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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6421 | 2025-10-06 |
Dynamics of Endothelial Cell Generation and Turnover in Arteries During Homeostasis and Diseases
2024-01-09, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究开发了一种遗传增殖追踪系统,用于定量分析动脉内皮细胞在稳态和疾病状态下的生成动态和细胞分裂方向 | 开发了基于Cre-loxP和Dre-rox的双重组系统,实现了体内内皮细胞增殖的无缝时间记录 | 研究主要针对小鼠大血管,对人类血管的适用性需要进一步验证 | 揭示动脉内皮细胞在稳态和疾病状态下的生成动态和调控机制 | 小鼠动脉内皮细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,遗传增殖追踪 | NA | 基因表达数据,细胞增殖数据 | 成年小鼠主动脉内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6422 | 2025-10-06 |
BACH1 promotes tissue necrosis and Mycobacterium tuberculosis susceptibility
2024-Jan, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01523-7
PMID:38066332
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研究论文 | 研究发现转录因子BACH1通过调控铁死亡促进结核分枝杆菌感染的组织坏死和宿主易感性 | 首次揭示BACH1通过抑制抗氧化基因表达调控铁死亡过程,从而影响结核分枝杆菌感染的宿主抵抗机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究BACH1在结核分枝杆菌感染中对宿主抵抗力的调控机制 | 小鼠模型、巨噬细胞、肺组织 | 分子生物学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 多个小鼠模型组(包括Bach1敲除和B6.Sst1小鼠) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6423 | 2025-10-06 |
Dandelion uses the single-cell adaptive immune receptor repertoire to explore lymphocyte developmental origins
2024-Jan, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01734-7
PMID:37055623
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研究论文 | 介绍用于单细胞V(D)J测序数据分析的计算流程Dandelion | 开发了能够改进V(D)J重叠群注释并识别非生产和部分剪接重叠群的单细胞分析流程,创建了可用于差异V(D)J使用分析和伪时间轨迹推断的AIR特征空间 | NA | 探索淋巴细胞发育起源 | 淋巴细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞V(D)J测序(scVDJ-seq), 单细胞RNA测序 | 计算流程 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞V(D)J测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6424 | 2025-10-06 |
MICA: a multi-omics method to predict gene regulatory networks in early human embryos
2024-01, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202302415
PMID:37879938
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研究论文 | 开发了一种名为MICA的多组学方法,用于预测早期人类胚胎中的基因调控网络 | 首次将基于互信息的非线性方法应用于结合染色质可及性的单细胞多组学数据,能够捕获复杂的非单调依赖关系和反馈回路 | 在单细胞样本有限的情况下进行GRN推断存在困难 | 开发适用于单细胞多组学数据的基因调控网络预测方法 | 早期人类胚胎 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序,染色质可及性分析 | 基于互信息的非线性方法 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
6425 | 2025-10-06 |
Gene module reconstruction elucidates cellular differentiation processes and the regulatory logic of specialized secretion
2023-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.29.573643
PMID:38234833
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序重建分化过程,揭示分泌组织中基因模块的调控逻辑 | 提出整合表达和功能相似性的基因模块识别方法,发现未折叠蛋白反应转录因子在调控通用和特化分泌功能中的新作用 | 研究仅基于斑马鱼脊索和孵化腺两种分泌组织,在其他组织中的普适性需进一步验证 | 解析细胞分化过程中基因模块重建和分泌功能调控机制 | 斑马鱼脊索和孵化腺组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎(功能缺失和功能获得突变体) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6426 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics identifies adipose tissue CD271+ progenitors for enhanced angiogenesis in limb ischemia
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101337
PMID:38118404
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析识别出脂肪组织CD271+祖细胞在肢体缺血模型中具有增强血管生成的能力 | 首次通过单细胞转录组技术从皮下脂肪组织中鉴定出CD271+祖细胞群体,并证明其在肢体缺血模型中具有优于传统脂肪基质细胞的血管生成能力 | 研究中使用了异种移植模型,可能无法完全模拟人类疾病环境;胰岛素抵抗供体中CD271祖细胞数量和功能下降的机制需要进一步研究 | 寻找更有效的细胞疗法用于治疗严重肢体缺血 | 人类组织中的CD271+祖细胞,特别是皮下脂肪组织来源的细胞群体 | 单细胞生物学 | 肢体缺血 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6427 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics and In Vitro Lineage Tracing Reveals Differential Susceptibility of Human iPSC-Derived Midbrain Dopaminergic Neurons in a Cellular Model of Parkinson's Disease
2023-12-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242860
PMID:38132179
