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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6381 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas enables mapping of homeostatic cellular shifts in the adult human breast
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01688-9
PMID:38548988
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建了包含55名捐赠者的人类乳腺细胞图谱,揭示了乳腺组织稳态的细胞变化 | 首次系统性地绘制了成人乳腺单细胞图谱,发现BRCA1/2携带者的免疫细胞具有独特的基因表达特征 | 样本主要来自整形手术和风险降低乳房切除术患者,可能无法完全代表普通人群 | 构建人类乳腺细胞图谱并研究影响乳腺癌风险的细胞稳态变化 | 55名接受乳房缩小术或风险降低乳房切除术的捐赠者的乳腺组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫组织化学数据 | 55名捐赠者,超过800,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6382 | 2025-10-06 |
A Multimodal Omics Framework to Empower Target Discovery for Cardiovascular Regeneration
2024-Apr, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07484-7
PMID:37421484
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综述 | 提出一个多物种多组学整合分析框架,用于推动心血管再生治疗靶点的发现 | 首次提出结合多物种、多组学和荟萃分析的系统性框架来识别心血管再生靶点 | NA | 开发促进心血管再生的新策略靶点 | 健康和损伤心脏的多物种样本(不同发育阶段) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
6383 | 2025-10-06 |
Gsα Regulates Macrophage Foam Cell Formation During Atherosclerosis
2024-Mar-29, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323156
PMID:38375634
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研究论文 | 本研究揭示了Gsα在动脉粥样硬化中通过调控巨噬细胞泡沫细胞形成的作用机制 | 首次发现Gsα在动脉粥样硬化斑块巨噬细胞中表达上调,并阐明了其通过cAMP-CREB信号通路促进CD36和SR-A1表达,从而增强脂质摄取和泡沫细胞形成的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步开展 | 探究Gsα在动脉粥样硬化发生发展中的具体作用机制 | 巨噬细胞、小鼠动脉粥样硬化模型、人类动脉粥样硬化斑块样本 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫荧光、cAMP检测、骨髓移植、染色质免疫沉淀、荧光素酶报告基因检测 | 巨噬细胞特异性Gsα敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞功能数据 | 小鼠模型和人类斑块样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
6384 | 2025-10-06 |
A transcription factor atlas of stem cell fate in planarians
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113843
PMID:38401119
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统绘制了涡虫干细胞命运选择的转录因子图谱 | 首次系统性地绘制了完整成年生物体中大多数细胞类型的干细胞命运及其相关转录因子表达特征图谱 | NA | 揭示涡虫干细胞命运选择的调控机制 | 地中海涡虫(Schmidtea mediterranea)的干细胞(neoblasts)及其有丝分裂后子代细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6385 | 2025-10-06 |
CD38-RyR2 axis-mediated signaling impedes CD8+ T cell response to anti-PD1 therapy in cancer
2024-Mar-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2315989121
PMID:38451948
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研究论文 | 本研究揭示了CD38-RyR2信号轴通过调控钙离子水平和AKT活性导致CD8+ T细胞终末耗竭,从而阻碍抗PD1疗法效果的分子机制 | 首次发现CD38通过激活RyR2钙通道升高细胞内钙水平,诱导慢性AKT活化并抑制TCF1表达,从而驱动CD8+ T细胞终末耗竭的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类临床试验中验证 | 探究CD8+ T细胞对抗PD1疗法产生抵抗的分子机制 | CD8+ T细胞,特别是肿瘤内和体外慢性刺激的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6386 | 2025-10-06 |
JAK/STAT3 represents a therapeutic target for colorectal cancer patients with stromal-rich tumors
2024-Mar-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02958-4
PMID:38424636
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研究论文 | 本研究探讨JAK/STAT3信号通路在结直肠癌中的治疗潜力,特别是在富含基质的肿瘤中 | 首次系统评估JAK抑制剂在不同结直肠癌模型中的疗效,并通过空间转录组学揭示JAK/STAT3信号异常与肿瘤微环境的空间依赖性基因表达关系 | 研究主要基于临床前模型和回顾性队列,需要前瞻性临床试验验证 | 评估JAK/STAT3抑制在结直肠癌中的治疗效果并确定其预后价值 | 结直肠癌细胞系、小鼠模型类器官、患者来源类器官和三个独立CRC患者队列 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学染色、突变分析、bulk RNA测序、空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据、空间转录组数据 | 三个独立CRC患者队列(包括TransSCOT临床试验队列) | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | NanoString GeoMx空间转录组学平台 |
6387 | 2025-10-06 |
Deep-qGFP: A Generalist Deep Learning Assisted Pipeline for Accurate Quantification of Green Fluorescent Protein Labeled Biological Samples in Microreactors
2024-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301293
PMID:38010980
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研究论文 | 提出一种深度学习辅助的自动化流程Deep-qGFP,用于精确量化绿色荧光蛋白标记的微反应器 | 首个无需迁移学习或重新训练即可应用于多种数字PCR和单细胞测序平台的一体化图像分析算法 | NA | 开发自动化GFP标记生物样本的绝对定量方法 | GFP标记的微反应器(液滴式、微孔式、琼脂糖式) | 计算机视觉 | NA | 荧光显微镜成像 | 深度学习 | 图像 | 10张图像中的2000多个微反应器 | NA | 数字PCR, 单细胞测序 | NA | 液滴数字PCR, 微孔数字PCR, 琼脂糖数字PCR, 液滴单细胞测序 |
6388 | 2025-10-06 |
CFTR expression in human salivary gland acinar cells
2024-03-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00549.2023
PMID:38284125
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研究论文 | 本研究通过免疫定位和单细胞RNA测序分析证实CFTR在人类唾液腺腺泡细胞中的表达 | 首次在人类唾液腺腺泡细胞中发现功能性CFTR表达,挑战了CFTR仅存在于导管细胞的传统模型 | 研究样本量有限,仅针对颌下腺和腮腺进行研究 | 探究CFTR在人类唾液腺组织中的表达模式和功能 | 人类颌下腺和腮腺组织 | 分子生物学 | 囊性纤维化 | 免疫定位,单细胞RNA测序,胶原酶消化,电生理记录 | NA | 基因表达数据,蛋白质定位数据,电生理数据 | 人类颌下腺和腮腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6389 | 2025-10-06 |
Oscillatory differentiation dynamics fundamentally restricts the resolution of pseudotime reconstruction algorithms
2024-03, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2023.0537
PMID:38503342
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研究论文 | 本文从理论上证明细胞分化过程中的振荡动态对伪时间重建算法的分辨率存在固有约束 | 首次揭示振荡性分化动态对轨迹重建质量的内在限制,即使在理想无噪声数据条件下 | 理论研究,尚未进行实验验证 | 探讨细胞分化轨迹重建算法的理论限制 | 细胞分化过程和伪时间重建算法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
6390 | 2025-10-06 |
Adipose tissue macrophage dysfunction is associated with a breach of vascular integrity in NASH
2024-03, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.10.039
PMID:37977244
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了非酒精性脂肪肝病中脂肪组织巨噬细胞亚群的异质性及其与血管完整性破坏的关联 | 首次在人类内脏脂肪组织中描述了骨髓细胞景观,发现了非酒精性脂肪性肝炎特异性的巨噬细胞转录变化 | 样本量相对有限,机制研究仍需进一步验证 | 评估非酒精性脂肪肝病队列中脂肪组织巨噬细胞的异质性 | 瘦型和肥胖患者的内脏脂肪组织巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,免疫荧光 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 包含瘦型和肥胖患者的队列(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6391 | 2025-10-06 |
Characterizing Neutrophil Subtypes in Cancer Using scRNA Sequencing Demonstrates the Importance of IL1β/CXCR2 Axis in Generation of Metastasis-specific Neutrophils
2024-02-29, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0319
PMID:38358352
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序表征癌症中的中性粒细胞亚型,发现IL1β/CXCR2轴在生成转移特异性中性粒细胞中的重要作用 | 首次系统比较健康和恶性肿瘤中中性粒细胞的转录状态,发现转移性结直肠癌中中性粒细胞具有更高异质性,并证实IL1β/CXCL8/CXCR2轴在中性粒细胞从健康状态向癌症和转移进展中的关键作用 | 研究主要基于转录组数据分析,需要更多功能实验验证 | 研究中性粒细胞在健康和恶性肿瘤中的转录亚型及其发育谱系 | 人类和小鼠的中性粒细胞,重点关注肺癌、乳腺癌和结直肠癌 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 伪时序分析 | 单细胞转录组数据 | 整合公开和独立生成的人类和小鼠数据集,涵盖肺癌、乳腺癌和结直肠癌 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6392 | 2025-10-06 |
Molecular portraits of patients with intrahepatic cholangiocarcinoma who diverge as rapid progressors or long survivors on chemotherapy
2024-02-23, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-330748
PMID:37758326
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研究论文 | 本研究通过分子特征分析预测肝内胆管癌患者对化疗的响应差异 | 首次发现基于肿瘤-髓系细胞动态变化的转录组特征可预测化疗疗效差异 | 需要进一步验证和开发该转录组特征 | 预测肝内胆管癌患者化疗疗效并阐明先天化疗耐药分子机制 | 晚期肝内胆管癌患者(快速进展者和长期生存者) | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 全转录组分析、空间转录组学、数字空间分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | 极端化疗反应差异患者队列 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序,全转录组分析 | GeoMx | 靶向数字空间分析平台 |
6393 | 2025-10-06 |
Immunosuppressive CD29+ Treg accumulation in the liver in mice on checkpoint inhibitor therapy
2024-02-23, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-330024
PMID:37770128
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序揭示了小鼠肝脏中CD29+调节性T细胞在免疫检查点抑制剂治疗中的独特反应机制 | 首次发现肝脏特异性CD29+Treg亚群在免疫检查点抑制剂治疗后显著扩增并介导治疗抵抗 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性尚待验证 | 探究肝脏调节性T细胞在免疫检查点抑制剂治疗抵抗中的作用机制 | 小鼠肝脏调节性T细胞 | 免疫学 | 肝癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6394 | 2025-10-06 |
Immunotherapy-resistant acute lymphoblastic leukemia cells exhibit reduced CD19 and CD22 expression and BTK pathway dependency
2024-Feb-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175199
PMID:38376944
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研究论文 | 本研究通过体外模型揭示了急性淋巴细胞白血病对CD19免疫疗法产生耐药性的机制 | 首次发现CD19免疫疗法耐药细胞同时出现CD19和CD22表达降低,并表现出对BTK通路的依赖性 | 研究主要基于体外模型,需要更多临床样本验证 | 探究B细胞恶性肿瘤对CD19免疫疗法产生耐药性的分子机制 | 急性淋巴细胞白血病细胞系和患者样本 | 肿瘤免疫学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 质谱流式细胞术 | 体外耐药模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 蛋白质表达数据 | 白血病细胞系和儿科及年轻成人B-ALL患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | NA |
6395 | 2025-10-06 |
Diverse macrophage populations contribute to distinct manifestations of human cutaneous graft-versus-host disease
2024-02-16, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad402
PMID:38010706
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重组织免疫荧光技术,揭示了不同巨噬细胞群体在人类皮肤移植物抗宿主病不同临床表现中的重要作用 | 首次在性别不匹配移植病例中利用X连锁基因表达追踪供体来源MNPs的组织适应性,并发现急性和慢性皮肤GvHD中巨噬细胞极化状态的显著差异 | 样本量相对有限(36例患者),且主要关注皮肤病变,未涉及其他器官的GvHD表现 | 表征急性皮肤移植物抗宿主病患者中单核吞噬细胞的特性、来源和功能 | 36例急性皮肤移植物抗宿主病患者的皮肤和血液样本 | 单细胞生物学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序,多重组织免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,组织影像数据 | 36例急性皮肤GvHD患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6396 | 2025-10-06 |
Recruitment and Maintenance of CX3CR1+CD4+ T Cells during Helminth Infection
2024-02-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300451
PMID:38180236
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研究论文 | 本研究通过命运示踪小鼠模型和单细胞RNA测序技术,揭示了蠕虫感染期间CX3CR1+CD4+ T细胞的招募、维持机制及其异质性 | 首次系统表征蠕虫感染中CX3CR1+CD4+ T细胞的行为特征,发现BCL6对其维持的关键作用,并鉴定出脾脏中独特的BCL6+TCF-1+PD1+CD4+ T细胞亚群 | 研究局限于小鼠模型,未涉及人类样本验证 | 探究2型炎症反应中CX3CR1+CD4+ T细胞的生物学特性和维持机制 | 巴西日圆线虫和曼氏血吸虫感染的小鼠模型 | 免疫学 | 蠕虫感染 | 单细胞RNA测序,命运示踪模型,条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6397 | 2025-10-06 |
Multi-organ single-cell RNA sequencing in mice reveals early hyperglycemia responses that converge on fibroblast dysregulation
2024-02-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302003R
PMID:38305779
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研究论文 | 通过小鼠多器官单细胞RNA测序揭示高血糖早期反应中成纤维细胞失调的共性机制 | 首次在单细胞水平对1型糖尿病早期高血糖进行多器官分析,发现成纤维细胞跨器官的一致性反应模式 | 研究仅使用雄性小鼠模型,时间点局限于8周,未涵盖糖尿病后期并发症 | 解析高血糖在多器官中的早期转录反应机制 | 链脲佐菌素诱导的1型糖尿病雄性小鼠 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 67,611个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6398 | 2025-10-06 |
Preservation of scRNA-Seq Libraries Using Existing Inactivation Protocols
2024-Feb-13, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens13020167
PMID:38392905
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研究论文 | 本研究验证了在生物安全高级别实验室中使用现有核酸提取灭活方案处理单细胞RNA测序文库的可行性 | 首次系统评估了现有核酸提取灭活方案对单细胞RNA测序文库质量的影响 | 仅测试了三种灭活方案,未涵盖所有可能的灭活方法 | 解决在生物安全高级别实验室中进行单细胞RNA测序分析的技术挑战 | 单细胞RNA测序文库 | 单细胞测序 | 病毒性疾病(埃博拉病毒、马尔堡病毒、拉沙病毒等) | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6399 | 2025-10-06 |
Lack of affinity signature for germinal center cells that have initiated plasma cell differentiation
2024-02-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.12.010
PMID:38228150
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序追踪疟疾免疫后生发中心B细胞发育,发现浆细胞分化的启动是一个亲和力非依赖过程 | 首次证明生发中心内启动浆细胞分化的前体细胞与留在生发中心的细胞具有相同的估计亲和力,挑战了高亲和力细胞优先分化为浆细胞的传统观点 | 研究聚焦于特定抗原(PfCSP)的免疫反应,结果在其他抗原系统中的普适性需要进一步验证 | 探究生发中心B细胞分化为浆细胞过程中亲和力选择的作用机制 | 特异性识别疟疾环子孢子蛋白(PfCSP)的Igh B细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6400 | 2025-10-06 |
Ultrahigh frequencies of peripherally matured LGI1- and CASPR2-reactive B cells characterize the cerebrospinal fluid in autoimmune encephalitis
2024-Feb-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311049121
PMID:38319973
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析自身免疫性脑炎患者脑脊液中LGI1和CASPR2反应性B细胞的特征 | 首次在LGI1和CASPR2抗体脑炎患者脑脊液中鉴定出极高频率的克隆扩增自身抗原反应性抗体分泌细胞 | 样本量较小(仅3例患者),需要更大规模研究验证 | 探究自身免疫性脑炎患者脑脊液中B细胞受体特征及其在疾病中的作用 | LGI1和CASPR2抗体阳性的自身免疫性脑炎患者 | 免疫学 | 自身免疫性脑炎 | 单细胞RNA测序,细胞分选,单克隆抗体表达 | NA | 单细胞RNA测序数据,B细胞受体序列数据 | 3例患者,381个配对IgG B细胞受体,166个单克隆抗体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |