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当前共找到 40024 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-05-29 |
[Single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneous features of cancer-associated fibroblasts in acral melanoma]
2026-May, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:42206704
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研究论文 | 单细胞转录组分析揭示肢端黑色素瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性特征及其功能角色 | 首次在单细胞水平系统解析肢端黑色素瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性，鉴定出三种亚型并揭示FOSL1在CAF分化中的关键调控作用 | 样本量较小（5例患者），未进行功能验证实验确认亚型的具体作用机制 | 探究肢端黑色素瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性特征及其在肿瘤微环境中的功能角色 | 肢端黑色素瘤患者肿瘤组织中的癌症相关成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 肢端黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 5例肢端黑色素瘤患者样本（4例原发肿瘤，1例淋巴结转移） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 622 | 2026-05-29 |
MCT1 governs a metabolic checkpoint at pachytene during spermatogenesis
2026-Apr-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9544748/v1
PMID:42094045
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研究论文 | 本研究鉴定了MCT1依赖的代谢检查点，该检查点控制哺乳动物精子发生中的减数分裂进程 | 首次发现MCT1介导的代谢检查点调控减数分裂，揭示乳酸代谢通过组蛋白乳酰化表观遗传调控减数分裂基因表达的新机制 | 未明确MCT1在其他组织或物种中的保守性，且体外验证实验可能有限 | 阐明代谢流如何直接控制减数分裂进程，特别是MCT1在精子发生中的作用 | 哺乳动物精子发生过程中的生殖细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学, 代谢组学, 计算扰动建模, 多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | 涉及小鼠生殖细胞样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 623 | 2026-05-29 |
Targeting Mycotoxin Toxicity: From Molecular Mechanisms to Nutritional Interventions
2026-Apr-26, Veterinary sciences
IF:2.0Q2
DOI:10.3390/vetsci13050421
PMID:42188891
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综述 | 探讨霉菌毒素（黄曲霉毒素B1、脱氧雪腐镰刀菌烯醇和赭曲霉毒素A）通过氧化应激、细胞凋亡、自噬、炎症和菌群失调等机制引发毒性，以及营养干预在缓解这些毒性中的作用 | 结合分子机制与营养干预策略，系统综述抗氧化剂、抗炎物质及益生菌等在缓解霉菌毒素毒性中的潜力，并强调组学技术在揭示机制和制定个性化营养建议中的新应用 | 未提及具体研究数据或实验验证，缺乏对营养干预效果的定量评估或临床证据的支持 | 阐明霉菌毒素毒性的分子机制及营养因素的调节作用，为食品安全和健康保护提供理论基础 | 霉菌毒素（黄曲霉毒素B1、脱氧雪腐镰刀菌烯醇和赭曲霉毒素A）及营养因子（如番茄红素、姜黄素、百里香油、阿拉伯胶、生姜、益生菌和益生元） | NA | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 624 | 2026-05-29 |
Study on the Mechanisms of Allogeneic NK Cells Combined with Myeloid Cells in Treating Acute Myeloid Leukemia
2026-Apr-24, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2026.03.043
PMID:42035877
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research paper | 研究异体NK细胞与髓系细胞联合治疗急性髓系白血病的机制 | 通过单细胞RNA测序分析G-CSF动员的NK细胞与髓系细胞的相互作用，提出NK细胞可能通过间接方式支持抗肿瘤免疫的新假设 | 多变量调整后，NK细胞剂量与生存率的关联不显著，且KIR配体不匹配和供体激活受体数量无显著影响，需进一步验证体内相互作用 | 探讨G-CSF动员的NK细胞在微移植中抗肿瘤作用的机制 | 急性髓系白血病患者及供体的NK细胞 | machine learning | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 72名接受微移植的AML患者，8名供体NK细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 625 | 2026-05-29 |
RAN-S100A10-EGFR axis facilitates papillary thyroid cancer metastasis by PI3K/AKT signaling
2026-Apr-16, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08649-6
PMID:41991927
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研究论文 | 揭示RAN-S100A10-EGFR轴通过PI3K/AKT信号促进甲状腺乳头状癌转移的机制 | 首次阐明S100A10在甲状腺乳头状癌中通过与RAN和EGFR相互作用形成调控轴，激活PI3K/AKT信号并促进上皮间质转化，从而增强肿瘤侵袭能力 | 未提及 | 探究S100A10在甲状腺乳头状癌转移中的功能及具体分子机制 | 甲状腺乳头状癌组织和细胞系 | 数字病理学 | 甲状腺乳头状癌 | 单细胞RNA测序，RT-qPCR，蛋白质印迹，质谱分析，免疫共沉淀，免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织样本，细胞系 | 来自公共数据库的单细胞RNA测序数据，以及PTC组织和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 626 | 2026-05-29 |
Single-cell omics uncovers novel pathological mechanisms and therapeutic targets for congenital heart diseases: insights from integrated intercellular communication analysis
2026-Apr-16, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05015-3
PMID:41992274
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综述 | 通过整合单细胞组学与细胞间通讯分析，揭示先天性心脏病各亚型的病理机制和治疗靶点 | 首次通过整合重新分析大规模单细胞核数据（157,273个细胞核），系统描绘五种先天性心脏病亚型（新生及婴儿左心发育不良综合征、法洛四联症、扩张型心肌病、肥厚型心肌病）的细胞间通讯网络重塑特征，发现各亚型具有独特的信号架构 | 尚未进行基于单细胞数据的基因功能验证实验，也未有体内或体外功能性研究证实所发现的信号通路变化与疾病机制之间的直接因果关系 | 利用单细胞组学技术探究先天性心脏病的细胞异质性和细胞间通讯机制，为精准治疗提供靶点 | 先天性心脏病患者（包括新生和婴儿左心发育不良综合征、法洛四联症、扩张型心肌病、肥厚型心肌病）及健康供体对照 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 网络拓扑分析、通路富集分析 | 单细胞核转录组数据 | 157,273个细胞核，来自162名儿科患者（5种诊断类别）和健康供体 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA |
| 627 | 2026-05-29 |
Microbial Monotherapy With Leuconostoc sp LB-P8 Improves Inflammation and Fibrosis in Mouse Primary Sclerosing Cholangitis by Inhibiting Transforming Growth Factor β1/SMAD Signaling
2026-Apr-15, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101789
PMID:41997362
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研究论文 | 本文鉴定了一种新型明串珠菌属菌株LB-P8，发现其通过抑制TGF-β1/SMAD信号通路改善小鼠原发性硬化性胆管炎的炎症和纤维化 | 首次揭示了明串珠菌属菌株LB-P8通过抑制TGF-β/SMAD信号通路发挥抗纤维化和抗炎作用，并将其作为PSC的潜在治疗策略 | 尚未在临床试验中验证LB-P8对人类PSC患者的疗效和安全性 | 研究微生物单药疗法LB-P8对原发性硬化性胆管炎的疗效及其作用机制 | 人肠道细胞、小鼠原代硬化性胆管炎模型（BDL、DDC喂养、Mdr2-/-小鼠）及DSS诱导的结肠炎模型 | NA | 原发性硬化性胆管炎 | 代谢组学分析、RNA测序、空间转录组学分析、实时荧光定量PCR | NA | 文本、图像 | 多个小鼠模型（具体数量未明确）及人肠道细胞培养系统 | NA | 空间转录组学 | NanoString GeoMX | NA |
| 628 | 2026-05-27 |
Exploration of the roles of SSR2 in hepatocellular carcinogenesis based on single-cell transcriptomics and spatial transcriptomics
2026-Apr-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05017-w
PMID:41979818
|
研究论文 | 基于单细胞转录组和空间转录组数据，探索SSR2基因在肝细胞癌发生中的作用机制 | 首次结合单细胞转录组和空间转录组分析，发现SSR2在NK细胞中高表达伴随细胞质翻译通路增强，驱动肿瘤免疫微环境紊乱 | NA | 探索SSR2基因在肝细胞癌发生中的作用，为改善预后提供新的诊断和治疗靶点 | 肝细胞癌患者的肝脏组织 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, 批量转录组测序 | 非负矩阵分解, 加权基因共表达网络分析, 集成机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 629 | 2026-05-29 |
Deciphering oxidative stress-related heterogeneity and developing a prognostic signature for colorectal cancer
2026-Apr-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-46560-4
PMID:41935137
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研究论文 | 通过单细胞和批量RNA-seq数据揭示氧化应激对结直肠癌肿瘤微环境的影响，并构建了基于氧化应激相关风险签名（OSRRS）的预后模型 | 首次整合单细胞与批量RNA-seq数据解析结直肠癌中氧化应激相关异质性，并基于LASSO Cox回归开发了12基因预后签名模型 | 研究依赖公共数据集（GSE132465、TCGA-CRC等），缺乏独立外部验证队列；qRT-PCR和IHC验证限于组织微阵列样本，临床转化需进一步验证 | 揭示氧化应激对结直肠癌肿瘤微环境的影响机制，并构建可预测预后的氧化应激相关风险签名模型 | 结直肠癌肿瘤细胞及肿瘤微环境中的恶性细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, 免疫组化 | LASSO Cox回归 | 基因表达数据（单细胞及批量RNA-seq） | TCGA-CRC数据集（批量RNA-seq）、GSE132465（单细胞RNA-seq）、GSE39582和GSE17538验证队列，以及组织微阵列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 630 | 2026-05-29 |
Coronary artery disease risk gene PRDM16 regulates smooth muscle homeostasis
2026-Apr, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2026.02.002
PMID:41667033
|
研究论文 | 研究发现冠心病风险基因PRDM16调控血管平滑肌细胞稳态，通过调节Tgfb2表达影响新生内膜形成。 | 首次发现转录因子PRDM16在血管平滑肌细胞中具有维持细胞稳态的功能，并揭示其作为冠心病风险基因的新机制 | 仅在小鼠模型中验证了Prdm16在平滑肌细胞中的功能，未在人体组织中进行直接的功能实验。 | 识别调控血管平滑肌细胞稳态的新型转录因子，探索其在冠心病发展中的作用 | 人类和小鼠的动脉组织、血管平滑肌细胞、PRDM16/Prdm16基因 | 基因组学、分子生物学 | 冠心病、血管再狭窄 | ChIP-seq、RNA-seq、scRNA-seq、qRT-PCR、Western blotting | NA | 测序数据、基因表达数据 | 多个动脉组织样本、基因敲除小鼠（诱导型和组成型） | NA | NA | NA | NA |
| 631 | 2026-05-29 |
Chemokine-defined macrophage niches establish spatial organization of tumor immunity
2026-Apr, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02445-2
PMID:41872505
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了肺癌中巨噬细胞谱系和空间组织对肿瘤免疫的调控机制 | 首次发现趋化因子定义的巨噬细胞亚群在肿瘤区域中划分不同的空间生态位，并揭示其对立功能：支气管血管区域的IM亚群促进抗肿瘤免疫，而肿瘤区域的IM亚群招募促肿瘤的recMacs | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证；莫拉维罗治疗的效果可能需要更广泛的临床评估 | 阐明巨噬细胞谱系和空间组织如何塑造抗肿瘤免疫，并识别保护保护性IM功能同时破坏巨噬细胞驱动的免疫抑制的策略 | 肺癌中的组织驻留CD206+和CD206-间质巨噬细胞亚群以及Ly6c2+Fn1+Vcan+募集巨噬细胞 | 计算机视觉, 机器学习 | 肺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 小鼠模型中的肿瘤样本和引流淋巴结样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学平台, Illumina NovaSeq测序平台 |
| 632 | 2026-05-29 |
Single-cell profiling reveals that dynamic lung immune responses distinguish protection from susceptibility to tuberculosis
2026-04, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013635
PMID:42044120
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示肺部免疫反应的动态变化如何区分对结核病的保护性与易感性 | 首次通过单细胞RNA测序，在多时间点、多小鼠品系和多结核分枝杆菌菌株下，系统比较了初次感染与已受控感染小鼠的肺免疫反应动态差异，发现保护性免疫依赖于免疫激活的时序和协调，而非单一反应的强度 | 研究中主要使用小鼠模型，结果向人类和灵长类的推广仍需进一步验证；且未深入探讨相关信号通路的分子机制 | 阐明肺结核保护性免疫的免疫相关因素，特别是时间动态和细胞协调机制 | 小鼠（未感染和已受控结核分枝杆菌感染的品系）及非人灵长类（静脉注射BCG疫苗后的样本） | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达谱（单细胞转录组数据） | 多个时间点、多个小鼠品系和多个结核分枝杆菌菌株的肺免疫细胞样本，以及非人灵长类样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 平台 |
| 633 | 2026-05-29 |
Limited protection against early-life lung murine cytomegalovirus infection results from deficiency of cytotoxic CD8 T cells
2026-04, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014150
PMID:42008567
|
研究论文 | 该研究利用小鼠巨细胞病毒呼吸道感染模型和过继性T细胞转移实验，结合单细胞RNA测序技术，揭示了早期生命中CD8 T细胞毒性功能缺陷导致对肺部MCMV感染保护不足的机制 | 首次发现新生期αβ T细胞普遍缺乏导致MCMV特异性CD8 T细胞富集延迟，并揭示关键细胞因子不足是造成CD8 T细胞启动缺陷的核心因素 | 仅在小鼠模型中验证，未在人类样本中确认；未深入探究除细胞因子外的其他微环境因素对T细胞启动的影响 | 阐明早期生命中对巨细胞病毒感染的抗病毒T细胞免疫应答机制 | 新生期和成年期小鼠的肺组织、MCMV特异性CD8 T细胞、αβ T细胞 | 数字病理学 | 巨细胞病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型，具体样本量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于分析效应T细胞分化 |
| 634 | 2026-05-29 |
Pulmonary fibroblast activation during Aspergillus fumigatus infection enhances lung defense via immunomodulation and tissue remodeling
2026-03-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71027-5
PMID:41917025
|
研究论文 | 研究烟曲霉感染时肺成纤维细胞的激活及其通过免疫调节和组织重塑增强肺防御的机制 | 首次通过细胞谱系追踪、靶向细胞消融和单细胞RNA测序揭示成纤维细胞在烟曲霉感染中的保护性免疫调节作用 | 未提及具体局限性 | 探究烟曲霉引起的肺损伤中成纤维细胞的功能反应及其在宿主防御中的作用 | 免疫正常和免疫抑制宿主中的肺成纤维细胞 | 机器学习 | 肺曲霉病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 免疫正常和免疫抑制小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 635 | 2026-05-29 |
Perspectives from machine learning and multi-omics to decoding the effects of VDAC2 malignant subsets on tumor evolution
2026-Mar-31, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01394-1
PMID:41917254
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研究论文 | 利用机器学习和多组学分析解码VDAC2恶性亚型对肿瘤演化的影响 | 通过整合批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据，首次系统揭示了VDAC2在泛癌中的恶性功能及其通过VDAC2-BAK1-IFNγ通路促进肿瘤进展和免疫逃逸的机制 | 基于公开数据库的分析，缺乏大规模独立临床样本验证，且实验主要在体外细胞模型中进行 | 系统挖掘VDAC2在泛癌中的作用及其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | VDAC2基因在泛癌中的表达、功能及免疫调控机制 | 机器学习 | 泛癌 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、RT-PCR、细胞共培养、CCK-8实验、Transwell侵袭实验、ELISA | NA | RNA测序数据、空间转录组数据 | 泛癌数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 636 | 2026-05-29 |
Taming autoimmunity: Alpha-1 antitrypsin overexpressing mesenchymal stromal cells promote regulatory T cell crosstalk to reverse diabetes
2026-Mar-31, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.03.032
PMID:41918165
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序等技术，研究了过表达alpha-1抗胰蛋白酶的间充质基质细胞如何调节T细胞以逆转糖尿病 | 首次揭示AAT-MSCs通过增强调节性T细胞与其他细胞的通讯来逆转新发糖尿病，并阐明其在CD4和CD8 T细胞上的免疫调节机制 | 仅在雌性非肥胖糖尿病小鼠模型中进行研究，尚未在人类临床试验中验证其效果 | 探索AAT-MSCs如何通过调节T细胞免疫反应来逆转1型糖尿病 | 过表达alpha-1抗胰蛋白酶的人和小鼠间充质基质细胞，以及CD4和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 50%以上的雌性非肥胖糖尿病小鼠（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 637 | 2026-05-29 |
A spatiotemporal transcriptomic atlas of porcine (Sus scrofa) female early gonadal development
2026-Mar-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09932-0
PMID:41906042
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研究论文 | 利用高分辨率空间转录组技术解析猪雌性早期性腺发育过程中细胞类型及其空间动态 | 首次应用高分辨率空间转录组技术绘制猪早期性腺发育的时空图谱，阐明了支持细胞谱系中两波颗粒细胞的空间定位及其在生殖细胞发育中的调控作用，并发现BMP信号通路在原始生殖细胞向卵原细胞特化中的关键角色 | 空间转录组技术无法直接解析单细胞水平的基因表达，可能遗漏部分细胞类型的细微差异 | 揭示猪雌性早期性腺发育过程中原始生殖细胞向卵原细胞特化和进入减数分裂的时空动态机制 | 猪（Sus scrofa）雌性早期性腺组织中的原始生殖细胞、体细胞及各种细胞类型 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 猪早期性腺样本（具体数量未在标题和摘要中明确） | NA | 空间转录组学 | NA | 高分辨率空间转录组技术（具体平台未在摘要中说明） |
| 638 | 2026-05-29 |
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration with IN-DEPTH Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2026-Mar-24, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-0775
PMID:41874448
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研究论文 | 提出IN-DEPTH工作流，实现同一玻片上的空间转录组和蛋白质组整合分析，结合SGCC框架揭示肿瘤微环境中的空间重排 | 开发了IN-DEPTH工作流，可在同一玻片上整合单细胞空间蛋白质组和转录组且无RNA信号丢失；提出SGCC框架用于跨模态整合，解析细胞间功能状态变化 | 新兴同玻片多组学方法在多重性、空间分辨率、信号保留和整合分析方面仍存在局限 | 实现空间多组学整合以揭示肿瘤微环境中的临床相关机制，并推动稳健的空间多模态AI模型发展 | 弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）组织样本 | 数字病理学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、IN-DEPTH、SGCC | NA | 图像、空间转录组数据 | EBV阳性和EBV阴性肿瘤样本 | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 639 | 2026-05-29 |
Metabolic RNA Labeling-Enabled Time-Resolved Single-Cell RNA Sequencing
2026-03-17, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.6c00010
PMID:41758996
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综述 | 本文综述了代谢RNA标记结合时间分辨单细胞RNA测序技术的最新进展，包括Well-TEMP-seq、scDUAL-seq、Dyna-vivo-seq等方法，并探讨了该技术在揭示细胞异质性和动态基因表达调控中的应用潜力 | 系统总结了基于代谢RNA标记的时间分辨单细胞RNA测序技术的创新，如双核苷酸标记的scDUAL-seq能同时监测RNA合成与降解，以及从体外细胞培养扩展到体内动物模型（Dyna-vivo-seq）的能力，并整合空间转录组学以解析时空动态 | 当前化学工具在单细胞RNA动态分析中存在局限性，如核苷酸标记效率、成本、体内外应用差异，以及时空整合的复杂度 | 探讨代谢RNA标记增强时间分辨单细胞RNA测序技术，以理解异质性和动态基因表达调控 | 单细胞RNA代谢标记、时间分辨测序技术及其在生物过程（如胚胎发育、疾病进展）中的应用 | 机器学习 | NA | 代谢RNA标记、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 640 | 2026-05-29 |
FineST: contrastive learning integrates histology and spatial transcriptomics for nuclei-resolved ligand-receptor analysis
2026-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70528-7
PMID:41839892
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研究论文 | FineST通过对比学习整合组织学和空间转录组学数据，实现核分辨率下的配体-受体分析 | 利用组织学基础模型的深度对比学习，实现核精度的RNA表达插补和细胞间通信分析，在VisiumHD和Xenium数据集上显著优于现有方法 | 主要聚焦于Visium平台，可能在其他平台上的泛化能力有限；数据稀疏性和分辨率限制在复杂组织中仍存在挑战 | 开发高分辨率空间转录组学分析方法以揭示细胞间通信模式 | 结直肠癌VisiumHD和乳腺癌Xenium数据集，以及多种癌症类型的肿瘤-免疫相互作用 | 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 | 结直肠癌, 乳腺癌, 鼻咽癌, 肝细胞癌 | 空间转录组学, 对比学习 | 对比学习模型 | 组织学图像, 空间转录组学数据 | 结直肠癌VisiumHD和乳腺癌Xenium数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x VisiumHD, 10x Xenium | 10x Visium平台用于空间基因表达分析，VisiumHD用于高分辨率数据，Xenium用于乳腺癌原位验证 |