单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40164 篇文献,本页显示第 6401 - 6420 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
6401 2026-03-06
Allelic variation in class I HLA determines CD8+ T cell repertoire shape and cross-reactive memory responses to SARS-CoV-2
2022-01-21, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本研究应用单细胞多组学技术,分析了四种主要HLA I类等位基因下CD8 T细胞对SARS-CoV-2的应答特征 首次统一表征了不同HLA I类等位基因如何影响CD8 T细胞对SARS-CoV-2的表位特异性、TCR多样性和记忆T细胞库的利用 仅关注了四种主要HLA I类等位基因,可能未涵盖所有遗传变异的影响 探究HLA I类等位基因变异如何塑造CD8 T细胞对SARS-CoV-2的免疫应答和记忆反应 SARS-CoV-2感染相关的CD8 T细胞 免疫学 COVID-19 单细胞多组学技术 NA 单细胞转录组和TCR序列数据 未明确指定样本数量,但涉及四种HLA I类等位基因的CD8 T细胞分析 NA 单细胞多组学 NA NA
6402 2026-03-06
IL-17 Producing Lymphocytes Cause Dry Eye and Corneal Disease With Aging in RXRα Mutant Mouse
2022, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究探讨了RXRα突变小鼠中IL-17相关机制在干眼病发展中的作用 首次通过单细胞RNA测序结合流式细胞术和共聚焦显微镜,揭示了RXRα突变导致γδ T细胞中IL-17表达增加,从而促进干眼病发展的机制 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且未探讨其他免疫细胞类型在干眼病中的潜在作用 研究RXRα突变小鼠中IL-17相关机制如何导致干眼病和角膜疾病 Pinkie小鼠(RXRα功能缺失突变)和野生型C57BL/6小鼠的角膜、结膜组织及免疫细胞 数字病理学 干眼病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、共聚焦显微镜 NA 基因表达数据、细胞表型数据 Pinkie小鼠和野生型C57BL/6小鼠的角膜和结膜组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6403 2026-03-06
A Spatial Quantitative Systems Pharmacology Platform spQSP-IO for Simulations of Tumor-Immune Interactions and Effects of Checkpoint Inhibitor Immunotherapy
2021-Jul-26, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本文介绍了一个名为spQSP-IO的混合计算模型平台,用于模拟肿瘤-免疫相互作用及检查点抑制剂免疫疗法的效果 开发了结合定量系统药理学模型和基于代理的空间模型的新平台,以整合空间数据并增强预测能力 未明确提及具体数据限制或模型验证的局限性 研究肿瘤微环境和癌症-免疫细胞相互作用在肿瘤发展中的作用,并评估抗PD-1治疗的效果 非小细胞肺癌的虚拟患者模型 机器学习 肺癌 定量系统药理学模型、基于代理的模型、空间转录组学 混合计算模型 空间数据、成像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
6404 2026-03-06
Fxr signaling and microbial metabolism of bile salts in the zebrafish intestine
2021-07, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过斑马鱼模型,揭示了胆汁盐代谢和Fxr信号通路在非哺乳类脊椎动物中的保守性及微生物修饰作用 首次在斑马鱼中系统解析了胆汁盐合成、转运及微生物修饰的全过程,并利用单细胞RNA测序构建了肠道上皮细胞图谱,明确了Fxr在回肠及其他细胞类型中的转录调控功能 研究主要基于斑马鱼模型,结果向哺乳动物的直接推演可能存在物种差异,且微生物修饰的具体机制仍需进一步探索 探究非哺乳类脊椎动物中胆汁盐代谢和Fxr信号通路的保守性与调控机制 斑马鱼的肝脏、肠道及肠道微生物 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6405 2026-03-06
Testicular germ cell tumors arise in the absence of sex-specific differentiation
2021-05-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究探讨了睾丸生殖细胞肿瘤的起源机制,发现NANOS2缺失导致生殖细胞无法进行性别特异性分化,从而驱动肿瘤发生 揭示了NANOS2作为关键内在因子,在连接遗传风险因素与肿瘤易感性中的核心作用,并首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪证明胚胎癌细胞仅来源于NANOS2缺失的生殖细胞 研究基于小鼠模型(129.MOLF-Chr19),可能不完全反映人类睾丸生殖细胞肿瘤的复杂性 探究睾丸生殖细胞肿瘤的起始机制,特别是性别特异性分化失败在肿瘤发生中的作用 小鼠睾丸生殖细胞,包括NANOS2缺失的生殖细胞和胚胎癌细胞 生殖生物学与肿瘤学 睾丸生殖细胞肿瘤 单细胞RNA测序,谱系追踪实验 NA RNA测序数据 使用129.MOLF-Chr19小鼠模型和NANOS2报告等位基因 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6406 2026-03-06
Hydro-Seq enables contamination-free high-throughput single-cell RNA-sequencing for circulating tumor cells
2019-05-15, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Hydro-Seq的可扩展流体动力学单细胞RNA测序条形码技术,用于高通量循环肿瘤细胞分析 Hydro-Seq技术具有高细胞捕获效率和污染去除能力,能够成功对21名乳腺癌患者样本中的666个CTC进行高通量单细胞RNA测序 NA 开发一种用于循环肿瘤细胞高通量单细胞RNA测序的技术,以解决CTC稀缺和血细胞大量污染的问题 循环肿瘤细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 21名乳腺癌患者样本中的666个CTC NA 单细胞RNA-seq NA NA
6407 2026-03-05
MyD88 Deficiency Protects Mice From Experimental Autoimmune Encephalomyelitis by Influencing Both Dendritic Cells and T Cells
2026-Apr, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 本研究探讨了MyD88在实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)中的作用,特别是其对树突状细胞和T细胞的影响 通过重新分析多发性硬化症(MS)患者的单细胞RNA测序数据,揭示了MYD88在DC和CD4 T细胞中的显著上调,并发现Myd88缺失会减少DC与T细胞簇的相互作用 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人类MS患者中的直接验证有限 阐明MyD88信号在MS和EAE发病机制中的具体贡献,特别是在不同细胞类型中的作用 小鼠模型(EAE)、树突状细胞(DCs)、T细胞(包括Th1和Th17细胞) NA 多发性硬化症 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6408 2026-03-05
Nafamostat Mesylate Protects Against Acute Renal Ischemia-Reperfusion Injury by Alleviating Mitochondrial Dysfunction, Inhibiting Ferroptosis, and Regulating Proximal Tubular Cells: A Multi-Omics Analysis
2026-Apr, Therapeutic apheresis and dialysis : official peer-reviewed journal of the International Society for Apheresis, the Japanese Society for Apheresis, the Japanese Society for Dialysis Therapy IF:1.5Q3
研究论文 本研究探讨了甲磺酸萘莫司他对缺血再灌注诱导的急性肾损伤的保护作用及其机制 首次通过多组学分析(包括RNA测序和单细胞测序)揭示甲磺酸萘莫司他通过调节线粒体功能、抑制铁死亡和调控近端肾小管细胞来保护肾脏 研究仅基于大鼠模型,样本量较小(21只),且未涉及长期效果或临床验证 探索甲磺酸萘莫司他在缺血再灌注诱导的急性肾损伤中的作用机制 雄性大鼠的肾脏组织 NA 急性肾损伤 RNA测序,单细胞测序,KEGG和GO富集分析 NA RNA序列数据 21只雄性大鼠 NA RNA-seq,单细胞测序 NA NA
6409 2026-03-05
Self-reinforcing IL-1b signaling accelerates the development and recurrence of TCF3::HLF-positive B-ALL
2026-Mar-03, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本文通过新建立的小鼠模型,揭示了TCF3::HLF阳性B细胞急性淋巴细胞白血病中自我强化的IL-1β信号网络是疾病进展和复发的核心驱动因素 首次发现TCF3::HLF直接结合IL1B基因座内的内含子调控元件,并利用单细胞RNA-seq证实IL1B在患者复发时显著诱导,突出了IL-1β阻断作为潜在治疗策略的临床相关性 研究主要基于小鼠模型和患者样本分析,尚未进行大规模临床试验验证IL-1β阻断疗法的有效性 探究TCF3::HLF阳性B-ALL的发病机制和潜在治疗靶点 TCF3::HLF阳性B细胞急性淋巴细胞白血病小鼠模型和患者样本 数字病理学 白血病 单细胞RNA-seq、表观遗传学分析 NA RNA-seq数据、表观遗传数据 患者样本(诊断与复发对比) NA 单细胞RNA-seq NA NA
6410 2026-03-05
SEAL: Semantic-Aware Contrastive Learning for scRNA-seq clustering
2026-Mar-03, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文提出了一种名为SEAL的语义感知对比学习方法,用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 通过随机掩蔽基因表达生成数据增强,并利用伪标签的语义信息进行对比学习,以捕获跨增强的语义不变表示,从而提高聚类性能 未明确讨论方法在高噪声或高丢失率数据下的具体局限性,也未与其他最新方法进行广泛比较 开发一种更稳定的单细胞RNA测序数据聚类方法,以准确区分不同细胞类型 单细胞RNA测序数据中的细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 对比学习 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6411 2026-03-05
Vascular bundle plasticity and cellular heterogeneity drive asymmetric carbon partitioning in maize nodes
2026-Mar-03, Journal of experimental botany IF:5.6Q1
研究论文 本研究结合组织学、荧光示踪和单细胞RNA测序,揭示了玉米基部节在异质磷供应下通过维管束可塑性和细胞异质性介导不对称碳分配的机制 首次在单细胞分辨率上揭示了玉米节点响应异质磷供应的维管束结构可塑性和细胞类型特异性转录重编程,并发现海藻糖-6-磷酸可能通过调控库强度参与此过程 研究主要关注磷异质性下的响应机制,其他养分或环境因素的交互作用尚未探讨;单细胞测序样本量相对有限 探究植物在异质养分供应下碳分配可塑性的结构和分子机制 玉米(Zea mays)基部节点组织 植物生物学/单细胞组学 NA 组织学分析、荧光示踪、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、拟时序分析 NA 组织切片图像、荧光成像数据、单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但包含异质磷供应处理的玉米节点组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6412 2026-03-05
STING Drives Psoriatic Inflammation by Promoting Neutrophil Recruitment and Facilitating NETosis
2026-Mar-03, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 本研究揭示了STING信号通路在银屑病炎症中通过促进中性粒细胞招募和NETosis来驱动疾病进程 首次明确STING在中性粒细胞介导的银屑病炎症中的双重作用:既调节细胞招募又直接驱动NETs形成 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类样本验证有限;遗传异质性可能影响结果的普适性 探究STING通路在银屑病中性粒细胞功能中的作用机制 银屑病患者组织、IMQ处理的小鼠模型(野生型、STING敲除、PADi4敲除)和HL-60细胞 数字病理学 银屑病 单细胞RNA-seq、转录组学、细胞计数和功能分析 NA RNA-seq数据、细胞功能数据 人类银屑病病变组织和外周血中性粒细胞、IMQ处理的小鼠模型、HL-60细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6413 2026-03-05
p21-Positive Senescent Stromal Cells Promote Prostate Cancer Immune Suppression and Progression That Can Be Reversed by Senolytic Therapy
2026-Mar-02, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本文研究了p21阳性衰老基质细胞在前列腺癌免疫抑制和进展中的作用,并探索了通过衰老细胞清除疗法逆转这一过程的潜力 揭示了p21阳性而非p16阳性的衰老基质细胞是驱动前列腺癌免疫抑制和进展的关键细胞群体,并首次证明靶向这些细胞可增强免疫检查点阻断疗法的效果 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,尚未在大型临床试验中得到验证 探索衰老细胞在前列腺癌进展中的作用机制,并开发新的治疗策略 前列腺癌患者样本和小鼠模型 数字病理学 前列腺癌 单细胞测序 NA 测序数据 未明确样本数量,但包括患者样本和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6414 2026-03-05
IFN signaling at the nexus of the radiotherapy response in malignant peripheral nerve sheath tumors
2026-Mar-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
评论 本文评论了一项关于I型干扰素信号通路在恶性外周神经鞘瘤放疗反应中核心作用的研究 整合功能基因组学、单细胞转录组学及人类肿瘤分析,首次揭示I型干扰素信号通路同时调控肿瘤内在放射敏感性及局部T细胞招募与激活 评论文章本身未直接开展实验,主要基于对他人研究的解读与延伸讨论 探讨恶性外周神经鞘瘤放疗反应差异的分子机制及免疫调控策略 恶性外周神经鞘瘤(MPNSTs)患者样本及肿瘤微环境 数字病理 软组织肉瘤 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6415 2026-03-05
CAD manipulates tumor intrinsic DHO/UBE4B/NF-κB pathway and fuels macrophage cross-talk, promoting HCC metastasis
2026-Mar-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究揭示了CAD通过调控DHO/UBE4B/NF-κB通路和巨噬细胞重编程促进肝细胞癌转移的机制 首次发现CAD通过调控嘧啶从头合成代谢导致DHO积累,进而结合UBE4B激活NF-κB通路促进HCC转移,并揭示了CAD通过重编程巨噬细胞创造免疫抑制微环境的新机制 研究样本量相对有限(159例),临床验证和靶向治疗的实际应用效果仍需进一步研究 阐明肝细胞癌门静脉癌栓形成和肿瘤转移的机制,并寻找临床干预的潜在靶点 肝细胞癌患者样本、肝癌细胞系、动物模型 肿瘤生物学 肝细胞癌 多组学分析、代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序、实验验证 NA 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 159例肝细胞癌患者(包括37例门静脉癌栓患者) NA 单细胞RNA测序 NA NA
6416 2026-03-05
Multi-omics approaches for identifying the PANoptosis signature and prognostic model via a multimachine-learning computational framework for intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Mar-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究通过多组学方法识别肝内胆管癌中的PANoptosis特征,并利用多机器学习计算框架构建预后模型 整合Cox回归分析和5种机器学习算法,筛选出5个关键基因,构建了PANoptosis风险评分模型,并在多中心队列中验证其预后预测和临床转化性能 研究基于公共队列和单一医院的组学数据,样本来源可能有限,且未详细说明模型的外部验证范围 表征肝内胆管癌患者的PANoptosis特征,构建指导临床诊断和治疗的模型,并探索耐药相关分子机制 肝内胆管癌患者 机器学习 肝内胆管癌 转录组学、蛋白质组学、单细胞转录组学、空间转录组学 Cox回归、机器学习算法 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 来自OEP001105公共队列和重庆医科大学第一附属医院的多组学数据,具体样本数未明确 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
6417 2026-03-05
Targeting SPP1-CD44-Hedgehog Axis Elicits Therapeutic Effects in Hepatocellular Carcinoma by Suppressing Intratumoral Fibrosis
2026-Mar, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究揭示了SPP1通过SPP1-CD44-GLI1轴促进肝细胞癌(HCC)瘤内纤维化和肿瘤进展的机制,并验证了靶向该轴的治疗潜力 首次系统性地将SPP1过表达与HCC瘤内纤维化联系起来,并阐明了其通过SPP1-CD44信号激活肝星状细胞(HSC)中Hedgehog通路(特别是GLI1)的具体分子机制 研究主要基于体外和动物模型,其临床转化效果仍需进一步的人体试验验证;SPP1作为治疗靶点的特异性及潜在副作用需更深入评估 探究HCC中瘤内纤维化的关键调控因子及其分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 肝细胞癌(HCC)组织、细胞系及小鼠异种移植模型 肿瘤生物学 肝细胞癌 转录组分析、免疫组化、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因集富集分析、差异基因表达分析、细胞共培养实验、细胞间相互作用预测分析 异种移植小鼠模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据、组织图像数据 372例HCC样本(公共数据集)、103例HCC组织、228,564个活细胞(单细胞测序) NA 单细胞RNA测序 NA NA
6418 2026-03-05
Single-cell multiomic atlas of healthy pediatric bone marrow reveals age-dependent differences in lineage differentiation driven by stromal signaling
2026-Mar, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究构建了一个健康儿童骨髓的单细胞多组学图谱,揭示了年龄依赖的谱系分化差异,由基质信号驱动 首次在单细胞水平上整合mRNA和表面蛋白表达,结合空间转录组学,系统描绘了从婴儿到青年期骨髓的年龄依赖性变化,并识别了调控谱系转换的关键淋巴祖细胞亚群和基质信号通路 样本量相对有限(9名捐赠者),年龄范围虽覆盖2-32岁,但可能未完全捕捉所有发育阶段的细微变化,且空间转录组学样本较少(6个活检) 探究儿童期造血发育的分子机制及年龄依赖性差异,以理解血液疾病的早期起源 健康人类骨髓细胞,包括造血干细胞和祖细胞(HSPC)及间充质基质细胞(MSC) 单细胞多组学 血液疾病 单细胞RNA测序,表面蛋白表达分析,空间转录组学 NA 单细胞mRNA和蛋白质表达数据,空间转录组数据 90,710个细胞,来自9名年龄在2-32岁的捐赠者,以及6个骨髓活检样本(0-23岁) NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
6419 2026-03-05
Resveratrol as a Novel YAP Inhibitor Targeting Glioblastoma Progression and Sensitizing to Chemotherapy
2026-Mar, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过分析单细胞RNA测序数据,发现YAP在胶质母细胞瘤中高表达,并证实白藜芦醇可作为新型YAP抑制剂,抑制肿瘤进展并增强化疗敏感性 首次发现天然化合物白藜芦醇可作为YAP抑制剂,并证实其能通过抑制YAP表达来抑制胶质母细胞瘤的恶性表型并增强对替莫唑胺和卡莫司汀的化疗敏感性 研究主要在体外细胞模型中进行,缺乏体内实验验证,临床转化需要进一步的动物模型研究 探究YAP在胶质母细胞瘤中的作用,并评估白藜芦醇作为YAP抑制剂对肿瘤进展和化疗敏感性的影响 胶质母细胞瘤细胞系(U-251 MG, U-87 MG)和患者来源的胶质母细胞瘤细胞 肿瘤生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,shRNA基因沉默,功能测定(增殖、球体形成、迁移、侵袭、药物敏感性) NA 单细胞RNA测序数据 未明确具体样本数量,使用了已发表的胶质母细胞瘤数据集、两种细胞系和患者来源细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6420 2026-03-05
Decoding the Mechanisms of Hepatocellular Carcinoma Cancer Stem Cells and Identifying Potential Therapeutic Strategies Based on Single-cell Omics
2026 Mar-Apr, Cancer genomics & proteomics IF:2.6Q3
研究论文 本研究利用单细胞组学和空间转录组学数据,系统解析了肝细胞癌中癌症干细胞的异质性、空间分布、分子特征及调控网络,并构建了预后模型和预测了潜在治疗化合物 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,首次在单细胞分辨率下全面描绘了肝细胞癌中癌症干细胞的空间生态位、调控程序和临床相关性,并基于此识别了新的预后生物标志物和候选治疗药物 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏独立的实验验证和体内外功能验证来确认预测化合物的疗效 系统表征肝细胞癌相关的癌症干细胞,识别预后生物标志物和潜在治疗策略 肝细胞癌中的癌症干细胞 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 Harmony, UMAP, Louvain聚类, SCENIC, GSVA, Monocle, CytoTRACE2, CellChat 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 数据来源于HCCDB v2.0数据库,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
回到顶部