单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 6501 - 6520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6501 | 2024-11-09 |
Single-cell transcriptomics reveal individual and synergistic effects of Trisomy 21 and GATA1s on hematopoiesis
2024-Oct-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.24.595827
PMID:38826323
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组测序分析唐氏综合症和GATA1s对造血作用的个体和协同效应 | 首次使用同基因人诱导多能干细胞研究唐氏综合症和GATA1s对造血祖细胞的个体和协同效应 | 研究仅限于同基因人诱导多能干细胞，未涉及临床样本 | 探讨唐氏综合症和GATA1s对造血作用的个体和协同效应 | 造血祖细胞 | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 同基因人诱导多能干细胞的造血祖细胞 |
| 6502 | 2024-11-09 |
Multi-omics revealed that ELAVL3 regulates MYCN in neuroblastoma via immunogenic cell death: Risk stratification and experimental research
2024-Oct-31, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.137045
PMID:39486730
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了ELAVL3通过免疫原性细胞死亡调节神经母细胞瘤中的MYCN，并进行了风险分层和实验研究 | 首次报道了免疫原性细胞死亡相关指数（ICDR-Index），并发现ELAVL3在神经母细胞瘤中的关键作用 | 研究主要基于批量转录组数据和单细胞RNA测序数据，未涉及临床试验 | 研究神经母细胞瘤的风险分层和免疫原性细胞死亡机制 | 神经母细胞瘤患者及其免疫治疗反应 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | 1244个神经母细胞瘤样本和16个单细胞RNA测序数据集 |
| 6503 | 2024-11-09 |
Learning antibody sequence constraints from allelic inclusion
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.22.619760
PMID:39484623
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研究论文 | 本文研究了从等位基因包含现象中学习抗体序列约束的方法 | 利用大规模单细胞测序数据，发现数千个幼稚B细胞中的轻链等位基因包含现象，并训练机器学习模型识别这些异常序列，结果模型与未训练的抗体特性（如多反应性、表面表达和亲和力成熟中的突变使用）相关性更高 | NA | 研究抗体序列约束 | 抗体和B细胞受体（BCR）的序列约束 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 序列数据 | 数千个幼稚B细胞 |
| 6504 | 2024-11-09 |
FlyRNAi.org 2025 update-expanded resources for new technologies and species
2024-Oct-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae917
PMID:39435987
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研究论文 | 本文介绍了FlyRNAi.org数据库2025年的更新，扩展了支持新技术和物种的资源 | 扩展了数据库以包括新的数据中心资源，支持单细胞转录组学的挖掘和分析，并将CRISPR试剂和基因中心生物信息学方法应用于Drosophila和其他节肢动物病媒 | NA | 推进生物学和生物医学理解的'omics研究设计、分析和挖掘 | Drosophila和其他节肢动物的功能基因组学研究 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学、CRISPR | NA | 基因组数据 | NA |
| 6505 | 2024-11-09 |
Heterotypic macrophages/microglia differentially contribute to retinal ischaemia and neovascularisation
2024-Oct, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06215-3
PMID:38977459
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研究论文 | 研究了异型巨噬细胞/小胶质细胞在视网膜缺血和新生血管形成中的不同作用 | 揭示了异型巨噬细胞/小胶质细胞在视网膜缺血和新生血管形成中的不同作用，为针对特定细胞的治疗方法提供了新的基础 | NA | 阐明巨噬细胞/小胶质细胞在增生性缺血性视网膜病变发病机制中的不同作用 | 巨噬细胞和小胶质细胞在糖尿病视网膜病变中的作用 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 免疫染色、定量实时RT-PCR、流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA |
| 6506 | 2024-11-09 |
Utilizing epigenetic regulators to improve HSC-based lentiviral gene therapy
2024-09-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024013047
PMID:38916861
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研究论文 | 本文探讨了利用表观遗传调节剂优化培养条件，以提高造血干细胞（HSC）为基础的慢病毒基因治疗效果 | 本文首次探索了使用组蛋白去乙酰化酶抑制剂和溴域抑制剂来增强HSC的体外扩增和基因转导效率 | NA | 优化HSC的体外扩增条件，以提高基于HSC的基因治疗效果 | 造血干细胞（HSC）及其早期祖细胞 | 基因治疗 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 6507 | 2024-11-09 |
scDTL: enhancing single-cell RNA-seq imputation through deep transfer learning with bulk cell information
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae555
PMID:39504481
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度迁移学习的单细胞RNA测序数据插补方法scDTL，通过利用批量细胞信息来增强插补效果 | scDTL利用批量RNA测序数据训练的去噪自编码器作为初始插补模型，并通过领域适应框架将批量插补模型的知识迁移到单细胞RNA测序学习任务中，同时采用1D U-Net去噪模型进行并行操作，捕捉单细胞RNA测序数据的粗粒度和细粒度特征，并通过交叉通道注意力机制融合特征 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题，提高下游分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 去噪自编码器、1D U-Net | RNA测序数据 | NA |
| 6508 | 2024-11-09 |
PAC1 constrains type 2 inflammation through promotion of CGRP signaling in ILC2s
2024-Sep-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI180109
PMID:39287985
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研究论文 | 研究探讨了PAC1通过促进CGRP信号传导在ILC2中调节2型炎症的作用 | 首次揭示了PAC1在ILC2中通过细胞内在机制促进CGRP信号传导，从而调节2型炎症 | 研究主要基于小鼠模型和人类循环ILC2，未来需进一步验证在其他物种和疾病模型中的适用性 | 探讨PAC1在ILC2中调节2型炎症的机制 | PAC1在ILC2中的作用及其对CGRP信号传导的影响 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类循环ILC2样本 |
| 6509 | 2024-11-09 |
Epigenetic regulation of cell state by H2AFY governs immunogenicity in high-risk neuroblastoma
2024-Sep-10, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175310
PMID:39255035
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研究论文 | 研究探讨了H2AFY在高度风险神经母细胞瘤中的表观遗传调控作用及其对免疫原性的影响 | 通过全基因组CRISPR/Cas9筛选识别出H2AFY作为PD-1阻断抗体nivolumab的耐药基因，并揭示了其在单细胞RNA-Seq数据中的富集及其与患者生存的关联 | NA | 阐明H2AFY在高度风险神经母细胞瘤中的表观遗传调控作用及其对免疫原性的影响 | H2AFY在神经母细胞瘤中的作用及其对PD-1阻断疗法的耐药性 | NA | 神经母细胞瘤 | CRISPR/Cas9筛选、单细胞RNA-Seq、多组学分析 | NA | RNA-Seq数据 | NA |
| 6510 | 2024-11-09 |
Single-cell sequencing analysis confirms the association of ANRIL with the increased smooth muscle cell proliferation and migration gene signatures in pulmonary artery hypertension in silico
2024-Sep, Advances in medical sciences
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.advms.2024.04.002
PMID:38631609
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析，探讨了肺动脉高压中平滑肌细胞的异质性及其与ANRIL表达的关系 | 首次通过单细胞测序技术分析了肺动脉高压中平滑肌细胞的异质性，并证实了ANRIL表达与平滑肌细胞增殖和迁移基因特征的关联 | 研究样本量较小，仅包括三名肺动脉高压患者和三名健康对照 | 探讨肺动脉高压中平滑肌细胞的异质性及其与ANRIL表达的关系 | 肺动脉高压患者的肺动脉平滑肌细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三名肺动脉高压患者和三名健康对照的肺动脉样本 |
| 6511 | 2024-11-09 |
Early Injury Landscape in Vein Harvest by Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2024-Jun-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323939
PMID:38808504
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研究论文 | 研究通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了静脉移植在采集和植入后的早期损伤反应 | 首次应用单细胞和空间转录组学技术研究静脉病理，揭示了静脉移植在采集和植入后的早期损伤反应及其分子机制 | 研究仅在犬模型中进行，结果的普适性需进一步验证 | 阐明静脉移植在采集和植入后的早期损伤反应，识别潜在的治疗靶点 | 静脉移植在采集和植入后的早期损伤反应及其分子机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 4只犬 |
| 6512 | 2024-11-09 |
Study on the mechanism of heterogeneous tumor-associated macrophages in three subtypes of breast cancer through the integration of single-cell RNA sequencing and in vitro experiments
2024-Jun-01, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-09665-5
PMID:38824268
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研究论文 | 研究了异质性肿瘤相关巨噬细胞在三种乳腺癌亚型中的机制，通过单细胞RNA测序和体外实验的整合 | 揭示了异质性肿瘤相关巨噬细胞在不同乳腺癌亚型中的作用机制，并通过特定的配体-受体对调控下游通路 | NA | 阐明肿瘤相关巨噬细胞在三种乳腺癌亚型中的作用 | 三种乳腺癌亚型（三阴性乳腺癌、腔内型和HER2型）中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三种乳腺癌细胞系（MDA-MB-231、MCF-7和SKBR3）和巨噬细胞 |
| 6513 | 2024-11-09 |
Pan-cancer scRNA-seq analysis reveals immunological and diagnostic significance of the peripheral blood mononuclear cells
2024-02-01, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddad187
PMID:37944069
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了癌症患者和健康供者外周血单核细胞的组成和状态差异，并探讨了这些特征在癌症诊断中的潜力 | 首次系统性地分析了癌症患者外周血单核细胞的免疫激活和分化状态，并基于这些特征构建了高敏感性的癌症诊断模型 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定类型的癌症和健康对照 | 探讨外周血单核细胞在癌症进展中的免疫反应及其在癌症诊断中的应用潜力 | 癌症患者和健康供者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归 | RNA | 262,025个外周血单核细胞，来自68个癌症样本和14个健康样本 |
| 6514 | 2024-11-09 |
Humanized CXCL12 antibody delays onset and modulates immune response in alopecia areata mice: insights from single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1444777
PMID:39483478
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序探讨人源化CXCL12抗体在斑秃小鼠模型中的作用机制 | 首次使用人源化CXCL12抗体治疗斑秃，并通过单细胞RNA测序揭示其分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，需进一步在人体中验证 | 探讨人源化CXCL12抗体在斑秃治疗中的作用及其分子机制 | 斑秃小鼠模型及其免疫细胞 | NA | 斑秃 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的皮肤样本 |
| 6515 | 2024-11-09 |
mRNA-seq-based analysis predicts: AEG-1 is a therapeutic target and immunotherapy biomarker for pan-cancer, including OSCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1484226
PMID:39483471
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研究论文 | 本文通过mRNA-seq分析预测AEG-1是泛癌治疗靶点和免疫治疗生物标志物，包括OSCC | 首次全面分析了AEG-1表达与OSCC及其他肿瘤类型中免疫浸润的关系，并发现AEG-1与免疫浸润标志物之间的强相关性 | NA | 探讨AEG-1在泛癌中的表达及其与免疫浸润和患者预后的关系 | AEG-1在不同肿瘤类型中的表达水平、预后和临床病理特征 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | mRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个数据库中的多种肿瘤样本，包括OSCC |
| 6516 | 2024-11-09 |
Potential molecular mechanisms of ETV6-RUNX1-positive B progenitor cell cluster in acute lymphoblastic leukemia revealed by single-cell RNA sequencing
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18445
PMID:39498293
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了ETV6-RUNX1阳性B祖细胞簇在急性淋巴细胞白血病中的潜在分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了ETV6-RUNX1阳性B祖细胞簇在急性淋巴细胞白血病中的细胞周期调控机制及其与NK细胞和T细胞的相互作用 | NA | 探索免疫景观和免疫细胞在急性淋巴细胞白血病进展中的作用 | ETV6-RUNX1阳性B祖细胞簇及其在急性淋巴细胞白血病中的作用 | 数字病理学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GSE132509的ETV6-RUNX1和健康儿科样本的骨髓单个核细胞 |
| 6517 | 2024-11-09 |
Characterization of cell-type specific circular RNAs associated with colorectal cancer metastasis
2023-Jun, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcad021
PMID:37213253
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研究论文 | 研究了与结直肠癌转移相关的细胞类型特异性环状RNA | 首次系统地研究了结直肠癌转移过程中细胞类型特异性环状RNA的表达和功能 | 研究样本量有限，且仅限于结直肠癌患者 | 探讨环状RNA在结直肠癌转移中的作用及其细胞类型特异性 | 结直肠癌患者的正常、原发和转移样本以及结直肠癌细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | 非负最小二乘统计模型 | RNA | 30个匹配的正常、原发和转移样本，14名结直肠癌转移患者，5个结直肠癌细胞系 |
| 6518 | 2024-11-09 |
A human model of asthma exacerbation reveals transcriptional programs and cell circuits specific to allergic asthma
2023-05-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq6352
PMID:37146132
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序比较过敏性哮喘患者和过敏性非哮喘对照组的下呼吸道黏膜，揭示了过敏性哮喘特有的转录程序和细胞回路 | 首次在人类模型中揭示了过敏性哮喘加重的特异性转录程序和细胞回路，特别是涉及T2细胞、DC2和MCs的相互作用 | 研究仅限于过敏性哮喘患者和对照组，未涵盖其他类型的哮喘 | 探究过敏性哮喘加重的分子机制和细胞回路 | 过敏性哮喘患者和过敏性非哮喘对照组的下呼吸道黏膜 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 过敏性哮喘患者和过敏性非哮喘对照组 |
| 6519 | 2024-11-09 |
Single-Cell Transcriptomics Analysis Identifies Nuclear Protein 1 as a Regulator of Docetaxel Resistance in Prostate Cancer Cells
2020-09, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-20-0051
PMID:32513898
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析，揭示了核蛋白1（NUPR1）在前列腺癌细胞对多西他赛耐药性中的调控作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出NUPR1作为前列腺癌多西他赛耐药性的关键调控因子 | 仅限于DU145和PC3两种前列腺癌细胞系的研究，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨前列腺癌细胞对多西他赛耐药性的分子机制 | DU145和PC3前列腺癌细胞系的多西他赛敏感和耐药变异体 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | DU145和PC3前列腺癌细胞系的多西他赛敏感和耐药变异体 |
| 6520 | 2024-11-08 |
High-throughput and multimodal profiling of antigen-specific T cells with a droplet-based cell-cell interaction screening platform
2025-Jan-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.116815
PMID:39348735
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研究论文 | 开发了一种基于液滴的细胞间相互作用筛选平台DropCCI，用于高通量和多模态分析抗原特异性T细胞 | 提出了DropCCI方法，通过液滴封装DNA条码和抗原负载的抗原呈递细胞，结合点击化学修饰的T细胞，实现了高通量、无污染的多模态分析 | NA | 开发一种新的策略，用于高通量和多模态分析抗原特异性T细胞，以改进T细胞免疫疗法的设计 | 抗原特异性T细胞 | 生物技术 | NA | 点击化学 | NA | 单细胞组学数据 | NA |