单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 6461 - 6480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6461 | 2024-11-08 |
Diverse macrophage populations contribute to distinct manifestations of human cutaneous graft-versus-host disease
2024-02-16, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad402
PMID:38010706
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研究论文 | 研究了不同巨噬细胞群体在人类皮肤移植物抗宿主病中的不同表现 | 首次详细描述了单核吞噬细胞在急性皮肤移植物抗宿主病中的身份、起源和功能，并揭示了其在不同临床亚型中的动态作用 | 研究样本量较小，且仅限于急性皮肤移植物抗宿主病，可能无法全面反映所有类型移植物抗宿主病的情况 | 研究单核吞噬细胞在急性皮肤移植物抗宿主病中的作用，以期为治疗提供新策略 | 急性皮肤移植物抗宿主病患者中的单核吞噬细胞 | NA | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序和多重组织免疫荧光 | NA | RNA | 36名急性皮肤移植物抗宿主病患者 |
| 6462 | 2024-11-08 |
Inflammatory Mediators Suppress FGFR2 Expression in Human Keratinocytes to Promote Inflammation
2024, Molecular and cellular biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1080/10985549.2024.2399766
PMID:39340759
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研究论文 | 研究探讨了炎症介质如何抑制人角质形成细胞中FGFR2的表达以促进炎症 | 首次揭示了FGFR2在人角质形成细胞中抑制炎症的关键作用，并提出了FGFR2下调在特应性皮炎及其他炎症性疾病发病机制中的潜在作用 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探讨FGFR2在人角质形成细胞中的功能及其在炎症性疾病中的作用 | 人角质形成细胞及特应性皮炎患者皮肤样本 | NA | 特应性皮炎 | CRISPR/Cas9基因编辑技术，RNA测序 | NA | RNA | 体外培养的人角质形成细胞及特应性皮炎患者皮肤样本 |
| 6463 | 2024-11-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals STAT1 Drives LHPP Downregulation in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression
2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338241293485
PMID:39497541
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学数据探讨了食管鳞状细胞癌（ESCC）中STAT1对LHPP下调的驱动作用 | 发现了STAT1在ESCC发病机制中对LHPP表达的调控作用，揭示了STAT1与LHPP之间的复杂调控回路 | NA | 探索食管鳞状细胞癌（ESCC）的分子机制和细胞动力学，特别是转录因子STAT1及其与LHPP的调控关系 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者及其细胞系 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 21名ESCC患者 |
| 6464 | 2024-11-08 |
Approaches for Benchmarking Single-Cell Gene Regulatory Network Methods
2024, Bioinformatics and biology insights
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11779322241287120
PMID:39502448
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研究论文 | 本文讨论了单细胞基因调控网络方法的基准测试方法 | 本文首次全面讨论了基准测试方法，并提出了替代的基准数据集和额外的考虑因素 | 本文未具体讨论每种方法的优缺点，而是集中在基准测试方法的讨论上 | 探讨单细胞基因调控网络方法的基准测试方法 | 单细胞基因调控网络方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | NA |
| 6465 | 2024-11-08 |
Ustekinumab affects myofibroblast metabolism to alleviate intestinal fibrosis by targeting KDELC1 in Crohn's disease through multi-machine learning combined with single-cell sequencing analysis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1476592
PMID:39502647
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研究论文 | 本研究通过多机器学习结合单细胞测序分析，探讨了乌司奴单抗通过靶向KDELC1基因缓解克罗恩病肠道纤维化的机制 | 首次揭示了乌司奴单抗通过靶向KDELC1基因影响肌成纤维细胞代谢，从而缓解肠道纤维化的机制 | 研究样本量较小，且仅限于克罗恩病患者，未来需扩大样本量并验证在其他疾病中的适用性 | 探讨乌司奴单抗在克罗恩病中缓解肠道纤维化的遗传机制 | 克罗恩病患者的肠道组织及健康对照组的肠道组织 | 生物信息学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 克罗恩病患者和健康对照组的内镜手术标本 |
