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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6401 | 2025-10-06 |
Recruitment and Maintenance of CX3CR1+CD4+ T Cells during Helminth Infection
2024-02-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300451
PMID:38180236
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研究论文 | 本研究通过命运示踪小鼠模型和单细胞RNA测序技术,揭示了蠕虫感染期间CX3CR1+CD4+ T细胞的招募、维持机制及其异质性 | 首次系统表征蠕虫感染中CX3CR1+CD4+ T细胞的行为特征,发现BCL6对其维持的关键作用,并鉴定出脾脏中独特的BCL6+TCF-1+PD1+CD4+ T细胞亚群 | 研究局限于小鼠模型,未涉及人类样本验证 | 探究2型炎症反应中CX3CR1+CD4+ T细胞的生物学特性和维持机制 | 巴西日圆线虫和曼氏血吸虫感染的小鼠模型 | 免疫学 | 蠕虫感染 | 单细胞RNA测序,命运示踪模型,条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6402 | 2025-10-06 |
Multi-organ single-cell RNA sequencing in mice reveals early hyperglycemia responses that converge on fibroblast dysregulation
2024-02-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302003R
PMID:38305779
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研究论文 | 通过小鼠多器官单细胞RNA测序揭示高血糖早期反应中成纤维细胞失调的共性机制 | 首次在单细胞水平对1型糖尿病早期高血糖进行多器官分析,发现成纤维细胞跨器官的一致性反应模式 | 研究仅使用雄性小鼠模型,时间点局限于8周,未涵盖糖尿病后期并发症 | 解析高血糖在多器官中的早期转录反应机制 | 链脲佐菌素诱导的1型糖尿病雄性小鼠 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 67,611个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6403 | 2025-10-06 |
Preservation of scRNA-Seq Libraries Using Existing Inactivation Protocols
2024-Feb-13, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens13020167
PMID:38392905
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研究论文 | 本研究验证了在生物安全高级别实验室中使用现有核酸提取灭活方案处理单细胞RNA测序文库的可行性 | 首次系统评估了现有核酸提取灭活方案对单细胞RNA测序文库质量的影响 | 仅测试了三种灭活方案,未涵盖所有可能的灭活方法 | 解决在生物安全高级别实验室中进行单细胞RNA测序分析的技术挑战 | 单细胞RNA测序文库 | 单细胞测序 | 病毒性疾病(埃博拉病毒、马尔堡病毒、拉沙病毒等) | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6404 | 2025-10-06 |
Lack of affinity signature for germinal center cells that have initiated plasma cell differentiation
2024-02-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.12.010
PMID:38228150
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序追踪疟疾免疫后生发中心B细胞发育,发现浆细胞分化的启动是一个亲和力非依赖过程 | 首次证明生发中心内启动浆细胞分化的前体细胞与留在生发中心的细胞具有相同的估计亲和力,挑战了高亲和力细胞优先分化为浆细胞的传统观点 | 研究聚焦于特定抗原(PfCSP)的免疫反应,结果在其他抗原系统中的普适性需要进一步验证 | 探究生发中心B细胞分化为浆细胞过程中亲和力选择的作用机制 | 特异性识别疟疾环子孢子蛋白(PfCSP)的Igh B细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6405 | 2025-10-06 |
Ultrahigh frequencies of peripherally matured LGI1- and CASPR2-reactive B cells characterize the cerebrospinal fluid in autoimmune encephalitis
2024-Feb-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311049121
PMID:38319973
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析自身免疫性脑炎患者脑脊液中LGI1和CASPR2反应性B细胞的特征 | 首次在LGI1和CASPR2抗体脑炎患者脑脊液中鉴定出极高频率的克隆扩增自身抗原反应性抗体分泌细胞 | 样本量较小(仅3例患者),需要更大规模研究验证 | 探究自身免疫性脑炎患者脑脊液中B细胞受体特征及其在疾病中的作用 | LGI1和CASPR2抗体阳性的自身免疫性脑炎患者 | 免疫学 | 自身免疫性脑炎 | 单细胞RNA测序,细胞分选,单克隆抗体表达 | NA | 单细胞RNA测序数据,B细胞受体序列数据 | 3例患者,381个配对IgG B细胞受体,166个单克隆抗体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6406 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of neuroblastoma by single-cell RNA sequencing identifies the NECTIN2-TIGIT axis as a target for immunotherapy
2024-02-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.12.008
PMID:38181797
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析神经母细胞瘤,发现NECTIN2-TIGIT轴可作为免疫治疗靶点 | 首次在神经母细胞瘤中通过单细胞RNA测序鉴定NECTIN2-TIGIT作为关键免疫检查点,并证明其与PD-L1联合阻断的疗效 | 样本量相对有限(24个肿瘤),且主要在临床前模型中进行验证 | 优化神经母细胞瘤免疫治疗策略 | 高风险神经母细胞瘤患者肿瘤样本 | 单细胞测序分析 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 24个肿瘤样本(10个化疗前,14个化疗后,含5对配对样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6407 | 2025-10-06 |
Molecularly stratified hypothalamic astrocytes are cellular foci for obesity
2024-Feb-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3748581/v1
PMID:38405925
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法分析星形胶质细胞分子特征,揭示其在肥胖发生中的关键作用 | 开发基于机器学习的特征识别算法,利用已发表单细胞RNA-seq数据构建参考图谱,逐步消除多效性和诱导性细胞特征 | 研究主要聚焦于健康下丘脑区域,其他脑区星形胶质细胞异质性仍需进一步验证 | 探索星形胶质细胞分子分层及其在代谢调控中的作用机制 | 下丘脑星形胶质细胞及其与神经元的相互作用 | 机器学习 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | 特征识别算法 | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6408 | 2025-10-06 |
Rapid anti-myeloma activity by T cells expressing an anti-BCMA CAR with a human heavy-chain-only antigen-binding domain
2024-Feb-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2023.12.018
PMID:38155568
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研究论文 | 本研究开发了一种全人源抗BCMA嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法,并在复发多发性骨髓瘤患者中进行了首次人体临床试验 | 首次使用具有重链-only抗原结合域的全人源抗BCMA CAR-T细胞进行临床治疗 | 样本量较小(25例患者),抗CAR抗体反应评估不完全 | 评估新型CAR-T细胞疗法在复发多发性骨髓瘤中的安全性和有效性 | 25例复发多发性骨髓瘤患者 | 免疫治疗 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,CAR-T细胞治疗 | NA | 临床数据,实验室检测数据,单细胞RNA测序数据 | 25例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6409 | 2025-10-06 |
Single-cell insights into immune dysregulation in rheumatoid arthritis flare versus drug-free remission
2024-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45213-2
PMID:38316770
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研究论文 | 通过单细胞技术研究类风湿关节炎复发期与药物缓解期免疫失调的细胞机制 | 利用药物撤除实验同步关节炎复发过程,首次系统识别预示关节炎复发的循环免疫细胞亚群及其克隆扩增特征 | 样本规模有限,研究主要关注循环免疫细胞而未涉及关节局部免疫环境 | 解析类风湿关节炎复发过程中的免疫失调机制 | 类风湿关节炎患者的免疫细胞 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 质谱流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6410 | 2025-10-06 |
A conserved transcriptional program for MAIT cells across mammalian evolution
2024-Feb-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231487
PMID:38117256
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研究论文 | 通过跨物种单细胞RNA测序揭示了MAIT细胞在哺乳动物进化中保守的转录程序 | 首次在六个物种中系统比较MAIT细胞的发育过程,揭示了ZBTB16诱导的保守成熟机制和肠道中独特的混合表型程序 | 研究物种数量有限,未涵盖所有哺乳动物类群;功能验证实验相对不足 | 探索MAIT细胞在哺乳动物进化过程中的保守转录特征 | 六个哺乳动物物种的MAIT细胞,涵盖1.1亿年进化历程 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序,物种特异性四聚体技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 六个哺乳动物物种的MAIT细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6411 | 2025-10-06 |
Leukaemia exposure alters the transcriptional profile and function of BCR::ABL1 negative macrophages in the bone marrow niche
2024-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45471-0
PMID:38316788
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示白血病暴露改变骨髓微环境中BCR::ABL1阴性巨噬细胞的转录谱和功能 | 首次发现慢性髓系白血病微环境中存在独特的未成熟巨噬细胞亚群,并鉴定出乳铁蛋白(LTF)是抑制巨噬细胞清除功能的关键因子 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限 | 探究白血病微环境对旁观者巨噬细胞的影响机制 | 慢性髓系白血病小鼠模型和人骨髓来源巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6412 | 2025-10-06 |
Human uterine natural killer cells regulate differentiation of extravillous trophoblast early in pregnancy
2024-02-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.12.013
PMID:38237587
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研究论文 | 本研究揭示了子宫自然杀伤细胞通过细胞因子信号促进妊娠早期绒毛外滋养细胞分化的机制 | 首次通过滋养细胞类器官和单细胞转录组学技术,识别出子宫自然杀伤细胞来源的细胞因子信号在滋养细胞分化过程中的关键调控作用 | 研究主要基于体外模型,需要进一步在体验证;样本来源和数量未明确说明 | 探究子宫自然杀伤细胞如何调控滋养细胞分化和妊娠过程 | 人类滋养细胞类器官和原代组织样本 | 生殖生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞转录组测序,体外类器官模型 | 类器官模型 | 转录组数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6413 | 2025-10-06 |
Dissociation of murine oral mucosal tissues for single cell applications
2024-02, Journal of immunological methods
IF:1.6Q4
DOI:10.1016/j.jim.2023.113605
PMID:38142927
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研究论文 | 本研究优化了小鼠口腔黏膜组织解离方法,提供了三种可分离主要细胞群的不同方案 | 开发了三种针对不同细胞类型(免疫细胞、基质细胞和上皮细胞)具有偏好性回收效果的组织解离方案 | 每种解离方法都存在局限性,可能因偏好性回收特定细胞类型而产生偏差 | 优化小鼠口腔黏膜组织单细胞应用的组织解离方法 | 小鼠口腔黏膜组织 | 单细胞分析 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞数据 | NA | Miltenyi | 单细胞RNA测序 | Miltenyi全皮肤解离试剂盒 | 使用胶原酶II、胶原酶IV和Miltenyi全皮肤解离试剂盒三种酶学方法 |
6414 | 2025-10-06 |
A time- and single-cell-resolved model of murine bone marrow hematopoiesis
2024-02-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.12.001
PMID:38183977
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研究论文 | 本研究通过结合持续标记和时间序列单细胞RNA测序,构建了小鼠骨髓造血过程的实时定量模型 | 将级联单细胞表达模式与分化和生长速度的动态变化相结合,建立了首个实时、定量的体内组织动力学模型 | 基于快照测量重建动态行为可能存在推断偏差,模型在小鼠骨髓中验证但需在其他系统中进一步测试 | 构建高分辨率的组织尺度动力学模型以理解造血过程 | 小鼠骨髓造血系统 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 动力学模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6415 | 2025-10-06 |
Tracking early mammalian organogenesis - prediction and validation of differentiation trajectories at whole organism scale
2024-Feb-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201867
PMID:37982461
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序追踪小鼠早期器官发生的细胞分化轨迹 | 建立了从原肠胚形成到器官发生的高密度采样时间序列数据集,结合计算谱系重建和实验验证揭示了血液和内皮发育的新程序 | 研究时间窗口仅限于E6.5-E9.5阶段,未覆盖更晚期的发育过程 | 解析早期哺乳动物器官发生过程中的细胞分化轨迹和命运决定机制 | 小鼠胚胎(E6.5-E9.5阶段) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算谱系重建 | 单细胞转录组数据 | 超过400,000个细胞(包含新采集的300,000个细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6416 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal modulation of growth factors directs the generation of multilineage mouse embryonic stem cell-derived mammary organoids
2024-01-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.003
PMID:38159568
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研究论文 | 通过时空调控生长因子实现了小鼠胚胎干细胞向多谱系乳腺类器官的定向分化 | 首次通过BMP4和PTHrP的顺序激活及hedgehog信号抑制,将皮肤类器官模型中的间充质转化为乳腺特异性间充质 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞模型,尚未在人类细胞中验证 | 开发能够模拟乳腺发育的多谱系类器官模型 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6417 | 2025-10-06 |
In-depth transcriptomic analysis of Anopheles gambiae hemocytes uncovers novel genes and the oenocytoid developmental lineage
2024-Jan-19, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-09986-6
PMID:38243165
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研究论文 | 通过深度转录组分析揭示了冈比亚按蚊血细胞的基因表达特征和细胞发育谱系 | 发现了4020个新基因和20008个新转录本异构体,鉴定了一个新的前血细胞前体细胞类型,明确了卵血细胞来源于前血细胞的发育路径 | 血细胞仅占昆虫总细胞的极小部分,研究主要基于成年雌蚊样本 | 构建冈比亚按蚊血细胞的全面转录组图谱,研究血细胞分化和免疫功能 | 冈比亚按蚊成年雌蚊的血细胞 | 转录组学 | NA | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 伪时序分析 | Monocle 3, 单细胞分析工具 | RNA测序数据 | 基于约24亿条Illumina短读长和940万条PacBio长读长高质量序列 | Illumina, PacBio | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina测序平台, PacBio测序平台 | 短读长Illumina测序和长读长PacBio测序技术 |
6418 | 2025-10-06 |
PancrESS - a meta-analysis resource for understanding cell-type specific expression in the human pancreas
2024-Jan-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-09964-y
PMID:38238687
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研究论文 | 开发了一个用于理解人类胰腺细胞类型特异性表达的元分析资源和工具 | 整合了多个胰腺单细胞RNA测序数据集,提供了参考转录组丰度和细胞类型特异性指标的数据库,并开发了可直接处理原始计数数据的通用工具 | NA | 理解人类胰腺细胞类型特异性转录程序,促进胰腺疾病治疗方法的开发 | 人类胰腺单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序 | 元分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6419 | 2025-10-06 |
Expansion of highly interferon-responsive T cells in early-onset Alzheimer's disease
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559634
PMID:37823036
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现早发性阿尔茨海默病患者外周血中干扰素信号相关基因高表达的T细胞显著扩增 | 首次在早发性阿尔茨海默病患者中发现干扰素信号相关基因高表达的抗病毒样T细胞群显著扩增 | 样本量有限,需要进一步研究确认这些细胞在神经退行性疾病中的具体作用机制 | 探究早发性阿尔茨海默病的免疫反应特征 | 早发性阿尔茨海默病患者和临床正常对照者的外周血单核细胞及CD4 T细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 微滴数字PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 约182,000个外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6420 | 2025-10-06 |
Deciphering maternal-fetal cross-talk in the human placenta during parturition using single-cell RNA sequencing
2024-01-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adh8335
PMID:38198568
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析人类胎盘在分娩过程中母胎交流的细胞机制 | 首次建立人类胎盘单细胞图谱,揭示分娩过程中母胎细胞类型的转录组变化及细胞间通讯网络 | 研究主要关注足月分娩,对早产机制的分析仍需进一步验证 | 阐明分娩过程中母胎交流的细胞和分子机制 | 人类胎盘组织中的母体和胎儿细胞 | 单细胞组学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胎盘组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |