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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6381 | 2025-10-06 |
A human neural crest model reveals the developmental impact of neuroblastoma-associated chromosomal aberrations
2024-May-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47945-7
PMID:38702304
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研究论文 | 通过人类胚胎干细胞分化模型研究神经母细胞瘤相关染色体畸变对神经嵴发育的影响 | 首次建立人类神经嵴发育模型,揭示染色体17q/1q增益与MYCN过表达协同破坏神经嵴细胞分化的机制 | 研究基于体外干细胞分化模型,可能与体内真实发育环境存在差异 | 探究染色体拷贝数变异在胚胎性肿瘤发生中的作用机制 | 人类胚胎干细胞分化的神经嵴细胞及其交感肾上腺衍生物 | 发育生物学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序, 单细胞表观基因组分析 | 人类胚胎干细胞分化模型 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞表观基因组学 | NA | NA |
6382 | 2025-10-06 |
Spatial Biology of Breast Cancer
2024-05-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041335
PMID:38110242
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综述 | 探讨空间生物学方法在乳腺癌研究中的应用与进展 | 整合传统空间方法与新兴多重成像技术,揭示空间关系对癌症进展和治疗的影响 | NA | 总结空间方法在乳腺癌研究中的贡献并展望未来研究方向 | 乳腺癌 | 空间生物学 | 乳腺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 多重成像技术 | NA | 空间分子数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
6383 | 2025-10-06 |
The p21+ perinecrotic hepatocytes produce the chemokine CXCL14 after a severe acetaminophen overdose promoting hepatocyte injury and delaying regeneration
2024-05, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2024.153804
PMID:38614205
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研究论文 | 本研究揭示了在对乙酰氨基酚严重过量后,p21+坏死周围肝细胞通过产生趋化因子CXCL14加剧肝细胞损伤并延迟再生 | 首次发现p21+肝细胞亚群通过分泌CXCL14直接阻碍肝脏恢复,而非传统认为的衰老细胞清除机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探索严重对乙酰氨基酚过量后肝脏修复障碍的机制 | 小鼠模型和人类APAP explant肝脏样本 | 分子病理学 | 急性肝衰竭 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 人类肝脏样本和雌雄小鼠模型 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
6384 | 2025-10-06 |
De novo detection of somatic mutations in high-throughput single-cell profiling data sets
2024-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01863-z
PMID:37414936
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研究论文 | 开发了一种名为SComatic的算法,用于直接从单细胞转录组和ATAC-seq数据中检测体细胞突变 | 无需匹配的bulk或单细胞DNA测序数据即可直接检测体细胞突变,能够检测多克隆组织中分化细胞的突变 | 未明确说明算法在特定突变类型或低质量数据上的性能限制 | 开发单细胞水平体细胞突变检测方法,用于研究癌症进化、克隆镶嵌和细胞可塑性 | 688个单细胞RNA-seq和单细胞ATAC-seq数据集中的超过260万个单细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 统计算法 | 单细胞测序数据 | 超过260万个单细胞,来自688个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
6385 | 2025-10-06 |
Blimp-1 and c-Maf regulate immune gene networks to protect against distinct pathways of pathobiont-induced colitis
2024-May, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01814-z
PMID:38609547
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了转录因子Blimp-1和c-Maf在调节肠道免疫反应中的关键作用 | 首次发现Blimp-1和c-Maf共同主导调节Il10表达,同时负调控促炎细胞因子,并揭示其在保护免受不同病原体诱导结肠炎途径中的特异性作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类疾病相关性仍需进一步验证 | 探究转录因子Blimp-1和c-Maf在肠道免疫调节中的作用机制 | 结肠固有层白细胞和纯化的CD4 T细胞 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,RNA-seq,ATAC-seq | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | 多种基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,ATAC-seq | NA | NA |
6386 | 2025-10-06 |
Single-cell analyses reveal transient retinal progenitor cells in the ciliary margin of developing human retina
2024-Apr-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47933-x
PMID:38670973
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示人类视网膜发育过程中睫状缘区存在短暂性视网膜祖细胞 | 首次在人类视网膜发育过程中发现睫状缘区存在短暂性早期视网膜祖细胞,并揭示其随时间递减的出现规律 | 研究仅涵盖人类视网膜发育至妊娠中期的过程 | 研究人类视网膜发育过程中视网膜祖细胞的规范和分化机制 | 人类发育期视网膜组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,染色质可及性数据,空间转录组数据 | 人类发育期视网膜样本(涵盖至妊娠中期) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
6387 | 2025-10-06 |
Adult Human, but Not Rodent, Spermatogonial Stem Cells Retain States with a Foetal-like Signature
2024-04-24, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13090742
PMID:38727278
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了人类与啮齿类动物精原干细胞在发育过程中的转录组差异 | 发现人类成年精原干细胞保留具有胎儿样特征的0B状态,而啮齿类动物则不会在成年期维持此状态 | 研究主要基于转录组数据分析,需要进一步的功能实验验证 | 比较不同物种精原干细胞的发育轨迹和转录状态 | 人类、绵羊、猪、水牛、猕猴、大鼠和小鼠的睾丸生殖细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 34个成年人类睾丸样本,28个胎儿和青春期前样本,以及多个其他物种样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6388 | 2025-10-06 |
Deciphering the spatiotemporal transcriptional and chromatin accessibility of human retinal organoid development at the single-cell level
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109397
PMID:38510120
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,首次绘制了人类视网膜类器官发育的单细胞时空转录组图谱 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统解析人类视网膜类器官发育的时空转录组特征,并揭示染色质可及性与转录因子结合模式的动态变化 | 研究基于体外培养的视网膜类器官模型,与真实人类视网膜发育过程可能存在时间出现和细胞丰度方面的差异 | 解析人类视网膜发育早期的分子机制 | 人多能干细胞来源的视网膜类器官 | 空间转录组学 | 视网膜发育疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
6389 | 2025-10-06 |
Cell-type-specific mRNA transcription and degradation kinetics in zebrafish embryogenesis from metabolically labeled single-cell RNA-seq
2024-Apr-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47290-9
PMID:38600066
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和代谢标记技术,定量分析斑马鱼胚胎发育过程中不同细胞类型的mRNA转录和降解动力学 | 首次在具有多样细胞身份的胚胎中系统解析mRNA转录和降解对基因表达谱形成的相对贡献,开发了量化单个细胞类型中mRNA转录和降解速率的动力学模型 | 研究局限于斑马鱼胚胎发育早期阶段,尚未扩展到更多发育时期或其他生物系统 | 系统解析胚胎发育过程中mRNA转录和降解动力学对细胞特化的调控机制 | 斑马鱼胚胎发育过程中的不同细胞类型,特别是原始生殖细胞和包被层细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢标记 | 动力学模型 | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6390 | 2025-10-06 |
Inhibition of ATR opposes glioblastoma invasion through disruption of cytoskeletal networks and integrin internalization via macropinocytosis
2024-04-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad210
PMID:37936324
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研究论文 | 本研究揭示了抑制ATR激酶可通过破坏细胞骨架网络和整合素内存作用来抑制胶质母细胞瘤的侵袭 | 首次发现ATR在胶质母细胞瘤侵袭中的新作用机制,涉及细胞骨架调控和巨胞饮介导的整合素内存 | 研究主要基于临床前模型,尚未进行临床试验验证 | 探索ATR抑制对胶质母细胞瘤侵袭的抑制作用及其分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 延时显微镜、超高分辨率成像、活体成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 两种原位胶质母细胞瘤模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
6391 | 2025-10-06 |
Immune microniches shape intestinal Treg function
2024-Apr, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07251-0
PMID:38570678
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研究论文 | 本研究通过活体成像和空间转录组学技术揭示了肠道免疫微环境如何塑造调节性T细胞功能 | 首次结合活体成像、光激活引导的单细胞RNA测序和空间转录组学技术,追踪肠道内微生物反应性T细胞在耐受和炎症状态下的时空动态 | 研究主要聚焦于Helicobacter hepaticus反应性T细胞,可能不适用于所有肠道微生物群 | 阐明肠道免疫微环境如何维持对共生微生物的耐受性机制 | 肠道调节性T细胞和效应T细胞 | 免疫学 | 炎症性肠道疾病 | 活体成像, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
6392 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas enables mapping of homeostatic cellular shifts in the adult human breast
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01688-9
PMID:38548988
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建了包含55名捐赠者的人类乳腺细胞图谱,揭示了乳腺组织稳态的细胞变化 | 首次系统性地绘制了成人乳腺单细胞图谱,发现BRCA1/2携带者的免疫细胞具有独特的基因表达特征 | 样本主要来自整形手术和风险降低乳房切除术患者,可能无法完全代表普通人群 | 构建人类乳腺细胞图谱并研究影响乳腺癌风险的细胞稳态变化 | 55名接受乳房缩小术或风险降低乳房切除术的捐赠者的乳腺组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫组织化学数据 | 55名捐赠者,超过800,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6393 | 2025-10-06 |
A Multimodal Omics Framework to Empower Target Discovery for Cardiovascular Regeneration
2024-Apr, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07484-7
PMID:37421484
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综述 | 提出一个多物种多组学整合分析框架,用于推动心血管再生治疗靶点的发现 | 首次提出结合多物种、多组学和荟萃分析的系统性框架来识别心血管再生靶点 | NA | 开发促进心血管再生的新策略靶点 | 健康和损伤心脏的多物种样本(不同发育阶段) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
6394 | 2025-10-06 |
Gsα Regulates Macrophage Foam Cell Formation During Atherosclerosis
2024-Mar-29, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323156
PMID:38375634
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研究论文 | 本研究揭示了Gsα在动脉粥样硬化中通过调控巨噬细胞泡沫细胞形成的作用机制 | 首次发现Gsα在动脉粥样硬化斑块巨噬细胞中表达上调,并阐明了其通过cAMP-CREB信号通路促进CD36和SR-A1表达,从而增强脂质摄取和泡沫细胞形成的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步开展 | 探究Gsα在动脉粥样硬化发生发展中的具体作用机制 | 巨噬细胞、小鼠动脉粥样硬化模型、人类动脉粥样硬化斑块样本 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫荧光、cAMP检测、骨髓移植、染色质免疫沉淀、荧光素酶报告基因检测 | 巨噬细胞特异性Gsα敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞功能数据 | 小鼠模型和人类斑块样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
6395 | 2025-10-06 |
A transcription factor atlas of stem cell fate in planarians
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113843
PMID:38401119
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统绘制了涡虫干细胞命运选择的转录因子图谱 | 首次系统性地绘制了完整成年生物体中大多数细胞类型的干细胞命运及其相关转录因子表达特征图谱 | NA | 揭示涡虫干细胞命运选择的调控机制 | 地中海涡虫(Schmidtea mediterranea)的干细胞(neoblasts)及其有丝分裂后子代细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6396 | 2025-10-06 |
CD38-RyR2 axis-mediated signaling impedes CD8+ T cell response to anti-PD1 therapy in cancer
2024-Mar-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2315989121
PMID:38451948
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研究论文 | 本研究揭示了CD38-RyR2信号轴通过调控钙离子水平和AKT活性导致CD8+ T细胞终末耗竭,从而阻碍抗PD1疗法效果的分子机制 | 首次发现CD38通过激活RyR2钙通道升高细胞内钙水平,诱导慢性AKT活化并抑制TCF1表达,从而驱动CD8+ T细胞终末耗竭的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类临床试验中验证 | 探究CD8+ T细胞对抗PD1疗法产生抵抗的分子机制 | CD8+ T细胞,特别是肿瘤内和体外慢性刺激的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6397 | 2025-10-06 |
JAK/STAT3 represents a therapeutic target for colorectal cancer patients with stromal-rich tumors
2024-Mar-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02958-4
PMID:38424636
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研究论文 | 本研究探讨JAK/STAT3信号通路在结直肠癌中的治疗潜力,特别是在富含基质的肿瘤中 | 首次系统评估JAK抑制剂在不同结直肠癌模型中的疗效,并通过空间转录组学揭示JAK/STAT3信号异常与肿瘤微环境的空间依赖性基因表达关系 | 研究主要基于临床前模型和回顾性队列,需要前瞻性临床试验验证 | 评估JAK/STAT3抑制在结直肠癌中的治疗效果并确定其预后价值 | 结直肠癌细胞系、小鼠模型类器官、患者来源类器官和三个独立CRC患者队列 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学染色、突变分析、bulk RNA测序、空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据、空间转录组数据 | 三个独立CRC患者队列(包括TransSCOT临床试验队列) | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | NanoString GeoMx空间转录组学平台 |
6398 | 2025-10-06 |
Deep-qGFP: A Generalist Deep Learning Assisted Pipeline for Accurate Quantification of Green Fluorescent Protein Labeled Biological Samples in Microreactors
2024-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301293
PMID:38010980
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研究论文 | 提出一种深度学习辅助的自动化流程Deep-qGFP,用于精确量化绿色荧光蛋白标记的微反应器 | 首个无需迁移学习或重新训练即可应用于多种数字PCR和单细胞测序平台的一体化图像分析算法 | NA | 开发自动化GFP标记生物样本的绝对定量方法 | GFP标记的微反应器(液滴式、微孔式、琼脂糖式) | 计算机视觉 | NA | 荧光显微镜成像 | 深度学习 | 图像 | 10张图像中的2000多个微反应器 | NA | 数字PCR, 单细胞测序 | NA | 液滴数字PCR, 微孔数字PCR, 琼脂糖数字PCR, 液滴单细胞测序 |
6399 | 2025-10-06 |
CFTR expression in human salivary gland acinar cells
2024-03-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00549.2023
PMID:38284125
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研究论文 | 本研究通过免疫定位和单细胞RNA测序分析证实CFTR在人类唾液腺腺泡细胞中的表达 | 首次在人类唾液腺腺泡细胞中发现功能性CFTR表达,挑战了CFTR仅存在于导管细胞的传统模型 | 研究样本量有限,仅针对颌下腺和腮腺进行研究 | 探究CFTR在人类唾液腺组织中的表达模式和功能 | 人类颌下腺和腮腺组织 | 分子生物学 | 囊性纤维化 | 免疫定位,单细胞RNA测序,胶原酶消化,电生理记录 | NA | 基因表达数据,蛋白质定位数据,电生理数据 | 人类颌下腺和腮腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6400 | 2025-10-06 |
Oscillatory differentiation dynamics fundamentally restricts the resolution of pseudotime reconstruction algorithms
2024-03, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2023.0537
PMID:38503342
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研究论文 | 本文从理论上证明细胞分化过程中的振荡动态对伪时间重建算法的分辨率存在固有约束 | 首次揭示振荡性分化动态对轨迹重建质量的内在限制,即使在理想无噪声数据条件下 | 理论研究,尚未进行实验验证 | 探讨细胞分化轨迹重建算法的理论限制 | 细胞分化过程和伪时间重建算法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |