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当前共找到 37547 篇文献，本页显示第 6481 - 6500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6481 | 2025-11-27 |
Liver Colonization by Colorectal Cancer Metastases Requires YAP-Controlled Plasticity at the Micrometastatic Stage
2022-05-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-0933
PMID:35570706
|
研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌肝转移过程中YAP控制的细胞可塑性在微转移阶段的关键作用 | 发现微转移灶缺乏癌症干细胞，而明显转移灶通过多细胞阶段的细胞可塑性重新产生癌症干细胞 | NA | 研究结直肠癌肝转移的分子机制和细胞动态变化 | 结直肠癌患者肝标本、小鼠肝脏转移模型、患者来源的结直肠癌类器官 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 活体显微镜、单细胞RNA测序、类器官培养 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6482 | 2025-11-26 |
Fibroblastic FLT3L supports lymph node dendritic cells in the interfollicular niche
2025-Dec, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02332-2
PMID:41249485
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研究论文 | 本研究揭示了表达Gremlin1的淋巴结成纤维网状细胞通过提供FLT3L支持树突状细胞稳态的机制 | 首次发现GREM1+成纤维网状细胞是淋巴结中提供FLT3L支持树突状细胞稳态的特定生态位 | NA | 探索淋巴结中维持树突状细胞稳态的特定生态位和机制 | 人和小鼠淋巴结中的树突状细胞和成纤维网状细胞 | 细胞生物学 | NA | 空间转录组学,细胞流式分析,遗传模型 | NA | 基因表达数据,细胞定位数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6483 | 2025-11-26 |
Macrophage Cell and Diagnostic Biomarkers in BLCA: Integrating Machine Learning With Single-Cell Analysis
2025-Dec, Clinical genitourinary cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.clgc.2025.102447
PMID:41139554
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析和机器学习方法，识别膀胱癌中巨噬细胞亚型并构建预后预测模型 | 首次系统识别膀胱癌中9种巨噬细胞亚型，并基于7个巨噬细胞相关基因构建预后模型 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏独立的前瞻性验证队列 | 探索膀胱癌中巨噬细胞异质性并开发诊断生物标志物 | 膀胱癌患者的外周血单核细胞、膀胱癌细胞和尿路上皮来源细胞 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞测序, 伪时间分析, 细胞间通讯分析, 加权基因共表达网络分析 | LASSO回归, 随机森林 | 单细胞测序数据, 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6484 | 2025-11-26 |
Construction of a deep learning model and identification of BSG, PPARD, and SLC16A8 expression as potential indicators in the context of strategies for precision therapy to acute myeloid leukemia
2025-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2025.2592516
PMID:41284982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析急性髓系白血病肿瘤微环境中T细胞的异质性，构建了基于BSG、PPARD和SLC16A8基因的预后风险模型 | 首次在AML中基于特定T细胞亚群（Cluster 4）构建深度学习预后模型，并鉴定BSG、PPARD和SLC16A8作为独立预后标志物 | 研究依赖于外部数据集进行验证，需要进一步实验验证基因功能机制 | 探索AML肿瘤微环境中T细胞异质性，寻找精准治疗的生物标志物 | 急性髓系白血病患者的T细胞亚群 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 随机森林, LASSO回归 | 基因表达数据 | AML患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6485 | 2025-11-26 |
Integrated bulk and single-cell RNA profiling implicates MFAP5+ CAFs in potential role in peritoneal metastasis of gastric cancer
2025-Nov-28, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152841
PMID:41205579
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序分析，揭示了MFAP5+ CAFs在胃癌腹膜转移中的关键作用 | 首次系统鉴定胃癌腹膜转移中CAF亚群的异质性，发现MFAP5+ CAFs作为终末促转移亚群的特异性富集 | NA | 探究胃癌腹膜转移的基质微环境驱动机制 | 配对的原发性胃癌和腹膜转移组织 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重免疫组化, 传统免疫组化 | NA | RNA测序数据, 免疫组化图像 | 配对的胃癌原发和转移组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6486 | 2025-11-26 |
Dexamethasone-induced immunosuppression in Pneumocystis pneumonia reprograms neutrophil metabolism and impairs antimicrobial function
2025-Nov-28, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152889
PMID:41205576
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研究论文 | 本研究揭示了地塞米松在肺孢子菌肺炎中通过重编程中性粒细胞代谢状态损害其抗菌功能的机制 | 首次发现地塞米松诱导的免疫抑制通过特异性抑制脂肪酸氧化代谢通路损害中性粒细胞功能 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究地塞米松在肺孢子菌肺炎中改变肺部免疫的免疫学和代谢机制 | 地塞米松处理的免疫缺陷小鼠肺组织中的中性粒细胞 | 免疫代谢学 | 肺孢子菌肺炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,RT-qPCR,批量RNA测序,代谢组学 | NA | 基因表达数据,代谢数据 | 对照和地塞米松处理的小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 6487 | 2025-11-26 |
Integrative Analysis of Lactylation-Associated Features in Abdominal Aortic Aneurysm and Its Immune Microenvironment Utilizing scRNA-seq and Bulk RNA Sequencing
2025-Nov-25, Circulation journal : official journal of the Japanese Circulation Society
IF:3.1Q2
DOI:10.1253/circj.CJ-24-0892
PMID:40301103
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，揭示了乳酰化修饰在腹主动脉瘤免疫微环境中的关键作用 | 首次系统性地探讨了乳酰化修饰在腹主动脉瘤中的特征及其与免疫微环境的关联，并利用113种机器学习算法组合识别出8个乳酰化相关枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限，需要进一步的功能实验确认机制 | 阐明乳酰化与腹主动脉瘤免疫反应之间的相互关系 | 腹主动脉瘤患者和动物模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, bulk RNA测序, 机器学习算法 | 多种机器学习算法组合 | 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6488 | 2025-11-26 |
PPARα Activation-Mediated Testosterone Reduction as the Key Adverse Outcome Pathway for Cd-Induced Male Infertility: A Novel Integrated Approach
2025-Nov-25, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.5c09190
PMID:41231235
|
研究论文 | 本研究通过整合多种方法识别了镉诱导男性不育的关键不良结局通路 | 首次系统构建了镉诱导男性不育的AOP网络，并确定PPARα激活介导的睾酮减少是关键通路 | NA | 识别镉诱导男性不育的关键不良结局通路 | 镉暴露的男性不育机制 | 环境毒理学 | 男性不育 | 网络毒理学,单细胞测序,NHANES研究,动物实验,分子建模 | NA | 基因表达数据,流行病学数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6489 | 2025-11-26 |
Decoding crops one cell at a time: from cell atlases to single-cell genetics
2025-Nov-25, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf516
PMID:41287580
|
综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在作物研究中的应用及其潜力 | 将哺乳动物细胞单细胞筛选的经验应用于植物研究，提出整合单细胞技术与性状相关位点的策略 | 存在技术和生物学障碍需要克服 | 加速作物改良关键遗传变异的鉴定 | 作物细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6490 | 2025-11-26 |
Spanve: A Statistical Method for Downstream-friendly Spatially Variable Genes in Large-scale Data
2025-Nov-24, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf111
PMID:41284930
|
研究论文 | 开发了一种用于大规模空间转录组数据中空间可变基因检测的非参数统计方法 | 通过量化每个点或细胞与其局部邻居之间的表达差异来识别空间依赖性，无需分布假设，假阳性较少 | NA | 改进空间转录组学分析中空间可变基因的识别准确性 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 非参数统计方法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6491 | 2025-11-26 |
Selective AMPKβ1 activation induces fetal hemoglobin in human erythroid cells and sickle cell mice via the noncanonical NRF2 pathway
2025-Nov-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx1144
PMID:41259521
|
研究论文 | 本研究通过选择性激活AMPKβ1诱导镰状细胞病中的胎儿血红蛋白表达 | 首次发现AMPKβ1亚型在红细胞谱系中占主导地位，并通过非经典NRF2通路诱导胎儿血红蛋白 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，尚未进行人体临床试验 | 开发通过AMPKβ1激活诱导胎儿血红蛋白的新型治疗方法 | 镰状细胞病患者来源的红细胞和Townes镰状细胞病小鼠模型 | 分子生物学 | 镰状细胞病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 镰状细胞病患者来源的红细胞和Townes小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6492 | 2025-11-26 |
Single-cell sequencing reveals a senescent immune landscape in bone marrow lesions inducing articular cartilage damage in osteoarthritis
2025-Nov-21, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00467-4
PMID:41272390
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示骨关节炎中骨髓病变区域存在衰老免疫景观，并通过细胞间通讯促进关节软骨损伤 | 首次在单细胞水平揭示骨髓病变区域的免疫细胞衰老特征及其通过TNF信号介导的骨髓-软骨串扰机制 | 研究样本量有限，机制验证主要在OA小鼠模型中进行 | 探索骨关节炎中骨髓病变诱导关节软骨损伤的细胞分子机制 | 骨髓组织和关节软骨组织 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 非BML区域和BML区域的骨髓组织，完整和损伤区域的关节软骨组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6493 | 2025-11-26 |
Systematic benchmarking of imaging spatial transcriptomics platforms in FFPE tissues
2025-Nov-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64990-y
PMID:41266321
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研究论文 | 对三种商业成像空间转录组平台在FFPE组织中的技术性能进行系统性基准测试 | 首次在包含17种肿瘤和16种正常组织的组织芯片上对三种主流iST平台进行综合性能比较 | 研究基于组织芯片样本，可能无法完全代表完整组织切片的情况 | 评估成像空间转录组平台在FFPE组织中的技术性能 | FFPE组织样本，包含17种肿瘤和16种正常组织类型 | 空间转录组学 | 多种肿瘤类型 | 成像空间转录组技术 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | 组织芯片包含33种组织类型（17种肿瘤+16种正常） | 10X Genomics, Vizgen, Nanostring | 成像空间转录组学 | 10X Xenium, Vizgen MERSCOPE, Nanostring CosMx | 三种商业成像空间转录组平台在FFPE组织上的应用 |
| 6494 | 2025-11-26 |
Piscis: A loss estimator of the F1 score enables accurate spot detection in fluorescence microscopy images via deep learning
2025-Nov-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101448
PMID:41265398
|
研究论文 | 提出一种名为Piscis的深度学习算法，用于荧光显微镜图像中的斑点检测 | 开发了SmoothF1损失函数，可近似F1分数并直接惩罚假阳性和假阴性，同时保持可微分性用于深度学习训练 | NA | 开发自动化的斑点检测算法以改进空间转录组学图像分析 | 荧光显微镜图像中的RNA转录本斑点 | 计算机视觉 | NA | RNA荧光原位杂交 | 深度学习 | 图像 | 358张手动标注的实验RNA FISH图像和240张合成图像 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6495 | 2025-11-26 |
[Neural regulation mechanism in bone regeneration]
2025-Nov-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
综述 | 本文系统阐述了神经系统在骨再生过程中的调控机制，重点关注神经肽在骨组织中的核心作用 | 提出'神经-骨骼'调控轴概念，系统梳理交感与副交感神经系统在骨再生中的相反调控作用 | 神经肽之间的相互作用网络尚未完全阐明，需要更先进的模型和技术进行深入研究 | 探讨骨再生过程中的神经调控机制 | 骨骼系统与神经系统的相互作用，特别是神经肽在骨再生中的功能 | 骨再生医学 | 退行性骨病，创伤性骨损伤 | 单细胞测序，三维生物打印骨模型，类器官技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6496 | 2025-11-26 |
Depletion of microenvironmental syndecan-2 impairs hematopoietic stem cell self-renewal and cytokine responses
2025-Nov-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.07.687077
PMID:41279398
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研究论文 | 本研究探讨骨髓微环境中syndecan-2对造血干细胞自我更新能力的调控作用 | 首次揭示间充质基质细胞表达的syndecan-2通过细胞外在机制支持造血干细胞自我更新 | 研究主要聚焦小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明骨髓微环境表达的syndecan-2在造血和造血干细胞自我更新中的功能 | 小鼠骨髓造血干细胞、间充质基质细胞和内皮细胞 | 干细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序、竞争性移植实验、共培养实验 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据、转录组数据 | 转基因小鼠模型和细胞系共培养系统 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6497 | 2025-11-26 |
Epigenetic repression of hepatocyte FoxO1 disrupts local immune homeostasis and promotes liver inflammation
2025-Nov-04, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001590
PMID:41190981
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研究论文 | 本研究揭示了肝细胞FoxO1通过JMJD1C维持的表观遗传调控在肝脏免疫稳态中的关键作用 | 首次发现JMJD1C通过调控Foxo1启动子区H3K9二甲基化抑制其转录，从而破坏局部免疫稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 阐明肝细胞FoxO1在肝脏免疫稳态和炎症中的作用机制 | 人类肝脏样本、肝细胞特异性Foxo1敲除小鼠、酒精性肝炎和血吸虫病肝病小鼠模型 | 分子生物学 | 肝脏炎症疾病 | 单细胞RNA测序、CUT&Tag分析、转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | 多种肝脏疾病患者样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6498 | 2025-11-26 |
Distinct Sarcoma Microenvironments Predict Benefit from Addition of Pembrolizumab to Preoperative Radiotherapy and Surgery in SU2C-SARC032
2025-Nov-04, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.11.01.25339299
PMID:41282894
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研究论文 | 本研究通过多组学分析识别了两种不同的肉瘤微环境，揭示了帕博利珠单抗联合术前放疗对不同微环境亚型患者的疗效机制 | 首次构建了UPS和LPS的单细胞RNA-seq图谱，发现两种相反的肿瘤微环境均能从帕博利珠单抗治疗中获益，并阐明了不同的免疫应答机制 | 研究样本量有限，仅针对特定肉瘤亚型，需要更大规模的验证研究 | 精确识别能从帕博利珠单抗联合术前放疗中获益的肉瘤患者 | III期未分化多形性肉瘤和去分化/多形性脂肪肉瘤患者 | 数字病理学 | 肉瘤 | bulk RNA-seq, 流式细胞术, 飞行时间细胞术, 单细胞RNA-seq, 数字细胞术 | NA | RNA测序数据, 细胞计数数据 | 65,786个细胞来自UPS和LPS肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 6499 | 2025-11-26 |
Endocrine disruptors and male infertility: multi-omics identification of key genes in non-obstructive azoospermia
2025-Nov, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03664-6
PMID:40956397
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研究论文 | 通过多组学方法识别环境内分泌干扰物与男性非梗阻性无精子症相关的关键基因 | 整合转录组学、毒理基因组学和孟德尔随机化分析，首次系统识别EDC相关基因在NOA中的因果作用 | 研究主要基于公共数据库和生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索环境内分泌干扰物导致男性不育的基因机制 | 非梗阻性无精子症患者及相关基因 | 生物信息学 | 男性不育症 | 转录组分析,孟德尔随机化,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,基因组数据 | GEO数据库数据集及单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组分析 | NA | NA |
| 6500 | 2025-11-26 |
Monod: model-based discovery and integration through fitting stochastic transcriptional dynamics to single-cell sequencing data
2025-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02832-x
PMID:41203866
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研究论文 | 提出一种基于物理模型的方法Monod，通过拟合随机转录动力学来分析单细胞RNA测序数据 | 利用单细胞数据中的新生和成熟RNA计数，在生物物理转录模型下进行有意义的整合，揭示传统方法无法识别的转录调控 | NA | 开发新方法以区分单细胞RNA测序数据的生物学和技术层面，同时揭示基础调控过程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机转录动力学模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |