单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 37547 篇文献,本页显示第 6501 - 6520 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
6501 2025-11-26
Comment on "Melanoma microsatellites exhibit a metastatic signature by spatial transcriptomics and overexpress mediators of immune evasion"
2025-Nov, Virchows Archiv : an international journal of pathology IF:3.4Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
6502 2025-11-26
Cardiomyocyte-specific plakophilin-2 loss is sufficient to induce aging and senescence of nonmyocytes. Relevance to arrhythmogenic cardiomyopathy
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过心肌细胞特异性PKP2敲除模型,首次证实仅心肌细胞中plakophilin-2缺失足以诱导非心肌细胞衰老和心脏整体早衰 首次将细胞衰老和早衰机制与桥粒性心律失常心肌病相关联,揭示了心肌细胞基因缺陷通过旁分泌机制引发非心肌细胞衰老的新路径 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;衰老机制的具体信号通路尚未完全阐明 探究PKP2缺陷是否仅通过心肌细胞即可引发非心肌细胞衰老和心脏早衰 心肌细胞特异性PKP2敲除小鼠模型中的心肌细胞和非心肌细胞 心血管疾病研究 心律失常性心肌病 多重成像、细胞因子阵列、表观遗传时钟、空间转录组学、扩展显微镜、结构照明显微镜 基因敲除小鼠模型 图像、转录组、蛋白质组、表观遗传数据 PKP2cKO小鼠模型,具体数量未明确说明 NA 空间转录组学、多重免疫组化 NA NA
6503 2025-11-26
Glutamine synthetase loss in β-catenin-mutant hepatocellular carcinoma promotes tumor burden through macrophage metabolic reprogramming
2025-Oct-23, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究探讨β-连环蛋白突变肝细胞癌中谷氨酰胺合成酶缺失如何通过巨噬细胞代谢重编程促进肿瘤负荷 首次揭示肿瘤细胞GS缺失后巨噬细胞通过代谢适应维持mTOR激活的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 阐明β-连环蛋白突变肝癌中谷氨酰胺合成酶缺失对肿瘤进展的影响机制 肝细胞癌小鼠模型和TCGA数据库中的肝癌患者数据 癌症代谢研究 肝细胞癌 单细胞空间转录组学,基因条件性敲除,巨噬细胞清除 基因工程小鼠模型 转录组数据,组织学数据 TCGA数据库中的CTNNB1突变肝癌患者和小鼠肿瘤模型 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
6504 2025-11-26
Modeling Alzheimer's Disease with APOE4 Neuron-Glial Brain Assembloids Reveals IGFBPs as Therapeutic Targets
2025-Oct-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种模拟阿尔茨海默病的3D脑类组装体模型,揭示了IGFBP通路在疾病进展中的新作用 首次创建包含神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞的3D类组装体模型,能够完整模拟阿尔茨海默病病理特征 模型仍需进一步验证其与人类疾病进展的完全一致性 开发能够准确模拟阿尔茨海默病进展的人类遗传背景模型,并探索治疗靶点 iPSC来源的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 疾病建模 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序,iPSC分化技术 3D类组装体模型 基因表达数据 APOE4/4和同基因对照细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6505 2025-11-26
Activated fatty acid synthesis pathway in macrophages propagates pathogenic fibroblast expansion after myocardial infarction
2025-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示心肌梗死后巨噬细胞中脂肪酸合成通路通过ACLY和FASN促进致病性成纤维细胞扩增的机制 首次发现心脏巨噬细胞通过脂肪酸合成通路调控成纤维细胞扩增,并阐明ACLY通过乙酰化调控促纤维化细胞因子IL-33产生的分子机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 探究巨噬细胞脂肪酸合成通路在心肌梗死后炎症和心脏重塑中的作用 心肌梗死小鼠模型和人类心脏样本中的巨噬细胞与成纤维细胞 代谢组学与单细胞生物学 心血管疾病 空间代谢组学,CUT&RUN,RNA测序,单细胞RNA测序,空间多组学 基因敲除小鼠模型 代谢组数据,基因组数据,转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序,空间多组学 NA NA
