单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 6481 - 6500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6481 | 2025-10-06 |
Plakoglobin is a mechanoresponsive regulator of naive pluripotency
2023-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39515-0
PMID:37419903
|
研究论文 | 本研究揭示了Plakoglobin作为机械敏感调节因子在调控初始多能性中的新作用 | 首次发现Plakoglobin是机械敏感性的初始多能性调节因子，并证明其过表达可在多能性不稳定条件下重建初始多能性基因调控网络 | 研究主要基于小鼠胚胎干细胞，人类胚胎验证数据有限 | 探索生物力学信号如何转化为转录程序，揭示哺乳动物植入前发育机制 | 小鼠胚胎干细胞、人和小鼠胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析、微流控技术 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6482 | 2025-10-06 |
Human and murine fibroblast single-cell transcriptomics reveals fibroblast clusters are differentially affected by ageing and serum cholesterol
2023-07-04, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad016
PMID:36718802
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了人和小鼠动脉中成纤维细胞的异质性及其在心血管疾病中的调控机制 | 首次鉴定出PDGFRA和DPEP1作为成纤维细胞特异性标志物，并发现三个不同的成纤维细胞轨迹在衰老和高胆固醇条件下差异调控 | 研究主要基于动物模型，人类样本验证相对有限 | 研究心血管疾病中成纤维细胞的异质性及其对风险因素的响应 | 人和小鼠动脉中的成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 流式细胞术, 伪时间分析 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 组织切片图像 | C57BL/6J小鼠和LDLR KO小鼠的主动脉组织，人类颈动脉和主动脉标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6483 | 2025-10-06 |
Transcriptome-based measurement of CD8+ T cell age and its applications
2023-07, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2023.05.005
PMID:37248098
|
研究论文 | 本文探讨了基于转录组的CD8+ T细胞年龄测量方法及其应用前景 | 开发了机器学习辅助的转录组定量方法，用于测量单个CD8+ T细胞的年龄 | NA | 更好地理解T细胞衰老过程，改进与年龄相关的T细胞变化测量方法 | CD8+ T细胞 | 机器学习 | 传染病,癌症,老年疾病 | 转录组测序 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6484 | 2025-10-06 |
Modelling capture efficiency of single-cell RNA-sequencing data improves inference of transcriptome-wide burst kinetics
2023-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad395
PMID:37354494
|
研究论文 | 提出一种新的数学理论来建模单细胞RNA测序数据中的捕获效率变异，改进转录组范围内爆发动力学的推断 | 开发了能够同时捕捉爆发动力学、细胞大小变异和捕获效率变异的新型数学模型，并提出了基于神经网络和近似贝叶斯计算的推断方法 | NA | 改进从单细胞RNA测序数据推断基因表达爆发动力学的方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络, 近似贝叶斯计算 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6485 | 2025-10-06 |
Elevated levels of MMP12 sourced from macrophages are associated with poor prognosis in urothelial bladder cancer
2023-Jun-30, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11100-0
PMID:37391708
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞转录组学分析，发现巨噬细胞来源的MMP12是膀胱尿路上皮癌预后不良的独立生物标志物 | 首次发现巨噬细胞来源的MMP12可作为膀胱癌独立预后标志物，并揭示了肿瘤微环境中免疫细胞来源生物标志物的重要性 | 转录组微阵列数据集未能验证MMP12的预后价值，组织活检材料可能存在肿瘤细胞生物标志物选择偏倚 | 探索膀胱尿路上皮癌患者分层生物标志物，改善风险分层和临床干预策略 | 90例新诊断未治疗的膀胱癌患者，包括血浆和尿液样本，以及公共单细胞RNA测序和微阵列数据 | 癌症生物标志物研究 | 膀胱癌 | 多重邻近延伸分析，单细胞RNA测序，微阵列分析，随机森林生存分析，多变量回归分析 | 随机森林，多变量回归模型 | 蛋白质组数据，转录组数据，单细胞测序数据 | 90例患者（血浆样本n=90，尿液样本n=40），外加公共数据库验证队列 | OLINK | 多重邻近延伸分析，单细胞RNA测序，微阵列 | NA | 免疫肿瘤学聚焦的多重邻近延伸分析 |
| 6486 | 2025-10-06 |
Lineage skewing and genome instability underlie marrow failure in a zebrafish model of GATA2 deficiency
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112571
PMID:37256751
|
研究论文 | 通过斑马鱼GATA2缺陷模型研究骨髓衰竭的机制基础 | 首次在斑马鱼模型中揭示GATA2缺陷通过谱系偏斜和基因组不稳定性导致骨髓衰竭的机制 | 研究局限于斑马鱼模型，尚未在人类系统中验证 | 探究GATA2缺陷导致骨髓衰竭的分子机制 | 斑马鱼gata2a突变体模型 | 发育生物学 | 骨髓衰竭 | 单细胞转录组学,染色质可及性分析 | 动物模型 | 基因表达数据,染色质可及性数据 | 斑马鱼造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 6487 | 2025-10-06 |
Age-associated B cells predict impaired humoral immunity after COVID-19 vaccination in patients receiving immune checkpoint blockade
2023-06-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38810-0
PMID:37369658
|
研究论文 | 本研究探讨年龄相关B细胞(ABC)对不同人群COVID-19疫苗免疫应答的影响 | 首次发现不同病因ABC具有共同转录特征，并揭示其通过FcγRIIB受体和免疫复合物结合能力影响疫苗应答的机制 | 研究样本来源和规模有限，需要更大规模验证ABC作为生物标志物的可靠性 | 探究ABC对COVID-19疫苗体液免疫应答的影响机制 | 接受免疫检查点阻断治疗的癌症患者和先天性免疫缺陷患者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6488 | 2025-10-06 |
Intravenous heterologous prime-boost vaccination activates innate and adaptive immunity to promote tumor regression
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112599
PMID:37279110
|
研究论文 | 本研究开发了一种异源初免-加强疫苗接种策略，通过静脉注射促进肿瘤消退 | 发现静脉注射黑猩猩腺病毒载体疫苗可产生比肌肉注射更强的CD8 T细胞反应，并首次证明编码无关抗原的静脉加强疫苗也能介导肿瘤消退 | 研究仅在MC38肿瘤模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 开发更有效的治疗性新抗原癌症疫苗策略 | 小鼠MC38肿瘤模型 | 免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6489 | 2025-10-06 |
Cell Type- and Tissue-specific Enhancers in Craniofacial Development
2023-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.26.546603
PMID:37425964
|
研究论文 | 本研究通过整合人类和小鼠颅面发育的表观基因组与单细胞数据，构建了首个组织水平和单细胞分辨率的颅面部增强子综合图谱 | 首次创建了涵盖多个发育阶段的颅面部增强子综合目录，并通过跨物种整合揭示了人类颅面增强子在功能上的保守性 | 研究主要基于小鼠模型验证人类增强子功能，可能存在物种间差异未被完全揭示 | 解析颅面部发育的调控机制，建立增强子与细胞类型特异性的关联 | 人类和小鼠胚胎颅面部组织 | 基因组学 | 颅面出生缺陷 | 组蛋白修饰分析、染色质可及性分析、单细胞RNA-seq、单核ATAC-seq、转基因小鼠报告基因检测 | NA | 基因组数据、表观基因组数据、单细胞转录组数据 | 人类胚胎4-8周7个发育阶段，小鼠胚胎e11.5至e15.5阶段 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 6490 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics and epigenomics unravel the role of monocytes in neuroblastoma bone marrow metastasis
2023-06-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39210-0
PMID:37365178
|
研究论文 | 通过单细胞转录组和表观基因组分析揭示单核细胞在神经母细胞瘤骨髓转移中的作用 | 首次对神经母细胞瘤骨髓转移灶进行单细胞转录组和表观基因组联合分析，揭示了肿瘤细胞通过巨噬细胞迁移抑制因子和中期因子信号通路特异性调控单核细胞的新机制 | 样本量相对有限（11例患者+5例对照），需要进一步功能验证 | 解析神经母细胞瘤骨髓转移的微环境特征和细胞间相互作用机制 | 神经母细胞瘤患者的骨髓穿刺样本和年龄匹配的无转移骨髓样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序, 单细胞表观基因组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表观基因组数据 | 11例神经母细胞瘤患者骨髓样本（涵盖三种主要亚型）和5例年龄匹配的无转移对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞表观基因组分析 | NA | NA |
| 6491 | 2025-10-06 |
Spatial determination and prognostic impact of the fibroblast transcriptome in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-06-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86125
PMID:37350578
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞RNA测序数据，定义了胰腺导管腺癌中肿瘤近端和远端癌症相关成纤维细胞的转录组特征及其与临床预后的关联 | 首次结合空间转录组学和scRNA-Seq数据集，系统揭示了CAFs的空间异质性及其与临床预后的直接关联 | 未明确说明样本数量和具体实验验证方法 | 探索胰腺导管腺癌中成纤维细胞转录组的空间分布特征及其预后价值 | 胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6492 | 2025-10-06 |
Positional influence on cellular transcriptional identity revealed through spatially segmented single-cell transcriptomics
2023-06-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.05.003
PMID:37348462
|
研究论文 | 开发了一种名为SEEP的空间分割单细胞转录组学方法，用于分析三维疾病模型中细胞位置与转录身份的关系 | 利用荧光染料的稳态扩散动力学建立径向梯度，通过染料可及性对样本层进行分类，将解离和分选的细胞与转录组和区域身份相关联 | NA | 揭示细胞在三维疾病模型中的空间位置对其转录身份的影响 | 高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)的球体、类器官和体内肿瘤模型 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6493 | 2025-10-06 |
Concerted epithelial and stromal changes during progression of Barrett's Esophagus to invasive adenocarcinoma exposed by multi-scale, multi-omics analysis
2023-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.08.544265
PMID:37333362
|
研究论文 | 通过多尺度多组学分析揭示巴雷特食管向浸润性腺癌进展过程中上皮和基质的协同变化 | 整合单细胞转录组学、细胞外基质蛋白质组学、组织力学和空间蛋白质组学，首次系统揭示巴雷特食管进展为腺癌过程中上皮和基质的协同变化 | 样本量相对有限（64个样本来自12名患者） | 研究巴雷特食管向食管腺癌进展的分子和细胞机制 | 巴雷特食管患者从鳞状上皮经化生、不典型增生到腺癌的进展过程 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组学, 细胞外基质蛋白质组学, 组织力学分析, 空间蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 力学数据, 空间数据 | 64个样本来自12名患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 6494 | 2025-10-06 |
Late-Stage Metastatic Melanoma Emerges through a Diversity of Evolutionary Pathways
2023-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-1427
PMID:36977461
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了晚期转移性黑色素瘤的多样化进化途径 | 提供了迄今最全面的黑色素瘤患者内转移数据集，揭示了全基因组倍增、杂合性缺失、KIT染色体外DNA和MYC扩增等新机制 | 样本量相对有限（14名患者），主要基于ICI治疗患者 | 探索黑色素瘤转移和对免疫检查点抑制剂耐药的进化途径 | 晚期转移性黑色素瘤患者 | 癌症基因组学 | 黑色素瘤 | 外显子组测序, 靶向测序, RNA测序, 单细胞全基因组测序 | NA | 基因组测序数据, 转录组数据 | 14名ICI治疗患者，共898个样本（222外显子组、493靶向测序、161RNA测序、22单细胞全基因组） | NA | 单细胞全基因组测序, 外显子组测序, RNA测序 | NA | NA |
| 6495 | 2025-10-06 |
Vascular mechanisms of post-COVID-19 conditions: Rho-kinase is a novel target for therapy
2023-06-02, European heart journal. Cardiovascular pharmacotherapy
DOI:10.1093/ehjcvp/pvad025
PMID:37019821
|
研究论文 | 本研究探讨了新冠后遗症中血管功能障碍的机制，发现Rho激酶是潜在治疗靶点 | 首次揭示新冠后遗症患者血管中Rho激酶激活导致血管纤维化和肌球蛋白轻链磷酸化增强 | 样本量较小（37例），主要为住院康复患者，缺乏长期随访数据 | 探究新冠后遗症血管功能障碍的分子机制并寻找治疗靶点 | 新冠住院康复患者和风险因素匹配的对照组 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学,免疫组织化学,组织病理学,血管肌动描记法 | NA | 生物组织样本,影像数据,生物标志物 | 37例（27例新冠康复患者，10例对照组） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6496 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Unifies Developmental Programs of Esophageal and Gastric Intestinal Metaplasia
2023-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-0824
PMID:36929873
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示食管和胃肠化生的共同发育轨迹 | 首次构建涵盖整个胃肠道的单细胞转录组图谱，发现食管和胃肠化生具有分子相似性及表型嵌合特征 | 未明确说明样本量大小及具体测序平台细节 | 探究食管和胃肠化生的发育轨迹与分子特征 | 胃肠道组织样本（包括正常生理状态和病理状态） | 单细胞组学 | 食管腺癌、胃腺癌 | 单细胞RNA测序、蛋白表达研究 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6497 | 2025-10-06 |
Antigen-driven colonic inflammation is associated with development of dysplasia in primary sclerosing cholangitis
2023-Jun, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02372-x
PMID:37322120
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示原发性硬化性胆管炎患者结肠炎症与异型增生发展的抗原驱动机制 | 首次发现PSC患者结肠中存在独特的适应性炎症转录特征，其特征为抗原驱动的IL-17A+FOXP3+ CD4 T细胞和IgG分泌浆细胞扩增 | 样本量有限（共221例），未验证干预措施效果 | 探究PSC患者结肠异型增生发展的分子机制 | 65例PSC患者、108例IBD患者和48例健康个体的右结肠组织 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 流式细胞术, 批量转录组测序, 单细胞转录组测序, T/B细胞受体谱分析 | NA | 组织样本, 基因表达数据, 免疫受体序列 | 221例（65例PSC+108例IBD+48例健康对照） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6498 | 2025-10-06 |
Transcriptomics for Clinical and Experimental Biology Research: Hang on a Seq
2023-Jun, Advanced genetics (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/ggn2.202200024
PMID:37288167
|
评论 | 比较现代微阵列与RNA测序技术在转录组研究中的优劣 | 提出需要重新评估批量转录组方法，强调现代高密度微阵列在准确量化基因表达方面的优势 | 主要关注批量转录组技术，对单细胞测序和长读长测序仅作简要讨论 | 比较不同转录组技术的性能并推动现有RNA参考图谱的修订 | 蛋白质编码基因和长链非编码RNA(lncRNA) | 转录组学 | NA | 微阵列, RNA测序(RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 6499 | 2025-10-06 |
Late-onset enteric virus infection associated with hepatitis (EVAH) in transplanted SCID patients
2023-06, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.12.822
PMID:36638922
|
研究论文 | 本研究探讨移植后严重联合免疫缺陷患者中与肠道病毒感染相关的迟发性肝炎的发病机制和风险因素 | 首次将移植后SCID患者的持续性肝炎与肠道病毒慢性感染联系起来，并命名为EVAH综合征 | 样本量较小（11例患者），为单中心研究 | 表征移植SCID患者中持续性肝炎的患病率和病理生理学，评估风险因素和治疗方法 | 接受造血干细胞移植或基因治疗的严重联合免疫缺陷患者 | 数字病理学 | 免疫缺陷疾病 | 病理学评估、宏基因组学、单细胞转录组学、飞行时间细胞术 | NA | 组织样本、粪便样本、多组学数据 | 23例患者（11例SCIDH+组，12例SCIDH-组） | NA | 单细胞转录组学, 飞行时间细胞术, 宏基因组学 | NA | NA |
| 6500 | 2025-10-06 |
Single-cell gene and isoform expression analysis reveals signatures of ageing in haematopoietic stem and progenitor cells
2023-05-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04936-6
PMID:37225862
|
研究论文 | 通过整合长短读长单细胞RNA测序分析造血干细胞和祖细胞，揭示衰老过程中的基因和亚型表达特征 | 首次在单细胞水平整合长短读长RNA测序分析，揭示造血系统中超过半数基因表达多种功能不同的亚型 | 主要关注造血系统，可能不适用于其他组织类型 | 研究造血干细胞和祖细胞在衰老过程中的基因和亚型表达变化 | 造血干细胞和祖细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 整合短读长和长读长单细胞RNA测序技术 |