单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 27435 篇文献,本页显示第 6461 - 6480 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
6461 2024-11-12
Dissecting L-glutamine metabolism in acute myeloid leukemia: single-cell insights and therapeutic implications
2024-Nov-06, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了急性髓系白血病中L-谷氨酰胺代谢相关基因对疾病进展的影响 揭示了CD34+前B细胞中谷氨酰胺相关活动的增加,并发现了与AML进展相关的10个基因,包括CCL5和CD52,这些基因可能是潜在的治疗靶点 NA 深入理解急性髓系白血病的生物学机制,并探索新的治疗策略 急性髓系白血病患者的单细胞RNA测序数据 数字病理学 血液癌 单细胞RNA测序 NA RNA 来自AML患者的单细胞RNA测序数据
6462 2024-11-12
γδ T17 Cells Regulate the Acute Antiviral Response of NK Cells in HSV-1-Infected Corneas
2024-Nov-04, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 研究γδ T17细胞在HSV-1感染的角膜中对NK细胞急性抗病毒反应的调节作用 首次揭示了γδ T17细胞在HSV-1感染的角膜中促进NK细胞积累,并通过IL-17A信号通路调节NK细胞的功能 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 探究γδ T细胞在HSV-1感染的角膜中对NK细胞的调节作用 γδ T细胞和NK细胞在HSV-1感染角膜中的相互作用 NA NA 单细胞RNA测序(scRNAseq)、流式细胞术、多重分析 NA RNA CD57Bl/6 (野生型[WT])、TCRδ-/-、IFN-γ-/-小鼠,每组若干只
6463 2024-11-12
PINK1/Parkin-Mediated Mitophagy Ameliorates Mitochondrial Dysfunction in Lacrimal Gland Acinar Cells During Aging
2024-Nov-04, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 研究了PINK1/Parkin介导的线粒体自噬在衰老过程中对泪腺腺泡细胞线粒体功能障碍的改善作用 首次揭示了PINK1/Parkin介导的线粒体自噬在衰老过程中对泪腺腺泡细胞的保护作用 仅使用了年轻和中年的C57BL/6J小鼠进行研究,缺乏更广泛年龄段的数据 探讨衰老过程中泪腺腺泡细胞线粒体功能障碍的机制及线粒体自噬的作用 泪腺腺泡细胞 NA NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 蛋白质表达数据 年轻 (6周) 和中年 (12个月) 的雄性C57BL/6J小鼠
6464 2024-11-12
Single-cell transcriptomics reveal diverging pathobiology and opportunities for precision targeting in scleroderma-associated versus idiopathic pulmonary arterial hypertension
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了硬皮病相关肺动脉高压与特发性肺动脉高压在病理生物学上的差异,并探讨了精准靶向治疗的机会 首次通过单细胞RNA测序技术比较了硬皮病相关肺动脉高压与特发性肺动脉高压的基因表达差异,揭示了潜在的治疗靶点 研究样本量较小,需要进一步的临床验证 探讨硬皮病相关肺动脉高压与特发性肺动脉高压的分子机制差异,寻找新的治疗靶点 硬皮病相关肺动脉高压和特发性肺动脉高压患者的肺组织样本 数字病理学 肺动脉高压 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 12个肺组织样本,包括4个硬皮病相关肺动脉高压、4个特发性肺动脉高压和4个失败供体样本
6465 2024-11-12
Spatiotemporal lineage tracing reveals the dynamic spatial architecture of tumor growth and metastasis
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过整合高分辨率空间转录组学和进化谱系追踪技术,研究了肺腺癌小鼠模型中肿瘤扩展、可塑性和转移与微环境重塑的共进化关系 本文创新性地整合了高分辨率空间转录组学和进化谱系追踪技术,揭示了肿瘤扩展、可塑性和转移与微环境重塑的动态关系 NA 研究肿瘤进展过程中癌细胞与微环境之间的动态相互作用 肺腺癌小鼠模型中的肿瘤扩展、可塑性和转移 数字病理学 肺癌 高分辨率空间转录组学 NA 空间数据 小鼠模型
6466 2024-11-12
Gene expression landscape of cutaneous squamous cell carcinoma progression
2024-Oct-17, The British journal of dermatology
研究论文 本文通过元分析公开的RNA-Seq样本,定义了从正常皮肤到皮肤鳞状细胞癌(cSCC)不同阶段的转录组景观 本文通过整合多个研究的数据,定义了cSCC进展过程中不同阶段的差异表达基因(DEGs),并使用单细胞RNA-Seq数据验证了这些基因的表达情况 由于样本量较小和分析协议的多样性,研究结果的可转移性可能有限 定义皮肤鳞状细胞癌进展过程中不同阶段的转录组景观 正常皮肤、光化性角化病、原位鳞状细胞癌、角化棘皮瘤和皮肤鳞状细胞癌的RNA-Seq样本 数字病理学 皮肤鳞状细胞癌 RNA测序 NA RNA-Seq数据 共分析了73个正常皮肤样本、46个光化性角化病样本、16个原位鳞状细胞癌样本、13个角化棘皮瘤样本和147个皮肤鳞状细胞癌样本
6467 2024-11-12
COL10A1 expression distinguishes a subset of cancer-associated fibroblasts present in the stroma of high-risk basal cell carcinoma
2024-Oct-17, The British journal of dermatology
研究论文 研究探讨了基底细胞癌(BCC)不同亚型间基质中癌症相关成纤维细胞(CAFs)的特征,特别是COL10A1的表达 首次发现COL10A1作为高风险BCC的标志物,特别是在硬化/浸润性和基底鳞状亚型中 研究样本量有限,且仅限于特定亚型的BCC 研究BCC不同亚型基质中CAFs的特征,以寻找新的治疗靶点和预后生物标志物 基底细胞癌的不同亚型及其基质中的癌症相关成纤维细胞 数字病理学 皮肤癌 RNA测序(RNA-Seq)、激光捕获显微切割(LCM)、免疫组织化学(IHC)、单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 基因表达数据 15个BCC样本(来自5种不同纯亚型,每种3个样本),6个健康皮肤样本,93个不同BCC样本和13个健康皮肤样本
6468 2024-11-12
Exploring Cellular Heterogeneity: Single-Cell and Spatial Transcriptomics of Alzheimer Disease Brains and iPSC-Derived Microglia
2024-Oct-16, Research square
研究论文 本文通过整合单细胞和空间转录组学数据,研究了阿尔茨海默病大脑和诱导多能干细胞衍生的微胶质细胞的细胞异质性 本文首次整合了单细胞和空间转录组学数据,揭示了微胶质细胞在阿尔茨海默病中的多样性和空间分布特征 本文未详细讨论微胶质细胞异质性对阿尔茨海默病进展的具体影响 揭示微胶质细胞在阿尔茨海默病中的转录状态多样性和空间分布特征 阿尔茨海默病大脑和诱导多能干细胞衍生的微胶质细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞转录组学和空间转录组学 NA 转录组数据 多个队列和脑区的微胶质细胞样本
6469 2024-11-12
Integrative approach using network pharmacology, bioinformatics, and experimental methods to explore the mechanism of cantharidin in treating colorectal cancer
2024-09, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 研究利用网络药理学、生物信息学和实验方法探讨斑蝥素治疗结直肠癌的机制 首次综合利用网络药理学、生物信息学和实验方法系统研究斑蝥素治疗结直肠癌的机制 研究主要集中在体外实验,缺乏体内实验验证;样本量较小,可能影响结果的普适性 探讨斑蝥素治疗结直肠癌的生物活性、影响及其抗癌机制 斑蝥素及其在结直肠癌治疗中的作用 生物信息学 结直肠癌 基因表达分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 197个斑蝥素相关靶基因和480个与疾病发展相关的关键基因
6470 2024-11-12
Multi-organ single-cell transcriptomics of immune cells uncovered organ-specific gene expression and functions
2024-Mar-27, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本文通过多器官单细胞转录组学分析,揭示了免疫细胞在不同器官中的基因表达和功能的特异性 本文通过大规模的单细胞转录组数据集,发现了免疫细胞在不同器官中的基因表达差异,并揭示了这些差异与转录因子活性和代谢途径的关联 本文仅分析了健康捐赠者的数据,未涉及疾病状态下的免疫细胞表达模式 研究免疫细胞在不同人体器官中的基因表达特异性和功能 来自14个器官的114,275个CD45+免疫细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 114,275个CD45+免疫细胞
6471 2024-11-12
STING agonist inflames the cervical cancer immune microenvironment and overcomes anti-PD-1 therapy resistance
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究探讨了STING激动剂在宫颈癌免疫微环境中的作用及其与抗PD-1疗法联合使用的潜力 首次探讨了STING激动剂MSA-2在宫颈癌治疗中的应用,并展示了其与抗PD-1疗法联合使用的显著效果 研究主要基于小鼠模型和公开数据集,需进一步验证在人体中的效果 探索STING激动剂在宫颈癌治疗中的作用及其与免疫检查点抑制剂联合使用的潜力 宫颈癌及其免疫微环境 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 使用了来自TCGA和GEO数据集的基因表达和临床病理数据,以及小鼠肿瘤模型U14和TC-1
6472 2024-11-12
Myeloid Cell Derived IL1β Contributes to Pulmonary Hypertension in HFpEF
2023-11-10, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 研究探讨了骨髓细胞衍生的IL-1β在心力衰竭伴保留射血分数(HFpEF)中的肺动脉高压(PH)中的作用 提出了一个新的HFpEF相关PH和右心重塑的研究模型,并识别出骨髓细胞衍生的IL-1β是HFpEF中PH的重要贡献者 NA 确定HFpEF小鼠模型是否也表现出PH特征,并识别可能驱动HFpEF早期肺血管重塑的通路 C57BL/6J小鼠和db/db小鼠模型,以及PH-HFpEF患者的肺组织 NA 心血管疾病 RNA测序、免疫染色、ELISA NA RNA C57BL/6J小鼠(8周龄,雄性和雌性)和db/db小鼠,以及PH-HFpEF患者的肺组织和血浆
6473 2024-11-12
Genome-wide mapping of cancer dependency genes and genetic modifiers of chemotherapy in high-risk hepatoblastoma
2023-07-06, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究报告了一种改进的MYC驱动的肝母细胞瘤样小鼠模型,并利用CRISPR-Cas9筛选技术识别了癌症依赖基因和化疗的遗传修饰因子 开发了一种新的肝母细胞瘤小鼠模型,并通过单细胞RNA测序和空间转录组学识别了不同的肝母细胞瘤细胞亚群,发现了与人类肝母细胞瘤共享的可药物靶点 研究主要基于小鼠模型,需要进一步验证在人类患者中的有效性 研究肝母细胞瘤的发病机制,并开发新的治疗策略 肝母细胞瘤及其治疗中的化疗反应 数字病理学 肝母细胞瘤 CRISPR-Cas9筛选 NA RNA测序数据 小鼠模型中的细胞系
6474 2024-11-11
Inhibition of PNCK inflames tumor microenvironment and sensitizes head and neck squamous cell carcinoma to immune checkpoint inhibitors
2024-Oct-12, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 研究探讨了PNCK在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的作用及其与免疫检查点抑制剂的关系 首次揭示了PNCK在调节肿瘤微环境(TME)和增强免疫检查点抑制剂敏感性中的关键作用 研究主要基于体外和体内实验,需要进一步的临床验证 探讨PNCK在HNSCC中的作用及其对免疫治疗的影响 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)及其肿瘤微环境 癌症研究 头颈部鳞状细胞癌 测序技术、单细胞转录组学、蛋白质组学 NA 基因表达数据、蛋白质数据 包括体外细胞实验、体内动物模型和公共数据库数据
6475 2024-11-11
Systematic Analysis of Human Colorectal Cancer scRNA-seq Revealed Limited Pro-tumoral IL-17 Production Potential in Gamma Delta T Cells
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究重新分析了九个已发表的人类结直肠癌全组织单细胞RNA测序数据集,揭示了γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中产生促肿瘤IL-17的潜力有限 首次系统分析了γδ T细胞在结直肠癌中的IL-17产生潜力,并发现其主要功能为细胞毒性效应细胞而非IL-17产生者 研究仅基于已发表的数据集,未进行新的实验验证 探讨γδ T细胞在结直肠癌肿瘤微环境中的作用及其产生IL-17的潜力 γδ T细胞在结直肠癌中的功能和IL-17产生潜力 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA RNA 165名结直肠癌患者,共951,785个细胞,其中18,483个为γδ T细胞
6476 2024-11-11
Advances in single-cell sequencing technology in microbiome research
2024-Jul, Genes & diseases IF:6.9Q1
综述 本文回顾了微生物检测技术的发展历史,分析了单细胞测序在微生物应用中的难点,并总结了新兴的微生物单细胞测序技术(Microbe-seq)的特点及应用前景 介绍了新兴的微生物单细胞测序技术(Microbe-seq)及其在微生物研究中的应用前景 Microbe-seq技术仍处于优化阶段 促进单细胞测序技术在微生物中的广泛应用并推动技术的进一步改进 微生物的基因型和功能表达 NA NA 单细胞测序 NA NA NA
6477 2024-11-11
Ephrin Forward Signaling Controls Interspecies Cell Competition in Pluripotent Stem Cells
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究探讨了在小鼠和人类多能干细胞共培养中,Ephrin A配体在小鼠细胞中如何通过信号传导导致相邻的人类细胞死亡的机制 开发了一种跨物种细胞接触报告系统,揭示了Ephrin A配体在跨物种多能干细胞竞争中的关键作用 NA 阐明跨物种多能干细胞竞争在早期胚胎发生中的关键机制,并为在动物中生成人类化组织或器官开辟新途径 小鼠和人类多能干细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
6478 2024-11-11
Spatial transcriptomics reveals molecular dysfunction associated with cortical Lewy pathology
2024-Mar-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究使用空间转录组学技术分析了与皮质Lewy病理相关的分子功能障碍 首次在帕金森病和相关痴呆症中识别出易受Lewy病理影响的特定兴奋性神经元类别,并描述了由聚集物引起的分子功能障碍的保守特征 NA 研究皮质神经元中Lewy病理相关的分子变化 帕金森病和相关痴呆症中的皮质神经元 数字病理学 帕金森病 空间转录组学 NA 转录组数据 包括帕金森病、Lewy体痴呆和预形成纤维α-突触核蛋白病变的鼠模型中的神经元
6479 2024-11-11
Identification of novel protein biomarkers from the blood and urine for the early diagnosis of bladder cancer via proximity extension analysis
2024-03-26, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过邻近延伸分析技术,从血液和尿液中识别出膀胱癌的潜在新型蛋白质生物标志物,并建立了一种新的非侵入性检测方法用于早期诊断 本研究首次通过邻近延伸分析技术,从血液和尿液中识别出与膀胱癌发展相关的蛋白质生物标志物,并建立了一个诊断模型用于早期膀胱癌的检测 本研究仅在有限的样本量中验证了蛋白质生物标志物的表达,未来需要在更大规模的临床样本中进行验证 识别膀胱癌的早期诊断生物标志物,并建立一种新的非侵入性检测方法 膀胱癌患者和健康对照组的血液和尿液样本 数字病理学 膀胱癌 邻近延伸分析(PEA) LASSO回归 蛋白质表达数据 99名膀胱癌患者和50名健康对照组
6480 2024-11-11
Spatial Transcriptomic and Metabolomic Landscapes of Oral Submucous Fibrosis-Derived Oral Squamous Cell Carcinoma and its Tumor Microenvironment
2024-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究整合空间转录组学和空间代谢组学技术,揭示了口腔黏膜下纤维化衍生的口腔鳞状细胞癌及其肿瘤微环境的分子机制 首次发现部分口腔黏膜下纤维化衍生的口腔鳞状细胞癌细胞在原位癌区域发生部分上皮-间质转化,获得成纤维细胞样表型并参与胶原蛋白沉积,并揭示了肿瘤微环境中上皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞之间的复杂相互作用 NA 揭示口腔黏膜下纤维化衍生的口腔鳞状细胞癌的分子机制 口腔黏膜下纤维化衍生的口腔鳞状细胞癌及其肿瘤微环境 数字病理学 口腔癌 空间转录组学和空间代谢组学 NA 转录组和代谢组数据 NA
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