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当前共找到 38417 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-04-10 |
Spatial transcriptomics reveal neuron-astrocyte synergy in long-term memory
2024-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07011-6
PMID:38326616
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研究论文 | 本研究利用空间和单细胞转录组学揭示了基底外侧杏仁核在长期记忆形成中的细胞和分子结构 | 首次结合单细胞RNA测序和单分子空间转录组学技术，在完整脑切片中提供了长期记忆印迹的丰富空间图谱，并揭示了神经元与星形胶质细胞之间的协同作用 | NA | 阐明基底外侧杏仁核在长期记忆形成中的细胞和分子机制 | 基底外侧杏仁核中的神经元和星形胶质细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 622 | 2026-04-10 |
Exercise mitigates flow recirculation and activates metabolic transducer SCD1 to catalyze vascular protective metabolites
2024-02-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj7481
PMID:38354249
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研究论文 | 本研究探讨了运动如何通过减少血流再循环并激活代谢转导酶SCD1来催化保护性脂质代谢物，从而改善血管内皮功能 | 首次揭示了运动通过调节血流动力学（如减少再循环和振荡剪切指数）并激活内皮SCD1酶，催化油酸和棕榈油酸等抗炎脂质代谢物，为血管保护提供新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证；SCD1的具体信号通路和长期效应需进一步探索 | 探究运动如何通过代谢转导酶SCD1介导血管保护作用，以改善心脏代谢疾病 | 野生型小鼠、内皮特异性SCD1敲除小鼠、高脂饮食诱导的小鼠模型以及小鼠主动脉组织 | NA | 心血管疾病 | 非靶向代谢组学分析、单细胞转录组学、计算机模拟分析、腺病毒转染 | NA | 代谢组数据、转录组数据、计算机模拟数据 | 未明确指定样本数量，涉及多种基因型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 623 | 2026-04-10 |
Hypoblast from human pluripotent stem cells regulates epiblast development
2024-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06871-2
PMID:38052228
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研究论文 | 本研究通过遗传和非遗传方法从人类多能干细胞生成真正的下胚层细胞，并构建了模拟胚胎发育的三维双层结构 | 首次从人类多能干细胞生成真实的下胚层细胞，并成功构建了能模拟胚胎前后轴模式和前原肠胚阶段细胞形成的三维双层结构 | 研究受限于体外模型，可能无法完全复制体内胚胎发育的复杂性 | 研究人类胚胎发育过程中下胚层和滋养外胚层对胚胎发育的调控机制 | 人类多能干细胞、下胚层细胞、滋养外胚层细胞、三维双层结构 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 624 | 2026-04-10 |
TWO-SIGMA-G: a new competitive gene set testing framework for scRNA-seq data accounting for inter-gene and cell-cell correlation
2022-05-13, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac084
PMID:35325048
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研究论文 | 本文提出了一种名为TWO-SIGMA-G的竞争性基因集测试框架，专门用于单细胞RNA测序数据，以解决基因间相关性和细胞间相关性的问题 | TWO-SIGMA-G采用了一种新颖的方法来调整基因集水平的基因间相关性，从而控制假阳性率，相比其他方法在存在基因间相关性时提高了统计功效 | NA | 开发一种用于单细胞RNA测序数据的竞争性基因集测试方法，以更准确地识别差异表达基因集 | 单细胞RNA测序数据，包括来自异种移植小鼠的HIV相关干扰素通路和人类阿尔茨海默病进展相关通路 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 混合效应回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2026-04-10 |
Deep learning of gene relationships from single cell time-course expression data
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab142
PMID:33876191
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研究论文 | 本文开发了一种基于深度学习的模型，用于从单细胞时间序列表达数据中预测基因间的相互作用 | 提出了一种新颖的单细胞RNA-Seq表达数据编码方法，并利用3D张量表示结合卷积和循环神经网络进行时间序列深度学习，以准确识别基因间的因果和调控关系 | 未明确提及具体的数据集大小或模型泛化能力的详细限制 | 从单细胞时间序列基因表达数据中推断基因间的调控和信号关系 | 基因间的相互作用，包括因果和调控关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-Seq | CNN, LSTM | 基因表达数据 | 在五个不同的时间序列单细胞RNA-Seq数据集上进行了测试 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 626 | 2026-04-10 |
ICAM1 initiates CTC cluster formation and trans-endothelial migration in lung metastasis of breast cancer
2021-08-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25189-z
PMID:34381029
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质分析，揭示了ICAM1在乳腺癌肺转移中启动循环肿瘤细胞簇形成和跨内皮迁移的作用 | 首次发现ICAM1在乳腺癌肺转移中表达增加200倍，并通过同型和异型相互作用促进CTC簇形成和跨内皮迁移，为TNBC转移提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于三例TNBC患者来源的异种移植模型，样本量较小，且未在更大临床队列中验证 | 探究ICAM1在乳腺癌肺转移中启动循环肿瘤细胞簇形成和跨内皮迁移的机制 | 三阴性乳腺癌的原发肿瘤细胞和肺转移灶 | 机器学习和单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基于机器学习的算法 | RNA测序数据和蛋白质分析数据 | 三例TNBC患者来源的异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 627 | 2026-04-10 |
A Novel Single Cell RNA-seq Analysis of Non-Myeloid Circulating Cells in Late Sepsis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.696536
PMID:34484194
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了晚期脓毒症患者非髓系循环细胞的转录组特征 | 首次在晚期脓毒症中应用CITE-seq技术对非髓系免疫细胞进行单细胞转录组分析，揭示了细菌性与真菌性脓毒症之间的转录组差异 | 样本量较小（仅4例患者和5例健康对照），且仅关注晚期时间点（脓毒症后14-21天） | 通过单细胞转录组分析更好地理解晚期脓毒症的病理机制 | 晚期脓毒症患者和健康对照者的外周血非髓系免疫细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CITE-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 4例晚期脓毒症患者和5例健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 628 | 2026-04-10 |
3D curvature-instructed endothelial flow response and tissue vascularization
2020-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abb3629
PMID:32938662
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研究论文 | 本研究开发了一种螺旋微血管模型，用于研究三维曲率对血管内皮细胞表型和转录的影响，并展示了其在肿瘤进展模拟和工程化心脏组织血管化中的应用 | 开发了可精确控制曲率和扭转的螺旋微血管模型，首次在厘米尺度实现均匀组织灌注，并揭示了三维曲率诱导层流下旋转和混合的独特流体动力学效应及其对内皮细胞表型和转录组的特异性影响 | 模型仍处于原理验证阶段，需要进一步在更复杂的组织环境中验证其长期功能和稳定性，且单细胞RNA-seq的样本量可能有限 | 研究三维血管几何特征（特别是曲率和扭转）对血管内皮细胞行为和组织血管化的影响，以解决工程化复杂组织血管化的长期挑战 | 螺旋微血管模型中的内皮细胞，以及在该模型中模拟的肿瘤组织和工程化心脏组织 | 组织工程与血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 螺旋微血管模型（体外三维模型） | 转录组数据, 表型数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 629 | 2026-04-09 |
Neutrophils have altered response to acute respiratory viral infection in sputum of patients with rheumatoid arthritis
2026-May, The journal of allergy and clinical immunology. Global
DOI:10.1016/j.jacig.2026.100665
PMID:41852854
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析类风湿关节炎患者与健康对照者在呼吸道感染前后痰液中的免疫细胞转录组差异 | 首次在类风湿关节炎患者痰液中应用单细胞RNA测序技术，揭示中性粒细胞在感染后30天内持续存在的转录组差异 | 样本量较小（仅5名女性捐赠者），且缺乏长期随访数据 | 探究类风湿关节炎患者肺部免疫细胞在急性呼吸道病毒感染前后的转录组变化 | 类风湿关节炎患者和健康对照者的痰液样本 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名女性捐赠者（2名健康，3名类风湿关节炎），共23,094个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Flex | 10x Flex单细胞RNA测序协议 |
| 630 | 2026-04-09 |
Shear stress-induced endothelial HEG1 signalling regulates vascular tone and blood pressure
2026-Apr-07, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf742
PMID:40986512
|
研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞中HEG1蛋白在血流剪切应力感应和血压调节中的关键作用及其分子机制 | 首次发现内皮HEG1通过CUL3介导的PHACTR1降解调控eNOS转录和NO产生，从而影响血管舒张和血压 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证相对有限，且未探讨HEG1信号通路在其他心血管疾病中的潜在作用 | 阐明内皮HEG1在血压调节中的作用及其分子机制 | 内皮细胞、小鼠模型、人类动脉和血浆样本 | 心血管生物学 | 高血压 | 单细胞RNA测序、计算流体动力学分析、蛋白质组学、转录组学、泛素化分析 | 内皮特异性Heg1敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、血流动力学数据 | 多个独立队列的人类动脉和血浆样本，以及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 631 | 2026-04-09 |
Fibroblast pentose phosphate pathway activation upon decreased circPLCE1 exacerbates intestinal fibrosis in Crohn's disease
2026-Apr-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336415
PMID:41390174
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研究论文 | 本研究探讨了克罗恩病中成纤维细胞代谢重编程在肠道纤维化中的作用，揭示了circPLCE1通过调控戊糖磷酸途径影响纤维化的新机制 | 首次发现circPLCE1通过直接结合XYLB酶并竞争性抑制其活性来调控戊糖磷酸途径，从而影响肠道纤维化进程 | 研究主要基于体外细胞模型和小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步扩大样本量 | 探索克罗恩病肠道纤维化过程中成纤维细胞的代谢重编程及其上游调控机制 | 人类肠道肌成纤维细胞、小鼠肠道纤维化模型、克罗恩病患者肠道组织 | 单细胞组学与空间转录组学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序、空间转录组、代谢组学、circRNA转录组、代谢流分析、海马分析、RNA pull-down | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、代谢组数据、转录组数据 | 配对的狭窄和非狭窄肠道组织样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 632 | 2026-04-09 |
spRefine denoises and imputes spatial transcriptomic data with a reference-free framework powered by genomic language model
2026-Apr-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281001.125
PMID:41633767
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研究论文 | 本文介绍了一种名为spRefine的深度学习框架，利用基因组语言模型对空间转录组数据进行去噪和插补，以提高数据质量和下游分析效果 | spRefine首次结合基因组语言模型，以无参考框架联合处理空间转录组数据的去噪和插补问题，并展示了在模型预训练和新型生物信号发现方面的潜力 | 未在摘要中明确提及 | 解决空间转录组数据中高噪声和基因测量缺失的问题，以提升数据整合和分析能力 | 空间转录组数据 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学 | 深度学习框架，基因组语言模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 633 | 2026-04-09 |
Single-nucleus multiomic profiling of the aging mouse substantia nigra reveals conserved gene alterations linked to Parkinson's disease
2026-Apr-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281113.125
PMID:41781332
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研究论文 | 本研究利用单核多组学测序技术，描绘了小鼠黑质随年龄变化的转录组和表观基因组图谱，揭示了与帕金森病相关的保守基因改变 | 首次在小鼠黑质中应用单核多组学测序进行全生命周期分析，并整合多个公共PD单细胞RNA-seq数据集，系统性地揭示了衰老与帕金森病在细胞类型特异性层面的共同基因调控网络变化 | 研究基于小鼠模型，其发现向人类帕金森病的直接转化需进一步验证；样本量相对有限，且主要关注黑质区域 | 探究衰老作为帕金森病主要风险因素的具体分子机制，并识别潜在的疾病相关基因和通路 | 小鼠黑质区域的细胞 | 单细胞基因组学 | 帕金森病 | 单核多组学测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 40,125个细胞 | NA | 单核多组学测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 634 | 2026-04-09 |
Scalable cell-specific coexpression networks for granular regulatory pattern discovery with NeighbourNet
2026-Apr-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281171.125
PMID:41786602
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研究论文 | 本文介绍了NeighbourNet（NNet）方法，用于构建细胞特异性共表达网络，以发现单细胞RNA测序数据中的精细调控模式 | NNet通过主成分分析和局部回归在K近邻内量化共表达，提高了计算效率并稳定了估计，克服了传统方法依赖预定义集群的局限，支持可扩展的下游分析 | NA | 开发一种可扩展的方法来构建细胞特异性共表达网络，以揭示单细胞水平的动态调控变化 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 主成分分析（PCA）、K近邻回归（KNN） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 635 | 2026-04-09 |
High-fidelity bidirectional translation between single-cell transcriptomes and DNA methylomes with scBOND
2026-Apr-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281350.125
PMID:41887797
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scBOND的双向跨模态翻译框架，用于在单细胞转录组和DNA甲基化组之间进行高保真转换 | scBOND利用混合专家块捕获上下文依赖的调控模式，结合自注意力机制和特征重校准模块增强生物信号保真度，并提出了scBOND-Aug变体以在配对数据稀缺场景中提升模型泛化能力 | 现有方法在单细胞RNA测序和单细胞DNA甲基化数据之间的跨模态翻译存在单向性、对上下文特异性DNA甲基化-表达关联建模不足、评估中忽视生物相关性以及在有限配对训练数据中性能差等限制 | 开发一个计算框架，用于在单细胞转录组和DNA甲基化组之间进行双向跨模态翻译，以克服多组学测序技术的技术挑战和高成本限制 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞DNA甲基化（scDNAm）数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 混合专家块、自注意力机制、特征重校准模块 | 单细胞转录组数据、DNA甲基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞DNA甲基化 | NA | NA |
| 636 | 2026-04-09 |
Single-cell RNA-seq reveals trans-sialidase-like superfamily gene expression heterogeneity in Trypanosoma cruzi populations
2026-Apr-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.105822
PMID:41945382
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析克氏锥虫在哺乳动物感染期间不同发育阶段的表面蛋白表达异质性 | 首次在单细胞水平揭示了克氏锥虫种群中转唾液酸酶样超家族基因表达的异质性，并发现每个细胞具有独特的TcS表达谱 | 研究仅关注了amastigote和trypomastigote阶段，未涵盖寄生虫完整生命周期；单细胞测序技术可能受技术噪音影响 | 探究克氏锥虫在哺乳动物感染期间表面蛋白表达的异质性及其在感染策略中的作用 | 克氏锥虫的amastigote和trypomastigote细胞 | 单细胞转录组学 | 恰加斯病 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，涉及amastigote和trypomastigote细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 637 | 2026-04-09 |
Separable Decomposition for Ragged Tensors
2026-Apr-07, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence
IF:20.8Q1
DOI:10.1109/TPAMI.2026.3679727
PMID:41945837
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研究论文 | 本文提出了一种基于CP分解的几何感知可分离分解框架，用于直接分解多维不规则张量数据（即“不规则张量”） | 引入了一种针对不规则张量数据的CP分解框架，通过二元加权张量建模有效域，并将全局目标解耦为独立的、良态子问题，实现了高效可扩展的求解 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够直接处理多维不规则张量数据的分解方法 | 不规则张量数据 | 机器学习 | NA | 张量分解 | CANDECOMP/PARAFAC (CP) 分解 | 多维数据、图像、空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 638 | 2026-04-09 |
Img2Gene: Debiased Spatially Resolved Transcriptomics with Biological Context from Pathology Images
2026-Apr-07, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3681769
PMID:41945845
|
研究论文 | 提出一个名为Img2Gene的去偏框架，用于从病理全切片图像中预测基因表达水平，通过整合生物学上下文信息来解决数据稀疏性和模态异质性问题 | 首次将因果分析整合到基因表达预测任务中，以缓解数据稀疏性并实现无偏预测；利用基因集富集分析识别高度相关的通路信息作为生物学上下文；引入跨模态一致性损失来对齐不同模态的数据 | 未明确说明模型在临床样本或更大规模数据集上的泛化能力，也未讨论计算资源需求 | 开发一个能够从病理图像中准确、无偏地预测空间分辨转录组基因表达水平的计算框架 | 空间转录组数据与病理全切片图像的整合分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习框架（具体架构未明确说明，但涉及因果分析和跨模态对齐） | 图像（病理全切片图像）与基因表达数据 | 四个公共数据集（具体样本数量未说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 639 | 2026-04-09 |
Androgen Receptor-Induced Lactoferrin Accelerates Prostate Tumorigenesis Through Modulating Ferroptosis
2026-Apr-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520109
PMID:41945871
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研究论文 | 本文揭示了乳铁蛋白在雄激素受体调控下，通过抑制铁死亡促进前列腺癌发生发展的新机制 | 首次发现乳铁蛋白在前列腺癌中具有促癌功能，并阐明了其通过AR-LF-铁死亡轴调控铁代谢和细胞死亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，临床转化仍需进一步验证 | 探究乳铁蛋白在前列腺癌发生发展中的作用机制 | 前列腺癌细胞、TRAMP小鼠模型、临床样本数据 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学、基因敲除模型 | TRAMP小鼠遗传模型、异种移植模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、单细胞转录组数据 | TRAMP小鼠模型、TCGA-PARD临床数据、单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 640 | 2026-04-09 |
SIRT1 mediates KU70 to maintain genomic stability in spermatogonial stem cells via the NHEJ repair pathway
2026-Apr-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08710-4
PMID:41946691
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研究论文 | 本研究揭示了SIRT1通过调控KU70在精原干细胞中维持基因组稳定性的机制，涉及非同源末端连接修复通路 | 首次在精原干细胞中阐明SIRT1通过去乙酰化KU70调控NHEJ修复通路，从而维持基因组稳定性和干细胞稳态 | 研究主要基于体外模型和临床样本分析，体内功能验证和长期效应仍需进一步探索 | 探究SIRT1在精原干细胞DNA损伤应答和基因组稳定性维持中的作用机制 | 人类睾丸组织、精原干细胞、非梗阻性无精子症患者 | 生殖医学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、Western blotting、免疫共沉淀、流式细胞术、NHEJ报告基因检测 | NA | 单细胞转录组数据、临床组织样本、体外细胞模型数据 | 非梗阻性无精子症患者和梗阻性无精子症对照的睾丸组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |