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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-04-27 |
Adversarial validation of in silico perturbation profiles for intelligence-associated genes in human prefrontal cortex
2026-Apr-21, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 基于Geneformer模型对与智力相关的21个基因在人类前额叶皮层中的计算机扰动进行对抗性验证 | 提出了一个可复现的对抗性验证框架,用于评估基础模型的计算机扰动结果,并揭示了表达水平混杂因素会显著放大原始扰动信号 | 研究在供体层面统计效力不足(n=3,估计效力约27%),推荐至少20个供体;交叉模型一致性受标记化问题限制 | 建立标准化对抗性验证框架,评估基础模型在计算机基因扰动中的可靠性,并检验智力相关基因的细胞类型特异性机制 | 人类背外侧前额叶皮层(DLPFC)单细胞RNA-seq数据中的21个智力相关基因 | 自然语言处理 | 智力相关疾病 | 单细胞RNA测序 | Geneformer, scGPT | 单细胞RNA-seq表达数据 | 3个供体的500个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 622 | 2026-04-27 |
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2026-Apr-20, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101346
PMID:41895263
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研究论文 | 本研究评估了整合单细胞和单细胞核数据集以改善批量RNA-seq反卷积的策略,并提出了最佳实践方法 | 首次系统比较了多种整合策略(包括基于主成分的潜在偏移、条件和非条件scVI以及跨模态差异表达基因过滤)在提升单细胞核RNA-seq参考数据反卷积准确性的效果,并推荐了优先使用scRNA-seq及跨模态DEG过滤的方法 | 研究仅基于四种组织类型进行基准测试,可能未涵盖所有组织类型;跨模态DEG过滤需要配对的scRNA-snRNA细胞类型信息,实际应用中可能受限于数据可用性 | 评估并改进单细胞核RNA-seq数据作为批量RNA-seq反卷积参考的准确性 | 四种组织类型(具体未列出)的scRNA-seq和snRNA-seq数据;真实的脂肪组织批量样本 | 机器学习 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | 条件/非条件scVI(单细胞变分推断) | 基因表达数据 | 四种组织的scRNA-seq和snRNA-seq数据集;真实的脂肪组织批量样本(具体数量未说明) | NA | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | NA |
| 623 | 2026-04-27 |
Brain endothelial tmTNFα overexpression in a mouse model altered cell type-specific signaling changes linked to schizophrenia-relevant behaviors
2026-Apr-20, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106777
PMID:42019828
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研究论文 | 在小鼠模型中,脑内皮细胞tmTNFα过表达引发与精神分裂症相关行为相关的细胞类型特异性信号变化 | 首次在脑内皮细胞中通过tmTNFα过表达模型,揭示其通过TNFR2信号通路引发精神分裂症相关行为的细胞类型特异性分子机制,包括从急性星形胶质细胞和突触紊乱到慢性免疫激活、代谢失调和翻译后调控的时序演变 | 未明确提及研究局限性 | 探究脑内皮细胞中tmTNFα过表达导致精神分裂症相关行为的分子机制 | 小鼠模型(短期和长期tmTNFα表达模型)及TNFR2敲除小鼠 | 机器学习 | 精神分裂症 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 蛋白质印迹, sGC活性检测 | NA | 转录组数据, 蛋白质表达数据, 信号通路数据 | 小鼠模型(短期4周和长期28周表达模型) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 624 | 2026-04-27 |
Maternal immune activation causes sex-specific impairment of microglial function during prefrontal cortex development
2026-Apr-19, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106770
PMID:42013920
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研究论文 | 该研究揭示了孕期母体免疫激活通过性别特异性损害小胶质细胞功能,导致前额叶皮层发育异常和雄性后代行为缺陷 | 首次证明MIA通过性别特异性方式损害小胶质细胞反应性,导致雄性后代前额叶皮层突触修剪缺陷和行为异常 | 未明确小胶质细胞功能障碍与神经发育异常之间的分子机制 | 探究母体免疫激活如何通过小胶质细胞介导性别特异性神经发育异常 | 母体免疫激活小鼠模型的后代,特别是前额叶皮层中的小胶质细胞 | 机器学习 | 神经发育障碍 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | MIA诱导的雄性及雌性小鼠后代,具体数量未在摘要中明确 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2026-04-27 |
M2 macrophage-derived exosomes deliver NGF-modified mRNA to promote comprehensive corneal repair
2026-Apr-17, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114930
PMID:42002048
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研究论文 | 利用M2巨噬细胞来源的外泌体递送NGF修饰mRNA用于促进角膜综合修复 | 首次将M2巨噬细胞外泌体与NGF修饰mRNA结合,实现多维度的角膜修复,同时促进组织再生、抑制炎症和新生血管 | 未明确提及研究限制 | 开发一种基于M2巨噬细胞外泌体和NGF修饰mRNA的创新递送平台,用于角膜损伤后的综合修复 | M2巨噬细胞来源的外泌体、NGF修饰mRNA、碱烧伤的角膜组织 | 数字病理学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 626 | 2026-04-27 |
Advanced single-cell transcriptomics deciphers cellular complexity and MIF-orchestrated signaling networks in diabetes-induced myocardial disease
2026-Apr-16, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100420
PMID:41997558
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研究论文 | 通过整合多组学方法,系统地解析糖尿病心肌病变中的转录结构及细胞间信号网络,揭示细胞异质性和MIF信号的关键作用 | 首次在单细胞水平全面描绘糖尿病心肌病中的细胞异质性和信号网络,特别是发现21种成纤维细胞亚型并确认MIF信号作为关键的细胞间协调轴 | 研究基于动物模型,结果可能不完全适用于人类;同时单细胞分辨率的采样深度和批次效应可能影响发现的普适性 | 阐明糖尿病所致心肌功能障碍中的转录组结构和细胞间信号框架 | 糖尿病疾病模型中的心脏样本 | 机器学习和生物信息学 | 糖尿病性心肌病 | RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 627 | 2026-04-27 |
SCTGE infers transformer-based graph embeddings to improve cell-cell interaction identification and cell identity annotations
2026-Apr-11, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | SCTGE是一种基于Transformer的图嵌入新架构,整合自适应多尺度注意力和图神经网络,用于解决单细胞转录组空间嵌入难题并提升细胞间相互作用识别与细胞身份注释性能 | 创新性地融合Transformer自注意力机制与图神经网络,引入上下文感知自适应多头注意力和APPNP增强特征传播,有效应对空间转录组学中的可扩展性和噪声挑战 | 在特定数据集上细胞身份注释性能存在例外情况 | 开发可扩展且可解释的解决方案,用于空间嵌入提取、细胞间通信分析和细胞身份注释 | 单细胞转录组数据中的空间嵌入和细胞间相互作用 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 基于Transformer的图神经网络 | 单细胞转录组数据 | 六个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 628 | 2026-04-27 |
Clonal amplification of peripheral CD4+ and CD8+ T cells is associated with clinical response to checkpoint blockade in chronic hepatitis B
2026-Apr-11, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlag020
PMID:42033764
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研究论文 | 通过单细胞测序分析,发现慢性乙型肝炎患者中外周血CD4+和CD8+ T细胞的克隆扩增与检查点阻断治疗的临床反应相关 | 首次揭示单次纳武利尤单抗治疗后,功能性治愈患者中干细胞样记忆CD8+ T细胞基线水平升高,以及T和B细胞特异性克隆的出现与阳性反应相关 | 样本量较小,仅对4名患者的血液样本进行分析 | 探究检查点阻断疗法在慢性乙型肝炎中的免疫机制 | 慢性乙型肝炎患者的血液样本,包括对纳武利尤单抗有反应和无反应的患者 | 机器学习 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 4名患者,多个时间点的血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 629 | 2026-04-27 |
Multidimensional single-cell analysis reveals immune dysfunction and inflammatory response in lymphatic malformations
2026-Apr-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf103
PMID:41273773
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research paper | 通过单细胞多组学分析揭示了淋巴管畸形中免疫功能障碍和炎症反应的细胞类型特异性机制 | 首次整合单细胞RNA测序、T细胞受体测序和B细胞受体测序对淋巴管畸形患者外周血和胸腔积液进行多维免疫图谱分析,发现促炎性单核细胞和记忆B细胞扩增、细胞毒性T细胞和自然杀伤细胞减少,并鉴定出S100A8作为潜在治疗靶点 | 未提及 | 阐明淋巴管畸形中循环细胞的免疫表型和潜在分子机制 | 淋巴管畸形患者的外周血和胸腔积液样本 | 单细胞组学 | 淋巴管畸形 | scRNA-seq, scTCR-seq, scBCR-seq | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列、B细胞受体序列 | 淋巴管畸形患者样本 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell TCR-seq, single-cell BCR-seq | NA | NA |
| 630 | 2026-04-27 |
Indirubin and Retinoic Acid Show Binding Affinity to Monocyte Biomarker CSF3R in Parkinson's Disease
2026-Apr, Journal of clinical laboratory analysis
IF:2.6Q2
DOI:10.1002/jcla.70197
PMID:41845882
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研究论文 | 本研究整合多组学数据分析,识别帕金森病单核细胞相关生物标志物CSF3R和IFITM3,并预测潜在靶向药物 | 首次结合单细胞测序与hdWGCNA分析,鉴定帕金森病外周血中单核细胞相关生物标志物,并预测其靶向药物 | NA | 通过多组学数据整合分析,揭示帕金森病中单核细胞的关键分子变化,识别新型生物标志物 | 帕金森病患者外周血单核细胞 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序、芯片分析 | NA | 单细胞转录组数据、芯片数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 631 | 2026-04-27 |
Multi-Omics Profiling Uncovers Predictive Factors for Tumor-Infiltrating Lymphocyte Therapy in Ovarian Cancer
2026-Apr, Journal of clinical laboratory analysis
IF:2.6Q2
DOI:10.1002/jcla.70196
PMID:41877397
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research paper | 通过多组学分析揭示卵巢癌肿瘤浸润淋巴细胞治疗中的预测因素 | 首次对卵巢癌肿瘤样本进行多组学分析,整合全外显子组测序、bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据,系统性地识别与TIL治疗成功相关的细胞组成、代谢活性和细胞间通讯特征 | 样本量较小(仅10例患者),且主要基于回顾性分析,需要更大规模的前瞻性研究进行验证 | 识别预测卵巢癌患者肿瘤浸润淋巴细胞分离和扩增成功与否的关键因素 | 10例卵巢癌患者的肿瘤样本 | machine learning | ovarian cancer | 多组学分析 | NA | 基因组数据 | 10例卵巢癌患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 632 | 2026-04-27 |
Development of a pediatric immune cell atlas and characterization of CD4+ T cells in food allergy
2026-Apr, Pediatric allergy and immunology : official publication of the European Society of Pediatric Allergy and Immunology
IF:4.3Q1
DOI:10.1111/pai.70337
PMID:42025535
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研究论文 | 利用公开的单细胞RNA测序数据构建儿童免疫细胞图谱,并研究食物过敏中CD4+ T细胞的特征 | 首次构建了包含57名个体的儿童单细胞参考图谱,并鉴定了与食物过敏相关的细胞毒性Th2样细胞亚群 | 数据来源于多个临床研究,可能存在批次效应;样本量相对较小,需进一步验证 | 构建儿童免疫细胞参考图谱并探索食物过敏中CD4+ T细胞的异质性和功能 | 8项临床研究中外周血单核细胞样本,共57名儿童 | 单细胞测序 | 食物过敏 | scRNA-seq | 随机森林模型 | 单细胞基因表达数据 | 57名儿童的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 633 | 2026-04-27 |
Macrophage Cluster of Differentiation 163 promotes post-infarction cardiac repair and preserves left ventricular function via osteopontin
2026-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70662
PMID:42026811
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研究论文 | 本文研究了巨噬细胞分化簇163(CD163)在心肌梗死后心脏修复中的作用,发现CD163通过上调骨桥蛋白表达促进修复并保护左心室功能 | 首次揭示了CD163在心肌梗死后心脏修复中的功能作用,并阐明了其通过上调骨桥蛋白表达的分子机制 | 主要基于小鼠模型,需进一步在人类中验证;未完全阐明CD163调控骨桥蛋白的具体信号通路 | 探讨CD163在心肌梗死后心脏修复中的作用及其分子机制 | 缺血性心肌病患者、野生型和Cd163基因敲除小鼠 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床研究比较心衰患者与非心衰个体;小鼠模型使用野生型和Cd163基因敲除小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 634 | 2026-04-27 |
Infection of 5xFAD mice with a mouse-adapted SARS-CoV-2 does not alter Alzheimer's disease neuropathology yet induces widespread changes in gene expression across diverse cell types
2026-Apr, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71394
PMID:42029189
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研究论文 | 感染小鼠适应性SARS-CoV-2的5xFAD小鼠不改变阿尔茨海默病神经病理学,但诱导多种细胞类型基因表达的广泛变化 | 首次在5xFAD阿尔茨海默病小鼠模型中评估小鼠适应性SARS-CoV-2(MA10)感染对神经病理学和基因表达的影响,并利用空间转录组学揭示细胞类型特异性基因表达变化 | 未在脑内检测到病毒RNA,可能无法直接模拟人类COVID-19对中枢神经系统的影响;样本量和检测时间点有限 | 研究SARS-CoV-2感染对阿尔茨海默病神经病理学和疾病进展的影响 | 老年5xFAD和野生型(WT)小鼠 | 机器学习 | 阿尔茨海默病,新冠肺炎 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 老年5xFAD和野生型小鼠,具体数量未提供 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 635 | 2026-04-27 |
Comprehensive Multi-Omics Characterization of CYP2R1 as a Diagnostic and Functional Biomarker in Hepatocellular Carcinoma
2026-Apr-01, Medical sciences (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/medsci14020178
PMID:42029602
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研究论文 | 系统分析了57个CYP基因在肝细胞癌中的表达,发现CYP2R1作为诊断和功能生物标志物具有高准确性和预后价值 | 首次全面描绘CYP基因家族在肝细胞癌中的失调图谱,并鉴定CYP2R1为连接代谢、DNA修复和免疫调节的新型生物标志物 | 未提及具体局限性 | 鉴定肝细胞癌中可靠分子生物标志物并阐明其功能意义 | 肝细胞癌患者多队列转录组数据 | 数字病理学, 机器学习 | 肝癌 | 转录组测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多队列数据,具体样本量未提供 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 636 | 2026-04-27 |
Exploring the immune environment of glioblastoma in humanized mouse models
2026-Mar-30, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag073
PMID:41913047
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研究论文 | 通过建立人源化小鼠模型,探索胶质母细胞瘤的免疫微环境 | 首次利用表达关键人细胞因子的免疫缺陷小鼠模型,结合患者来源异种移植物和单细胞RNA测序,成功构建了模拟复发胶质母细胞瘤免疫特征的人源化小鼠模型 | 未明确提及具体局限性,但可能包括模型对肿瘤异质性复制的有限性和人源化小鼠免疫系统完全重建的挑战 | 建立能够模拟人类复发胶质母细胞瘤免疫环境的动物模型,以促进新疗法特别是免疫疗法的研究 | 胶质母细胞瘤患者来源的异种移植物及人源化小鼠中的肿瘤和免疫细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 未明确提及具体样本数量,涉及多个人源化小鼠模型和患者数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 637 | 2026-04-27 |
A Composite interaction Score: Prioritizing cell-cell interactions from single-cell RNA-seq with application to pre-menopausal epithelial barriers
2026-Mar-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.046
PMID:41875947
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研究论文 | 提出Composite Interaction Score (CIS)方法,整合六种细胞-细胞相互作用预测工具,优先排序来自单细胞RNA-seq的相互作用 | 通过排名偏差精度加权工具间一致性,强调排名列表顶部的一致性,优于简单平均值基线,并应用于上皮屏障组织 | 未明确提及局限性 | 开发优先排序细胞-细胞相互作用的共识策略,强调可重复性和生物学相关性 | 肠、皮肤和子宫的上皮屏障组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 来自肠、皮肤和子宫的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 638 | 2026-03-18 |
Single-cell sequencing combined with transcriptome sequencing to reveal the molecular mechanisms related to integrated stress responses in atherosclerosis
2026-Mar-17, Journal of cardiothoracic surgery
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13019-026-03862-y
PMID:41840716
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 639 | 2026-03-19 |
Single-cell transcriptome analysis reveals DNMT1+ epithelial cells promote lymphatic metastasis via CXCL17-mediated TAM infiltration
2026-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08032-1
PMID:41845371
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 640 | 2026-04-27 |
AGPAT3 reshapes tumor cell vulnerability to IFNγ-mediated ferroptosis and enhances immunotherapy efficacy through lipid remodeling
2026-Mar-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013305
PMID:41807033
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研究论文 | 本研究揭示了AGPAT3通过脂质重塑调控肿瘤细胞对IFNγ介导的铁死亡易感性,并增强免疫检查点抑制剂疗效的机制 | 首次发现IFN-γ-IRF1-AGPAT3轴通过脂质重塑促进铁死亡,并构建了基于铁死亡相关基因的机器学习预测模型以提升免疫治疗效果 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,临床样本分析有限,且未深入探讨AGPAT3在其他免疫微环境细胞中的作用 | 探究铁死亡在增强免疫检查点抑制剂疗效中的潜力及其分子机制 | 肿瘤细胞(涉及IFN-γ信号通路和铁死亡敏感性) | 机器学习, 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 脂质组学, 转录组学, ChIP-seq, CUT&Tag | 机器学习模型(针对铁死亡相关基因) | 单细胞RNA测序数据, 脂质组数据, 转录组数据 | 大型单细胞RNA测序数据集(具体样本量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |