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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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6381 | 2025-10-06 |
Adult Human, but Not Rodent, Spermatogonial Stem Cells Retain States with a Foetal-like Signature
2024-04-24, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13090742
PMID:38727278
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了人类与啮齿类动物精原干细胞在发育过程中的转录组差异 | 发现人类成年精原干细胞保留具有胎儿样特征的0B状态,而啮齿类动物则不会在成年期维持此状态 | 研究主要基于转录组数据分析,需要进一步的功能实验验证 | 比较不同物种精原干细胞的发育轨迹和转录状态 | 人类、绵羊、猪、水牛、猕猴、大鼠和小鼠的睾丸生殖细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 34个成年人类睾丸样本,28个胎儿和青春期前样本,以及多个其他物种样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6382 | 2025-10-06 |
Deciphering the spatiotemporal transcriptional and chromatin accessibility of human retinal organoid development at the single-cell level
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109397
PMID:38510120
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,首次绘制了人类视网膜类器官发育的单细胞时空转录组图谱 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统解析人类视网膜类器官发育的时空转录组特征,并揭示染色质可及性与转录因子结合模式的动态变化 | 研究基于体外培养的视网膜类器官模型,与真实人类视网膜发育过程可能存在时间出现和细胞丰度方面的差异 | 解析人类视网膜发育早期的分子机制 | 人多能干细胞来源的视网膜类器官 | 空间转录组学 | 视网膜发育疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
6383 | 2025-10-06 |
Cell-type-specific mRNA transcription and degradation kinetics in zebrafish embryogenesis from metabolically labeled single-cell RNA-seq
2024-Apr-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47290-9
PMID:38600066
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和代谢标记技术,定量分析斑马鱼胚胎发育过程中不同细胞类型的mRNA转录和降解动力学 | 首次在具有多样细胞身份的胚胎中系统解析mRNA转录和降解对基因表达谱形成的相对贡献,开发了量化单个细胞类型中mRNA转录和降解速率的动力学模型 | 研究局限于斑马鱼胚胎发育早期阶段,尚未扩展到更多发育时期或其他生物系统 | 系统解析胚胎发育过程中mRNA转录和降解动力学对细胞特化的调控机制 | 斑马鱼胚胎发育过程中的不同细胞类型,特别是原始生殖细胞和包被层细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢标记 | 动力学模型 | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6384 | 2025-10-06 |
Inhibition of ATR opposes glioblastoma invasion through disruption of cytoskeletal networks and integrin internalization via macropinocytosis
2024-04-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad210
PMID:37936324
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研究论文 | 本研究揭示了抑制ATR激酶可通过破坏细胞骨架网络和整合素内存作用来抑制胶质母细胞瘤的侵袭 | 首次发现ATR在胶质母细胞瘤侵袭中的新作用机制,涉及细胞骨架调控和巨胞饮介导的整合素内存 | 研究主要基于临床前模型,尚未进行临床试验验证 | 探索ATR抑制对胶质母细胞瘤侵袭的抑制作用及其分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 延时显微镜、超高分辨率成像、活体成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 两种原位胶质母细胞瘤模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
6385 | 2025-10-06 |
Immune microniches shape intestinal Treg function
2024-Apr, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07251-0
PMID:38570678
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研究论文 | 本研究通过活体成像和空间转录组学技术揭示了肠道免疫微环境如何塑造调节性T细胞功能 | 首次结合活体成像、光激活引导的单细胞RNA测序和空间转录组学技术,追踪肠道内微生物反应性T细胞在耐受和炎症状态下的时空动态 | 研究主要聚焦于Helicobacter hepaticus反应性T细胞,可能不适用于所有肠道微生物群 | 阐明肠道免疫微环境如何维持对共生微生物的耐受性机制 | 肠道调节性T细胞和效应T细胞 | 免疫学 | 炎症性肠道疾病 | 活体成像, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
6386 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas enables mapping of homeostatic cellular shifts in the adult human breast
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01688-9
PMID:38548988
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建了包含55名捐赠者的人类乳腺细胞图谱,揭示了乳腺组织稳态的细胞变化 | 首次系统性地绘制了成人乳腺单细胞图谱,发现BRCA1/2携带者的免疫细胞具有独特的基因表达特征 | 样本主要来自整形手术和风险降低乳房切除术患者,可能无法完全代表普通人群 | 构建人类乳腺细胞图谱并研究影响乳腺癌风险的细胞稳态变化 | 55名接受乳房缩小术或风险降低乳房切除术的捐赠者的乳腺组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫组织化学数据 | 55名捐赠者,超过800,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6387 | 2025-10-06 |
A Multimodal Omics Framework to Empower Target Discovery for Cardiovascular Regeneration
2024-Apr, Cardiovascular drugs and therapy
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10557-023-07484-7
PMID:37421484
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综述 | 提出一个多物种多组学整合分析框架,用于推动心血管再生治疗靶点的发现 | 首次提出结合多物种、多组学和荟萃分析的系统性框架来识别心血管再生靶点 | NA | 开发促进心血管再生的新策略靶点 | 健康和损伤心脏的多物种样本(不同发育阶段) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
6388 | 2025-10-06 |
Gsα Regulates Macrophage Foam Cell Formation During Atherosclerosis
2024-Mar-29, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323156
PMID:38375634
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研究论文 | 本研究揭示了Gsα在动脉粥样硬化中通过调控巨噬细胞泡沫细胞形成的作用机制 | 首次发现Gsα在动脉粥样硬化斑块巨噬细胞中表达上调,并阐明了其通过cAMP-CREB信号通路促进CD36和SR-A1表达,从而增强脂质摄取和泡沫细胞形成的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步开展 | 探究Gsα在动脉粥样硬化发生发展中的具体作用机制 | 巨噬细胞、小鼠动脉粥样硬化模型、人类动脉粥样硬化斑块样本 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫荧光、cAMP检测、骨髓移植、染色质免疫沉淀、荧光素酶报告基因检测 | 巨噬细胞特异性Gsα敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞功能数据 | 小鼠模型和人类斑块样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
6389 | 2025-10-06 |
A transcription factor atlas of stem cell fate in planarians
2024-03-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113843
PMID:38401119
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统绘制了涡虫干细胞命运选择的转录因子图谱 | 首次系统性地绘制了完整成年生物体中大多数细胞类型的干细胞命运及其相关转录因子表达特征图谱 | NA | 揭示涡虫干细胞命运选择的调控机制 | 地中海涡虫(Schmidtea mediterranea)的干细胞(neoblasts)及其有丝分裂后子代细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
6390 | 2025-10-06 |
CD38-RyR2 axis-mediated signaling impedes CD8+ T cell response to anti-PD1 therapy in cancer
2024-Mar-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2315989121
PMID:38451948
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研究论文 | 本研究揭示了CD38-RyR2信号轴通过调控钙离子水平和AKT活性导致CD8+ T细胞终末耗竭,从而阻碍抗PD1疗法效果的分子机制 | 首次发现CD38通过激活RyR2钙通道升高细胞内钙水平,诱导慢性AKT活化并抑制TCF1表达,从而驱动CD8+ T细胞终末耗竭的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类临床试验中验证 | 探究CD8+ T细胞对抗PD1疗法产生抵抗的分子机制 | CD8+ T细胞,特别是肿瘤内和体外慢性刺激的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6391 | 2025-10-06 |
JAK/STAT3 represents a therapeutic target for colorectal cancer patients with stromal-rich tumors
2024-Mar-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02958-4
PMID:38424636
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研究论文 | 本研究探讨JAK/STAT3信号通路在结直肠癌中的治疗潜力,特别是在富含基质的肿瘤中 | 首次系统评估JAK抑制剂在不同结直肠癌模型中的疗效,并通过空间转录组学揭示JAK/STAT3信号异常与肿瘤微环境的空间依赖性基因表达关系 | 研究主要基于临床前模型和回顾性队列,需要前瞻性临床试验验证 | 评估JAK/STAT3抑制在结直肠癌中的治疗效果并确定其预后价值 | 结直肠癌细胞系、小鼠模型类器官、患者来源类器官和三个独立CRC患者队列 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学染色、突变分析、bulk RNA测序、空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据、空间转录组数据 | 三个独立CRC患者队列(包括TransSCOT临床试验队列) | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | NanoString GeoMx空间转录组学平台 |
6392 | 2025-10-06 |
Deep-qGFP: A Generalist Deep Learning Assisted Pipeline for Accurate Quantification of Green Fluorescent Protein Labeled Biological Samples in Microreactors
2024-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301293
PMID:38010980
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研究论文 | 提出一种深度学习辅助的自动化流程Deep-qGFP,用于精确量化绿色荧光蛋白标记的微反应器 | 首个无需迁移学习或重新训练即可应用于多种数字PCR和单细胞测序平台的一体化图像分析算法 | NA | 开发自动化GFP标记生物样本的绝对定量方法 | GFP标记的微反应器(液滴式、微孔式、琼脂糖式) | 计算机视觉 | NA | 荧光显微镜成像 | 深度学习 | 图像 | 10张图像中的2000多个微反应器 | NA | 数字PCR, 单细胞测序 | NA | 液滴数字PCR, 微孔数字PCR, 琼脂糖数字PCR, 液滴单细胞测序 |
6393 | 2025-10-06 |
CFTR expression in human salivary gland acinar cells
2024-03-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00549.2023
PMID:38284125
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研究论文 | 本研究通过免疫定位和单细胞RNA测序分析证实CFTR在人类唾液腺腺泡细胞中的表达 | 首次在人类唾液腺腺泡细胞中发现功能性CFTR表达,挑战了CFTR仅存在于导管细胞的传统模型 | 研究样本量有限,仅针对颌下腺和腮腺进行研究 | 探究CFTR在人类唾液腺组织中的表达模式和功能 | 人类颌下腺和腮腺组织 | 分子生物学 | 囊性纤维化 | 免疫定位,单细胞RNA测序,胶原酶消化,电生理记录 | NA | 基因表达数据,蛋白质定位数据,电生理数据 | 人类颌下腺和腮腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6394 | 2025-10-06 |
Oscillatory differentiation dynamics fundamentally restricts the resolution of pseudotime reconstruction algorithms
2024-03, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2023.0537
PMID:38503342
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研究论文 | 本文从理论上证明细胞分化过程中的振荡动态对伪时间重建算法的分辨率存在固有约束 | 首次揭示振荡性分化动态对轨迹重建质量的内在限制,即使在理想无噪声数据条件下 | 理论研究,尚未进行实验验证 | 探讨细胞分化轨迹重建算法的理论限制 | 细胞分化过程和伪时间重建算法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
6395 | 2025-10-06 |
Adipose tissue macrophage dysfunction is associated with a breach of vascular integrity in NASH
2024-03, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.10.039
PMID:37977244
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了非酒精性脂肪肝病中脂肪组织巨噬细胞亚群的异质性及其与血管完整性破坏的关联 | 首次在人类内脏脂肪组织中描述了骨髓细胞景观,发现了非酒精性脂肪性肝炎特异性的巨噬细胞转录变化 | 样本量相对有限,机制研究仍需进一步验证 | 评估非酒精性脂肪肝病队列中脂肪组织巨噬细胞的异质性 | 瘦型和肥胖患者的内脏脂肪组织巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,免疫荧光 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 包含瘦型和肥胖患者的队列(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6396 | 2025-10-06 |
Characterizing Neutrophil Subtypes in Cancer Using scRNA Sequencing Demonstrates the Importance of IL1β/CXCR2 Axis in Generation of Metastasis-specific Neutrophils
2024-02-29, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0319
PMID:38358352
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序表征癌症中的中性粒细胞亚型,发现IL1β/CXCR2轴在生成转移特异性中性粒细胞中的重要作用 | 首次系统比较健康和恶性肿瘤中中性粒细胞的转录状态,发现转移性结直肠癌中中性粒细胞具有更高异质性,并证实IL1β/CXCL8/CXCR2轴在中性粒细胞从健康状态向癌症和转移进展中的关键作用 | 研究主要基于转录组数据分析,需要更多功能实验验证 | 研究中性粒细胞在健康和恶性肿瘤中的转录亚型及其发育谱系 | 人类和小鼠的中性粒细胞,重点关注肺癌、乳腺癌和结直肠癌 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 伪时序分析 | 单细胞转录组数据 | 整合公开和独立生成的人类和小鼠数据集,涵盖肺癌、乳腺癌和结直肠癌 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6397 | 2025-10-06 |
Molecular portraits of patients with intrahepatic cholangiocarcinoma who diverge as rapid progressors or long survivors on chemotherapy
2024-02-23, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-330748
PMID:37758326
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研究论文 | 本研究通过分子特征分析预测肝内胆管癌患者对化疗的响应差异 | 首次发现基于肿瘤-髓系细胞动态变化的转录组特征可预测化疗疗效差异 | 需要进一步验证和开发该转录组特征 | 预测肝内胆管癌患者化疗疗效并阐明先天化疗耐药分子机制 | 晚期肝内胆管癌患者(快速进展者和长期生存者) | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 全转录组分析、空间转录组学、数字空间分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | 极端化疗反应差异患者队列 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序,全转录组分析 | GeoMx | 靶向数字空间分析平台 |
6398 | 2025-10-06 |
Immunosuppressive CD29+ Treg accumulation in the liver in mice on checkpoint inhibitor therapy
2024-02-23, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-330024
PMID:37770128
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序揭示了小鼠肝脏中CD29+调节性T细胞在免疫检查点抑制剂治疗中的独特反应机制 | 首次发现肝脏特异性CD29+Treg亚群在免疫检查点抑制剂治疗后显著扩增并介导治疗抵抗 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性尚待验证 | 探究肝脏调节性T细胞在免疫检查点抑制剂治疗抵抗中的作用机制 | 小鼠肝脏调节性T细胞 | 免疫学 | 肝癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
6399 | 2025-10-06 |
Immunotherapy-resistant acute lymphoblastic leukemia cells exhibit reduced CD19 and CD22 expression and BTK pathway dependency
2024-Feb-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175199
PMID:38376944
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研究论文 | 本研究通过体外模型揭示了急性淋巴细胞白血病对CD19免疫疗法产生耐药性的机制 | 首次发现CD19免疫疗法耐药细胞同时出现CD19和CD22表达降低,并表现出对BTK通路的依赖性 | 研究主要基于体外模型,需要更多临床样本验证 | 探究B细胞恶性肿瘤对CD19免疫疗法产生耐药性的分子机制 | 急性淋巴细胞白血病细胞系和患者样本 | 肿瘤免疫学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 质谱流式细胞术 | 体外耐药模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 蛋白质表达数据 | 白血病细胞系和儿科及年轻成人B-ALL患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | NA |
6400 | 2025-10-06 |
Diverse macrophage populations contribute to distinct manifestations of human cutaneous graft-versus-host disease
2024-02-16, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad402
PMID:38010706
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重组织免疫荧光技术,揭示了不同巨噬细胞群体在人类皮肤移植物抗宿主病不同临床表现中的重要作用 | 首次在性别不匹配移植病例中利用X连锁基因表达追踪供体来源MNPs的组织适应性,并发现急性和慢性皮肤GvHD中巨噬细胞极化状态的显著差异 | 样本量相对有限(36例患者),且主要关注皮肤病变,未涉及其他器官的GvHD表现 | 表征急性皮肤移植物抗宿主病患者中单核吞噬细胞的特性、来源和功能 | 36例急性皮肤移植物抗宿主病患者的皮肤和血液样本 | 单细胞生物学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序,多重组织免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,组织影像数据 | 36例急性皮肤GvHD患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |