了连接蛋白43介导的神经干细胞与内皮细胞相互作用调控成年大脑脑室下区神经发生的机制 | 首次发现Cx43通过非通道依赖方式(借助胞质尾端和ERK激活)调控神经干细胞静息状态 | 具体信号通路细节仍需进一步阐明 | 探究成年大脑脑室下区神经干细胞与内皮细胞相互作用的调控机制 | 成年小鼠脑室下区的神经干细胞和内皮细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 体外实验 | 基因敲除模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6513 | 2025-10-06 |
Anti-Cancer Activity of Verteporfin in Cholangiocarcinoma
2023-Apr-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15092454
PMID:37173920
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研究论文 | 本研究探讨了YAP1通路抑制剂维替泊芬在胆管癌小鼠模型中的抗肿瘤活性及其对免疫细胞和肿瘤干细胞的影响 | 首次在YAP1/AKT小鼠模型中验证维替泊芬通过调节肿瘤相关巨噬细胞极化和激活CD8 T细胞发挥抗胆管癌作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 研究维替泊芬在胆管癌中的抗肿瘤机制 | YAP1/AKT水动力尾静脉注射小鼠模型 | 癌症研究 | 胆管癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 小鼠模型分组比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6514 | 2025-10-06 |
Pseudotime dynamics of T cells in pancreatic ductal adenocarcinoma inform distinct functional states within the regulatory and cytotoxic T cells
2023-Apr-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106324
PMID:36968070
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和RNA速度分析研究胰腺导管腺癌中T细胞的功能动态 | 首次在PDAC中应用基于RNA速度的拟时序分析揭示T细胞功能状态转变轨迹 | 研究基于手术切除样本,可能无法完全反映疾病进展全过程 | 理解PDAC微环境中T细胞的功能动态以开发新的治疗策略 | 人类胰腺导管腺癌手术切除标本中的T细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, RNA速度分析, 拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6515 | 2025-10-06 |
Novel Candidate Regulators and Developmental Trajectory of Pituitary Thyrotropes
2023-04-17, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad076
PMID:37183548
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究小鼠垂体促甲状腺激素细胞的发育轨迹和新型调控因子 | 发现了同时表达促甲状腺激素和促性腺激素标记物的细胞群体,确定了Nr5a1祖细胞在促甲状腺激素发育中的作用,并识别了Shox2b和Sox14等新型调控因子 | 研究仅使用P7幼年小鼠垂体细胞,未涵盖其他发育阶段 | 探究垂体干细胞分化为特定细胞类型,特别是促甲状腺激素细胞的分子机制 | 幼年P7小鼠垂体细胞,重点关注促甲状腺激素细胞和稀有亚型 | 发育生物学 | 内分泌系统疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 幼年P7小鼠垂体细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6516 | 2025-10-06 |
Spatially Resolved Transcriptomics Deconvolutes Prognostic Histological Subgroups in Patients with Colorectal Cancer and Synchronous Liver Metastases
2023-04-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2794
PMID:37057593
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术解析结直肠癌肝转移患者预后相关的组织学亚群 | 首次将空间转录组学应用于同步结直肠癌肝转移研究,揭示了转移瘤边缘和中心的空间异质性特征与预后的关联 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 确定组织学评估在预测结直肠癌肝转移患者同步切除术后预后的实际应用价值 | 接受同步切除的原发性结直肠癌和肝转移患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学, 免疫组织化学, 基因组panel测序, 批量转录组测序 | NA | 空间转录组数据, 组织图像, 基因组数据, 转录组数据 | 同步切除的结直肠癌肝转移患者样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组分析平台 |
6517 | 2025-10-06 |
Low-dose IL-2 enhances the generation of IL-10-producing immunoregulatory B cells
2023-04-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37424-w
PMID:37045832
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研究论文 | 本研究证明低剂量IL-2能增强人类B细胞产生IL-10的能力,并通过单细胞RNA测序揭示了其分子机制 | 首次发现低剂量IL-2可治疗性诱导人类调节性B细胞,并揭示BACH2转录抑制因子在此过程中的关键作用 | 研究样本量有限,机制研究主要基于体外实验和转录组分析 | 探究低剂量IL-2对调节性B细胞的诱导作用及其分子机制 | 人类外周血和脾脏B细胞,接受低剂量IL-2治疗的患者 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序,体外细胞培养,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 未明确样本数量,包括患者外周血细胞和脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6518 | 2025-10-06 |
Tissue-Resident Memory T Cells in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Coexpress PD-1 and TIGIT and Functional Inhibition Is Reversible by Dual Antibody Blockade
2023-04-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0121
PMID:36689623
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了胰腺导管腺癌中组织驻留记忆T细胞共表达PD-1和TIGIT的耗竭表型,并证明双抗体阻断可逆转其功能抑制 | 首次在PDAC中发现大量TRM细胞共表达PD-1和TIGIT,并证实双检查点阻断能有效增强T细胞功能 | 研究样本量有限,未进行体内功能验证实验 | 阐明PDAC肿瘤免疫微环境中T细胞的特征及免疫检查点阻断的治疗潜力 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤浸润T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 飞行时间质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据, 蛋白质表达数据 | PDAC患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
6519 | 2025-10-06 |
Transcriptomic landscapes of effective and failed liver regeneration in humans
2023-Apr, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100683
PMID:36950091
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研究论文 | 本研究通过转录组分析探索人类肝脏再生过程中功能性再生与功能障碍性再生的分子机制差异 | 首次在人类中系统评估肝脏再生早期转录变化,发现功能障碍性再生患者存在DUSP4表达降低和过度炎症反应的新机制 | 样本量相对有限(21例用于RNA测序),主要关注早期转录变化,长期再生过程未涉及 | 系统评估人类肝脏再生早期转录变化及其在功能障碍性再生中的差异 | 接受肝切除术的154例患者血液样本和46例患者术中组织样本 | 转录组学 | 肝脏疾病 | RNA测序, 空间转录组学, 细胞因子检测 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 细胞因子数据 | 154例患者血液样本, 46例患者组织样本, 其中21例匹配队列用于RNA测序 | NA | RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
6520 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling to explore pancreatic cancer heterogeneity, plasticity and response to therapy
2023-04, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00526-x
PMID:36959420
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综述 | 本文综述了单细胞分析技术在胰腺导管腺癌研究中的应用,探讨肿瘤异质性、可塑性及治疗反应机制 | 整合高分辨率单细胞测序与空间转录组学技术,系统解析PDAC在稳态和治疗扰动下的细胞类型特征 | NA | 通过单细胞多组学方法阐明胰腺癌生物学特性及治疗反应机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的恶性细胞和宿主细胞类型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |