单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
621	2025-07-20	Heavy Metal Exposure-Mediated Dysregulation of Sphingolipid Metabolism 2024-Aug-12, Antioxidants (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/antiox13080978 PMID:39199224	研究论文	本研究探讨了重金属暴露对鞘脂代谢和氧化应激的影响	首次研究了特定重金属局部高浓度对鞘脂代谢稳态的影响，并利用体外模型和三维离体人体组织模型进行了分析	研究主要基于体外和离体模型，可能无法完全反映体内情况	探究重金属暴露对鞘脂代谢和氧化应激的影响	鞘脂代谢和氧化应激	生物医学	哮喘	空间转录组学、实时定量PCR	体外模型系统、三维离体人体组织模型	分子生物学数据	未明确说明具体样本数量
622	2025-07-20	Thrombospondin-1 promotes fibro-adipogenic stromal expansion and contractile dysfunction of the diaphragm in obesity 2024-Jul-02, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.175047 PMID:38954467	研究论文	探讨血栓反应蛋白-1（THBS1）在肥胖引起的膈肌纤维脂肪化基质扩张和收缩功能障碍中的作用	首次揭示THBS1通过促进纤维脂肪化祖细胞（FAPs）增殖，驱动膈肌基质重塑和收缩功能障碍	研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证	阐明肥胖相关膈肌功能障碍的病理机制	野生型和Thbs1敲除小鼠的膈肌组织	病理生理学	肥胖相关呼吸功能障碍	批量转录组学和单细胞转录组学	Thbs1敲除小鼠模型	基因表达数据	野生型和Thbs1敲除小鼠的膈肌组织样本
623	2025-07-20	Rod-shaped microglia interact with neuronal dendrites to regulate cortical excitability in TDP-43 related neurodegeneration 2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.06.30.601396 PMID:39005475	研究论文	本研究探讨了在小鼠TDP-43神经退行性变模型中，杆状小胶质细胞如何通过与神经元树突的相互作用调节皮质兴奋性	首次发现并描述了一种独特的杆状小胶质细胞亚群，该亚群通过调节神经元活动来减轻皮质过度兴奋	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证	探究TDP-43相关神经退行性变中皮质过度兴奋的调节机制	TDP-43神经退行性变小鼠模型(rNLS8)中的小胶质细胞和神经元	神经科学	神经退行性疾病	多通道探针记录、纵向钙成像、空间和单细胞RNA测序	TDP-43神经退行性变小鼠模型(rNLS8)	电生理记录数据、成像数据、RNA测序数据	未明确说明小鼠数量
624	2025-07-20	Integration of spatial and single-cell data across modalities with weakly linked features 2024-Jul, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-023-01935-0 PMID:37679544	research paper	提出了一种名为MaxFuse的跨模态数据整合方法，能够在特征弱关联的情况下实现高质量的数据整合	MaxFuse通过迭代共嵌入、数据平滑和细胞匹配，利用每种模态中的所有信息，在特征弱关联的情况下实现高质量整合	未提及具体局限性	开发一种能够在特征弱关联情况下实现高质量跨模态数据整合的方法	单细胞测序数据和空间测序数据	生物信息学	NA	单细胞测序、空间测序	MaxFuse	蛋白质组数据、转录组数据、表观基因组数据	未提及具体样本数量
625	2025-07-20	Challenges and opportunities in cancer immunotherapy: a Society for Immunotherapy of Cancer (SITC) strategic vision 2024-Jun-19, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-009063 PMID:38901879	review	本文总结了癌症免疫疗法在过去10-15年的发展，并提出了未来十年的战略愿景	提出了七个高优先级领域和三个关键指导原则，以促进癌症免疫疗法的未来发展	未提及具体实验数据或样本量，更多是基于专家共识的战略性讨论	识别癌症免疫疗法领域的当前机遇和挑战，优先考虑具有最高临床潜力的领域	癌症免疫疗法的科学和临床进展	癌症免疫疗法	癌症	单细胞测序和空间转录组学	NA	NA	NA
626	2025-07-20	Deciphering the molecular landscape of human peripheral nerves: implications for diabetic peripheral neuropathy 2024-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.06.15.599167 PMID:38915676	研究论文	通过批量及空间RNA测序技术，研究糖尿病周围神经病变（DPN）患者胫神经和腓肠神经的分子特征	首次在人类感觉轴突中发现了mRNA的显著定位，揭示了感觉轴突mRNA运输在周围神经退行性变中的潜在作用	研究样本主要来自糖尿病患者的下肢截肢，可能限制了结果的普遍性	深入理解糖尿病周围神经病变的分子机制	糖尿病周围神经病变患者的胫神经和腓肠神经	分子生物学	糖尿病周围神经病变	批量RNA测序, 空间转录组学分析	NA	RNA测序数据	主要来自糖尿病患者的下肢截肢神经样本
627	2025-07-20	Single-cell multi-ome and immune profiles of the Inspiration4 crew reveal conserved, cell-type, and sex-specific responses to spaceflight 2024-Jun-11, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-49211-2 PMID:38862516	研究论文	通过单细胞多组学和免疫分析，研究Inspiration4宇航员在太空飞行中的免疫反应	首次在单细胞水平上揭示了太空飞行对免疫系统的具体影响，并确认了这种影响在不同数据集中的一致性	样本量较小，仅针对Inspiration4任务的四名宇航员进行研究	表征太空飞行对宇航员免疫系统的影响	SpaceX Inspiration4任务的宇航员	生物医学	NA	单细胞多组学分析、细胞游离RNA测序、生化分析、血液学分析	NA	单细胞多组学数据、cfRNA数据、生化数据、血液学数据	4名宇航员（Inspiration4任务机组人员）
628	2025-07-20	Single cell regulatory architecture of human pancreatic islets suggests sex differences in β cell function and the pathogenesis of type 2 diabetes 2024-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.04.11.589096 PMID:38645001	research paper	该研究通过单细胞RNA测序等技术，探讨了人类胰腺胰岛中性别差异对β细胞功能及2型糖尿病发病机制的影响	揭示了性别差异在胰岛细胞基因表达和染色质可及性中的独特模式，特别是在X连锁KDM6A和Y连锁KDM5D染色质重塑因子上的差异，以及在2型糖尿病中性别对常染色体基因表达的显著影响	研究主要基于体外培养的胰岛细胞，可能无法完全反映体内环境下的性别差异	探究性别差异在胰岛调控和功能中的作用，以理解β细胞衰竭在糖尿病中的性别特异性异质性	人类胰腺胰岛细胞	生物医学	2型糖尿病	scRNA-seq, snATAC-seq, 动态激素分泌分析, 生物能量学分析	NA	单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 激素分泌数据	52名捐赠者（包括37名来自HPAP数据集）的胰岛样本
629	2025-07-20	IL-17 signaling in primary sclerosing cholangitis patient-derived organoids 2024-06-01, Hepatology communications IF:5.6Q1 DOI:10.1097/HC9.0000000000000454 PMID:38829197	研究论文	本研究通过患者来源的胆管细胞类器官（ECO）研究了IL-17信号在原发性硬化性胆管炎（PSC）中的作用	首次直接评估了PSC胆管细胞对IL-17A刺激的反应，并发现了PSC ECO与非PSC ECO在IL-17刺激下的不同反应	未发现调控IL-17通路的候选罕见变异	探究IL-17信号在PSC发病机制中的作用	原发性硬化性胆管炎（PSC）患者的胆管细胞类器官	NA	原发性硬化性胆管炎	转录组学、分泌组分析、基因组测序	NA	RNA测序数据、分泌组数据、基因组数据	PSC患者和非PSC患者的胆管细胞类器官
630	2025-07-20	Vascular restoration through local delivery of angiogenic factors stimulates bone regeneration in critical size defects 2024-Jun, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.07.003 PMID:39100886	研究论文	通过局部递送血管生成因子刺激临界尺寸骨缺损中的骨再生	利用单细胞RNA测序揭示了临界尺寸骨缺损中细胞群体的显著变化，并开发了一种整合电纺PCL纤维与电喷雾PLGA微球的新方法，用于递送Spp1和Cxcl12以促进骨再生	研究仅在鼠模型中进行，尚未在人体中验证	解决临界尺寸骨缺损的修复问题，促进骨再生	临界尺寸骨缺损的再生组织	组织工程	骨缺损	单细胞RNA测序，电纺，电喷雾	鼠模型	基因表达数据，生物材料数据	鼠模型中的临界尺寸骨缺损样本
631	2025-07-20	Stem-cell states converge in multistage cutaneous squamous cell carcinoma development 2024-05-31, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.adi7453 PMID:38815020	研究论文	通过基因表达网络、谱系追踪和单细胞RNA-seq技术，研究多阶段皮肤鳞状细胞癌发展过程中干细胞状态的趋同现象	揭示了癌前肿瘤细胞中表达谱系可塑性和耐药性标记的细胞状态趋同现象，并发现两种代表多谱系可塑性或增殖的细胞状态呈负相关	研究主要基于小鼠组织样本，人类样本的验证尚不充分	探究干细胞状态在皮肤鳞状细胞癌多阶段发展中的作用及其治疗潜力	小鼠正常组织和肿瘤组织	癌症生物学	皮肤鳞状细胞癌	基因表达网络分析、谱系追踪、单细胞RNA-seq	NA	基因表达数据	数百个小鼠组织样本（正常和肿瘤）
632	2025-07-20	Pioneer factor ETV2 safeguards endothelial cell specification by recruiting the repressor REST to restrict alternative lineage commitment 2024-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.05.28.595971 PMID:38853821	研究论文	本研究探讨了先驱因子ETV2通过招募抑制因子REST来限制内皮细胞谱系定向分化的机制	揭示了ETV2通过招募REST抑制非内皮细胞谱系基因的创新机制	研究主要基于体外诱导多能干细胞系统，可能不完全反映体内情况	阐明内皮细胞谱系定向分化的分子机制	人类诱导多能干细胞来源的中胚层祖细胞	发育生物学	NA	CUT&RUN, scRNA-seq, scATAC-seq	NA	单细胞转录组数据、染色质可及性数据	NA
633	2025-07-20	Multiplexed single-cell lineage tracing of mitotic kinesin inhibitor resistance in glioblastoma 2024-05-28, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114139 PMID:38652658	研究论文	本研究利用单细胞谱系追踪和RNA测序技术，分析了患者来源的胶质母细胞瘤神经球对KIF11抑制剂ispinesib的耐药性	首次在患者来源的胶质母细胞瘤模型中系统研究了KIF11抑制剂的耐药机制，并发现耐药细胞表现出前神经表型	研究主要基于体外和异种移植模型，尚未在人体临床试验中验证	探索胶质母细胞瘤对KIF11抑制剂的耐药机制	患者来源的胶质母细胞瘤神经球	肿瘤生物学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序，谱系追踪条形码技术	NA	单细胞转录组数据	患者来源的胶质母细胞瘤神经球和异种移植模型
634	2025-07-20	Envelope protein-specific B cell receptors direct lentiviral vector tropism in vivo 2024-May-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2024.03.002 PMID:38449314	研究论文	研究探讨了慢病毒载体在体内系统性给药后，B细胞受体（BCR）如何指导慢病毒载体的趋向性	揭示了不同假型慢病毒载体通过特异性BCR介导进入特定B细胞亚群的新机制，为BCR靶向基因递送提供了新思路	研究主要聚焦于脾脏B细胞，未涉及其他组织或细胞类型的趋向性机制	探究慢病毒载体在体内系统性给药后的转导机制和趋向性	脾脏B细胞及其亚群	基因治疗	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量，研究涉及不同假型慢病毒载体处理的B细胞亚群
635	2025-07-20	Thrombopoietin mimetic stimulates bone marrow vascular and stromal niches to mitigate acute radiation syndrome 2024-04-29, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-03734-z PMID:38679747	research paper	研究探讨了PEG化血小板生成素模拟肽JNJ-26366821（TPOm）在急性放射综合征（ARS）中通过调节骨髓血管和基质微环境促进造血干细胞和祖细胞（HSPCs）再生的作用	首次揭示了TPOm通过调节骨髓血管和基质微环境支持HSPC再生的机制，并证明其作为辐射医学对策（MCM）的潜力	研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探索TPOm在急性放射综合征中促进骨髓再生的作用机制	C57BL/6J小鼠的骨髓造血干细胞和祖细胞（HSPCs）、内皮细胞（ECs）和间充质基质细胞（MSCs）	放射医学	急性放射综合征	流式细胞术、全组织共聚焦显微镜、单细胞RNA测序	小鼠急性放射综合征模型	组织学数据、流式细胞数据、RNA测序数据	9-14周龄的C57BL/6J小鼠，具体数量未明确说明
636	2025-07-20	STRUCTURE-FUNCTION RELATIONSHIPS OF MUCOCILIARY CLEARANCE IN HUMAN AIRWAYS 2024-Apr-25, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-4164522/v1 PMID:38746209	研究论文	本研究探讨了人类气道中组织水平结构与纤毛器官功能之间的复杂联系，特别是气道的形态组织及其在粘液纤毛清除中的作用	首次绘制了大鼠和人类气道树中纤毛和分泌细胞类型的分布图，揭示了物种间纤毛功能的特异性差异，并阐明了气道上皮的结构参数如何预测清除功能	研究依赖于动物数据，限制了人类气道屏障功能的关键见解，并阻碍了与人类相关的气道疾病建模	理解粘液纤毛清除的机制及其与气道结构的关系，以更好地认识清除功能障碍与呼吸系统疾病的关联	人类和大鼠的气道组织	生物医学研究	慢性阻塞性肺疾病(COPD)和哮喘	单细胞转录组学	NA	组织样本和转录组数据	NA
637	2025-07-20	Autophagy unrelated transcriptional mechanisms of hydroxychloroquine resistance revealed by integrated multi-omics of evolved cancer cells 2024-Apr, Cell cycle (Georgetown, Tex.) DOI:10.1080/15384101.2024.2402191 PMID:39299930	研究论文	通过多组学方法揭示羟基氯喹耐药性的非自噬相关转录机制	研究发现羟基氯喹耐药性主要通过转录可塑性而非自噬途径实现，揭示了糖酵解、外泌作用、染色体凝聚/分离等新途径	研究仅针对OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结肠癌细胞，可能不适用于其他癌症类型	探究羟基氯喹耐药性的分子机制	OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结肠癌细胞	肿瘤学	卵巢癌, 结肠癌	RNA-seq, exome-seq, scRNA-seq, CRISPR-Cas9筛选	NA	基因组数据, 转录组数据	两种癌细胞系（OVCAR3和CCL218）的进化细胞群体
638	2025-07-20	Intercellular communication atlas reveals Oprm1 as a neuroprotective factor for retinal ganglion cells 2024-Mar-11, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-46428-z PMID:38467611	研究论文	本研究通过单细胞RNA-seq分析探索了细胞间通讯对视网膜神经节细胞（RGC）在视神经损伤后存活的影响	揭示了μ-阿片受体（Oprm1）作为视网膜神经节细胞的神经保护因子，并证明其神经保护作用可通过泛RGC过表达转移至其他亚类	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探索细胞间通讯对视网膜神经节细胞存活的贡献	视网膜神经节细胞（RGCs）、星形胶质细胞和Müller胶质细胞	神经科学	视神经损伤	单细胞RNA-seq分析	NA	RNA-seq数据	NA
639	2025-07-20	An organism-wide atlas of hormonal signaling based on the mouse lemur single-cell transcriptome 2024-Mar-11, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-46070-9 PMID:38467625	research paper	利用小鼠狐猴单细胞转录组数据构建了全生物体范围的激素信号图谱	首次系统地绘制了84类激素的源细胞和靶细胞图谱，揭示了激素信号网络的密集连接、去中心化和丰富的反馈循环	研究仅基于非人灵长类动物小鼠狐猴，未直接验证人类数据	系统性地研究激素信号传导网络及其在生理和代谢中的作用	小鼠狐猴（Microcebus murinus）的全生物体单细胞转录组	生物信息学	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	NA
640	2025-07-20	A mouse model of Zhu-Tokita-Takenouchi-Kim syndrome reveals indispensable SON functions in organ development and hematopoiesis 2024-Mar-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.175053 PMID:38290089	研究论文	本研究开发了一种模拟Zhu-Tokita-Takenouchi-Kim（ZTTK）综合征的小鼠模型，揭示了SON基因在器官发育和造血过程中的不可或缺作用	首次开发了Son单倍体不足（Son+/-）小鼠作为ZTTK综合征的模型，并系统研究了SON基因在器官发育和造血中的功能	研究仅在小鼠模型中进行，需要进一步验证在人类中的适用性	探究SON基因在器官发育和造血过程中的功能及其与ZTTK综合征的关系	Son单倍体不足（Son+/-）小鼠	生物医学研究	ZTTK综合征	单细胞转录组分析	小鼠模型	基因表达数据	未明确说明具体样本数量