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和体外谱系追踪技术,揭示了人类iPSC来源的中脑多巴胺能神经元在帕金森病细胞模型中的差异性易感性 | 开发了能够通过BFP表达纯化和追踪新生中脑多巴胺能祖细胞及其分化后代的人类iPSC系,结合CRISPR/Cas9基因编辑和单细胞RNA测序技术 | 研究基于体外细胞模型,可能无法完全模拟体内帕金森病的复杂病理环境 | 建立帕金森病的干细胞模型并研究疾病相关细胞类型的易感性 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)分化的中脑多巴胺能神经元 | 干细胞生物学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑, 免疫细胞化学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6428 | 2025-10-06 |
Early human lung immune cell development and its role in epithelial cell fate
2023-12-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adf9988
PMID:38100545
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研究论文 | 通过单细胞技术研究人类胚胎和胎儿肺脏免疫细胞的发育过程及其对上皮细胞命运的影响 | 首次系统揭示人类胚胎肺脏免疫细胞的发育时序和多样性,发现免疫细胞可能通过IL-1β信号通路指导上皮细胞发育 | 研究主要基于发育早期样本,缺乏出生后肺脏免疫发育的追踪数据 | 探究人类肺脏发育过程中免疫细胞的作用机制 | 人类胚胎和胎儿肺脏组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单分子荧光原位杂交, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 人类胚胎和胎儿肺脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组技术 | NA | NA |
6429 | 2025-10-06 |
Preleukemic single-cell landscapes reveal mutation-specific mechanisms and gene programs predictive of AML patient outcomes
2023-12-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100426
PMID:38116120
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析八种小鼠模型的269,048个单细胞图谱,揭示前白血病突变对细胞适应性、谱系命运和代谢的影响,并开发可预测AML患者预后的11基因评分系统 | 首次在单细胞分辨率下系统解析前白血病突变对造血干祖细胞的异质性影响,并建立基于前白血病转录特征的预后预测模型 | 研究基于小鼠模型,在人类AML中的直接适用性需要进一步验证 | 解析前白血病突变对造血干祖细胞的影响机制并开发AML预后预测方法 | 携带髓系恶性肿瘤驱动突变的八种小鼠模型的造血干祖细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 269,048个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6430 | 2025-10-06 |
Early cellular mechanisms of type I interferon-driven susceptibility to tuberculosis
2023-12-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.11.002
PMID:38029747
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研究论文 | 本研究揭示了浆细胞样树突状细胞产生的I型干扰素通过作用于间质巨噬细胞促进结核分枝杆菌复制的早期细胞机制 | 首次发现间质巨噬细胞和浆细胞样树突状细胞是结核感染中I型干扰素的主要生产者,并阐明了I型干扰素通过抑制IFNγ反应促进细菌复制的机制 | 研究主要基于小鼠和非人灵长类动物模型,人类数据有限 | 探究I型干扰素驱动结核病易感性的早期细胞机制 | 结核分枝杆菌感染的小鼠、非人灵长类动物和人类肉芽肿组织 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6431 | 2025-10-06 |
Avoiding false discoveries in single-cell RNA-seq by revisiting the first Alzheimer's disease dataset
2023-Dec-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90214
PMID:38047913
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研究论文 | 重新分析首个阿尔茨海默病单细胞RNA-seq数据集,通过改进数据处理和差异表达分析方法显著减少假阳性发现 | 采用最佳实践方法重新分析首个AD单细胞RNA-seq数据,将假发现率为0.05时的差异表达基因数量减少549倍 | 基于已有数据的重新分析,未涉及新的实验数据收集 | 评估质量控制和分析方法对疾病相关基因发现的影响,纠正先前研究中的虚假发现 | 阿尔茨海默病患者脑组织单细胞RNA-seq数据 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单核RNA-seq | NA | NA |
6432 | 2025-10-06 |
Neural plate progenitors give rise to both anterior and posterior pituitary cells
2023-12-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.018
PMID:37683631
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学发现神经板前体细胞可同时分化为垂体前叶和后叶细胞 | 挑战了垂体前叶细胞仅来源于非神经外胚层的传统观点,揭示了神经板前体对垂体双叶的贡献 | 研究主要基于斑马鱼和小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究垂体发育的细胞谱系来源和分化机制 | 斑马鱼和小鼠的垂体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学,遗传谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼和小鼠垂体细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6433 | 2025-10-06 |
Clonally expanded memory CD8+ T cells accumulate in atherosclerotic plaques and are pro-atherogenic in aged mice
2023-Dec, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00515-w
PMID:37996758
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研究论文 | 本研究揭示了衰老过程中记忆CD8+ T细胞在动脉粥样硬化斑块中的克隆性扩增及其促动脉粥样硬化作用 | 首次发现衰老相关的记忆CD8+ T细胞亚群在动脉粥样硬化斑块中克隆性扩增并具有促动脉粥样硬化功能 | 研究仅使用雌性小鼠,未探讨性别差异的影响 | 探究衰老过程中CD8+ T细胞在动脉粥样硬化发生发展中的作用机制 | 年轻和老年雌性小鼠的CD8+ T细胞及动脉粥样硬化斑块 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,适应性转移实验,细胞清除实验 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 年轻和老年雌性小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6434 | 2025-10-06 |
Effect of stretching on inflammation in a subcutaneous carrageenan mouse model analyzed at single-cell resolution
2023-12, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31133
PMID:37909412
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析拉伸对小鼠皮下角叉菜胶炎症模型的影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示拉伸对炎症反应的分子机制,发现拉伸同时调节促炎和促消退基因表达 | 研究仅限于小鼠皮下炎症模型,结果可能不直接适用于其他物种或炎症类型 | 探索拉伸在细胞/分子水平对炎症反应的影响机制 | 小鼠皮下角叉菜胶诱导的炎症模型 | 单细胞生物学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6435 | 2025-10-06 |
Meta-Analysis of COVID-19 BAL Single-Cell RNA Sequencing Reveals Alveolar Epithelial Transitions and Unique Alveolar Epithelial Cell Fates
2023-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0077OC
PMID:37523502
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荟萃分析 | 通过对COVID-19患者支气管肺泡灌洗液单细胞RNA测序数据的荟萃分析,揭示肺泡上皮细胞的异常分化状态 | 首次发现并描述了一种新的AT-I细胞状态,其特征是表皮分化复合体基因的诱导表达,包括SPRR3蛋白和多种角蛋白基因的上调 | 样本量相对有限(健康对照13例,COVID-19患者20例),且为观察性研究,无法确定因果关系 | 通过单细胞RNA测序荟萃分析揭示COVID-19患者肺泡上皮细胞的异常分化和细胞命运 | 支气管肺泡灌洗液细胞,重点关注肺泡上皮II型细胞和I型细胞 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,细胞培养实验 | 伪时间序列分析 | 单细胞RNA测序数据,免疫组织化学图像 | 33个样本(13个健康对照,20个COVID-19患者),共167,280个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6436 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals key differences between early-stage and late-stage systemic sclerosis skin across autoantibody subgroups
2023-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224184
PMID:37580109
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析弥漫性皮肤系统性硬化症患者皮肤组织的细胞差异 | 首次在单细胞水平揭示不同自身抗体亚组(ATA+和ARA+)和疾病阶段(早期和晚期)的系统性硬化症皮肤细胞差异 | 样本量较小(12例患者和3例健康对照),仅分析了前臂皮肤活检 | 研究弥漫性皮肤系统性硬化症不同自身抗体亚组和疾病阶段的皮肤细胞差异 | 弥漫性皮肤系统性硬化症患者和健康对照的皮肤组织 | 单细胞生物学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例前臂皮肤活检(12例患者,3例健康对照) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞测序技术 |
6437 | 2025-10-06 |
Human brain single nucleus cell type enrichments in neurodegenerative diseases
2023-Nov-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3390225/v1
PMID:38014237
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研究论文 | 通过整合基因组关联研究、单细胞测序数据和批量表达研究,识别神经退行性疾病中重要的脑细胞类型和基因 | 首次在三种主要神经退行性疾病中系统识别免疫相关脑细胞类型,并精细定位30个基因座涉及7个基因在多种疾病中的作用 | 研究依赖于现有数据库和样本,可能未覆盖所有相关细胞类型和基因 | 识别神经退行性疾病谱系中治疗靶点开发相关的重要细胞类型和基因 | 人类脑组织样本,重点关注阿尔茨海默病、肌萎缩侧索硬化和帕金森病 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 批量表达分析 | NA | 基因表达数据, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
6438 | 2025-10-06 |
Wound-healing plasticity enables clonal expansion of founder progenitor cells in colitis
2023-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.011
PMID:37652012
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研究论文 | 本研究揭示了急性结肠炎中通过伤口愈合可塑性实现克隆扩张的新机制 | 发现了伤口修复过程中结构约束丧失形成迷宫状通道,以及少量但高度增殖的创始祖细胞(FPCs)驱动大规模中性克隆扩张的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类结肠炎中的适用性需要进一步验证 | 探索结肠炎中克隆扩张的细胞机制及其与癌前病变的潜在联系 | 小鼠结肠上皮细胞 | 数字病理学 | 结肠炎 | 单细胞转录组学, 三维成像, 定量命运图谱 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6439 | 2025-10-06 |
Hepatic lipid-associated macrophages mediate the beneficial effects of bariatric surgery against MASH
2023-Nov-02, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3446960/v1
PMID:37961666
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研究论文 | 本研究揭示肝脏脂质相关巨噬细胞通过TREM2介导减重手术对MASH的改善作用 | 发现垂直袖状胃切除术通过TREM2依赖的免疫调节机制改善MASH,且不依赖于体重减轻 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究减重手术改善代谢功能障碍相关脂肪性肝炎的免疫调节机制 | 肥胖和代谢综合征患者及小鼠模型 | 单细胞生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6440 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals novel genes during the remodelling of the embryonic human arterial valves
2023-Nov, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010777
PMID:38011284
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示人类胚胎动脉瓣膜重塑过程中的新基因 | 首次在人类胚胎中应用空间转录组学研究动脉瓣膜发育,发现了四个小鼠基因组中不存在且与瓣膜发育相关的新基因 | 研究样本量有限,仅分析了CS16和CS19两个胚胎阶段 | 探索人类胚胎动脉瓣膜形成和重塑的分子机制 | 人类胚胎动脉瓣膜组织 | 空间转录组学 | 先天性心脏病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | CS16和CS19两个胚胎阶段的动脉瓣膜样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |