单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 6401 - 6420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6401 | 2024-11-17 |
Uncovering SPP1+ Macrophage, Neutrophils and Their Related Diagnostic Biomarkers in Intracranial Aneurysm and Subarachnoid Hemorrhage
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S493828
PMID:39539729
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研究论文 | 本研究通过单细胞和转录组数据分析，揭示了颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血中SPP1+巨噬细胞和嗜中性粒细胞的作用及其相关诊断生物标志物 | 首次通过单细胞测序和孟德尔随机化分析揭示了SPP1+巨噬细胞在颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血中的有害作用，并识别出CD36作为风险因素和有效的血液生物标志物 | NA | 探讨颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血的分子机制和诊断生物标志物 | 颅内动脉瘤和蛛网膜下腔出血中的巨噬细胞、嗜中性粒细胞及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞测序、转录组分析、孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞数据、转录组数据 | 从GEO数据库获取的单细胞和转录组数据，以及建立的临床队列 |
| 6402 | 2024-11-17 |
Differences in cell subsets between sun-exposed and unexposed skin: preliminary single-cell sequencing and biological analysis from a single case
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1453940
PMID:39540047
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和生物分析，比较了同一患者阳光暴露和未暴露皮肤中的细胞亚群差异 | 首次揭示了光老化皮肤中单个病例的细胞成分变化，并提供了关于细胞亚群和病理学的新见解 | 研究仅基于单一病例，结果的普遍性和代表性有待进一步验证 | 评估光老化皮肤中细胞亚群变化的生物学过程和机制 | 阳光暴露和未暴露的皮肤细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 单一病例，包括阳光暴露的前臂皮肤和未暴露的臀部皮肤 |
| 6403 | 2024-11-17 |
Identify novel therapeutic targets for type II diabetes and periodontitis: insights from single-cell analysis and Mendelian randomization analysis
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1410537
PMID:39544234
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研究论文 | 通过单细胞分析和孟德尔随机化分析，识别II型糖尿病和牙周炎的新治疗靶点 | 整合单细胞分析、孟德尔随机化分析和共定位分析，识别出II型糖尿病和牙周炎的新治疗靶点 | NA | 揭示II型糖尿病和牙周炎之间的关联，并识别新的治疗靶点 | II型糖尿病和牙周炎 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞分析、孟德尔随机化分析、共定位分析 | NA | 基因数据 | NA |
| 6404 | 2024-11-17 |
Possible involvement of Toll-like receptor 8-positive monocytes/macrophages in the pathogenesis of Sjögren's disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1480675
PMID:39544932
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研究论文 | 研究探讨了Toll样受体8阳性单核细胞/巨噬细胞在干燥综合征发病机制中的可能作用 | 首次通过单细胞RNA测序和多色免疫荧光染色技术，揭示了Toll样受体8阳性单核细胞/巨噬细胞在干燥综合征中的表达和功能 | 研究样本量较小，且仅限于干燥综合征患者，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨Toll样受体在干燥综合征发病机制中的作用 | 干燥综合征患者的唾液腺组织 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序、实时PCR、多色免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 32例实时PCR样本，19例多色免疫荧光染色样本 |
| 6405 | 2024-11-17 |
Retrospective pharmacogenetic study of psoriasis highlights the role of KLK7 in tumour necrosis factor signalling
2023-12-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad332
PMID:37672660
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研究论文 | 本研究通过回顾性药物基因组学研究，探讨了银屑病治疗中药物反应相关的潜在遗传途径 | 揭示了两个与治疗反应相关的新的遗传标记，并强调了KLK7在肿瘤坏死因子信号传导中的作用 | 研究基于回顾性数据，样本量有限，且未涵盖所有可能的治疗选项 | 利用回顾性数据进行药物基因组学研究，探索银屑病治疗中药物反应的潜在遗传途径 | 1942名银屑病患者及其治疗反应 | 药物基因组学 | 银屑病 | 线性回归分析 | NA | 基因型数据 | 1942名银屑病患者 |
| 6406 | 2024-11-17 |
Ezh2-dependent methylation in oral epithelia promotes secondary palatogenesis
2023-11-15, Birth defects research
IF:1.6Q4
DOI:10.1002/bdr2.2216
PMID:37435868
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研究论文 | 研究Ezh2依赖的甲基化在口腔上皮中对次级腭发育的影响 | 首次揭示了Ezh2在口腔上皮中的甲基化对次级腭发育的作用 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨Ezh2依赖的甲基化在次级腭发育中的上皮作用 | 小鼠胚胎的口腔上皮 | NA | NA | 单细胞RNA测序、免疫荧光、RT-qPCR | NA | RNA | 小鼠胚胎的口腔上皮样本 |
| 6407 | 2024-11-17 |
ScRNAPip: A systematic and dynamic pipeline for single-cell RNA sequencing analysis
2023-Nov, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.132
PMID:38868218
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研究论文 | 本文开发了一个可重复的计算工作流程，用于单细胞RNA测序数据分析 | 提出了一个系统化和动态的单细胞RNA测序分析管道ScRNAPip | NA | 为研究人员提供一个全面的教程，帮助他们构建和优化自己的分析管道 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用公开数据集进行演示 |
| 6408 | 2024-11-17 |
Recording morphogen signals reveals origins of gastruloid symmetry breaking
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.02.543474
PMID:37333235
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研究论文 | 研究使用合成基因电路追踪早期细胞内信号如何预测干细胞类胚体中细胞的未来前后位置 | 首次揭示了Wnt信号从均匀状态演变为极化状态的关键6小时时间窗口，并发现早期TGF信号的异质性预测了前后位置并调节Wnt信号 | NA | 探究干细胞类胚体如何打破对称性以可重复地定义单一前后轴 | 干细胞类胚体中的前后轴形成机制 | 发育生物学 | NA | 合成基因电路、单细胞RNA测序、活体成像 | NA | 信号数据、细胞位置数据 | NA |
| 6409 | 2024-11-17 |
CIMLA: Interpretable AI for inference of differential causal networks
2023-Apr-25, ArXiv
PMID:37163135
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CIMLA的新工具，用于发现条件依赖的因果关系变化，并展示了其在基因调控网络中的应用 | CIMLA工具在发现条件依赖的因果关系变化方面比现有方法更稳健和准确 | NA | 发现高维数据中的因果关系 | 基因调控网络在不同生物条件下的差异 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 特征归因模型 | 高维数据 | NA |
| 6410 | 2024-11-17 |
Integrated identification of growth pattern and taxon of bacterium in gut microbiota via confocal fluorescence imaging-oriented single-cell sequencing
2022-Sep, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.12041
PMID:38818223
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研究论文 | 本文提出了一种结合荧光探针标记、共聚焦成像和单细胞测序的综合策略，用于识别小鼠肠道微生物群中细菌的生长模式和分类 | 本文的创新点在于将荧光探针标记、共聚焦成像和单细胞测序相结合，实现了对肠道细菌生长模式和分类的集成识别 | 本文的局限性在于仅在小鼠肠道微生物群中进行了验证，尚未在其他复杂细菌系统中进行广泛应用 | 本文的研究目的是开发一种高通量的方法，用于直接研究肠道微生物群中细菌的体内活动和过程 | 本文的研究对象是小鼠肠道微生物群中的细菌 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 图像 | 小鼠肠道细菌 |
| 6411 | 2024-11-17 |
The rise of single-cell proteomics
2021-Apr, Analytical science advances
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/ansa.202000152
PMID:38716457
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研究论文 | 本文讨论了单细胞蛋白质组学的最新进展及其在生物学研究中的应用 | 本文介绍了单细胞蛋白质组学领域的最新技术进展，包括样品制备流程和质谱仪器的改进，能够从单个细胞中定量超过1000种蛋白质 | 目前单细胞蛋白质组学研究的数据通量和可靠性仍需进一步提高 | 旨在通过生成单个细胞的蛋白质表达谱，补充转录组和基因组数据，以更好地理解细胞功能和身份 | 单细胞蛋白质组学技术及其在生物学研究中的应用 | 蛋白质组学 | NA | 质谱(MS) | NA | 蛋白质表达谱 | 数千个细胞 |
| 6412 | 2024-11-17 |
Single-Cell Transcriptional Archetypes of Airway Inflammation in Cystic Fibrosis
2020-11-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202004-0991OC
PMID:32603604
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研究论文 | 本文首次对囊性纤维化患者的痰液进行了单细胞转录组分析，定义了气道免疫功能障碍的转录特征 | 首次对囊性纤维化患者的痰液进行单细胞转录组分析，并定义了基于表达的细胞功能和成熟度特征，称为转录原型 | 样本量较小，仅包括9名囊性纤维化患者和5名健康对照者 | 研究囊性纤维化患者气道免疫功能障碍的转录特征及其在疾病发病机制中的作用 | 囊性纤维化患者的痰液细胞 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 9名囊性纤维化患者和5名健康对照者的痰液细胞 |
| 6413 | 2024-11-15 |
A pancreatic cancer organoid incorporating macrophages reveals the correlation between the diversity of tumor-associated macrophages and cancer cell survival
2025-Mar, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本文通过构建包含巨噬细胞的胰腺癌类器官模型，研究了肿瘤相关巨噬细胞多样性与癌细胞存活之间的关联 | 首次在胰腺癌类器官模型中引入巨噬细胞，揭示了肿瘤相关巨噬细胞的多样性及其在血管生成和癌细胞存活中的作用 | 研究仅限于体外模型，未涉及体内实验验证 | 探讨胰腺导管腺癌微环境中巨噬细胞多样性与癌细胞存活的关系 | 胰腺导管腺癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、血管内皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包含五个肿瘤相关巨噬细胞亚群的胰腺癌类器官模型 |
| 6414 | 2024-11-15 |
Analysis of the pluripotent and germline marker gene expression, and the state of X chromosome reactivation of primordial germ cells in pig gonads
2025-Jan-01, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 研究分析了猪性腺原始生殖细胞（PGCs）的多能性和性染色体再激活状态 | 首次揭示了猪性腺PGCs的异质性，并鉴定了GDF3作为其特异性表面标记 | NA | 评估猪性腺PGCs的多能性状态、特定基因表达模式和性染色体再激活 | 猪性腺原始生殖细胞（PGCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6415 | 2024-11-15 |
Integration of transcriptomics and spatial biology analyses reveals Galactomyces ferment filtrate promotes epidermal interconnectivity via induction of keratinocyte differentiation, proliferation and cellular bioenergetics
2024-Dec, International journal of cosmetic science
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/ics.12991
PMID:38924095
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研究论文 | 研究评估了Galactomyces Ferment Filtrate（GFF）对表皮分化和氧化应激反应的影响 | 首次通过转录组学和空间生物学分析揭示了GFF促进表皮细胞间连通性，并通过诱导角质形成细胞分化、增殖和细胞生物能量来实现 | NA | 评估GFF对表皮分化和氧化应激反应的影响 | 角质形成细胞和体外皮肤组织 | NA | NA | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个供体的角质形成细胞和体外皮肤组织 |
| 6416 | 2024-11-15 |
Single-cell integrated transcriptomics reveals the role of keratinocytes in head and neck squamous cell carcinoma
2024-Dec, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-024-00842-7
PMID:38421592
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，全面分析了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞水平特征，揭示了角质形成细胞在HNSCC发展中的潜在作用 | 通过hdWGCNA共表达网络分析，识别了与HNSCC进展相关的基因模块，并构建了一个基于特定基因的预测模型，展示了其在多个数据集中的稳健预测性能 | 需要进一步研究来验证和扩展这些发现，以最终改善HNSCC患者的治疗效果 | 理解HNSCC的分子机制，识别预后标志物和治疗靶点，以提高患者治疗效果 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 多个数据集 |
| 6417 | 2024-11-15 |
Prediction of clinical prognosis and drug sensitivity in hepatocellular carcinoma through the combination of multiple cell death pathways
2024-Dec, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.12235
PMID:39192561
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研究论文 | 研究通过结合多种细胞死亡途径预测肝细胞癌的临床预后和药物敏感性 | 开发了一种基于细胞死亡指数（CDI）的预测模型，结合了多种细胞死亡途径和临床信息，用于预测肝细胞癌的预后和药物敏感性 | 研究依赖于现有数据集，可能存在数据偏差；模型在不同数据集上的验证结果可能存在差异 | 开发一种预测肝细胞癌临床预后和药物敏感性的模型 | 肝细胞癌患者的临床预后和药物敏感性 | 机器学习 | 肝癌 | 机器学习算法 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据、基因组数据和临床信息 | 使用了来自TCGA-LIHC、GSE14520、GSE45436和GSE166635数据集的数据 |
| 6418 | 2024-11-15 |
Elucidating ferroptosis mechanisms in heart failure through transcriptomics, single-cell sequencing, and experimental validation
2024-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111416
PMID:39293745
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研究论文 | 本研究通过转录组学、单细胞测序和实验验证，阐明了铁死亡在心力衰竭中的机制 | 首次通过转录组学和单细胞测序技术，识别并验证了与心力衰竭相关的铁死亡基因，揭示了这些基因在不同细胞类型中的差异表达模式 | 研究主要基于公共数据集和实验模型，需要进一步的临床验证 | 阐明铁死亡在心力衰竭中的机制，并识别潜在的治疗靶点 | 心力衰竭相关的铁死亡基因及其在不同细胞类型中的表达模式 | 基因组学 | 心血管疾病 | 转录组学、单细胞测序、LASSO回归、SVM-RFE机器学习 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 心力衰竭细胞和小鼠模型 |
| 6419 | 2024-11-15 |
SNRPB2 in the pan-cancer landscape: A bioinformatics exploration and validation in hepatocellular carcinoma
2024-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111445
PMID:39366532
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研究论文 | 本文探讨了SNRPB2在泛癌中的作用，并通过实验验证了其在肝细胞癌中的影响 | 首次系统研究了SNRPB2在多种癌症中的表达及其与预后和免疫微环境的关系，并通过实验验证了其对肝癌细胞增殖和迁移的影响 | 需要进一步研究SNRPB2的潜在机制和临床治疗潜力 | 探讨SNRPB2在癌症中的作用及其作为预后标志物和免疫治疗候选者的潜力 | SNRPB2在多种癌症中的表达及其对肝癌细胞增殖和迁移的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | 基因表达分析、基因组和表观基因组分析、基因集富集分析、免疫细胞浸润评估 | NA | 基因表达数据、基因组数据、表观基因组数据 | 来自多个公共数据库的数据，包括TCGA、CPTAC和GEO |
| 6420 | 2024-11-15 |
Identification and Verification of Key Genes in Colorectal Cancer Liver Metastases Through Analysis of Single-Cell Sequencing Data and TCGA Data
2024-Dec, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-024-16194-9
PMID:39382748
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据和TCGA数据分析，识别和验证结直肠癌肝转移中的关键基因 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据和TCGA数据结合，识别出结直肠癌肝转移中的关键基因，并进行了实验验证 | 研究主要基于现有数据库和实验验证，未涉及大规模临床试验 | 识别结直肠癌肝转移中的关键基因，为治疗提供潜在靶点 | 结直肠癌肝转移样本和相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 17个结直肠癌肝转移样本 |