| 6466 | 2024-11-08 |
Histamine and Th2 cytokines independently and synergistically upregulate MMP12 expression in human M2 macrophages
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1429009
PMID:39502691
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研究论文 | 研究探讨了组胺和Th2细胞因子在人M2巨噬细胞中独立及协同上调MMP12表达的机制 | 揭示了Th2细胞因子和组胺调控MMP12表达的新机制，可能影响特应性皮炎皮肤屏障稳态 | NA | 研究MMP12在特应性皮炎皮肤病变中的表达及其调控机制 | 特应性皮炎患者的皮肤病变和健康个体的M2巨噬细胞 | NA | 特应性皮炎 | RNA测序 (scRNA-seq), 定量PCR, ELISA | NA | RNA | 特应性皮炎患者和健康个体的M2巨噬细胞样本 |
| 6467 | 2024-11-08 |
Wound-healing plasticity enables clonal expansion of founder progenitor cells in colitis
2023-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.011
PMID:37652012
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研究论文 | 研究揭示了急性小鼠结肠炎中，伤口愈合过程中的克隆扩展机制 | 首次通过三维成像、定量命运图谱和单细胞转录组学揭示了伤口愈合过程中上皮细胞的非增殖可塑状态及其对克隆扩展的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨慢性结肠损伤和炎症中克隆扩展的机制 | 急性小鼠结肠炎中的上皮细胞和创始前体细胞 | NA | NA | 三维成像、定量命运图谱、单细胞转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 小鼠模型 |
| 6468 | 2024-11-08 |
Reconstructing human brown fat developmental trajectory in vitro
2023-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.001
PMID:37647896
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术，分析了小鼠肩胛间棕色脂肪的发育过程，并成功在体外重现了人类棕色脂肪细胞的分化轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了棕色脂肪细胞分化过程中GATA6转录因子的表达，并成功在体外重现了人类棕色脂肪细胞的分化 | 研究主要集中在小鼠模型上，人类棕色脂肪细胞的分化过程可能存在差异 | 揭示棕色脂肪细胞的发育轨迹，并探索在体外重现人类棕色脂肪细胞分化的方法 | 小鼠肩胛间棕色脂肪和人类多能干细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肩胛间棕色脂肪和人类多能干细胞的单细胞样本 |
| 6469 | 2024-11-08 |
Combined inactivation of RB and Hippo converts differentiating Drosophila photoreceptors into eye progenitor cells through derepression of homothorax
2023-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.09.003
PMID:37848027
|
研究论文 | 研究了RB和Hippo通路在果蝇光感受器细胞分化中的相互作用 | 揭示了RB和Hippo通路通过抑制homothorax表达来维持光感受器细胞分化的机制 | NA | 探讨RB和Hippo通路在细胞增殖和分化中的相互作用机制 | 果蝇光感受器细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 6470 | 2024-11-08 |
Bayesian-frequentist hybrid inference framework for single cell RNA-seq analyses
2023-Oct-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3384541/v1
PMID:37886581
|
研究论文 | 本文提出了一种贝叶斯-频率主义混合推断框架用于单细胞RNA测序分析 | 本文的创新点在于提出了贝叶斯-频率主义混合框架，以提高单细胞RNA测序数据中差异表达基因的识别能力 | 本文的局限性在于仅在一个特例（特发性肺纤维化）中进行了验证，尚未在其他疾病或数据集中进行广泛验证 | 本文的研究目的是提高单细胞RNA测序数据中差异表达基因的识别能力 | 本文的研究对象是单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯-频率主义混合框架 | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 6471 | 2024-11-08 |
Single-nucleus chromatin accessibility identifies a critical role for TWIST1 in idiopathic pulmonary fibrosis myofibroblast activity
2023-07, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00474-2022
PMID:37142338
|
研究论文 | 研究通过单核染色质可及性分析，揭示了TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞活性中的关键作用 | 首次通过单核染色质可及性分析结合单细胞RNA测序数据，精确识别了TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞中的关键转录因子活性 | 研究样本量较小，仅包括3例特发性肺纤维化患者和2例供体对照 | 探讨TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞活性中的调控作用 | 特发性肺纤维化患者的肺组织和肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、单核染色质可及性测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 3例特发性肺纤维化患者和2例供体对照的肺组织，以及10例特发性肺纤维化和8例对照的单细胞RNA测序数据 |
| 6472 | 2024-11-08 |
Single-cell transcriptomics reveals that tumor-infiltrating natural killer cells are activated by localized ablative immunotherapy and share anti-tumor signatures induced by immune checkpoint inhibitors
2023-May-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.02.539163
PMID:37205468
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学揭示肿瘤浸润自然杀伤细胞在局部消融免疫疗法激活下与免疫检查点抑制剂诱导的抗肿瘤特征共享 | 首次揭示局部消融免疫疗法激活自然杀伤细胞的细胞毒性，并发现上调基因与癌症患者的有益临床结果正相关 | NA | 探讨自然杀伤细胞在癌症治疗中的激活基因特征和通路 | 自然杀伤细胞在肿瘤微环境中的转录变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用MMTV-PyMT小鼠模型和人类样本进行分析 |
| 6473 | 2024-11-08 |
M-CSFR/CSF1R signaling regulates myeloid fates in zebrafish via distinct action of its receptors and ligands
2022-03-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021005459
PMID:34979548
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研究论文 | 研究了斑马鱼中M-CSFR/CSF1R信号通路在髓系细胞分化、增殖和存活中的作用 | 揭示了Csf1rb在斑马鱼粒细胞生成中的未知作用，并发现Il34信号通过Csf1rb对粒细胞的重要性 | NA | 探讨斑马鱼中Csf1rs及其配体在胚胎和成年髓系生成中的作用 | 斑马鱼的Csf1rs及其配体（Csf1a、Csf1b和Il34）在髓系生成中的作用 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年斑马鱼的全肾骨髓（WKM）造血细胞 |
| 6474 | 2024-11-07 |
Inhibition of SUMOylation Induces Adaptive Antitumor Immunity against Pancreatic Cancer through Multiple Effects on the Tumor Microenvironment
2024-Nov-04, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-23-0572
PMID:39150446
|
研究论文 | 研究通过抑制SUMOylation诱导胰腺癌的适应性抗肿瘤免疫，并探讨其在肿瘤微环境中的多重效应 | 首次探讨了SUMOylation抑制在胰腺癌肿瘤微环境中对适应性抗肿瘤免疫的影响 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在临床试验中验证 | 探索改善胰腺导管腺癌患者预后的新治疗靶点 | 胰腺导管腺癌及其肿瘤微环境 | NA | 胰腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 使用临床相关的小鼠胰腺癌模型进行研究 |
| 6475 | 2024-11-07 |
CRISPR Screening of Transcribed Super-Enhancers Identifies Drivers of Triple-Negative Breast Cancer Progression
2024-Nov-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3995
PMID:39186674
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研究论文 | 研究通过CRISPR筛选转录超级增强子，识别三阴性乳腺癌进展的驱动因素 | 系统分析了三阴性乳腺癌特异性转录增强子的调控机制及其非编码增强子RNA（eRNA）转录本，并使用高吞吐量CRISPR干扰实验结合RNA测序，无偏倚地检测了全基因组的目标基因 | NA | 探讨eRNA产生的超级增强子如何驱动基因表达网络，从而影响三阴性乳腺癌的生物学特性 | 三阴性乳腺癌（TNBC）的转录超级增强子及其eRNA转录本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | CRISPR干扰、RNA测序、Hi-C染色质相互作用图谱、单细胞RNA测序、高吞吐量测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA |
| 6476 | 2024-11-07 |
HiDDEN: a machine learning method for detection of disease-relevant populations in case-control single-cell transcriptomics data
2024-Nov-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53666-8
PMID:39487129
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研究论文 | 本文介绍了一种名为HiDDEN的机器学习方法，用于在病例对照单细胞转录组数据中检测与疾病相关的细胞群体 | HiDDEN方法能够改进病例对照标签，准确反映每个细胞的扰动状态，从而在模拟数据和实际数据中表现出优于标准分析流程的能力 | 标准单细胞分析方法在受影响子集较小或扰动强度较弱时无法有效隔离受影响的病例细胞及其标记 | 开发一种能够准确检测病例对照单细胞转录组数据中与疾病相关细胞群体的方法 | 病例对照单细胞转录组数据中的细胞群体及其与疾病相关的扰动状态 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括人类多发性骨髓瘤前体条件数据和鼠类脱髓鞘模型数据 |
| 6477 | 2024-11-07 |
Single-cell sequencing: Current applications in various tuberculosis specimen types
2024-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13698
PMID:38956399
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在结核病研究中的应用，特别是其在分析不同来源结核病样本中的应用 | 单细胞测序技术具有高分辨率，能够超越传统技术，揭示与结核病发病机制相关的免疫细胞亚群的组成和比例 | NA | 探讨单细胞测序技术在结核病研究中的临床应用潜力 | 结核病样本，主要包括外周血和肺部样本 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 6478 | 2024-11-07 |
Combined lineage tracing and scRNA-seq reveal the activation of Sox9+ cells in renal regeneration with PGE2 treatment
2024-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13679
PMID:38801100
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研究论文 | 研究揭示了PGE2处理下Sox9+细胞在肾再生中的激活机制 | 首次结合谱系追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了PGE2在急性肾损伤后激活Sox9+细胞并促进其分化为近端小管上皮细胞的机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 揭示内源性再生和修复机制，开发针对驻留干细胞谱系的特定疗法 | Sox9+干细胞在急性肾损伤后的命运决定机制 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | Sox9谱系追踪小鼠模型中的样本 |
| 6479 | 2024-11-07 |
Macrophages in the infarcted heart acquire a fibrogenic phenotype, expressing matricellular proteins, but do not undergo fibroblast conversion
2024-Nov, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.07.010
PMID:39089570
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研究论文 | 研究探讨了心肌梗死后巨噬细胞是否转化为成纤维细胞及其对细胞外基质表达的影响 | 首次通过谱系追踪和单细胞转录组学方法，证明了心肌梗死后的巨噬细胞并未转化为成纤维细胞，但表达多种促纤维化基质蛋白 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类心肌梗死的数据 | 验证心肌梗死后巨噬细胞是否转化为成纤维细胞，并分析其细胞外基质表达特征 | 心肌梗死后的巨噬细胞及其细胞外基质表达 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠心肌梗死模型 |
| 6480 | 2024-11-07 |
Immunologic Profiling of CSF in Subarachnoid Neurocysticercosis Reveals Specific Interleukin-10-Producing Cell Populations During Treatment
2024-Nov, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200320
PMID:39475624
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研究论文 | 研究了在治疗期间，蛛网膜下腔神经囊虫病（SANCC）患者脑脊液（CSF）中免疫细胞群体的特征，特别是IL-10产生细胞的分布和作用 | 首次全面分析了SANCC患者CSF和外周血中IL-10产生细胞的多样性和动态变化 | 样本量较小，仅包括5名患者，可能影响结果的普遍性 | 深入理解SANCC的免疫学机制，特别是IL-10在治疗过程中的作用 | SANCC患者的脑脊液和外周血中的免疫细胞群体 | NA | 神经囊虫病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞 | 5名SANCC患者，共8份脑脊液样本和4份匹配的外周血样本 |