单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27443 篇文献，本页显示第 6441 - 6460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6441 | 2024-11-14 |
Correct stimulation of CD28H arms NK cells against tumor cells
2024-Nov, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350901
PMID:39101623
|
研究论文 | 研究通过靶向CD28H激活NK细胞，增强其对肿瘤细胞的杀伤作用 | 首次研究了靶向CD28H的单克隆抗体对NK细胞的激活作用及其对肿瘤细胞的杀伤效果 | NA | 探讨CD28H在NK细胞激活和肿瘤免疫逃逸中的作用 | CD28H、NK细胞、肿瘤细胞 | 免疫学 | 肾癌 | 单克隆抗体、scRNA-seq | NA | 细胞 | 涉及多种血液细胞系和透明细胞肾癌细胞 |
| 6442 | 2024-11-14 |
Computational methods for allele-specific expression in single cells
2024-Nov, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.07.003
PMID:39127549
|
综述 | 本文综述了单细胞等位基因特异性表达（ASE）数据的计算方法 | 本文讨论了处理和分析单细胞ASE数据的计算方法，并强调了未来需要整合和优化的生物信息学流程以及统计方法的发展 | NA | 探讨单细胞等位基因特异性表达数据的计算方法 | 单细胞等位基因特异性表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 6443 | 2024-11-14 |
Adding Highly Variable Genes to Spatially Variable Genes Can Improve Cell Type Clustering Performance in Spatial Transcriptomics Data
2024-Oct-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5315913/v1
PMID:39502778
|
研究论文 | 研究探讨了在空间转录组数据中，将高变异基因与空间变异基因结合是否能提高细胞类型聚类性能 | 首次研究了将高变异基因与空间变异基因结合对细胞类型聚类性能的影响 | 仅在50个真实空间转录组数据集上进行了测试，可能需要更多数据集验证 | 探讨在空间转录组数据中，结合高变异基因与空间变异基因对细胞类型聚类性能的影响 | 空间转录组数据中的高变异基因和空间变异基因 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 50个真实空间转录组数据集 |
| 6444 | 2024-11-14 |
Single-cell sequencing technology to characterize stem T-cell subpopulations in acute T-lymphoblastic leukemia and the role of stem T-cells in the disease process
2024-Oct-17, Aging
DOI:10.18632/aging.206123
PMID:39422621
|
研究论文 | 研究使用单细胞测序技术分析急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群及其在疾病过程中的作用 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群及其在疾病发展中的作用 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 探讨急性T淋巴母细胞白血病中干细胞T细胞亚群的特征及其在疾病过程中的作用 | 急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 来自公共数据库的单细胞测序数据 |
| 6445 | 2024-11-14 |
Antibody-Fab and -Fc features promote Mycobacterium tuberculosis restriction
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.617070
PMID:39416184
|
研究论文 | 研究了抗体Fab和Fc特征在限制结核分枝杆菌中的作用 | 通过Fc交换优化了保护性脂阿拉伯甘露聚糖特异性单克隆抗体，并揭示了Fc效应功能在限制中的关键作用 | NA | 探讨抗体在控制结核分枝杆菌中的机制 | 结核分枝杆菌、单克隆抗体、Fc变体 | NA | 结核病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 6446 | 2024-11-14 |
IKKα-STAT3-S727 axis: a novel mechanism in DOX-induced cardiomyopathy
2024-Sep-17, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05439-1
PMID:39287798
|
研究论文 | 研究探讨了IKKα在DOX诱导的心肌病中的作用及其机制 | 发现了IKKα-STAT3-S727信号通路在DOX诱导的心肌病中的关键作用 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 研究IKKα如何调节巨噬细胞激活并导致DOX诱导的心肌病 | 巨噬细胞IKKα在小鼠模型中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 使用巨噬细胞特异性IKKα敲除小鼠进行研究 |
| 6447 | 2024-11-14 |
TWIST1+FAP+ fibroblasts in the pathogenesis of intestinal fibrosis in Crohn's disease
2024-Jul-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179472
PMID:39024569
|
研究论文 | 研究了克罗恩病中肠纤维化的发病机制，特别是TWIST1+FAP+成纤维细胞的作用 | 首次揭示了TWIST1+FAP+成纤维细胞在肠纤维化中的关键作用，并提出了通过抑制TWIST1来治疗克罗恩病纤维化的潜在策略 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA测序数据，需要进一步的临床验证 | 探讨克罗恩病中肠纤维化的发病机制，并寻找有效的治疗策略 | 克罗恩病患者的纤维化和非纤维化回肠组织，以及小鼠的慢性葡聚糖硫酸钠盐结肠炎模型 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 克罗恩病患者和小鼠模型的多个样本 |
| 6448 | 2024-11-14 |
Metabolic regulator ERRγ governs gastric stem cell differentiation into acid-secreting parietal cells
2024-Jun-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.04.016
PMID:38733994
|
研究论文 | 研究揭示了代谢调节因子ERRγ在胃干细胞向壁细胞分化中的作用 | 首次识别了从峡部干细胞产生的壁细胞前体，并展示了ERRγ在壁细胞分化过程中的关键作用 | NA | 阐明胃干细胞向壁细胞分化的机制 | 小鼠模型和人类胃细胞中的壁细胞前体 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 细胞 | 小鼠模型和人类胃细胞 |
| 6449 | 2024-11-14 |
Differential CpG methylation at Nnat in the early establishment of beta cell heterogeneity
2024-Jun, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06123-6
PMID:38512414
|
研究论文 | 研究探讨了Nnat基因在β细胞异质性早期建立中的差异CpG甲基化机制 | 首次揭示了Nnat基因的差异甲基化在β细胞异质性建立中的作用 | NA | 探讨β细胞异质性建立的分子机制 | 胰腺β细胞及其亚群 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、亲和纯化质谱分析、钙成像 | NA | RNA、蛋白质 | 转基因小鼠和db/db小鼠 |
| 6450 | 2024-11-14 |
Cellular-resolution gene expression mapping reveals organization in the head ganglia of the gastropod, Berghia stephanieae
2024-06, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25628
PMID:38852042
|
研究论文 | 本文通过结合高通量单细胞RNA测序和原位杂交链反应，在海蛞蝓Berghia stephanieae中识别和可视化了细胞类型的标记基因表达 | 首次在海蛞蝓中进行细胞分辨率的基因表达图谱绘制，揭示了神经元和胶质细胞的分子标记及其在神经节中的组织结构 | 仅限于海蛞蝓Berghia stephanieae，未涵盖其他软体动物 | 揭示软体动物神经系统中神经元和胶质细胞的基本细胞组织结构 | 海蛞蝓Berghia stephanieae的头部神经节 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、原位杂交链反应 | NA | 基因表达数据 | 多个神经元和胶质细胞样本 |
| 6451 | 2024-11-14 |
Notch ligands are biomarkers of anti-TNF response in RA patients
2024-May, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-023-09897-2
PMID:37796367
|
研究论文 | 研究探讨了Notch配体在类风湿性关节炎（RA）患者中的表达及其作为抗TNF治疗反应的生物标志物的潜力 | 首次揭示了RA患者中Notch配体在不同细胞类型中的表达模式及其对抗TNF治疗反应的影响 | 研究主要集中在RA患者的滑膜组织，未涵盖其他组织或细胞类型 | 探讨Notch通路在RA发病机制中的作用及其在RA治疗中的潜在应用 | RA患者的滑膜组织细胞和内皮细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及RA患者的滑膜组织细胞和内皮细胞 |
| 6452 | 2024-11-14 |
Maximum Likelihood Inference of Time-scaled Cell Lineage Trees with Mixed-type Missing Data
2024-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.05.583638
PMID:38496496
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于推断带有混合类型缺失数据的时间缩放细胞谱系树的最大似然方法 | 引入了Probabilistic Mixed-type Missing (PMM)模型，并开发了LAML算法，该算法结合了期望最大化(EM)算法和启发式树搜索，能够更准确地推断树拓扑结构和分支长度 | NA | 解决动态谱系追踪中的关键计算问题，即从测量的CRISPR诱导突变中推断细胞谱系树 | 细胞谱系树的推断 | 生物信息学 | 肺癌 | CRISPR-based genome editing, single-cell sequencing | 最大似然模型 | 基因组数据 | NA |
| 6453 | 2024-11-14 |
Comprehensive phenotypic and genomic characterization of venous malformations
2024-03, Human pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1016/j.humpath.2024.02.004
PMID:38367816
|
研究论文 | 研究静脉畸形（VMs）的表型和基因型特征，并探讨基因突变与临床病理特征之间的关系 | 首次系统地分析了TEK和PIK3CA基因突变与静脉畸形临床病理特征之间的关联，并揭示了基因特异性效应 | 研究样本量有限，且未涉及所有可能的基因突变类型 | 探讨静脉畸形中基因突变与临床病理特征之间的关联 | 静脉畸形患者及其基因突变和临床病理特征 | 数字病理学 | 血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因数据 | 114名静脉畸形患者 |
| 6454 | 2024-11-14 |
Inference after latent variable estimation for single-cell RNA sequencing data
2023-12-15, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxac047
PMID:36511385
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为count splitting的灵活框架，用于在单细胞RNA测序数据分析中进行有效的推断 | 提出了count splitting方法，解决了在单细胞RNA测序数据分析中使用相同数据进行潜在变量估计和基因关联测试时无法控制第一类错误的问题 | 仅在泊松假设下有效 | 开发一种新的方法，以在单细胞RNA测序数据分析中实现有效的统计推断 | 单细胞RNA测序数据中的潜在变量估计和基因关联测试 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多能干细胞分化为心肌细胞的数据集 |
| 6455 | 2024-11-14 |
Kidney single-cell transcriptome profile reveals distinct response of proximal tubule cells to SGLT2i and ARB treatment in diabetic mice
2022-04-06, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2021.10.013
PMID:34678510
|
研究论文 | 研究了糖尿病小鼠肾脏单细胞转录组在不同药物治疗下的反应 | 揭示了ARBs和SGLT2i对近端小管细胞的不同影响，并发现了一个新的近端小管亚群 | NA | 探讨ARBs和SGLT2i在糖尿病肾病中的保护作用机制 | 糖尿病小鼠的肾脏细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | db/db小鼠和db/m小鼠 |
| 6456 | 2024-11-14 |
SCDC: bulk gene expression deconvolution by multiple single-cell RNA sequencing references
2021-01-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbz166
PMID:31925417
|
研究论文 | 提出了一种名为SCDC的批量基因表达反卷积方法，利用多个单细胞RNA测序参考数据集进行细胞类型特异性基因表达分析 | SCDC采用ENSEMBLE方法整合来自不同实验室和时间的单细胞RNA测序数据，解决了批次效应问题，并在细胞类型分解的准确性上优于现有方法 | NA | 开发一种新的反卷积方法，以提高批量RNA测序数据中细胞类型分解的准确性 | 批量RNA测序数据和多个单细胞RNA测序参考数据集 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（RNA-seq） | ENSEMBLE方法 | 基因表达数据 | 包括人工合成的伪批量样本和实验混合的细胞系，以及人类胰腺胰岛和老鼠乳腺腺体数据集 |
| 6457 | 2024-11-14 |
SAME-clustering: Single-cell Aggregated Clustering via Mixture Model Ensemble
2020-01-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz959
PMID:31777938
|
研究论文 | 提出了一种基于混合模型集合的单细胞聚类方法SAME-clustering，通过整合多种聚类方法的结果来提高聚类效果 | SAME-clustering通过选择多种聚类方法的多样性子集，生成改进的集合解决方案，从而在单细胞RNA-seq数据聚类中表现出色 | NA | 开发一种新的单细胞RNA-seq数据聚类方法，以提高聚类效果 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 聚类分析 | 混合模型 | RNA-seq数据 | 15个scRNA-seq数据集，包含49到32695个单细胞，聚类数从3到15 |
| 6458 | 2024-11-14 |
Background fluorescence and spreading error are major contributors of variability in high-dimensional flow cytometry data visualization by t-distributed stochastic neighboring embedding
2018-08, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.23566
PMID:30107099
|
研究论文 | 本文探讨了在高维流式细胞术数据可视化中，背景荧光和扩散误差对t-分布随机邻域嵌入（tSNE）算法的影响 | 本文首次识别了背景值分布差异和扩散误差是高维流式细胞术数据可视化中tSNE算法的主要变异来源，并提出了通过双指数变换和限制扩散误差来改善数据可视化的方法 | 本文主要关注了背景荧光和扩散误差的影响，未全面探讨其他可能影响tSNE算法性能的因素 | 研究tSNE算法在高维流式细胞术数据可视化中的应用及其变异来源 | 高维流式细胞术数据及其在tSNE算法中的可视化效果 | 生物信息学 | NA | 流式细胞术 | tSNE | 流式细胞术数据 | 多个独立实验或临床试验中的大量样本 |
| 6459 | 2024-11-13 |
Spatial domains identification in spatial transcriptomics using modality-aware and subspace-enhanced graph contrastive learning
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.10.029
PMID:39507820
|
研究论文 | 本文提出了一种基于图对比学习和子空间分析的框架GRAS4T，用于空间转录组学中的空间域识别 | 结合对比学习和子空间分析模型，通过捕捉同一域内点的自表达性来准确区分不同的空间域 | NA | 开发一种新的方法来提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性 | 空间转录组学数据中的空间域 | 空间转录组学 | NA | 图对比学习 | 图对比学习框架 | 空间转录组数据 | 八个来自五个不同平台的空间转录组数据集 |
| 6460 | 2024-11-13 |
Shared and unique transcriptomic signatures of antidepressant and probiotics action in the mammalian brain
2024-Nov, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02619-0
PMID:38844534
|
研究论文 | 研究探讨了不同抗抑郁药物和益生菌对哺乳动物大脑不同区域的转录组影响 | 首次系统分析了抗抑郁药物和益生菌在哺乳动物大脑中的共同和独特转录组特征 | 研究仅限于特定药物和益生菌组合，未涵盖所有可能的治疗方案 | 揭示抗抑郁药物和益生菌在治疗情绪障碍中的共同和差异机制 | 抗抑郁药物（如安非他酮、地昔帕明、氟西汀）和益生菌（Lacidofil®）对大脑10个区域的影响 | 数字病理学 | 情绪障碍 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及10个大脑区域，每个区域-治疗组合平均有2211个差异表达基因 |