6506 2025-11-26
ST2HE: A Cross-Platform Framework for Virtual Histology and Annotation of High-Resolution Spatial Transcriptomics Data
2025-Oct-13, ArXiv
PMID:41281202
研究论文 提出ST2HE跨平台生成框架,能够从高分辨率空间转录组数据直接合成虚拟H&E图像 首次开发了基于一步扩散模型的跨平台框架,整合细胞核形态和空间转录坐标生成组织学忠实的虚拟H&E图像 NA 为高分辨率空间转录组数据开发标准化的组织学注释框架 乳腺癌、非小细胞肺癌和卡波西肉瘤组织样本 计算病理学 多种癌症 空间转录组学 扩散模型 空间转录组数据 NA NA 高分辨率空间转录组学 NA NA
6507 2025-11-26
Transposable Elements and Homotypic Niches Drive Immune Dynamics and Resistance in Melanoma Epigenetic-based immunotherapy
2025-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞多组学和高分辨率空间转录组学分析,揭示了表观遗传免疫疗法如何重塑黑色素瘤生态系统 发现转座子元件激活和同型生态位驱动免疫动态,识别NFATC2作为神经嵴样表型的主调控因子和耐药促进因子 样本来源于单一临床试验队列,需要更大规模验证 探索表观遗传免疫疗法对黑色素瘤生态系统重塑的机制 黑色素瘤患者纵向活检样本 空间转录组学 黑色素瘤 单细胞多组学,空间转录组学 空间建模 单细胞多组学数据,空间转录组数据 NIBIT-M4临床试验患者纵向活检样本 NA 单细胞多组学,空间转录组学 NA NA
6508 2025-11-26
Nutritional hyperketonemia by dietary medium-chain fatty acids is driven by the liver without contribution from the intestine
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过基因敲除小鼠模型和细胞实验证明膳食中链脂肪酸诱导的营养性高酮血症主要由肝脏介导,肠道几乎不参与此过程 首次明确区分肝脏和肠道在膳食中链脂肪酸诱导酮体生成中的具体作用,挑战了通过门静脉代谢物测量推断肠道贡献的常规做法 研究主要聚焦于C8:0中链脂肪酸,其他类型中链脂肪酸的作用尚未验证;细胞实验可能无法完全模拟体内复杂环境 阐明膳食中链脂肪酸诱导营养性高酮血症的主要器官来源 基因敲除小鼠、原代肝细胞、人和小鼠肠道细胞系 代谢研究 代谢疾病 RNA测序、细胞培养、代谢物测量 基因敲除动物模型 基因表达数据、代谢物浓度数据 多种基因型小鼠、原代细胞和细胞系 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
6509 2025-11-26
Transcriptional and epigenetic repression of hematopoietic stem cells underlies bone marrow failure after spinal cord injury
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了脊髓损伤通过转录和表观遗传抑制导致造血干细胞功能受损和骨髓衰竭的机制 首次发现脊髓损伤通过抑制造血干细胞的转录程序和染色质可塑性导致骨髓衰竭的系统性后果 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 探究脊髓损伤对造血干细胞功能和长期造血的影响机制 造血干细胞(HSCs) 表观遗传学 脊髓损伤 单细胞转录组学,染色质可及性分析,体内移植实验 NA 基因表达数据,表观遗传数据 小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq,ATAC-seq NA NA
6510 2025-11-26
Investigating the dynamic signaling pathways involved in the specialization and differentiation of epiblast cells in early human embryos
2025-Oct, Developmental biology IF:2.5Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析人类胚胎早期发育过程中外胚层细胞特化的动态信号通路 首次系统揭示BMP、WNT、FGF、LIF和TGFβ等多条信号通路在人类胚胎外胚层发育中的动态作用模式 研究结果基于RNA表达模式推断,需要蛋白质水平和功能验证 探索人类胚胎外胚层细胞特化和分化过程中的细胞间通讯机制 人类早期胚胎发育过程中的外胚层细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 涵盖植入前、植入后、原肠胚形成前和早期原肠胚形成阶段的人类胚胎 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6511 2025-11-26
Treg activation during allograft tolerance induction requires mitochondrion-induced TGF-β1 in type 1 conventional dendritic cells
2025-Sep-16, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究揭示了1型常规树突状细胞通过线粒体代谢诱导TGF-β1表达,进而促进抗原特异性调节性T细胞生成和心脏移植物耐受的机制 首次发现cDC1细胞在移植物耐受诱导中的关键作用,并阐明线粒体代谢-TGF-β1信号轴调控抗原特异性Treg生成的新机制 研究基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;cDC1特异性基因敲除模型可能存在脱靶效应 探究1型常规树突状细胞在实体器官移植物耐受诱导中的作用机制 小鼠心脏移植模型、1型常规树突状细胞、CD4+CD25+FoxP3+调节性T细胞 免疫学 器官移植排斥 单细胞RNA测序、代谢分析、基因敲除 NA 基因表达数据、代谢数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
6512 2025-11-26
Integrated multi-omics analysis identifies lipid metabolism biomarkers in ONFH and reveals therapeutic potential of retinoic acid
2025-Aug-21, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过多组学分析识别股骨头坏死中脂质代谢生物标志物并揭示视黄酸的治疗潜力 首次整合多组学分析与机器学习技术识别ONFH脂质代谢生物标志物,并通过单细胞测序验证生物标志物与免疫细胞的关联 未明确说明样本量大小及数据来源的具体细节 识别股骨头坏死的潜在生物标志物并为疾病治疗提供参考 股骨头坏死相关基因和免疫细胞 生物信息学 股骨头坏死 多组学分析、机器学习、分子对接、单细胞测序 列线图模型、ROC曲线分析 基因组数据、单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
6513 2025-11-26
Piscis: a novel loss estimator of the F1 score enables accurate spot detection in fluorescence microscopy images via deep learning
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出了一种名为Piscis的深度学习算法,通过新颖的SmoothF1损失函数实现荧光显微镜图像中RNA转录本斑点的自动检测 开发了SmoothF1损失函数,可近似F1分数并直接惩罚假阳性和假阴性,同时保持可微性以用于深度学习训练 NA 开发无需手动参数调优的自动斑点检测算法,用于空间转录组学图像分析 荧光显微镜图像中的RNA转录本斑点 计算机视觉 NA RNA荧光原位杂交 深度学习 图像 358张手动标注的实验RNA FISH图像和240张合成图像 NA 空间转录组学, 单分子RNA荧光原位杂交 NA NA
6514 2025-11-26
Correction: Unveiling the NEFH+ malignant cell subtype: insights from single-cell RNA sequencing in prostate cancer progression and tumor microenvironment interactions
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
correction 对前列腺癌研究中关于NEFH+恶性细胞亚型的文章进行更正 NA NA NA NA NA prostate cancer NA NA NA NA NA NA NA NA
6515 2025-11-26
Multimodal cortical neuronal cell type classification
2024-05, Pflugers Archiv : European journal of physiology
综述 本文综述了大脑皮层神经元细胞类型分类方法的历史演变和当前基于单细胞转录组学的分类进展 整合了形态学、电生理和转录组学多模态特征,提出了皮层神经元的新型分类框架 承认转录组学定义的细胞类型是否对应真实功能类型仍需未来验证 建立可靠的大脑皮层神经元细胞类型分类系统 大脑皮层兴奋性和抑制性神经元 神经科学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
6516 2025-11-26
Systematic benchmarking of imaging spatial transcriptomics platforms in FFPE tissues
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 对三种商业化成像空间转录组平台在FFPE组织中的性能进行系统性基准测试 首次在包含23种肿瘤和正常组织类型的组织芯片上对三种商业iST平台进行全面性能比较 研究基于组织芯片样本,可能无法完全代表完整组织切片的情况 评估成像空间转录组平台在FFPE组织中的技术和生物学性能 包含23种肿瘤和正常组织类型的组织芯片连续切片 空间转录组学 多种肿瘤类型 成像空间转录组学 NA 空间转录组数据 包含23种组织类型的组织芯片 10x Genomics 成像空间转录组学 10x Xenium 三种商业化成像空间转录组平台(包括10x Xenium)
6517 2025-11-25
An integrated approach of experiment validation and single-cell RNA sequencing reveal dual-pathway inhibition of NLRP3/ferroptosis by flavonoids of Sanyeqing fibrous root in acute lung injury
2026-Feb-10, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过实验验证和单细胞RNA测序揭示了三叶青纤维根黄酮类化合物通过双重通路抑制NLRP3/铁死亡缓解急性肺损伤的作用机制 首次发现三叶青纤维根黄酮类化合物能同时抑制NLRP3炎症小体激活和铁死亡通路,并通过单细胞RNA测序鉴定出双通路激活的巨噬细胞亚群 研究主要基于LPS诱导的急性肺损伤模型,临床转化价值需进一步验证 探究三叶青纤维根黄酮类化合物对急性肺损伤的保护作用及分子机制 C57BL/6小鼠、BEAS-2B人支气管上皮细胞、人类支气管肺泡灌洗液样本 单细胞组学 急性肺损伤 单细胞RNA测序,UPLC-Q-TOF-MS/MS,HPLC NA 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,病理学数据 动物模型和细胞系实验,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6518 2025-11-25
Ciao3 knockout causes acute lung injury through immune activation using single cell sequencing
2025-Dec-15, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术揭示Ciao3基因敲除通过免疫激活导致急性肺损伤的机制 首次在Ciao3条件性敲除小鼠模型中结合单细胞RNA测序技术系统阐明免疫细胞在急性肺损伤中的核心作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本数量有限 阐明Ciao3基因缺失导致急性肺损伤的分子机制 Ciao3基因突变患者和内皮细胞特异性Ciao3敲除小鼠 单细胞生物学 急性肺损伤 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫组化 NA 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据 1名纯合子患者和Ciao3条件性敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
6519 2025-11-25
Malignant cell-mediated Treg immune suppression via ICOSLG-ICOS axis in tumor microenvironment relates to nasopharyngeal carcinoma prognosis
2025-Dec-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 通过单细胞测序技术揭示鼻咽癌肿瘤微环境中恶性细胞通过ICOSLG-ICOS轴激活Treg细胞介导免疫抑制的机制 首次在鼻咽癌中发现Mal (TUBB2B+)细胞通过ICOSLG-ICOS通路激活Treg (TNFRSF4+)细胞,进而抑制多种免疫细胞功能的免疫逃逸新机制 研究样本主要来自亚洲人群,结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 阐明鼻咽癌肿瘤微环境中细胞间相互作用与患者预后的关系 鼻咽癌患者肿瘤组织和肿瘤微环境中的各类细胞 单细胞生物学 鼻咽癌 单细胞RNA测序, 空间转录组, 多重免疫组化 scissor, scAB, CellChat分析 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 82个样本共488,771个细胞(其中50个样本269,521个单细胞),183例鼻咽癌患者批量RNA数据 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组, 批量RNA测序 NA NA
6520 2025-11-25
Melatonin ameliorates bronchopulmonary dysplasia by modulating the NF-κB pathway via the gut microbiota-short-chain fatty acid axis
2025-Dec-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了褪黑素通过调节肠道微生物群-短链脂肪酸轴改善支气管肺发育不良的机制 首次发现褪黑素通过增加肠道Ligilactobacillus murinus丰度和短链脂肪酸产生,抑制NF-κB通路和细胞焦亡来改善BPD 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 阐明褪黑素通过肠道微生物-短链脂肪酸轴改善支气管肺发育不良的作用机制 博来霉素诱导的BPD小鼠模型、人支气管上皮细胞(BEAS-2B)、婴儿肺组织单细胞RNA测序数据 生物医学研究 支气管肺发育不良 宏基因组学、16S rRNA测序、非靶向代谢组学、RNA转录组学、单细胞RNA测序 动物模型、细胞模型 基因组数据、转录组数据、代谢组数据、单细胞测序数据 BPD小鼠模型、BEAS-2B细胞系、公共单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序,宏基因组学,代谢组学,转录组学 NA NA
回到顶部